RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589162.1

CAPNS1-208, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 701 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-208ENST00000589162 CT45A7P0DMV0 189 aa4.86□□□□□ -1.63
CAPNS1-208ENST00000589162 CNTFRP26992 372 aa4.86□□□□□ -1.63
CAPNS1-208ENST00000589162 CD34P28906 385 aa4.86□□□□□ -1.63
CAPNS1-208ENST00000589162 BRWD1-AS2P59051 145 aa4.86□□□□□ -1.63
CAPNS1-208ENST00000589162 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
CAPNS1-208ENST00000589162 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
CAPNS1-208ENST00000589162 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
CAPNS1-208ENST00000589162 OXA1LQ15070 435 aa4.86□□□□□ -1.63
CAPNS1-208ENST00000589162 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
CAPNS1-208ENST00000589162 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa4.86□□□□□ -1.63
CAPNS1-208ENST00000589162 ABCA11PQ4W5N1 156 aa4.86□□□□□ -1.63
CAPNS1-208ENST00000589162 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa4.86□□□□□ -1.63
CAPNS1-208ENST00000589162 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa4.86□□□□□ -1.63
CAPNS1-208ENST00000589162 PLET1Q6UQ28 207 aa4.86□□□□□ -1.63
CAPNS1-208ENST00000589162 MOB3BQ86TA1 216 aa4.86□□□□□ -1.63
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF645Q8N7E2 425 aa4.86□□□□□ -1.63
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF383Q8NA42 475 aa4.86□□□□□ -1.63
CAPNS1-208ENST00000589162 BVESQ8NE79 360 aa4.86□□□□□ -1.63
CAPNS1-208ENST00000589162 OR11H6Q8NGC7 330 aa4.86□□□□□ -1.63
CAPNS1-208ENST00000589162 OR10A7Q8NGE5 316 aa4.86□□□□□ -1.63
CAPNS1-208ENST00000589162 OR13D1Q8NGV5 346 aa4.86□□□□□ -1.63
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF596Q8TC21 504 aa4.86□□□□□ -1.63
CAPNS1-208ENST00000589162 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa4.86□□□□□ -1.63
CAPNS1-208ENST00000589162 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP4.86□□□□□ -1.63
CAPNS1-208ENST00000589162 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa4.86□□□□□ -1.63
CAPNS1-208ENST00000589162 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
CAPNS1-208ENST00000589162 TP53RKQ96S44 253 aa4.86□□□□□ -1.63
CAPNS1-208ENST00000589162 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa4.86□□□□□ -1.63
CAPNS1-208ENST00000589162 SLC2A9Q9NRM0 540 aa4.86□□□□□ -1.63
CAPNS1-208ENST00000589162 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
CAPNS1-208ENST00000589162 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa4.86□□□□□ -1.63
CAPNS1-208ENST00000589162 ABCA12Q86UK0 2595 aa4.86□□□□□ -1.63
CAPNS1-208ENST00000589162 APCP25054 2843 aa4.85□□□□□ -1.63
CAPNS1-208ENST00000589162 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
CAPNS1-208ENST00000589162 A0A1W2PPI3 338 aa4.85□□□□□ -1.63
CAPNS1-208ENST00000589162 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
CAPNS1-208ENST00000589162 CCSO14618 274 aa4.85□□□□□ -1.63
CAPNS1-208ENST00000589162 TIMM23O14925 209 aa4.85□□□□□ -1.63
CAPNS1-208ENST00000589162 NXPH3O95157 252 aa4.85□□□□□ -1.63
CAPNS1-208ENST00000589162 PTTG1O95997 202 aa4.85□□□□□ -1.63
CAPNS1-208ENST00000589162 FSHBP01225 129 aa4.85□□□□□ -1.63
CAPNS1-208ENST00000589162 RBP4P02753 201 aa4.85□□□□□ -1.63
CAPNS1-208ENST00000589162 MYOD1P15172 320 aa4.85□□□□□ -1.63
CAPNS1-208ENST00000589162 HTR1DP28221 377 aa4.85□□□□□ -1.63
CAPNS1-208ENST00000589162 DUTP33316 252 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
CAPNS1-208ENST00000589162 LPAR6P43657 344 aa4.85□□□□□ -1.63
CAPNS1-208ENST00000589162 UBE2E1P51965 193 aa4.85□□□□□ -1.63
CAPNS1-208ENST00000589162 PRRX1P54821 245 aa4.85□□□□□ -1.63
CAPNS1-208ENST00000589162 UCP3P55916 312 aa4.85□□□□□ -1.63
CAPNS1-208ENST00000589162 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
CAPNS1-208ENST00000589162 CBX3Q13185 183 aa4.85□□□□□ -1.63
CAPNS1-208ENST00000589162 HNF4GQ14541 408 aa4.85□□□□□ -1.63
CAPNS1-208ENST00000589162 LY6EQ16553 131 aa4.85□□□□□ -1.63
CAPNS1-208ENST00000589162 C2orf68Q2NKX9 166 aa4.85□□□□□ -1.63
CAPNS1-208ENST00000589162 DEFB112Q30KQ8 113 aa4.85□□□□□ -1.63
CAPNS1-208ENST00000589162 ANKRD55Q3KP44 614 aa4.85□□□□□ -1.63
CAPNS1-208ENST00000589162 C4orf46Q504U0 113 aa4.85□□□□□ -1.63
CAPNS1-208ENST00000589162 GPR157Q5UAW9 335 aa4.85□□□□□ -1.63
CAPNS1-208ENST00000589162 CLEC9AQ6UXN8 241 aa4.85□□□□□ -1.63
CAPNS1-208ENST00000589162 SPNS3Q6ZMD2 512 aa4.85□□□□□ -1.63
CAPNS1-208ENST00000589162 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa4.85□□□□□ -1.63
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa4.85□□□□□ -1.63
CAPNS1-208ENST00000589162 KCTD9Q7L273 389 aa4.85□□□□□ -1.63
CAPNS1-208ENST00000589162 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa4.85□□□□□ -1.63
CAPNS1-208ENST00000589162 SLC38A6Q8IZM9 456 aa4.85□□□□□ -1.63
CAPNS1-208ENST00000589162 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa4.85□□□□□ -1.63
CAPNS1-208ENST00000589162 LINC00311Q8N616 119 aa4.85□□□□□ -1.63
CAPNS1-208ENST00000589162 ZDHHC22Q8N966 263 aa4.85□□□□□ -1.63
CAPNS1-208ENST00000589162 UXS1Q8NBZ7 420 aa4.85□□□□□ -1.63
CAPNS1-208ENST00000589162 BEND2Q8NDZ0 799 aa4.85□□□□□ -1.63
CAPNS1-208ENST00000589162 DUSP18Q8NEJ0 188 aa4.85□□□□□ -1.63
CAPNS1-208ENST00000589162 LHFPL5Q8TAF8 219 aa4.85□□□□□ -1.63
CAPNS1-208ENST00000589162 ZFAND1Q8TCF1 268 aa4.85□□□□□ -1.63
CAPNS1-208ENST00000589162 CHPT1Q8WUD6 406 aa4.85□□□□□ -1.63
CAPNS1-208ENST00000589162 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
CAPNS1-208ENST00000589162 DUX5Q96PT3 197 aa4.85□□□□□ -1.63
CAPNS1-208ENST00000589162 NABP2Q9BQ15 211 aa4.85□□□□□ -1.63
CAPNS1-208ENST00000589162 RAB9BQ9NP90 201 aa4.85□□□□□ -1.63
CAPNS1-208ENST00000589162 COPZ2Q9P299 210 aa4.85□□□□□ -1.63
CAPNS1-208ENST00000589162 DPM3Q9P2X0 92 aa4.85□□□□□ -1.63
CAPNS1-208ENST00000589162 ALG5Q9Y673 324 aa4.85□□□□□ -1.63
CAPNS1-208ENST00000589162 A0A0A6YYJ9 748 aa4.84□□□□□ -1.63
CAPNS1-208ENST00000589162 TRAV3A0A0B4J244 114 aa4.84□□□□□ -1.63
CAPNS1-208ENST00000589162 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa4.84□□□□□ -1.63
CAPNS1-208ENST00000589162 A0A0G2JRQ6 117 aa4.84□□□□□ -1.63
CAPNS1-208ENST00000589162 C9orf170A2RU37 121 aa4.84□□□□□ -1.63
CAPNS1-208ENST00000589162 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa4.84□□□□□ -1.63
CAPNS1-208ENST00000589162 LEUTXA8MZ59 168 aa4.84□□□□□ -1.63
CAPNS1-208ENST00000589162 INAFM1C9JVW0 142 aa4.84□□□□□ -1.63
CAPNS1-208ENST00000589162 H0YJW9 148 aa4.84□□□□□ -1.63
CAPNS1-208ENST00000589162 J3QLI3 93 aa4.84□□□□□ -1.63
CAPNS1-208ENST00000589162 ITGB1BP1O14713 200 aa4.84□□□□□ -1.63
CAPNS1-208ENST00000589162 RAB29O14966 203 aa4.84□□□□□ -1.63
CAPNS1-208ENST00000589162 MPPED1O15442 326 aa4.84□□□□□ -1.63
CAPNS1-208ENST00000589162 FCGR3BO75015 233 aa4.84□□□□□ -1.63
CAPNS1-208ENST00000589162 ADAP1O75689 374 aa4.84□□□□□ -1.63
CAPNS1-208ENST00000589162 S1PR2O95136 353 aa4.84□□□□□ -1.63
CAPNS1-208ENST00000589162 SIX6O95475 246 aa4.84□□□□□ -1.63
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