RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000599236.5

FCHO1-228, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

TSL 5

Gene FCHO1, Length 586 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-228ENST00000599236 C5orf30Q96GV9 206 aa10.64□□□□□ -0.71
FCHO1-228ENST00000599236 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
FCHO1-228ENST00000599236 UQCC2Q9BRT2 126 aa10.64□□□□□ -0.71
FCHO1-228ENST00000599236 FAM53CQ9NYF3 392 aa10.64□□□□□ -0.71
FCHO1-228ENST00000599236 AK3Q9UIJ7 227 aa10.64□□□□□ -0.71
FCHO1-228ENST00000599236 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
FCHO1-228ENST00000599236 PKHD1P08F94 4074 aa10.63□□□□□ -0.71
FCHO1-228ENST00000599236 BMPR1BO00238 502 aa10.63□□□□□ -0.71
FCHO1-228ENST00000599236 PRH1P02810 166 aa10.63□□□□□ -0.71
FCHO1-228ENST00000599236 CD3GP09693 182 aa10.63□□□□□ -0.71
FCHO1-228ENST00000599236 RASSF2P50749 326 aa10.63□□□□□ -0.71
FCHO1-228ENST00000599236 MOGAT2Q3SYC2 334 aa10.63□□□□□ -0.71
FCHO1-228ENST00000599236 TMEM80Q96HE8 168 aa10.63□□□□□ -0.71
FCHO1-228ENST00000599236 C9orf16Q9BUW7 83 aa10.63□□□□□ -0.71
FCHO1-228ENST00000599236 TM2D1Q9BX74 207 aa10.63□□□□□ -0.71
FCHO1-228ENST00000599236 SRD5A3Q9H8P0 318 aa10.63□□□□□ -0.71
FCHO1-228ENST00000599236 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
FCHO1-228ENST00000599236 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
FCHO1-228ENST00000599236 MSGN1A6NI15 193 aa10.62□□□□□ -0.71
FCHO1-228ENST00000599236 SPDEFO95238 335 aa10.62□□□□□ -0.71
FCHO1-228ENST00000599236 LY6G6CO95867 125 aa10.62□□□□□ -0.71
FCHO1-228ENST00000599236 CELP19835 753 aa10.62□□□□□ -0.71
FCHO1-228ENST00000599236 TMEM50BP56557 158 aa10.62□□□□□ -0.71
FCHO1-228ENST00000599236 ZNF45Q02386 682 aa10.62□□□□□ -0.71
FCHO1-228ENST00000599236 RPEL1Q2QD12 228 aa10.62□□□□□ -0.71
FCHO1-228ENST00000599236 DEFB114Q30KQ6 69 aa10.62□□□□□ -0.71
FCHO1-228ENST00000599236 C1orf100Q5SVJ3 147 aa10.62□□□□□ -0.71
FCHO1-228ENST00000599236 LAIR2Q6ISS4 152 aa10.62□□□□□ -0.71
FCHO1-228ENST00000599236 PTX4Q96A99 478 aa10.62□□□□□ -0.71
FCHO1-228ENST00000599236 COA4Q9NYJ1 87 aa10.62□□□□□ -0.71
FCHO1-228ENST00000599236 DMRT1Q9Y5R6 373 aa10.62□□□□□ -0.71
FCHO1-228ENST00000599236 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa10.61□□□□□ -0.71
FCHO1-228ENST00000599236 TMEM14DPA8MWL7 114 aa10.61□□□□□ -0.71
FCHO1-228ENST00000599236 OR11H12B2RN74 326 aa10.61□□□□□ -0.71
FCHO1-228ENST00000599236 M0R1X1 148 aa10.61□□□□□ -0.71
FCHO1-228ENST00000599236 ATP5HO75947 161 aa10.61□□□□□ -0.71
FCHO1-228ENST00000599236 TPPPO94811 219 aa10.61□□□□□ -0.71
FCHO1-228ENST00000599236 MYL12AP19105 171 aa10.61□□□□□ -0.71
FCHO1-228ENST00000599236 HLA-DRB3P79483 266 aa10.61□□□□□ -0.71
FCHO1-228ENST00000599236 ST3GAL4Q11206 333 aa10.61□□□□□ -0.71
FCHO1-228ENST00000599236 PDPNQ86YL7 162 aa10.61□□□□□ -0.71
FCHO1-228ENST00000599236 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP10.61□□□□□ -0.71
FCHO1-228ENST00000599236 OVOL2Q9BRP0 275 aa10.61□□□□□ -0.71
FCHO1-228ENST00000599236 LPAR5Q9H1C0 372 aa10.61□□□□□ -0.71
FCHO1-228ENST00000599236 Q9N2K0 584 aa10.61□□□□□ -0.71
FCHO1-228ENST00000599236 AKIP1Q9NQ31 210 aa10.61□□□□□ -0.71
FCHO1-228ENST00000599236 SLC35D1Q9NTN3 355 aa10.61□□□□□ -0.71
FCHO1-228ENST00000599236 GHRLQ9UBU3 117 aa10.61□□□□□ -0.71
FCHO1-228ENST00000599236 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP10.6□□□□□ -0.71
FCHO1-228ENST00000599236 OR2A4O95047 310 aa10.6□□□□□ -0.71
FCHO1-228ENST00000599236 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
FCHO1-228ENST00000599236 CD37P11049 281 aa10.6□□□□□ -0.71
FCHO1-228ENST00000599236 AADACP22760 399 aa10.6□□□□□ -0.71
FCHO1-228ENST00000599236 ZBTB25P24278 435 aa10.6□□□□□ -0.71
FCHO1-228ENST00000599236 TATDN3Q17R31 274 aa10.6□□□□□ -0.71
FCHO1-228ENST00000599236 ZFP1Q6P2D0 407 aa10.6□□□□□ -0.71
FCHO1-228ENST00000599236 NKAIN3Q8N8D7 197 aa10.6□□□□□ -0.71
FCHO1-228ENST00000599236 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP10.6□□□□□ -0.71
FCHO1-228ENST00000599236 USMG5Q96IX5 58 aa10.6□□□□□ -0.71
FCHO1-228ENST00000599236 TMEM59Q9BXS4 323 aa10.6□□□□□ -0.71
FCHO1-228ENST00000599236 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa10.6□□□□□ -0.71
FCHO1-228ENST00000599236 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP10.6□□□□□ -0.71
FCHO1-228ENST00000599236 ACSM3Q53FZ2 586 aa10.59□□□□□ -0.71
FCHO1-228ENST00000599236 IDO2Q6ZQW0 420 aa10.59□□□□□ -0.71
FCHO1-228ENST00000599236 C19orf35Q6ZS72 473 aa10.59□□□□□ -0.71
FCHO1-228ENST00000599236 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
FCHO1-228ENST00000599236 OR2K2Q8NGT1 345 aa10.59□□□□□ -0.71
FCHO1-228ENST00000599236 EDARADDQ8WWZ3 215 aa10.59□□□□□ -0.71
FCHO1-228ENST00000599236 SNAPC3Q92966 411 aa10.59□□□□□ -0.71
FCHO1-228ENST00000599236 GFI1Q99684 422 aa10.59□□□□□ -0.71
FCHO1-228ENST00000599236 S100A14Q9HCY8 104 aa10.59□□□□□ -0.71
FCHO1-228ENST00000599236 SDHAF2Q9NX18 166 aa10.59□□□□□ -0.71
FCHO1-228ENST00000599236 RDH8Q9NYR8 311 aa10.59□□□□□ -0.71
FCHO1-228ENST00000599236 ZNF221Q9UK13 617 aa10.59□□□□□ -0.71
FCHO1-228ENST00000599236 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa10.58□□□□□ -0.72
FCHO1-228ENST00000599236 C2orf70A6NJV1 201 aa10.58□□□□□ -0.72
FCHO1-228ENST00000599236 PPP5D1E7EU14 171 aa10.58□□□□□ -0.72
FCHO1-228ENST00000599236 APOA2P02652 100 aa10.58□□□□□ -0.72
FCHO1-228ENST00000599236 CD1AP06126 327 aa10.58□□□□□ -0.72
FCHO1-228ENST00000599236 UBBP0CG47 229 aa10.58□□□□□ -0.72
FCHO1-228ENST00000599236 FOLR2P14207 255 aa10.58□□□□□ -0.72
FCHO1-228ENST00000599236 KIR2DS2P43631 304 aa10.58□□□□□ -0.72
FCHO1-228ENST00000599236 LGALS7P47929 136 aa10.58□□□□□ -0.72
FCHO1-228ENST00000599236 RHOGP84095 191 aa10.58□□□□□ -0.72
FCHO1-228ENST00000599236 PLA2G7Q13093 441 aa10.58□□□□□ -0.72
FCHO1-228ENST00000599236 PMS2P11Q13670 270 aa10.58□□□□□ -0.72
FCHO1-228ENST00000599236 GUCA2BQ16661 112 aa10.58□□□□□ -0.72
FCHO1-228ENST00000599236 FAM89BQ8N5H3 189 aa10.58□□□□□ -0.72
FCHO1-228ENST00000599236 KCNG3Q8TAE7 436 aa10.58□□□□□ -0.72
FCHO1-228ENST00000599236 CACNG8Q8WXS5 425 aa10.58□□□□□ -0.72
FCHO1-228ENST00000599236 HARBI1Q96MB7 349 aa10.58□□□□□ -0.72
FCHO1-228ENST00000599236 TMEM68Q96MH6 324 aa10.58□□□□□ -0.72
FCHO1-228ENST00000599236 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa10.58□□□□□ -0.72
FCHO1-228ENST00000599236 SLC2A8Q9NY64 477 aa10.58□□□□□ -0.72
FCHO1-228ENST00000599236 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP10.57□□□□□ -0.72
FCHO1-228ENST00000599236 IRGMA1A4Y4 181 aa10.57□□□□□ -0.72
FCHO1-228ENST00000599236 EFCAB10A6NFE3 127 aa10.57□□□□□ -0.72
FCHO1-228ENST00000599236 OR2C1O95371 312 aa10.57□□□□□ -0.72
FCHO1-228ENST00000599236 OR9G9P0C7N8 305 aa10.57□□□□□ -0.72
FCHO1-228ENST00000599236 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP10.57□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.6 ms