RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000604516.1

HMGN3-AS1-201, HMGN3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HMGN3-AS1, Length 2,946 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MOGAT3Q86VF5 341 aa9.83□□□□□ -0.84
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa9.83□□□□□ -0.84
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP9.83□□□□□ -0.84
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LEAP2Q969E1 77 aa9.83□□□□□ -0.84
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 OR2V2Q96R30 315 aa9.83□□□□□ -0.84
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 C12orf57Q99622 126 aa9.83□□□□□ -0.84
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SMDT1Q9H4I9 107 aa9.83□□□□□ -0.84
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TUBA4BQ9H853 241 aa9.83□□□□□ -0.84
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 YLPM1P49750 1951 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 EDDM3BP56851 147 aa9.82□□□□□ -0.84
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RAB2AP61019 212 aa9.82□□□□□ -0.84
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CATR1Q13166 79 aa9.82□□□□□ -0.84
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa9.82□□□□□ -0.84
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa9.82□□□□□ -0.84
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GCSAMQ8N6F7 178 aa9.82□□□□□ -0.84
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GNG12Q9UBI6 72 aa9.82□□□□□ -0.84
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CUL9Q8IWT3 2517 aa9.82□□□□□ -0.84
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TACC2O95359 2948 aa9.82□□□□□ -0.84
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa9.82□□□□□ -0.84
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 IFNL4K9M1U5 179 aa9.82□□□□□ -0.84
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CEACAM4O75871 244 aa9.82□□□□□ -0.84
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 HBE1P02100 147 aa9.82□□□□□ -0.84
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 AGAP20933 346 aa9.82□□□□□ -0.84
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ZBTB34Q8NCN2 500 aa9.82□□□□□ -0.84
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa9.82□□□□□ -0.84
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 COA4Q9NYJ1 87 aa9.82□□□□□ -0.84
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa9.81□□□□□ -0.84
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP9.81□□□□□ -0.84
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP9.81□□□□□ -0.84
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP9.81□□□□□ -0.84
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP9.81□□□□□ -0.84
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SPINT2O43291 252 aa9.81□□□□□ -0.84
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PPIHO43447 177 aaKnown RBP9.81□□□□□ -0.84
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 S100A6P06703 90 aa9.81□□□□□ -0.84
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ZNF134P52741 427 aa9.81□□□□□ -0.84
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MSMO1Q15800 293 aa9.81□□□□□ -0.84
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RPL39P5Q59GN2 51 aa9.81□□□□□ -0.84
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP9.81□□□□□ -0.84
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP9.81□□□□□ -0.84
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ZNF561Q8N587 486 aa9.81□□□□□ -0.84
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP9.81□□□□□ -0.84
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 DTD1Q8TEA8 209 aa9.81□□□□□ -0.84
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LURAP1Q96LR2 239 aa9.81□□□□□ -0.84
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MARCH11A6NNE9 402 aa9.81□□□□□ -0.84
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SRRM5B3KS81 715 aa9.81□□□□□ -0.84
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FCGR3BO75015 233 aa9.81□□□□□ -0.84
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FAM27E3Q08E93 113 aa9.81□□□□□ -0.84
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RNF212Q495C1 297 aa9.81□□□□□ -0.84
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 KHDC3LQ587J8 217 aa9.81□□□□□ -0.84
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ACSM6Q6P461 480 aa9.81□□□□□ -0.84
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 DPPA3Q6W0C5 159 aa9.81□□□□□ -0.84
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP9.81□□□□□ -0.84
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa9.81□□□□□ -0.84
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa9.8□□□□□ -0.84
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CEBPZOSA8MTT3 80 aa9.8□□□□□ -0.84
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FAM90A26D6RGX4 464 aa9.8□□□□□ -0.84
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TFF3Q07654 80 aa9.8□□□□□ -0.84
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MUCL1Q96DR8 90 aa9.8□□□□□ -0.84
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa9.8□□□□□ -0.84
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 C5orf52A6NGY3 159 aa9.8□□□□□ -0.84
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CLDN14O95500 239 aa9.8□□□□□ -0.84
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CRYAAP02489 173 aa9.8□□□□□ -0.84
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 OR9G9P0C7N8 305 aa9.8□□□□□ -0.84
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 BCL2P10415 239 aa9.8□□□□□ -0.84
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FAM90A2PQ658T7 463 aa9.8□□□□□ -0.84
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa9.8□□□□□ -0.84
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 DEFB108BQ8NET1 73 aa9.8□□□□□ -0.84
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ITLN1Q8WWA0 313 aa9.8□□□□□ -0.84
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa9.8□□□□□ -0.84
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SLC25A22Q9H936 323 aa9.8□□□□□ -0.84
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PMS2P5A8MQ11 134 aa9.79□□□□□ -0.84
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NQO2P16083 231 aa9.79□□□□□ -0.84
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RPS10P46783 165 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GPR12P47775 334 aa9.79□□□□□ -0.84
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ERVFRD-1P60508 538 aa9.79□□□□□ -0.84
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SERF2P84101 59 aa9.79□□□□□ -0.84
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FABP9Q0Z7S8 132 aa9.79□□□□□ -0.84
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MORN2Q502X0 79 aa9.79□□□□□ -0.84
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TMEM41BQ5BJD5 291 aa9.79□□□□□ -0.84
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MBD3L1Q8WWY6 194 aa9.79□□□□□ -0.84
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TVP23CQ96ET8 276 aa9.79□□□□□ -0.84
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 YPEL4Q96NS1 127 aa9.79□□□□□ -0.84
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SLC31A2O15432 143 aa9.79□□□□□ -0.84
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 KLK10O43240 276 aa9.79□□□□□ -0.84
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CXCL1P09341 107 aa9.79□□□□□ -0.84
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 BMP5P22003 454 aa9.79□□□□□ -0.84
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 DUTP33316 252 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 Q8WTZ3 238 aa9.79□□□□□ -0.84
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LHX4Q969G2 390 aa9.79□□□□□ -0.84
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 R3HDM4Q96D70 268 aa9.79□□□□□ -0.84
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TOLLIPQ9H0E2 274 aa9.79□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 68.3 ms