RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000235150.4

RNF19B-201, Transcript of ring finger protein 19B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene RNF19B, Length 2,334 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF19B-201ENST00000235150 CCL20P78556 96 aa20.55■□□□□ 0.88
RNF19B-201ENST00000235150 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
RNF19B-201ENST00000235150 ZNF439Q8NDP4 499 aa20.55■□□□□ 0.88
RNF19B-201ENST00000235150 LEAP2Q969E1 77 aa20.55■□□□□ 0.88
RNF19B-201ENST00000235150 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa20.55■□□□□ 0.88
RNF19B-201ENST00000235150 KIAA1456Q9P272 454 aa20.55■□□□□ 0.88
RNF19B-201ENST00000235150 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
RNF19B-201ENST00000235150 OR9G9P0C7N8 305 aa20.54■□□□□ 0.88
RNF19B-201ENST00000235150 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
RNF19B-201ENST00000235150 ZDHHC16Q969W1 377 aa20.54■□□□□ 0.88
RNF19B-201ENST00000235150 POLEQ07864 2286 aa20.54■□□□□ 0.88
RNF19B-201ENST00000235150 IGF2RP11717 2491 aa20.54■□□□□ 0.88
RNF19B-201ENST00000235150 TMPRSS2O15393 492 aa20.54■□□□□ 0.88
RNF19B-201ENST00000235150 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
RNF19B-201ENST00000235150 OR8G2PQ6IF36 304 aa20.54■□□□□ 0.88
RNF19B-201ENST00000235150 TMEM88Q6PEY1 159 aa20.54■□□□□ 0.88
RNF19B-201ENST00000235150 C1orf87Q8N0U7 546 aa20.54■□□□□ 0.88
RNF19B-201ENST00000235150 CLRN3Q8NCR9 226 aa20.54■□□□□ 0.88
RNF19B-201ENST00000235150 S1PR3Q99500 378 aa20.54■□□□□ 0.88
RNF19B-201ENST00000235150 PMS2P5A8MQ11 134 aa20.53■□□□□ 0.88
RNF19B-201ENST00000235150 CASP6P55212 293 aa20.53■□□□□ 0.88
RNF19B-201ENST00000235150 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
RNF19B-201ENST00000235150 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa20.53■□□□□ 0.88
RNF19B-201ENST00000235150 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
RNF19B-201ENST00000235150 SERF2P84101 59 aa20.53■□□□□ 0.88
RNF19B-201ENST00000235150 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa20.53■□□□□ 0.88
RNF19B-201ENST00000235150 TMEM178BH3BS89 294 aa20.52■□□□□ 0.88
RNF19B-201ENST00000235150 ATP6V1FQ16864 119 aa20.52■□□□□ 0.88
RNF19B-201ENST00000235150 ZNF251Q9BRH9 671 aa20.52■□□□□ 0.88
RNF19B-201ENST00000235150 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
RNF19B-201ENST00000235150 SLC35B3Q9H1N7 401 aa20.52■□□□□ 0.88
RNF19B-201ENST00000235150 LINC00312Q9Y6C7 94 aa20.52■□□□□ 0.88
RNF19B-201ENST00000235150 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa20.52■□□□□ 0.87
RNF19B-201ENST00000235150 A0A1W2PPE3 182 aa20.52■□□□□ 0.87
RNF19B-201ENST00000235150 hADV38S2A0JD32 116 aa20.52■□□□□ 0.87
RNF19B-201ENST00000235150 E7EQL1 145 aa20.52■□□□□ 0.87
RNF19B-201ENST00000235150 HBE1P02100 147 aa20.52■□□□□ 0.87
RNF19B-201ENST00000235150 CA7P43166 264 aa20.52■□□□□ 0.87
RNF19B-201ENST00000235150 CBLN2Q8IUK8 224 aa20.52■□□□□ 0.87
RNF19B-201ENST00000235150 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP20.52■□□□□ 0.87
RNF19B-201ENST00000235150 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa20.51■□□□□ 0.87
RNF19B-201ENST00000235150 RBFOX3A6NFN3 312 aa20.51■□□□□ 0.87
RNF19B-201ENST00000235150 CEBPZOSA8MTT3 80 aa20.51■□□□□ 0.87
RNF19B-201ENST00000235150 NQO2P16083 231 aa20.51■□□□□ 0.87
RNF19B-201ENST00000235150 NFYBP25208 207 aa20.51■□□□□ 0.87
RNF19B-201ENST00000235150 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa20.51■□□□□ 0.87
RNF19B-201ENST00000235150 OR4S2Q8NH73 311 aa20.51■□□□□ 0.87
RNF19B-201ENST00000235150 SFT2D1Q8WV19 159 aa20.51■□□□□ 0.87
RNF19B-201ENST00000235150 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
RNF19B-201ENST00000235150 YLPM1P49750 1951 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
RNF19B-201ENST00000235150 ERVK-16P61578 105 aa20.5■□□□□ 0.87
RNF19B-201ENST00000235150 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
RNF19B-201ENST00000235150 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
RNF19B-201ENST00000235150 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
RNF19B-201ENST00000235150 RARRES2Q99969 163 aa20.5■□□□□ 0.87
RNF19B-201ENST00000235150 RPRMQ9NS64 109 aa20.5■□□□□ 0.87
RNF19B-201ENST00000235150 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
RNF19B-201ENST00000235150 PPIAL4EA0A075B759 164 aa20.5■□□□□ 0.87
RNF19B-201ENST00000235150 PPIAL4DF5H284 164 aa20.5■□□□□ 0.87
RNF19B-201ENST00000235150 LY86O95711 162 aa20.5■□□□□ 0.87
RNF19B-201ENST00000235150 PPIAL4FP0DN26 164 aa20.5■□□□□ 0.87
RNF19B-201ENST00000235150 NDUFB7P17568 137 aa20.5■□□□□ 0.87
RNF19B-201ENST00000235150 RAB2AP61019 212 aa20.5■□□□□ 0.87
RNF19B-201ENST00000235150 KLRB1Q12918 225 aa20.5■□□□□ 0.87
RNF19B-201ENST00000235150 PPIAL4AQ9Y536 164 aa20.5■□□□□ 0.87
RNF19B-201ENST00000235150 PKDREJQ9NTG1 2253 aa20.49■□□□□ 0.87
RNF19B-201ENST00000235150 MMP23AO75900 390 aa20.49■□□□□ 0.87
RNF19B-201ENST00000235150 THBS3P49746 956 aa20.49■□□□□ 0.87
RNF19B-201ENST00000235150 OR2B8PP59922 312 aa20.49■□□□□ 0.87
RNF19B-201ENST00000235150 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
RNF19B-201ENST00000235150 SSX9Q7RTT3 188 aa20.49■□□□□ 0.87
RNF19B-201ENST00000235150 OR10P1Q8NGE3 313 aa20.49■□□□□ 0.87
RNF19B-201ENST00000235150 TMEM147Q9BVK8 224 aa20.49■□□□□ 0.87
RNF19B-201ENST00000235150 TMEM106BQ9NUM4 274 aa20.49■□□□□ 0.87
RNF19B-201ENST00000235150 TIMM9Q9Y5J7 89 aa20.49■□□□□ 0.87
RNF19B-201ENST00000235150 MRPS11P82912 194 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
RNF19B-201ENST00000235150 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa20.49■□□□□ 0.87
RNF19B-201ENST00000235150 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
RNF19B-201ENST00000235150 OR52E5Q8NH55 327 aa20.49■□□□□ 0.87
RNF19B-201ENST00000235150 NEUROG1Q92886 237 aa20.49■□□□□ 0.87
RNF19B-201ENST00000235150 ADTRPQ96IZ2 230 aa20.49■□□□□ 0.87
RNF19B-201ENST00000235150 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
RNF19B-201ENST00000235150 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa20.48■□□□□ 0.87
RNF19B-201ENST00000235150 SPINK9Q5DT21 86 aa20.48■□□□□ 0.87
RNF19B-201ENST00000235150 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
RNF19B-201ENST00000235150 CENPVQ7Z7K6 275 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
RNF19B-201ENST00000235150 LYG1Q8N1E2 194 aa20.48■□□□□ 0.87
RNF19B-201ENST00000235150 OR4A16Q8NH70 328 aa20.48■□□□□ 0.87
RNF19B-201ENST00000235150 VSIRQ9H7M9 311 aa20.48■□□□□ 0.87
RNF19B-201ENST00000235150 SPTA1P02549 2419 aa20.48■□□□□ 0.87
RNF19B-201ENST00000235150 SPCS3P61009 180 aa20.48■□□□□ 0.87
RNF19B-201ENST00000235150 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa20.48■□□□□ 0.87
RNF19B-201ENST00000235150 OR10A7Q8NGE5 316 aa20.48■□□□□ 0.87
RNF19B-201ENST00000235150 CCL17Q92583 94 aa20.48■□□□□ 0.87
RNF19B-201ENST00000235150 MS4A5Q9H3V2 200 aa20.48■□□□□ 0.87
RNF19B-201ENST00000235150 DYNLRB1Q9NP97 96 aa20.48■□□□□ 0.87
RNF19B-201ENST00000235150 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
RNF19B-201ENST00000235150 IFNA17P01571 189 aa20.47■□□□□ 0.87
RNF19B-201ENST00000235150 GNB2P62879 340 aa20.47■□□□□ 0.87
RNF19B-201ENST00000235150 RELBQ01201 579 aa20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.3 ms