RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584243.5

GGA3-218, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 3

Gene GGA3, Length 646 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-218ENST00000584243 GUK1Q16774 197 aa6.74□□□□□ -1.33
GGA3-218ENST00000584243 MST1LQ2TV78 715 aa6.74□□□□□ -1.33
GGA3-218ENST00000584243 ZNF718Q3SXZ3 478 aa6.74□□□□□ -1.33
GGA3-218ENST00000584243 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
GGA3-218ENST00000584243 SLC25A24Q6NUK1 477 aa6.74□□□□□ -1.33
GGA3-218ENST00000584243 ZNF66Q6ZN08 573 aa6.74□□□□□ -1.33
GGA3-218ENST00000584243 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa6.74□□□□□ -1.33
GGA3-218ENST00000584243 BEND4Q6ZU67 534 aa6.74□□□□□ -1.33
GGA3-218ENST00000584243 MDP1Q86V88 176 aa6.74□□□□□ -1.33
GGA3-218ENST00000584243 TMEM252Q8N6L7 170 aa6.74□□□□□ -1.33
GGA3-218ENST00000584243 DMBX1Q8NFW5 382 aa6.74□□□□□ -1.33
GGA3-218ENST00000584243 P2RX4Q99571 388 aa6.74□□□□□ -1.33
GGA3-218ENST00000584243 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
GGA3-218ENST00000584243 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
GGA3-218ENST00000584243 C11orf1Q9H5F2 150 aa6.74□□□□□ -1.33
GGA3-218ENST00000584243 CHODLQ9H9P2 273 aa6.74□□□□□ -1.33
GGA3-218ENST00000584243 HES4Q9HCC6 221 aa6.74□□□□□ -1.33
GGA3-218ENST00000584243 SIRT7Q9NRC8 400 aa6.74□□□□□ -1.33
GGA3-218ENST00000584243 EML6Q6ZMW3 1958 aa6.73□□□□□ -1.33
GGA3-218ENST00000584243 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa6.73□□□□□ -1.33
GGA3-218ENST00000584243 TRAV24A0A0B4J272 114 aa6.73□□□□□ -1.33
GGA3-218ENST00000584243 K7N7A8 449 aa6.73□□□□□ -1.33
GGA3-218ENST00000584243 ITGB1BP1O14713 200 aa6.73□□□□□ -1.33
GGA3-218ENST00000584243 SPINT2O43291 252 aa6.73□□□□□ -1.33
GGA3-218ENST00000584243 ADAM20O43506 726 aa6.73□□□□□ -1.33
GGA3-218ENST00000584243 IGHV3-9P01782 118 aa6.73□□□□□ -1.33
GGA3-218ENST00000584243 S100A8P05109 93 aa6.73□□□□□ -1.33
GGA3-218ENST00000584243 CELA3AP09093 270 aa6.73□□□□□ -1.33
GGA3-218ENST00000584243 BMP5P22003 454 aa6.73□□□□□ -1.33
GGA3-218ENST00000584243 CD80P33681 288 aa6.73□□□□□ -1.33
GGA3-218ENST00000584243 WNT5AP41221 380 aa6.73□□□□□ -1.33
GGA3-218ENST00000584243 AKR1C2P52895 323 aa6.73□□□□□ -1.33
GGA3-218ENST00000584243 HTD2P86397 168 aa6.73□□□□□ -1.33
GGA3-218ENST00000584243 CLINT1Q14677 625 aa6.73□□□□□ -1.33
GGA3-218ENST00000584243 HFEQ30201 348 aa6.73□□□□□ -1.33
GGA3-218ENST00000584243 SP6Q3SY56 376 aa6.73□□□□□ -1.33
GGA3-218ENST00000584243 KHDC3LQ587J8 217 aa6.73□□□□□ -1.33
GGA3-218ENST00000584243 IGSF11Q5DX21 431 aa6.73□□□□□ -1.33
GGA3-218ENST00000584243 SOHLH1Q5JUK2 328 aa6.73□□□□□ -1.33
GGA3-218ENST00000584243 SLC35E3Q7Z769 313 aa6.73□□□□□ -1.33
GGA3-218ENST00000584243 ZNF645Q8N7E2 425 aa6.73□□□□□ -1.33
GGA3-218ENST00000584243 OR2G3Q8NGZ4 309 aa6.73□□□□□ -1.33
GGA3-218ENST00000584243 ERGIC1Q969X5 290 aa6.73□□□□□ -1.33
GGA3-218ENST00000584243 BTF3L4Q96K17 158 aa6.73□□□□□ -1.33
GGA3-218ENST00000584243 CLCC1Q96S66 551 aa6.73□□□□□ -1.33
GGA3-218ENST00000584243 SSX3Q99909 188 aa6.73□□□□□ -1.33
GGA3-218ENST00000584243 EGLN1Q9GZT9 426 aa6.73□□□□□ -1.33
GGA3-218ENST00000584243 FBXO7Q9Y3I1 522 aa6.73□□□□□ -1.33
GGA3-218ENST00000584243 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
GGA3-218ENST00000584243 ALPK2Q86TB3 2170 aa6.73□□□□□ -1.33
GGA3-218ENST00000584243 C1orf196B1AJZ1 125 aa6.72□□□□□ -1.33
GGA3-218ENST00000584243 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
GGA3-218ENST00000584243 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP6.72□□□□□ -1.33
GGA3-218ENST00000584243 TXNL1O43396 289 aa6.72□□□□□ -1.33
GGA3-218ENST00000584243 SYNGR2O43760 224 aa6.72□□□□□ -1.33
GGA3-218ENST00000584243 SSSCA1O60232 199 aa6.72□□□□□ -1.33
GGA3-218ENST00000584243 WDR1O75083 606 aa6.72□□□□□ -1.33
GGA3-218ENST00000584243 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
GGA3-218ENST00000584243 OR2H2O95918 312 aa6.72□□□□□ -1.33
GGA3-218ENST00000584243 HAND1O96004 215 aa6.72□□□□□ -1.33
GGA3-218ENST00000584243 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
GGA3-218ENST00000584243 SCTP09683 121 aa6.72□□□□□ -1.33
GGA3-218ENST00000584243 GZMHP20718 246 aa6.72□□□□□ -1.33
GGA3-218ENST00000584243 CA6P23280 308 aa6.72□□□□□ -1.33
GGA3-218ENST00000584243 RAB13P51153 203 aa6.72□□□□□ -1.33
GGA3-218ENST00000584243 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
GGA3-218ENST00000584243 SELENOVP59797 346 aa6.72□□□□□ -1.33
GGA3-218ENST00000584243 HERPUD1Q15011 391 aa6.72□□□□□ -1.33
GGA3-218ENST00000584243 FAM74A3Q4VXF1 159 aa6.72□□□□□ -1.33
GGA3-218ENST00000584243 HIKESHIQ53FT3 197 aa6.72□□□□□ -1.33
GGA3-218ENST00000584243 Q6P435 159 aa6.72□□□□□ -1.33
GGA3-218ENST00000584243 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
GGA3-218ENST00000584243 RTN4RL2Q86UN3 420 aa6.72□□□□□ -1.33
GGA3-218ENST00000584243 ZNF561Q8N587 486 aa6.72□□□□□ -1.33
GGA3-218ENST00000584243 OR52M1Q8NGK5 317 aa6.72□□□□□ -1.33
GGA3-218ENST00000584243 OR5C1Q8NGR4 320 aa6.72□□□□□ -1.33
GGA3-218ENST00000584243 OR51H1Q8NH63 302 aa6.72□□□□□ -1.33
GGA3-218ENST00000584243 MALSU1Q96EH3 234 aa6.72□□□□□ -1.33
GGA3-218ENST00000584243 TXNDC17Q9BRA2 123 aa6.72□□□□□ -1.33
GGA3-218ENST00000584243 ZNF251Q9BRH9 671 aa6.72□□□□□ -1.33
GGA3-218ENST00000584243 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa6.72□□□□□ -1.33
GGA3-218ENST00000584243 C1QTNF6Q9BXI9 259 aa6.72□□□□□ -1.33
GGA3-218ENST00000584243 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa6.72□□□□□ -1.33
GGA3-218ENST00000584243 TMEM242Q9NWH2 141 aa6.72□□□□□ -1.33
GGA3-218ENST00000584243 RNF115Q9Y4L5 304 aa6.72□□□□□ -1.33
GGA3-218ENST00000584243 PCNX3Q9H6A9 2034 aa6.71□□□□□ -1.33
GGA3-218ENST00000584243 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
GGA3-218ENST00000584243 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
GGA3-218ENST00000584243 RBFOX3A6NFN3 312 aa6.71□□□□□ -1.34
GGA3-218ENST00000584243 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa6.71□□□□□ -1.34
GGA3-218ENST00000584243 C17orf112F2Z3M2 114 aa6.71□□□□□ -1.34
GGA3-218ENST00000584243 NDUFA2O43678 99 aa6.71□□□□□ -1.34
GGA3-218ENST00000584243 SYNGR1O43759 233 aa6.71□□□□□ -1.34
GGA3-218ENST00000584243 MPDU1O75352 247 aa6.71□□□□□ -1.34
GGA3-218ENST00000584243 NGFP01138 241 aa6.71□□□□□ -1.34
GGA3-218ENST00000584243 IGLV1-44P01699 117 aa6.71□□□□□ -1.34
GGA3-218ENST00000584243 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
GGA3-218ENST00000584243 ADCYAP1P18509 176 aa6.71□□□□□ -1.34
GGA3-218ENST00000584243 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
GGA3-218ENST00000584243 IL2RGP31785 369 aa6.71□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.2 ms