RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591376.5

CIRBP-232, Transcript of cold inducible RNA binding protein, humanhuman

TSL 3

Gene CIRBP, Length 830 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIRBP-232ENST00000591376 M0R1X1 148 aa14.13□□□□□ -0.15
CIRBP-232ENST00000591376 SLC25A17O43808 307 aa14.13□□□□□ -0.15
CIRBP-232ENST00000591376 TRGV3P03979 118 aa14.13□□□□□ -0.15
CIRBP-232ENST00000591376 FABP5Q01469 135 aa14.13□□□□□ -0.15
CIRBP-232ENST00000591376 FXYD3Q14802 87 aa14.13□□□□□ -0.15
CIRBP-232ENST00000591376 PLAC9Q5JTB6 97 aa14.13□□□□□ -0.15
CIRBP-232ENST00000591376 OVCH2Q7RTZ1 564 aa14.13□□□□□ -0.15
CIRBP-232ENST00000591376 SBSPONQ8IVN8 264 aa14.13□□□□□ -0.15
CIRBP-232ENST00000591376 RHOVQ96L33 236 aa14.13□□□□□ -0.15
CIRBP-232ENST00000591376 OR4C12Q96R67 309 aa14.13□□□□□ -0.15
CIRBP-232ENST00000591376 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa14.13□□□□□ -0.15
CIRBP-232ENST00000591376 SLC35D1Q9NTN3 355 aa14.13□□□□□ -0.15
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CIRBP-232ENST00000591376 C3orf84H3BNL1 204 aa14.12□□□□□ -0.15
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CIRBP-232ENST00000591376 SERPINB10P48595 397 aa14.12□□□□□ -0.15
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CIRBP-232ENST00000591376 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP14.12□□□□□ -0.15
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CIRBP-232ENST00000591376 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa14.1□□□□□ -0.15
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CIRBP-232ENST00000591376 H3BUA1 57 aa14.1□□□□□ -0.15
CIRBP-232ENST00000591376 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa14.1□□□□□ -0.15
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CIRBP-232ENST00000591376 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP14.1□□□□□ -0.15
CIRBP-232ENST00000591376 IGSF11Q5DX21 431 aa14.1□□□□□ -0.15
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CIRBP-232ENST00000591376 OR10J5Q8NHC4 309 aa14.1□□□□□ -0.15
CIRBP-232ENST00000591376 RAB3CQ96E17 227 aa14.1□□□□□ -0.15
CIRBP-232ENST00000591376 RSRP1Q9BUV0 290 aa14.1□□□□□ -0.15
CIRBP-232ENST00000591376 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP14.1□□□□□ -0.15
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CIRBP-232ENST00000591376 IGLV2-23P01705 113 aa14.09□□□□□ -0.15
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CIRBP-232ENST00000591376 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP14.08□□□□□ -0.16
CIRBP-232ENST00000591376 PJVKQ0ZLH3 352 aa14.08□□□□□ -0.16
CIRBP-232ENST00000591376 HAPLN4Q86UW8 402 aa14.08□□□□□ -0.16
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CIRBP-232ENST00000591376 IGLV1-51P01701 117 aa14.06□□□□□ -0.16
CIRBP-232ENST00000591376 OR10A3P58181 314 aa14.06□□□□□ -0.16
CIRBP-232ENST00000591376 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP14.06□□□□□ -0.16
CIRBP-232ENST00000591376 RTL8BQ17RB0 113 aa14.06□□□□□ -0.16
CIRBP-232ENST00000591376 TMEM177Q53S58 311 aa14.06□□□□□ -0.16
CIRBP-232ENST00000591376 ZNF367Q7RTV3 350 aa14.06□□□□□ -0.16
CIRBP-232ENST00000591376 GINS4Q9BRT9 223 aa14.06□□□□□ -0.16
CIRBP-232ENST00000591376 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP14.06□□□□□ -0.16
CIRBP-232ENST00000591376 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa14.05□□□□□ -0.16
CIRBP-232ENST00000591376 MFNGO00587 321 aa14.05□□□□□ -0.16
CIRBP-232ENST00000591376 RRASP10301 218 aa14.05□□□□□ -0.16
CIRBP-232ENST00000591376 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP14.05□□□□□ -0.16
CIRBP-232ENST00000591376 MYL9P24844 172 aa14.05□□□□□ -0.16
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