RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590422.1

CTIF-208, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 3

Gene CTIF, Length 412 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-208ENST00000590422 TPSG1Q9NRR2 321 aa9.35□□□□□ -0.91
CTIF-208ENST00000590422 GHRLQ9UBU3 117 aa9.35□□□□□ -0.91
CTIF-208ENST00000590422 GAB2Q9UQC2 676 aa9.35□□□□□ -0.91
CTIF-208ENST00000590422 A3GALT2U3KPV4 340 aa9.35□□□□□ -0.91
CTIF-208ENST00000590422 STARD9Q9P2P6 4700 aa9.34□□□□□ -0.91
CTIF-208ENST00000590422 TMEM14DPA8MWL7 114 aa9.34□□□□□ -0.91
CTIF-208ENST00000590422 FCN1O00602 326 aa9.34□□□□□ -0.91
CTIF-208ENST00000590422 LDLRAD4O15165 306 aa9.34□□□□□ -0.91
CTIF-208ENST00000590422 SAP30O75446 220 aa9.34□□□□□ -0.91
CTIF-208ENST00000590422 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa9.34□□□□□ -0.91
CTIF-208ENST00000590422 ARSBP15848 533 aa9.34□□□□□ -0.91
CTIF-208ENST00000590422 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP9.34□□□□□ -0.91
CTIF-208ENST00000590422 CX3CL1P78423 397 aa9.34□□□□□ -0.91
CTIF-208ENST00000590422 CNPY1Q3B7I2 92 aa9.34□□□□□ -0.91
CTIF-208ENST00000590422 C2orf76Q3KRA6 126 aa9.34□□□□□ -0.91
CTIF-208ENST00000590422 CASC10Q5T4H9 136 aa9.34□□□□□ -0.91
CTIF-208ENST00000590422 ZNF880Q6PDB4 577 aa9.34□□□□□ -0.91
CTIF-208ENST00000590422 HAPLN4Q86UW8 402 aa9.34□□□□□ -0.91
CTIF-208ENST00000590422 ZNF429Q86V71 674 aa9.34□□□□□ -0.91
CTIF-208ENST00000590422 OR2AK2Q8NG84 335 aa9.34□□□□□ -0.91
CTIF-208ENST00000590422 MUC7Q8TAX7 377 aa9.34□□□□□ -0.91
CTIF-208ENST00000590422 NICN1Q9BSH3 213 aa9.34□□□□□ -0.91
CTIF-208ENST00000590422 FAAP24Q9BTP7 215 aa9.34□□□□□ -0.91
CTIF-208ENST00000590422 TM2D1Q9BX74 207 aa9.34□□□□□ -0.91
CTIF-208ENST00000590422 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP9.34□□□□□ -0.91
CTIF-208ENST00000590422 ABRACLQ9P1F3 81 aa9.34□□□□□ -0.91
CTIF-208ENST00000590422 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
CTIF-208ENST00000590422 A0A0A6YYD4 124 aa9.33□□□□□ -0.92
CTIF-208ENST00000590422 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP9.33□□□□□ -0.92
CTIF-208ENST00000590422 H0YJW9 148 aa9.33□□□□□ -0.92
CTIF-208ENST00000590422 RRHO14718 337 aa9.33□□□□□ -0.92
CTIF-208ENST00000590422 RGS11O94810 467 aa9.33□□□□□ -0.92
CTIF-208ENST00000590422 NAPSAO96009 420 aa9.33□□□□□ -0.92
CTIF-208ENST00000590422 IGHV3-11P01762 117 aa9.33□□□□□ -0.92
CTIF-208ENST00000590422 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
CTIF-208ENST00000590422 CT45A6P0DMU7 189 aa9.33□□□□□ -0.92
CTIF-208ENST00000590422 CT45A5P0DMU8 189 aa9.33□□□□□ -0.92
CTIF-208ENST00000590422 CT45A7P0DMV0 189 aa9.33□□□□□ -0.92
CTIF-208ENST00000590422 SCAND1P57086 179 aa9.33□□□□□ -0.92
CTIF-208ENST00000590422 FAM71F2Q6NXP2 309 aa9.33□□□□□ -0.92
CTIF-208ENST00000590422 OR5H6Q8NGV6 325 aa9.33□□□□□ -0.92
CTIF-208ENST00000590422 KCNG3Q8TAE7 436 aa9.33□□□□□ -0.92
CTIF-208ENST00000590422 LGALS14Q8TCE9 139 aa9.33□□□□□ -0.92
CTIF-208ENST00000590422 ACOT12Q8WYK0 555 aa9.33□□□□□ -0.92
CTIF-208ENST00000590422 AP3S1Q92572 193 aa9.33□□□□□ -0.92
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CTIF-208ENST00000590422 NEDD4LQ96PU5 975 aa9.33□□□□□ -0.92
CTIF-208ENST00000590422 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP9.33□□□□□ -0.92
CTIF-208ENST00000590422 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
CTIF-208ENST00000590422 TMEM59Q9BXS4 323 aa9.33□□□□□ -0.92
CTIF-208ENST00000590422 CST11Q9H112 138 aa9.33□□□□□ -0.92
CTIF-208ENST00000590422 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
CTIF-208ENST00000590422 KIAA1456Q9P272 454 aa9.33□□□□□ -0.92
CTIF-208ENST00000590422 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP9.33□□□□□ -0.92
CTIF-208ENST00000590422 A0A075B6Q4 140 aa9.32□□□□□ -0.92
CTIF-208ENST00000590422 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa9.32□□□□□ -0.92
CTIF-208ENST00000590422 LINC01619G3V211 115 aa9.32□□□□□ -0.92
CTIF-208ENST00000590422 GP9P14770 177 aa9.32□□□□□ -0.92
CTIF-208ENST00000590422 PLA2G7Q13093 441 aa9.32□□□□□ -0.92
CTIF-208ENST00000590422 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP9.32□□□□□ -0.92
CTIF-208ENST00000590422 ACSM6Q6P461 480 aa9.32□□□□□ -0.92
CTIF-208ENST00000590422 ABHD5Q8WTS1 349 aa9.32□□□□□ -0.92
CTIF-208ENST00000590422 PTX4Q96A99 478 aa9.32□□□□□ -0.92
CTIF-208ENST00000590422 AGMATQ9BSE5 352 aa9.32□□□□□ -0.92
CTIF-208ENST00000590422 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
CTIF-208ENST00000590422 OR1A1Q9P1Q5 309 aa9.32□□□□□ -0.92
CTIF-208ENST00000590422 SLC23A1Q9UHI7 598 aa9.32□□□□□ -0.92
CTIF-208ENST00000590422 SPATA2Q9UM82 520 aa9.32□□□□□ -0.92
CTIF-208ENST00000590422 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa9.32□□□□□ -0.92
CTIF-208ENST00000590422 ETV7Q9Y603 341 aa9.32□□□□□ -0.92
CTIF-208ENST00000590422 TNCP24821 2201 aa9.31□□□□□ -0.92
CTIF-208ENST00000590422 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa9.31□□□□□ -0.92
CTIF-208ENST00000590422 OR5H14A6NHG9 310 aa9.31□□□□□ -0.92
CTIF-208ENST00000590422 RAB29O14966 203 aa9.31□□□□□ -0.92
CTIF-208ENST00000590422 PROP1O75360 226 aa9.31□□□□□ -0.92
CTIF-208ENST00000590422 RAB6AP20340 208 aa9.31□□□□□ -0.92
CTIF-208ENST00000590422 LINC00205P59089 165 aa9.31□□□□□ -0.92
CTIF-208ENST00000590422 PLGLAQ15195 96 aa9.31□□□□□ -0.92
CTIF-208ENST00000590422 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
CTIF-208ENST00000590422 OR5AN1Q8NGI8 311 aa9.31□□□□□ -0.92
CTIF-208ENST00000590422 MCFD2Q8NI22 146 aa9.31□□□□□ -0.92
CTIF-208ENST00000590422 SETD6Q8TBK2 473 aa9.31□□□□□ -0.92
CTIF-208ENST00000590422 MS4A10Q96PG2 267 aa9.31□□□□□ -0.92
CTIF-208ENST00000590422 CLCC1Q96S66 551 aa9.31□□□□□ -0.92
CTIF-208ENST00000590422 LPAR5Q9H1C0 372 aa9.31□□□□□ -0.92
CTIF-208ENST00000590422 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
CTIF-208ENST00000590422 PIPOXQ9P0Z9 390 aa9.31□□□□□ -0.92
CTIF-208ENST00000590422 COMMD3Q9UBI1 195 aa9.31□□□□□ -0.92
CTIF-208ENST00000590422 RAB22AQ9UL26 194 aa9.31□□□□□ -0.92
CTIF-208ENST00000590422 WASHC3Q9Y3C0 194 aa9.31□□□□□ -0.92
CTIF-208ENST00000590422 CTDSP2O14595 271 aa9.3□□□□□ -0.92
CTIF-208ENST00000590422 CA2P00918 260 aa9.3□□□□□ -0.92
CTIF-208ENST00000590422 IGKV1-16P04430 117 aa9.3□□□□□ -0.92
CTIF-208ENST00000590422 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP9.3□□□□□ -0.92
CTIF-208ENST00000590422 ACTBL2Q562R1 376 aa9.3□□□□□ -0.92
CTIF-208ENST00000590422 MZT2AQ6P582 158 aa9.3□□□□□ -0.92
CTIF-208ENST00000590422 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa9.3□□□□□ -0.92
CTIF-208ENST00000590422 PPP1R27Q86WC6 154 aa9.3□□□□□ -0.92
CTIF-208ENST00000590422 FAM89BQ8N5H3 189 aa9.3□□□□□ -0.92
CTIF-208ENST00000590422 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa9.3□□□□□ -0.92
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