RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636573.1

GABRA1-215, Transcript of gamma-aminobutyric acid type A receptor alpha1 subunit, human

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene GABRA1, Length 2,262 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GABRA1-215	ENST00000636573	LRFN3	Q9BTN0	628 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GABRA1-215	ENST00000636573	QTRT1	Q9BXR0	403 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
GABRA1-215	ENST00000636573	NPCDR1	Q9BY65	106 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GABRA1-215	ENST00000636573	PPP1R3C	Q9UQK1	317 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GABRA1-215	ENST00000636573	TBL2	Q9Y4P3	447 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
GABRA1-215	ENST00000636573	C2orf16	Q68DN1	1984 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GABRA1-215	ENST00000636573	EXPH5	Q8NEV8	1989 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GABRA1-215	ENST00000636573	LOC105371242	A0A075B767	164 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GABRA1-215	ENST00000636573	DPRX	A6NFQ7	191 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GABRA1-215	ENST00000636573	SNURFL	B1AK76	121 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GABRA1-215	ENST00000636573	NPIPB11	E5RHQ5	1161 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GABRA1-215	ENST00000636573	RBFOX2	O43251	390 aa	Known RBP eCLIP	4.87	□□□□□ -1.63
GABRA1-215	ENST00000636573	GFRA3	O60609	400 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GABRA1-215	ENST00000636573	WDR1	O75083	606 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GABRA1-215	ENST00000636573	TSPO	P30536	169 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GABRA1-215	ENST00000636573	ATP5G3	P48201	142 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GABRA1-215	ENST00000636573	AMT	P48728	403 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GABRA1-215	ENST00000636573	HINT1	P49773	126 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
GABRA1-215	ENST00000636573	VWC2	Q2TAL6	325 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GABRA1-215	ENST00000636573	ZNF585B	Q52M93	769 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GABRA1-215	ENST00000636573	TRIM61	Q5EBN2	209 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GABRA1-215	ENST00000636573	DCAF12	Q5T6F0	453 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GABRA1-215	ENST00000636573	PARM1	Q6UWI2	310 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GABRA1-215	ENST00000636573	BATF2	Q8N1L9	274 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GABRA1-215	ENST00000636573	FADS6	Q8N9I5	356 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GABRA1-215	ENST00000636573	ZNF114	Q8NC26	417 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GABRA1-215	ENST00000636573	NUDT10	Q8NFP7	164 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GABRA1-215	ENST00000636573	CADM4	Q8NFZ8	388 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GABRA1-215	ENST00000636573	OR10G3	Q8NGC4	313 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GABRA1-215	ENST00000636573	OCC1	Q8TAD7	63 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GABRA1-215	ENST00000636573	LMX1A	Q8TE12	382 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GABRA1-215	ENST00000636573	RAB1C	Q92928	201 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GABRA1-215	ENST00000636573	APOBEC3D	Q96AK3	386 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
GABRA1-215	ENST00000636573	BORCS7	Q96B45	105 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GABRA1-215	ENST00000636573	KCNS1	Q96KK3	526 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GABRA1-215	ENST00000636573	SGCZ	Q96LD1	299 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GABRA1-215	ENST00000636573	VPS25	Q9BRG1	176 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GABRA1-215	ENST00000636573	GNB4	Q9HAV0	340 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GABRA1-215	ENST00000636573	RBM7	Q9Y580	266 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
GABRA1-215	ENST00000636573	LY96	Q9Y6Y9	160 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GABRA1-215	ENST00000636573	ATG2B	Q96BY7	2078 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GABRA1-215	ENST00000636573	IGHV2-26	A0A0B4J1V2	119 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GABRA1-215	ENST00000636573	IGHV1-69-2	A0A0G2JMI3	117 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GABRA1-215	ENST00000636573		A0A1W2PS18	150 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GABRA1-215	ENST00000636573	CBY3	A6NI87	242 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GABRA1-215	ENST00000636573	ANKHD1-EIF4EBP3	H7C0V5	636 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
GABRA1-215	ENST00000636573	ZNF32	P17041	273 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GABRA1-215	ENST00000636573	TGFBR3	Q03167	851 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GABRA1-215	ENST00000636573	TFF3	Q07654	80 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GABRA1-215	ENST00000636573	TRIP6	Q15654	476 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
GABRA1-215	ENST00000636573	STUM	Q69YW2	141 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GABRA1-215	ENST00000636573	UNQ5815/PRO19632	Q6UWF5	114 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GABRA1-215	ENST00000636573	FGFRL1	Q8N441	504 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GABRA1-215	ENST00000636573	ZIC4	Q8N9L1	334 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GABRA1-215	ENST00000636573	OR5A2	Q8NGI9	324 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GABRA1-215	ENST00000636573	CPT1C	Q8TCG5	803 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GABRA1-215	ENST00000636573	SPSB4	Q96A44	273 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GABRA1-215	ENST00000636573	RPP25	Q9BUL9	199 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
GABRA1-215	ENST00000636573	DERL1	Q9BUN8	251 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GABRA1-215	ENST00000636573	SFXN3	Q9BWM7	321 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GABRA1-215	ENST00000636573	CTNNBIP1	Q9NSA3	81 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
GABRA1-215	ENST00000636573	TMEM38B	Q9NVV0	291 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GABRA1-215	ENST00000636573	IGHV3-15	A0A0B4J1V0	119 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GABRA1-215	ENST00000636573	PGPEP1L	A6NFU8	196 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GABRA1-215	ENST00000636573	PMS2P5	A8MQ11	134 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GABRA1-215	ENST00000636573	C10orf142	B7Z368	130 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GABRA1-215	ENST00000636573		F2Z2F3	143 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GABRA1-215	ENST00000636573	SIRPB1	O00241	398 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GABRA1-215	ENST00000636573	HSPB6	O14558	160 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GABRA1-215	ENST00000636573	SH2D1B	O14796	132 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GABRA1-215	ENST00000636573	S1PR2	O95136	353 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GABRA1-215	ENST00000636573	CXorf1	O96002	111 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GABRA1-215	ENST00000636573	C3orf79	P0CE67	100 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GABRA1-215	ENST00000636573	GABRG2	P18507	467 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GABRA1-215	ENST00000636573	PLA2G5	P39877	138 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GABRA1-215	ENST00000636573	THBS3	P49746	956 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GABRA1-215	ENST00000636573	PSG4	Q00888	419 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GABRA1-215	ENST00000636573	KRTCAP3	Q53RY4	240 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GABRA1-215	ENST00000636573	FBXO46	Q6PJ61	603 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
GABRA1-215	ENST00000636573	C7orf61	Q8IZ16	206 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GABRA1-215	ENST00000636573	DOCK8	Q8NF50	2099 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GABRA1-215	ENST00000636573	ZNF837	Q96EG3	531 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
GABRA1-215	ENST00000636573	ZPBP	Q9BS86	351 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GABRA1-215	ENST00000636573	SF3B5	Q9BWJ5	86 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
GABRA1-215	ENST00000636573	OR2H1	Q9GZK4	316 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GABRA1-215	ENST00000636573	MRPL27	Q9P0M9	148 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
GABRA1-215	ENST00000636573	KCNS2	Q9ULS6	477 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GABRA1-215	ENST00000636573	SHANK1	Q9Y566	2161 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GABRA1-215	ENST00000636573	CHD7	Q9P2D1	2997 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GABRA1-215	ENST00000636573	TRAV34	A0A0B4J273	112 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GABRA1-215	ENST00000636573		A0A1W2PR80	420 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GABRA1-215	ENST00000636573	IGLC7	A0M8Q6	106 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GABRA1-215	ENST00000636573	LRRC30	A6NM36	301 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GABRA1-215	ENST00000636573	ZNF324	O75467	553 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
GABRA1-215	ENST00000636573	PMCH	P20382	165 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GABRA1-215	ENST00000636573	SRD5A2	P31213	254 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GABRA1-215	ENST00000636573	RHOB	P62745	196 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GABRA1-215	ENST00000636573	VAMP3	Q15836	100 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GABRA1-215	ENST00000636573	CEACAM21	Q3KPI0	293 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GABRA1-215	ENST00000636573	WDR74	Q6RFH5	385 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63

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