RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586851.5

CAPNS1-202, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 616 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-202ENST00000586851 STAG3L2P0CL84 134 aa6.5□□□□□ -1.37
CAPNS1-202ENST00000586851 STAG3L3P0CL85 134 aa6.5□□□□□ -1.37
CAPNS1-202ENST00000586851 RD3LP0DJH9 198 aa6.5□□□□□ -1.37
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
CAPNS1-202ENST00000586851 GZMHP20718 246 aa6.5□□□□□ -1.37
CAPNS1-202ENST00000586851 CCNOP22674 350 aa6.5□□□□□ -1.37
CAPNS1-202ENST00000586851 NTF4P34130 210 aa6.5□□□□□ -1.37
CAPNS1-202ENST00000586851 CLDN18P56856 261 aa6.5□□□□□ -1.37
CAPNS1-202ENST00000586851 ERVS71-1P61550 626 aa6.5□□□□□ -1.37
CAPNS1-202ENST00000586851 RELQ04864 619 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
CAPNS1-202ENST00000586851 HLA-BQ31612 363 aa6.5□□□□□ -1.37
CAPNS1-202ENST00000586851 SMIM21Q3B7S5 101 aa6.5□□□□□ -1.37
CAPNS1-202ENST00000586851 OR10J3Q5JRS4 329 aa6.5□□□□□ -1.37
CAPNS1-202ENST00000586851 DMRTA1Q5VZB9 504 aa6.5□□□□□ -1.37
CAPNS1-202ENST00000586851 FBXW9Q5XUX1 488 aa6.5□□□□□ -1.37
CAPNS1-202ENST00000586851 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
CAPNS1-202ENST00000586851 SLC23A3Q6PIS1 610 aa6.5□□□□□ -1.37
CAPNS1-202ENST00000586851 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
CAPNS1-202ENST00000586851 UBALD2Q8IYN6 164 aa6.5□□□□□ -1.37
CAPNS1-202ENST00000586851 PNKDQ8N490 385 aa6.5□□□□□ -1.37
CAPNS1-202ENST00000586851 KLHDC1Q8N7A1 406 aa6.5□□□□□ -1.37
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
CAPNS1-202ENST00000586851 NAXEQ8NCW5 288 aa6.5□□□□□ -1.37
CAPNS1-202ENST00000586851 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
CAPNS1-202ENST00000586851 OR2M7Q8NG81 312 aa6.5□□□□□ -1.37
CAPNS1-202ENST00000586851 OR10G8Q8NGN5 311 aa6.5□□□□□ -1.37
CAPNS1-202ENST00000586851 OR1K1Q8NGR3 316 aa6.5□□□□□ -1.37
CAPNS1-202ENST00000586851 FGFBP3Q8TAT2 258 aa6.5□□□□□ -1.37
CAPNS1-202ENST00000586851 HLA-CQ95604 372 aa6.5□□□□□ -1.37
CAPNS1-202ENST00000586851 MISP3Q96FF7 219 aa6.5□□□□□ -1.37
CAPNS1-202ENST00000586851 ADTRPQ96IZ2 230 aa6.5□□□□□ -1.37
CAPNS1-202ENST00000586851 TMEM68Q96MH6 324 aa6.5□□□□□ -1.37
CAPNS1-202ENST00000586851 RNF2Q99496 336 aa6.5□□□□□ -1.37
CAPNS1-202ENST00000586851 MIEN1Q9BRT3 115 aa6.5□□□□□ -1.37
CAPNS1-202ENST00000586851 GNB1LQ9BYB4 327 aa6.5□□□□□ -1.37
CAPNS1-202ENST00000586851 PRO1933Q9H354 126 aa6.5□□□□□ -1.37
CAPNS1-202ENST00000586851 VSIRQ9H7M9 311 aa6.5□□□□□ -1.37
CAPNS1-202ENST00000586851 OBP2BQ9NPH6 170 aa6.5□□□□□ -1.37
CAPNS1-202ENST00000586851 TMEM106BQ9NUM4 274 aa6.5□□□□□ -1.37
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF586Q9NXT0 402 aa6.5□□□□□ -1.37
CAPNS1-202ENST00000586851 IL36BQ9NZH7 164 aa6.5□□□□□ -1.37
CAPNS1-202ENST00000586851 OR1A1Q9P1Q5 309 aa6.5□□□□□ -1.37
CAPNS1-202ENST00000586851 JPT1Q9UK76 154 aa6.5□□□□□ -1.37
CAPNS1-202ENST00000586851 CACNA1EQ15878 2313 aa6.49□□□□□ -1.37
CAPNS1-202ENST00000586851 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa6.49□□□□□ -1.37
CAPNS1-202ENST00000586851 KLRC4-KLRK1H3BQV0 150 aa6.49□□□□□ -1.37
CAPNS1-202ENST00000586851 HAND1O96004 215 aa6.49□□□□□ -1.37
CAPNS1-202ENST00000586851 OR5G3P0C626 314 aa6.49□□□□□ -1.37
CAPNS1-202ENST00000586851 PATE4P0C8F1 98 aa6.49□□□□□ -1.37
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF883P0CG24 379 aa6.49□□□□□ -1.37
CAPNS1-202ENST00000586851 TIMP3P35625 211 aa6.49□□□□□ -1.37
CAPNS1-202ENST00000586851 THBS3P49746 956 aa6.49□□□□□ -1.37
CAPNS1-202ENST00000586851 RAB7AP51149 207 aa6.49□□□□□ -1.37
CAPNS1-202ENST00000586851 PDCD1Q15116 288 aa6.49□□□□□ -1.37
CAPNS1-202ENST00000586851 FAM78BQ5VT40 261 aa6.49□□□□□ -1.37
CAPNS1-202ENST00000586851 TEX43Q6ZNM6 134 aa6.49□□□□□ -1.37
CAPNS1-202ENST00000586851 C20orf204Q6ZNR8 217 aa6.49□□□□□ -1.37
CAPNS1-202ENST00000586851 GCNT2Q8N0V5 402 aa6.49□□□□□ -1.37
CAPNS1-202ENST00000586851 TMEM37Q8WXS4 190 aa6.49□□□□□ -1.37
CAPNS1-202ENST00000586851 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
CAPNS1-202ENST00000586851 CYYR1Q96J86 154 aa6.49□□□□□ -1.37
CAPNS1-202ENST00000586851 SLC35E1Q96K37 410 aa6.49□□□□□ -1.37
CAPNS1-202ENST00000586851 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
CAPNS1-202ENST00000586851 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
CAPNS1-202ENST00000586851 OR2D2Q9H210 308 aa6.49□□□□□ -1.37
CAPNS1-202ENST00000586851 CXXC4Q9H2H0 198 aa6.49□□□□□ -1.37
CAPNS1-202ENST00000586851 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa6.49□□□□□ -1.37
CAPNS1-202ENST00000586851 NPVFQ9HCQ7 196 aa6.49□□□□□ -1.37
CAPNS1-202ENST00000586851 ELOVL5Q9NYP7 299 aa6.49□□□□□ -1.37
CAPNS1-202ENST00000586851 SLC45A2Q9UMX9 530 aa6.49□□□□□ -1.37
CAPNS1-202ENST00000586851 ABCA7Q8IZY2 2146 aa6.49□□□□□ -1.37
CAPNS1-202ENST00000586851 MARCH11A6NNE9 402 aa6.48□□□□□ -1.37
CAPNS1-202ENST00000586851 HSPB6O14558 160 aa6.48□□□□□ -1.37
CAPNS1-202ENST00000586851 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
CAPNS1-202ENST00000586851 NEURL1O76050 574 aa6.48□□□□□ -1.37
CAPNS1-202ENST00000586851 IGKV1D-33P01593 117 aa6.48□□□□□ -1.37
CAPNS1-202ENST00000586851 IGKV1-33P01594 117 aa6.48□□□□□ -1.37
CAPNS1-202ENST00000586851 CELA2AP08217 269 aa6.48□□□□□ -1.37
CAPNS1-202ENST00000586851 CRISP2P16562 243 aa6.48□□□□□ -1.37
CAPNS1-202ENST00000586851 BRS3P32247 399 aa6.48□□□□□ -1.37
CAPNS1-202ENST00000586851 RPL29P47914 159 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
CAPNS1-202ENST00000586851 TDGF1P3P51864 188 aa6.48□□□□□ -1.37
CAPNS1-202ENST00000586851 FOXL2P58012 376 aa6.48□□□□□ -1.37
CAPNS1-202ENST00000586851 TAS2R45P59539 299 aa6.48□□□□□ -1.37
CAPNS1-202ENST00000586851 RPEL1Q2QD12 228 aa6.48□□□□□ -1.37
CAPNS1-202ENST00000586851 CR1LQ2VPA4 569 aa6.48□□□□□ -1.37
CAPNS1-202ENST00000586851 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa6.48□□□□□ -1.37
CAPNS1-202ENST00000586851 TEX38Q6PEX7 206 aa6.48□□□□□ -1.37
CAPNS1-202ENST00000586851 C19orf35Q6ZS72 473 aa6.48□□□□□ -1.37
CAPNS1-202ENST00000586851 SSX7Q7RTT5 188 aa6.48□□□□□ -1.37
CAPNS1-202ENST00000586851 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa6.48□□□□□ -1.37
CAPNS1-202ENST00000586851 SCCPDHQ8NBX0 429 aa6.48□□□□□ -1.37
CAPNS1-202ENST00000586851 OR5AU1Q8NGC0 362 aa6.48□□□□□ -1.37
CAPNS1-202ENST00000586851 OR4A16Q8NH70 328 aa6.48□□□□□ -1.37
CAPNS1-202ENST00000586851 SGMS2Q8NHU3 365 aa6.48□□□□□ -1.37
CAPNS1-202ENST00000586851 SMIM12Q96EX1 92 aa6.48□□□□□ -1.37
CAPNS1-202ENST00000586851 VAMP8Q9BV40 100 aa6.48□□□□□ -1.37
CAPNS1-202ENST00000586851 DCAF16Q9NXF7 216 aa6.48□□□□□ -1.37
CAPNS1-202ENST00000586851 RFNGQ9Y644 331 aa6.48□□□□□ -1.37
CAPNS1-202ENST00000586851 CHD9Q3L8U1 2897 aa6.48□□□□□ -1.37
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