RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000596941.5

GTPBP3-215, Transcript of GTP binding protein 3, mitochondrial, human

TSL 2

Gene GTPBP3, Length 678 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GTPBP3-215	ENST00000596941	APOA2	P02652	100 aa		13.63	□□□□□ -0.23
GTPBP3-215	ENST00000596941	EGR2	P11161	476 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
GTPBP3-215	ENST00000596941	CHRNA7	P36544	502 aa		13.63	□□□□□ -0.23
GTPBP3-215	ENST00000596941	TALDO1	P37837	337 aa		13.63	□□□□□ -0.23
GTPBP3-215	ENST00000596941	FHL3	Q13643	280 aa		13.63	□□□□□ -0.23
GTPBP3-215	ENST00000596941	CDNF	Q49AH0	187 aa		13.63	□□□□□ -0.23
GTPBP3-215	ENST00000596941	ASPHD1	Q5U4P2	390 aa		13.63	□□□□□ -0.23
GTPBP3-215	ENST00000596941	ZNF660	Q6AZW8	331 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
GTPBP3-215	ENST00000596941		Q6ZS49	121 aa		13.63	□□□□□ -0.23
GTPBP3-215	ENST00000596941	PDPN	Q86YL7	162 aa		13.63	□□□□□ -0.23
GTPBP3-215	ENST00000596941	ZNF491	Q8N8L2	437 aa		13.63	□□□□□ -0.23
GTPBP3-215	ENST00000596941	MINDY2	Q8NBR6	621 aa		13.63	□□□□□ -0.23
GTPBP3-215	ENST00000596941	CASTOR1	Q8WTX7	329 aa		13.63	□□□□□ -0.23
GTPBP3-215	ENST00000596941	NUDCD2	Q8WVJ2	157 aa		13.63	□□□□□ -0.23
GTPBP3-215	ENST00000596941	CLCC1	Q96S66	551 aa		13.63	□□□□□ -0.23
GTPBP3-215	ENST00000596941	RNF5	Q99942	180 aa		13.63	□□□□□ -0.23
GTPBP3-215	ENST00000596941	FAM103A1	Q9BTL3	118 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
GTPBP3-215	ENST00000596941	CENPO	Q9BU64	300 aa		13.63	□□□□□ -0.23
GTPBP3-215	ENST00000596941	SLC35D1	Q9NTN3	355 aa		13.63	□□□□□ -0.23
GTPBP3-215	ENST00000596941	METTL1	Q9UBP6	276 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
GTPBP3-215	ENST00000596941	SLC25A17	O43808	307 aa		13.62	□□□□□ -0.23
GTPBP3-215	ENST00000596941	SPDEF	O95238	335 aa		13.62	□□□□□ -0.23
GTPBP3-215	ENST00000596941	CA2	P00918	260 aa		13.62	□□□□□ -0.23
GTPBP3-215	ENST00000596941	CD36	P16671	472 aa		13.62	□□□□□ -0.23
GTPBP3-215	ENST00000596941	DTYMK	P23919	212 aa		13.62	□□□□□ -0.23
GTPBP3-215	ENST00000596941	RPS16	P62249	146 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
GTPBP3-215	ENST00000596941	SRSF7	Q16629	238 aa	Known RBP eCLIP	13.62	□□□□□ -0.23
GTPBP3-215	ENST00000596941	H1FOO	Q8IZA3	346 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
GTPBP3-215	ENST00000596941	OR5H6	Q8NGV6	325 aa		13.62	□□□□□ -0.23
GTPBP3-215	ENST00000596941	ABHD5	Q8WTS1	349 aa		13.62	□□□□□ -0.23
GTPBP3-215	ENST00000596941	SLC25A38	Q96DW6	304 aa		13.62	□□□□□ -0.23
GTPBP3-215	ENST00000596941	UBE2E2	Q96LR5	201 aa		13.62	□□□□□ -0.23
GTPBP3-215	ENST00000596941	OR5B12	Q96R08	314 aa		13.62	□□□□□ -0.23
GTPBP3-215	ENST00000596941	GINS4	Q9BRT9	223 aa		13.62	□□□□□ -0.23
GTPBP3-215	ENST00000596941	MCRIP2	Q9BUT9	160 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
GTPBP3-215	ENST00000596941	GPR61	Q9BZJ8	451 aa		13.62	□□□□□ -0.23
GTPBP3-215	ENST00000596941	RHBDL2	Q9NX52	303 aa		13.62	□□□□□ -0.23
GTPBP3-215	ENST00000596941	LUM	P51884	338 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
GTPBP3-215	ENST00000596941	GNB1	P62873	340 aa		13.61	□□□□□ -0.23
GTPBP3-215	ENST00000596941	SSBP2	P81877	361 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
GTPBP3-215	ENST00000596941	ARL6IP1	Q15041	203 aa		13.61	□□□□□ -0.23
GTPBP3-215	ENST00000596941	ZNF260	Q3ZCT1	412 aa		13.61	□□□□□ -0.23
GTPBP3-215	ENST00000596941	HACD4	Q5VWC8	232 aa		13.61	□□□□□ -0.23
GTPBP3-215	ENST00000596941	DPF1	Q92782	380 aa		13.61	□□□□□ -0.23
GTPBP3-215	ENST00000596941	TSNAX	Q99598	290 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
GTPBP3-215	ENST00000596941	FOXA2	Q9Y261	457 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
GTPBP3-215	ENST00000596941	NUBP2	Q9Y5Y2	271 aa		13.61	□□□□□ -0.23
GTPBP3-215	ENST00000596941		I3L521	148 aa		13.6	□□□□□ -0.23
GTPBP3-215	ENST00000596941	SSX5	O60225	188 aa		13.6	□□□□□ -0.23
GTPBP3-215	ENST00000596941	IGLV2-23	P01705	113 aa		13.6	□□□□□ -0.23
GTPBP3-215	ENST00000596941	TGFBR1	P36897	503 aa		13.6	□□□□□ -0.23
GTPBP3-215	ENST00000596941	RAB9A	P51151	201 aa		13.6	□□□□□ -0.23
GTPBP3-215	ENST00000596941	TMEM65	Q6PI78	240 aa		13.6	□□□□□ -0.23
GTPBP3-215	ENST00000596941	PPP1R27	Q86WC6	154 aa		13.6	□□□□□ -0.23
GTPBP3-215	ENST00000596941	OR11H1	Q8NG94	326 aa		13.6	□□□□□ -0.23
GTPBP3-215	ENST00000596941	OR5M8	Q8NGP6	311 aa		13.6	□□□□□ -0.23
GTPBP3-215	ENST00000596941	FLYWCH2	Q96CP2	140 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
GTPBP3-215	ENST00000596941	VSIG4	Q9Y279	399 aa		13.6	□□□□□ -0.23
GTPBP3-215	ENST00000596941	ARPC1B	O15143	372 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
GTPBP3-215	ENST00000596941	RUNX1	Q01196	453 aa		13.59	□□□□□ -0.23
GTPBP3-215	ENST00000596941	UNQ5815/PRO19632	Q6UWF5	114 aa		13.59	□□□□□ -0.23
GTPBP3-215	ENST00000596941	BVES	Q8NE79	360 aa		13.59	□□□□□ -0.23
GTPBP3-215	ENST00000596941	LFNG	Q8NES3	379 aa		13.59	□□□□□ -0.23
GTPBP3-215	ENST00000596941	DDB2	Q92466	427 aa		13.59	□□□□□ -0.23
GTPBP3-215	ENST00000596941	ARPC1A	Q92747	370 aa		13.59	□□□□□ -0.23
GTPBP3-215	ENST00000596941	HARBI1	Q96MB7	349 aa		13.59	□□□□□ -0.23
GTPBP3-215	ENST00000596941	ST6GALNAC5	Q9BVH7	336 aa		13.59	□□□□□ -0.23
GTPBP3-215	ENST00000596941	ALX4	Q9H161	411 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
GTPBP3-215	ENST00000596941	RBM7	Q9Y580	266 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
GTPBP3-215	ENST00000596941	LINC00473	A8K010	186 aa		13.58	□□□□□ -0.24
GTPBP3-215	ENST00000596941		J3QRK9	145 aa		13.58	□□□□□ -0.24
GTPBP3-215	ENST00000596941	SCGN	O76038	276 aa		13.58	□□□□□ -0.24
GTPBP3-215	ENST00000596941	CRYGB	P07316	175 aa		13.58	□□□□□ -0.24
GTPBP3-215	ENST00000596941	NFYA	P23511	347 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
GTPBP3-215	ENST00000596941	GNG2	P59768	71 aa		13.58	□□□□□ -0.24
GTPBP3-215	ENST00000596941	PJVK	Q0ZLH3	352 aa		13.58	□□□□□ -0.24
GTPBP3-215	ENST00000596941	TMEM177	Q53S58	311 aa		13.58	□□□□□ -0.24
GTPBP3-215	ENST00000596941	IDNK	Q5T6J7	187 aa		13.58	□□□□□ -0.24
GTPBP3-215	ENST00000596941	ZNF562	Q6V9R5	426 aa		13.58	□□□□□ -0.24
GTPBP3-215	ENST00000596941	TCTEX1D1	Q8N7M0	179 aa		13.58	□□□□□ -0.24
GTPBP3-215	ENST00000596941	GRPEL2	Q8TAA5	225 aa		13.58	□□□□□ -0.24
GTPBP3-215	ENST00000596941	ETV7	Q9Y603	341 aa		13.58	□□□□□ -0.24
GTPBP3-215	ENST00000596941	DUT	P33316	252 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
GTPBP3-215	ENST00000596941	SCAND1	P57086	179 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GTPBP3-215	ENST00000596941	ZNF616	Q08AN1	781 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GTPBP3-215	ENST00000596941	ACTBL2	Q562R1	376 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GTPBP3-215	ENST00000596941	DCSTAMP	Q9H295	470 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GTPBP3-215	ENST00000596941	IGKV1D-13	A0A0B4J2D9	117 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GTPBP3-215	ENST00000596941	SRRM4	A7MD48	611 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
GTPBP3-215	ENST00000596941	SEC14L6	B5MCN3	397 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GTPBP3-215	ENST00000596941	IGKV1-13	P0DP09	117 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GTPBP3-215	ENST00000596941	PITPNA	Q00169	270 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GTPBP3-215	ENST00000596941	TMEM267	Q0VDI3	215 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
GTPBP3-215	ENST00000596941	FXYD3	Q14802	87 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GTPBP3-215	ENST00000596941	RTL8B	Q17RB0	113 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GTPBP3-215	ENST00000596941	MRGPRG-AS1	Q2M3A8	158 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GTPBP3-215	ENST00000596941	AKIRIN2	Q53H80	203 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GTPBP3-215	ENST00000596941	C9orf66	Q5T8R8	295 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GTPBP3-215	ENST00000596941	OR1N2	Q8NGR9	330 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GTPBP3-215	ENST00000596941	YIPF6	Q96EC8	236 aa		13.56	□□□□□ -0.24

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