RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000234111.8

ODC1-201, Transcript of ornithine decarboxylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ODC1, Length 2,653 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1-201ENST00000234111 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP17.86■□□□□ 0.45
ODC1-201ENST00000234111 SPINK9Q5DT21 86 aa17.86■□□□□ 0.45
ODC1-201ENST00000234111 MMD2Q8IY49 270 aa17.86■□□□□ 0.45
ODC1-201ENST00000234111 ZNF488Q96MN9 340 aa17.86■□□□□ 0.45
ODC1-201ENST00000234111 SFXN3Q9BWM7 321 aa17.86■□□□□ 0.45
ODC1-201ENST00000234111 C17orf112F2Z3M2 114 aa17.85■□□□□ 0.45
ODC1-201ENST00000234111 EDDM3BP56851 147 aa17.85■□□□□ 0.45
ODC1-201ENST00000234111 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa17.85■□□□□ 0.45
ODC1-201ENST00000234111 Q8N7P7 452 aa17.85■□□□□ 0.45
ODC1-201ENST00000234111 OR56B2PQ8NGI1 322 aa17.85■□□□□ 0.45
ODC1-201ENST00000234111 TMEM38BQ9NVV0 291 aa17.85■□□□□ 0.45
ODC1-201ENST00000234111 A0A1W2PPV4 95 aa17.85■□□□□ 0.45
ODC1-201ENST00000234111 LRP5LA4QPB2 252 aa17.85■□□□□ 0.45
ODC1-201ENST00000234111 ARL14EPLP0DKL9 152 aa17.85■□□□□ 0.45
ODC1-201ENST00000234111 KIAA0895LQ68EN5 471 aa17.85■□□□□ 0.45
ODC1-201ENST00000234111 OR2M7Q8NG81 312 aa17.85■□□□□ 0.45
ODC1-201ENST00000234111 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa17.85■□□□□ 0.45
ODC1-201ENST00000234111 IGHV1-69-2A0A0G2JMI3 117 aa17.85■□□□□ 0.45
ODC1-201ENST00000234111 IGLC7A0M8Q6 106 aa17.85■□□□□ 0.45
ODC1-201ENST00000234111 TRAPPC2LH3BP13 241 aa17.85■□□□□ 0.45
ODC1-201ENST00000234111 NTF4P34130 210 aa17.85■□□□□ 0.45
ODC1-201ENST00000234111 G6PCP35575 357 aa17.85■□□□□ 0.45
ODC1-201ENST00000234111 HTD2P86397 168 aa17.85■□□□□ 0.45
ODC1-201ENST00000234111 RPEL1Q2QD12 228 aa17.85■□□□□ 0.45
ODC1-201ENST00000234111 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP17.85■□□□□ 0.45
ODC1-201ENST00000234111 FADS6Q8N9I5 356 aa17.85■□□□□ 0.45
ODC1-201ENST00000234111 CST9LQ9H4G1 147 aa17.85■□□□□ 0.45
ODC1-201ENST00000234111 ESPL1Q14674 2120 aa17.84■□□□□ 0.45
ODC1-201ENST00000234111 ABCA7Q8IZY2 2146 aa17.84■□□□□ 0.45
ODC1-201ENST00000234111 EML6Q6ZMW3 1958 aa17.84■□□□□ 0.45
ODC1-201ENST00000234111 SYNGR1O43759 233 aa17.84■□□□□ 0.45
ODC1-201ENST00000234111 RAMP3O60896 148 aa17.84■□□□□ 0.45
ODC1-201ENST00000234111 CA2P00918 260 aa17.84■□□□□ 0.45
ODC1-201ENST00000234111 NTF3P20783 257 aa17.84■□□□□ 0.45
ODC1-201ENST00000234111 RAET1LQ5VY80 246 aa17.84■□□□□ 0.45
ODC1-201ENST00000234111 GNB1LQ9BYB4 327 aa17.84■□□□□ 0.45
ODC1-201ENST00000234111 OR2H1Q9GZK4 316 aa17.84■□□□□ 0.45
ODC1-201ENST00000234111 CHODLQ9H9P2 273 aa17.84■□□□□ 0.45
ODC1-201ENST00000234111 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa17.84■□□□□ 0.45
ODC1-201ENST00000234111 S1PR2O95136 353 aa17.84■□□□□ 0.45
ODC1-201ENST00000234111 VAMP5O95183 116 aa17.84■□□□□ 0.45
ODC1-201ENST00000234111 SLC35B1P78383 322 aa17.84■□□□□ 0.45
ODC1-201ENST00000234111 CFHR1Q03591 330 aa17.84■□□□□ 0.45
ODC1-201ENST00000234111 OCIAD2Q56VL3 154 aa17.83■□□□□ 0.44
ODC1-201ENST00000234111 OR10J3Q5JRS4 329 aa17.83■□□□□ 0.44
ODC1-201ENST00000234111 OR4F17Q8NGA8 305 aa17.83■□□□□ 0.44
ODC1-201ENST00000234111 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa17.83■□□□□ 0.44
ODC1-201ENST00000234111 TRAV24A0A0B4J272 114 aa17.83■□□□□ 0.44
ODC1-201ENST00000234111 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP17.83■□□□□ 0.44
ODC1-201ENST00000234111 STUMQ69YW2 141 aa17.83■□□□□ 0.44
ODC1-201ENST00000234111 A0A1W2PRS3 328 aa17.82■□□□□ 0.44
ODC1-201ENST00000234111 ODAMA1E959 279 aa17.82■□□□□ 0.44
ODC1-201ENST00000234111 SRIP30626 198 aa17.82■□□□□ 0.44
ODC1-201ENST00000234111 RPL19P84098 196 aaKnown RBP17.82■□□□□ 0.44
ODC1-201ENST00000234111 VWC2Q2TAL6 325 aa17.82■□□□□ 0.44
ODC1-201ENST00000234111 DRAM1Q8N682 238 aa17.82■□□□□ 0.44
ODC1-201ENST00000234111 CLEC7AQ9BXN2 247 aa17.82■□□□□ 0.44
ODC1-201ENST00000234111 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa17.82■□□□□ 0.44
ODC1-201ENST00000234111 RRHO14718 337 aa17.82■□□□□ 0.44
ODC1-201ENST00000234111 TGFBR3Q03167 851 aa17.82■□□□□ 0.44
ODC1-201ENST00000234111 MKXQ8IYA7 352 aa17.82■□□□□ 0.44
ODC1-201ENST00000234111 TP73-AS1Q9UF72 201 aa17.82■□□□□ 0.44
ODC1-201ENST00000234111 LRRC30A6NM36 301 aa17.81■□□□□ 0.44
ODC1-201ENST00000234111 PSG1P11464 419 aa17.81■□□□□ 0.44
ODC1-201ENST00000234111 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP17.81■□□□□ 0.44
ODC1-201ENST00000234111 RPL31P62899 125 aaKnown RBP17.81■□□□□ 0.44
ODC1-201ENST00000234111 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP17.81■□□□□ 0.44
ODC1-201ENST00000234111 RAB1CQ92928 201 aa17.81■□□□□ 0.44
ODC1-201ENST00000234111 BORCS7Q96B45 105 aa17.81■□□□□ 0.44
ODC1-201ENST00000234111 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP17.81■□□□□ 0.44
ODC1-201ENST00000234111 SRXN1Q9BYN0 137 aa17.81■□□□□ 0.44
ODC1-201ENST00000234111 FGF21Q9NSA1 209 aa17.81■□□□□ 0.44
ODC1-201ENST00000234111 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP17.81■□□□□ 0.44
ODC1-201ENST00000234111 TMEM11P17152 192 aa17.81■□□□□ 0.44
ODC1-201ENST00000234111 TSKUQ8WUA8 353 aa17.81■□□□□ 0.44
ODC1-201ENST00000234111 CSTL1Q9H114 145 aa17.81■□□□□ 0.44
ODC1-201ENST00000234111 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa17.81■□□□□ 0.44
ODC1-201ENST00000234111 V9GYV3 84 aa17.81■□□□□ 0.44
ODC1-201ENST00000234111 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP17.8■□□□□ 0.44
ODC1-201ENST00000234111 OR5B3Q8NH48 314 aa17.8■□□□□ 0.44
ODC1-201ENST00000234111 DEPPQ9NTK1 212 aa17.8■□□□□ 0.44
ODC1-201ENST00000234111 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa17.8■□□□□ 0.44
ODC1-201ENST00000234111 OR5B21A6NL26 309 aa17.8■□□□□ 0.44
ODC1-201ENST00000234111 TMEM249Q2WGJ8 235 aa17.8■□□□□ 0.44
ODC1-201ENST00000234111 DCAF12Q5T6F0 453 aa17.8■□□□□ 0.44
ODC1-201ENST00000234111 TMEM136Q6ZRR5 245 aa17.8■□□□□ 0.44
ODC1-201ENST00000234111 VASH2Q86V25 355 aa17.8■□□□□ 0.44
ODC1-201ENST00000234111 MUC15Q8N387 334 aa17.8■□□□□ 0.44
ODC1-201ENST00000234111 SPSB4Q96A44 273 aa17.8■□□□□ 0.44
ODC1-201ENST00000234111 COL6A3P12111 3177 aa17.8■□□□□ 0.44
ODC1-201ENST00000234111 C10orf142B7Z368 130 aa17.79■□□□□ 0.44
ODC1-201ENST00000234111 ZFAND5O76080 213 aa17.79■□□□□ 0.44
ODC1-201ENST00000234111 CCNOP22674 350 aa17.79■□□□□ 0.44
ODC1-201ENST00000234111 RELBQ01201 579 aa17.79■□□□□ 0.44
ODC1-201ENST00000234111 A0A0J9YW62 118 aa17.79■□□□□ 0.44
ODC1-201ENST00000234111 COL8A2P25067 703 aa17.79■□□□□ 0.44
ODC1-201ENST00000234111 DEFB119Q8N690 84 aa17.79■□□□□ 0.44
ODC1-201ENST00000234111 FOXB1Q99853 325 aa17.79■□□□□ 0.44
ODC1-201ENST00000234111 CD207Q9UJ71 328 aa17.79■□□□□ 0.44
ODC1-201ENST00000234111 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.7 ms