RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000216416.8

CNIH1-201, Transcript of cornichon family AMPA receptor auxiliary protein 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNIH1, Length 4,793 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH1-201ENST00000216416 ST8SIA2Q92186 375 aa5.36□□□□□ -1.55
CNIH1-201ENST00000216416 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
CNIH1-201ENST00000216416 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa5.36□□□□□ -1.55
CNIH1-201ENST00000216416 C3orf36Q3SXR2 165 aa5.36□□□□□ -1.55
CNIH1-201ENST00000216416 BRD3OSQ6XYD6 125 aa5.36□□□□□ -1.55
CNIH1-201ENST00000216416 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa5.36□□□□□ -1.55
CNIH1-201ENST00000216416 OR5C1Q8NGR4 320 aa5.36□□□□□ -1.55
CNIH1-201ENST00000216416 LURAP1Q96LR2 239 aa5.36□□□□□ -1.55
CNIH1-201ENST00000216416 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
CNIH1-201ENST00000216416 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa5.36□□□□□ -1.55
CNIH1-201ENST00000216416 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
CNIH1-201ENST00000216416 S4R3C0 116 aa5.36□□□□□ -1.55
CNIH1-201ENST00000216416 EFNB3Q15768 340 aa5.36□□□□□ -1.55
CNIH1-201ENST00000216416 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa5.36□□□□□ -1.55
CNIH1-201ENST00000216416 PRSS54Q6PEW0 395 aa5.36□□□□□ -1.55
CNIH1-201ENST00000216416 Q6ZS49 121 aa5.36□□□□□ -1.55
CNIH1-201ENST00000216416 C1orf174Q8IYL3 243 aa5.36□□□□□ -1.55
CNIH1-201ENST00000216416 OR5D13Q8NGL4 314 aa5.36□□□□□ -1.55
CNIH1-201ENST00000216416 TNFRSF19Q9NS68 423 aa5.36□□□□□ -1.55
CNIH1-201ENST00000216416 TMEM8BA6NDV4 472 aa5.36□□□□□ -1.55
CNIH1-201ENST00000216416 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa5.36□□□□□ -1.55
CNIH1-201ENST00000216416 H7C1Q1 480 aa5.36□□□□□ -1.55
CNIH1-201ENST00000216416 CT45A6P0DMU7 189 aa5.36□□□□□ -1.55
CNIH1-201ENST00000216416 CT45A5P0DMU8 189 aa5.36□□□□□ -1.55
CNIH1-201ENST00000216416 CT45A7P0DMV0 189 aa5.36□□□□□ -1.55
CNIH1-201ENST00000216416 PAX9P55771 341 aa5.36□□□□□ -1.55
CNIH1-201ENST00000216416 ZNF787Q6DD87 383 aa5.36□□□□□ -1.55
CNIH1-201ENST00000216416 MOB1BQ7L9L4 216 aa5.36□□□□□ -1.55
CNIH1-201ENST00000216416 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP5.36□□□□□ -1.55
CNIH1-201ENST00000216416 R3HDM4Q96D70 268 aa5.36□□□□□ -1.55
CNIH1-201ENST00000216416 TENM1Q9UKZ4 2725 aa5.35□□□□□ -1.55
CNIH1-201ENST00000216416 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa5.35□□□□□ -1.55
CNIH1-201ENST00000216416 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa5.35□□□□□ -1.55
CNIH1-201ENST00000216416 H0Y980 276 aa5.35□□□□□ -1.55
CNIH1-201ENST00000216416 DEDDO75618 318 aa5.35□□□□□ -1.55
CNIH1-201ENST00000216416 IGHV2-70P01814 119 aa5.35□□□□□ -1.55
CNIH1-201ENST00000216416 TLE4Q04727 773 aa5.35□□□□□ -1.55
CNIH1-201ENST00000216416 S1PR3Q99500 378 aa5.35□□□□□ -1.55
CNIH1-201ENST00000216416 RSG1Q9BU20 258 aa5.35□□□□□ -1.55
CNIH1-201ENST00000216416 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
CNIH1-201ENST00000216416 NMES1Q9C002 83 aa5.35□□□□□ -1.55
CNIH1-201ENST00000216416 VWFP04275 2813 aa5.35□□□□□ -1.55
CNIH1-201ENST00000216416 HLA-GP17693 338 aa5.35□□□□□ -1.55
CNIH1-201ENST00000216416 SMCO1Q147U7 214 aa5.35□□□□□ -1.55
CNIH1-201ENST00000216416 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa5.35□□□□□ -1.55
CNIH1-201ENST00000216416 LPCAT3Q6P1A2 487 aa5.35□□□□□ -1.55
CNIH1-201ENST00000216416 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa5.35□□□□□ -1.55
CNIH1-201ENST00000216416 OR4D5Q8NGN0 318 aa5.35□□□□□ -1.55
CNIH1-201ENST00000216416 TMEM56Q96MV1 263 aa5.35□□□□□ -1.55
CNIH1-201ENST00000216416 HRH4Q9H3N8 390 aa5.35□□□□□ -1.55
CNIH1-201ENST00000216416 FBXO7Q9Y3I1 522 aa5.35□□□□□ -1.55
CNIH1-201ENST00000216416 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa5.35□□□□□ -1.55
CNIH1-201ENST00000216416 CEBPZOSA8MTT3 80 aa5.35□□□□□ -1.55
CNIH1-201ENST00000216416 IGHV1-8P0DP01 117 aa5.35□□□□□ -1.55
CNIH1-201ENST00000216416 DYNLT3P51808 116 aa5.35□□□□□ -1.55
CNIH1-201ENST00000216416 VAMP2P63027 116 aa5.35□□□□□ -1.55
CNIH1-201ENST00000216416 DYNAPQ8N1N2 210 aa5.35□□□□□ -1.55
CNIH1-201ENST00000216416 TMEM252Q8N6L7 170 aa5.35□□□□□ -1.55
CNIH1-201ENST00000216416 EDARADDQ8WWZ3 215 aa5.35□□□□□ -1.55
CNIH1-201ENST00000216416 CYTL1Q9NRR1 136 aa5.35□□□□□ -1.55
CNIH1-201ENST00000216416 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa5.35□□□□□ -1.55
CNIH1-201ENST00000216416 SHOXO15266 292 aa5.35□□□□□ -1.55
CNIH1-201ENST00000216416 SLC25A17O43808 307 aa5.35□□□□□ -1.55
CNIH1-201ENST00000216416 GNB1P62873 340 aa5.35□□□□□ -1.55
CNIH1-201ENST00000216416 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
CNIH1-201ENST00000216416 OR2C3Q8N628 320 aa5.35□□□□□ -1.55
CNIH1-201ENST00000216416 GON7Q9BXV9 100 aa5.35□□□□□ -1.55
CNIH1-201ENST00000216416 SLC25A32Q9H2D1 315 aa5.35□□□□□ -1.55
CNIH1-201ENST00000216416 NUP50Q9UKX7 468 aa5.35□□□□□ -1.55
CNIH1-201ENST00000216416 TMED3Q9Y3Q3 217 aa5.35□□□□□ -1.55
CNIH1-201ENST00000216416 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP5.34□□□□□ -1.55
CNIH1-201ENST00000216416 ADH4P08319 380 aa5.34□□□□□ -1.55
CNIH1-201ENST00000216416 S100GP29377 79 aa5.34□□□□□ -1.55
CNIH1-201ENST00000216416 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa5.34□□□□□ -1.55
CNIH1-201ENST00000216416 KCNRGQ8N5I3 272 aa5.34□□□□□ -1.55
CNIH1-201ENST00000216416 KIR3DL3Q8N743 410 aa5.34□□□□□ -1.55
CNIH1-201ENST00000216416 CLDND2Q8NHS1 167 aa5.34□□□□□ -1.55
CNIH1-201ENST00000216416 RAB1CQ92928 201 aa5.34□□□□□ -1.55
CNIH1-201ENST00000216416 CCL19Q99731 98 aa5.34□□□□□ -1.55
CNIH1-201ENST00000216416 SLC35D1Q9NTN3 355 aa5.34□□□□□ -1.55
CNIH1-201ENST00000216416 LINC00312Q9Y6C7 94 aa5.34□□□□□ -1.55
CNIH1-201ENST00000216416 F2RL2O00254 374 aa5.34□□□□□ -1.55
CNIH1-201ENST00000216416 YPEL1O60688 119 aa5.34□□□□□ -1.55
CNIH1-201ENST00000216416 NMBP08949 121 aa5.34□□□□□ -1.55
CNIH1-201ENST00000216416 HTD2P86397 168 aa5.34□□□□□ -1.55
CNIH1-201ENST00000216416 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP5.34□□□□□ -1.55
CNIH1-201ENST00000216416 HES1Q14469 280 aa5.34□□□□□ -1.55
CNIH1-201ENST00000216416 HEPN1Q6WQI6 88 aa5.34□□□□□ -1.55
CNIH1-201ENST00000216416 Q8N7P7 452 aa5.34□□□□□ -1.55
CNIH1-201ENST00000216416 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP5.34□□□□□ -1.55
CNIH1-201ENST00000216416 YPEL2Q96QA6 119 aa5.34□□□□□ -1.55
CNIH1-201ENST00000216416 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP5.34□□□□□ -1.55
CNIH1-201ENST00000216416 TMEM140Q9NV12 185 aa5.34□□□□□ -1.55
CNIH1-201ENST00000216416 LINC00527Q9UJ94 153 aa5.34□□□□□ -1.55
CNIH1-201ENST00000216416 JPT1Q9UK76 154 aa5.34□□□□□ -1.55
CNIH1-201ENST00000216416 FAM96BQ9Y3D0 163 aa5.34□□□□□ -1.55
CNIH1-201ENST00000216416 AUP1Q9Y679 476 aa5.34□□□□□ -1.55
CNIH1-201ENST00000216416 HMSDA8MTL9 139 aa5.34□□□□□ -1.55
CNIH1-201ENST00000216416 J3QR06 171 aa5.34□□□□□ -1.55
CNIH1-201ENST00000216416 RRHO14718 337 aa5.34□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.7 ms