RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584229.1

GPS1-223, Transcript of G protein pathway suppressor 1, human

TSL 3

Gene GPS1, Length 535 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GPS1-223	ENST00000584229	TSPAN9	O75954	239 aa		19.88	■□□□□ 0.77
GPS1-223	ENST00000584229	CSF1	P09603	554 aa		19.88	■□□□□ 0.77
GPS1-223	ENST00000584229	SSBP1	Q04837	148 aa	Known RBP	19.88	■□□□□ 0.77
GPS1-223	ENST00000584229	CNPY1	Q3B7I2	92 aa		19.88	■□□□□ 0.77
GPS1-223	ENST00000584229	CCDC190	Q86UF4	302 aa		19.88	■□□□□ 0.77
GPS1-223	ENST00000584229		Q8N6K4	173 aa		19.88	■□□□□ 0.77
GPS1-223	ENST00000584229	TMEM229B	Q8NBD8	167 aa		19.88	■□□□□ 0.77
GPS1-223	ENST00000584229	TINAGL1	Q9GZM7	467 aa	Predicted RBP	19.88	■□□□□ 0.77
GPS1-223	ENST00000584229	ZNF702P	Q9H963	129 aa		19.88	■□□□□ 0.77
GPS1-223	ENST00000584229	RNF114	Q9Y508	228 aa		19.88	■□□□□ 0.77
GPS1-223	ENST00000584229	CLPSL1	A2RUU4	121 aa		19.87	■□□□□ 0.77
GPS1-223	ENST00000584229	KCTD9	Q7L273	389 aa		19.87	■□□□□ 0.77
GPS1-223	ENST00000584229	C5orf56	Q8N8D9	126 aa		19.87	■□□□□ 0.77
GPS1-223	ENST00000584229	OR5AN1	Q8NGI8	311 aa		19.87	■□□□□ 0.77
GPS1-223	ENST00000584229	LINC01006	Q8NI28	216 aa		19.87	■□□□□ 0.77
GPS1-223	ENST00000584229	ADTRP	Q96IZ2	230 aa		19.87	■□□□□ 0.77
GPS1-223	ENST00000584229	FXYD6	Q9H0Q3	95 aa		19.87	■□□□□ 0.77
GPS1-223	ENST00000584229	TAS2R8	Q9NYW2	309 aa		19.87	■□□□□ 0.77
GPS1-223	ENST00000584229	KIAA1456	Q9P272	454 aa		19.87	■□□□□ 0.77
GPS1-223	ENST00000584229	GSTZ1	O43708	216 aa	Predicted RBP	19.86	■□□□□ 0.77
GPS1-223	ENST00000584229	RAB3D	O95716	219 aa		19.86	■□□□□ 0.77
GPS1-223	ENST00000584229	TBP	P20226	339 aa		19.86	■□□□□ 0.77
GPS1-223	ENST00000584229	CNTFR	P26992	372 aa		19.86	■□□□□ 0.77
GPS1-223	ENST00000584229	DUT	P33316	252 aa	Known RBP	19.86	■□□□□ 0.77
GPS1-223	ENST00000584229	RTL8B	Q17RB0	113 aa		19.86	■□□□□ 0.77
GPS1-223	ENST00000584229	OR2B11	Q5JQS5	317 aa		19.86	■□□□□ 0.77
GPS1-223	ENST00000584229	VAX1	Q5SQQ9	334 aa		19.86	■□□□□ 0.77
GPS1-223	ENST00000584229	STEAP1B	Q6NZ63	245 aa		19.86	■□□□□ 0.77
GPS1-223	ENST00000584229	DHRS11	Q6UWP2	260 aa		19.86	■□□□□ 0.77
GPS1-223	ENST00000584229	PDPN	Q86YL7	162 aa		19.86	■□□□□ 0.77
GPS1-223	ENST00000584229	BVES	Q8NE79	360 aa		19.86	■□□□□ 0.77
GPS1-223	ENST00000584229	TCTEX1D2	Q8WW35	142 aa		19.86	■□□□□ 0.77
GPS1-223	ENST00000584229	MOB3A	Q96BX8	217 aa		19.86	■□□□□ 0.77
GPS1-223	ENST00000584229	RASL11B	Q9BPW5	248 aa		19.86	■□□□□ 0.77
GPS1-223	ENST00000584229	SOST	Q9BQB4	213 aa		19.86	■□□□□ 0.77
GPS1-223	ENST00000584229	C16orf95	Q9H693	158 aa		19.86	■□□□□ 0.77
GPS1-223	ENST00000584229		A0A1B0GUS0	222 aa		19.85	■□□□□ 0.77
GPS1-223	ENST00000584229	FGF16	O43320	207 aa		19.85	■□□□□ 0.77
GPS1-223	ENST00000584229	VDAC2	P45880	294 aa	Predicted RBP	19.85	■□□□□ 0.77
GPS1-223	ENST00000584229	F2RL1	P55085	397 aa		19.85	■□□□□ 0.77
GPS1-223	ENST00000584229	RPS16	P62249	146 aa	Known RBP	19.85	■□□□□ 0.77
GPS1-223	ENST00000584229	PLGLA	Q15195	96 aa		19.85	■□□□□ 0.77
GPS1-223	ENST00000584229	TMEM95	Q3KNT9	176 aa		19.85	■□□□□ 0.77
GPS1-223	ENST00000584229	ZNF660	Q6AZW8	331 aa	Predicted RBP	19.85	■□□□□ 0.77
GPS1-223	ENST00000584229		Q6ZS46	218 aa		19.85	■□□□□ 0.77
GPS1-223	ENST00000584229		Q8N402	240 aa		19.85	■□□□□ 0.77
GPS1-223	ENST00000584229	C3orf56	Q8N813	242 aa		19.85	■□□□□ 0.77
GPS1-223	ENST00000584229	OR8H1	Q8NGG4	311 aa		19.85	■□□□□ 0.77
GPS1-223	ENST00000584229	RITA1	Q96K30	269 aa		19.85	■□□□□ 0.77
GPS1-223	ENST00000584229	GPHA2	Q96T91	129 aa		19.85	■□□□□ 0.77
GPS1-223	ENST00000584229	COL6A5	A8TX70	2615 aa		19.85	■□□□□ 0.77
GPS1-223	ENST00000584229	LINC00473	A8K010	186 aa		19.84	■□□□□ 0.77
GPS1-223	ENST00000584229	NBR2	O15453	112 aa		19.84	■□□□□ 0.77
GPS1-223	ENST00000584229	AMY2A	P04746	511 aa		19.84	■□□□□ 0.77
GPS1-223	ENST00000584229	ZNF79	Q15937	498 aa		19.84	■□□□□ 0.77
GPS1-223	ENST00000584229	SCGB2B2	Q4G0G5	96 aa		19.84	■□□□□ 0.77
GPS1-223	ENST00000584229	FAAP20	Q6NZ36	180 aa		19.84	■□□□□ 0.77
GPS1-223	ENST00000584229	C11orf88	Q6PI97	169 aa		19.84	■□□□□ 0.77
GPS1-223	ENST00000584229	ZNF818P	Q6ZRF7	136 aa		19.84	■□□□□ 0.77
GPS1-223	ENST00000584229	OR4D10	Q8NGI6	311 aa		19.84	■□□□□ 0.77
GPS1-223	ENST00000584229	BORCS5	Q969J3	196 aa		19.84	■□□□□ 0.77
GPS1-223	ENST00000584229	HSD17B10	Q99714	261 aa	Known RBP	19.84	■□□□□ 0.77
GPS1-223	ENST00000584229	THAP7	Q9BT49	309 aa	Predicted RBP	19.84	■□□□□ 0.77
GPS1-223	ENST00000584229	PRELID3B	Q9Y3B1	194 aa		19.84	■□□□□ 0.77
GPS1-223	ENST00000584229	IGLV2-14	P01704	120 aa		19.83	■□□□□ 0.77
GPS1-223	ENST00000584229	IGKV1-16	P04430	117 aa		19.83	■□□□□ 0.77
GPS1-223	ENST00000584229	AMY1A	P04745	511 aa		19.83	■□□□□ 0.77
GPS1-223	ENST00000584229	AKAIN1	P0CW23	69 aa		19.83	■□□□□ 0.77
GPS1-223	ENST00000584229	PTBP1	P26599	531 aa	Known RBP eCLIP	19.83	■□□□□ 0.77
GPS1-223	ENST00000584229	COMP	P49747	757 aa	Predicted RBP	19.83	■□□□□ 0.77
GPS1-223	ENST00000584229	MEF2D	Q14814	521 aa		19.83	■□□□□ 0.77
GPS1-223	ENST00000584229		Q8N9W7	124 aa		19.83	■□□□□ 0.77
GPS1-223	ENST00000584229	FLYWCH2	Q96CP2	140 aa	Known RBP	19.83	■□□□□ 0.77
GPS1-223	ENST00000584229	ZNF107	Q9UII5	783 aa	Predicted RBP	19.83	■□□□□ 0.77
GPS1-223	ENST00000584229	FCGR3B	O75015	233 aa		19.82	■□□□□ 0.76
GPS1-223	ENST00000584229	VSIG10L2	P0DP72	767 aa		19.82	■□□□□ 0.76
GPS1-223	ENST00000584229	RRAS	P10301	218 aa		19.82	■□□□□ 0.76
GPS1-223	ENST00000584229	PGAM2	P15259	253 aa		19.82	■□□□□ 0.76
GPS1-223	ENST00000584229	PPP5C	P53041	499 aa		19.82	■□□□□ 0.76
GPS1-223	ENST00000584229	TAGLN	Q01995	201 aa	Known RBP	19.82	■□□□□ 0.76
GPS1-223	ENST00000584229	ARRDC1	Q8N5I2	433 aa		19.82	■□□□□ 0.76
GPS1-223	ENST00000584229	ZBTB34	Q8NCN2	500 aa		19.82	■□□□□ 0.76
GPS1-223	ENST00000584229	HARBI1	Q96MB7	349 aa		19.82	■□□□□ 0.76
GPS1-223	ENST00000584229	LIN7C	Q9NUP9	197 aa	Known RBP	19.82	■□□□□ 0.76
GPS1-223	ENST00000584229	MMP24	Q9Y5R2	645 aa		19.82	■□□□□ 0.76
GPS1-223	ENST00000584229	DISC1	C4P0D8	188 aa		19.81	■□□□□ 0.76
GPS1-223	ENST00000584229	SHOX	O15266	292 aa		19.81	■□□□□ 0.76
GPS1-223	ENST00000584229	CRYZL1	O95825	349 aa		19.81	■□□□□ 0.76
GPS1-223	ENST00000584229	CD74	P04233	296 aa		19.81	■□□□□ 0.76
GPS1-223	ENST00000584229	ETV6	P41212	452 aa		19.81	■□□□□ 0.76
GPS1-223	ENST00000584229	INPP1	P49441	399 aa		19.81	■□□□□ 0.76
GPS1-223	ENST00000584229	RPL30	P62888	115 aa	Known RBP	19.81	■□□□□ 0.76
GPS1-223	ENST00000584229	CATR1	Q13166	79 aa		19.81	■□□□□ 0.76
GPS1-223	ENST00000584229	AADACL3	Q5VUY0	350 aa		19.81	■□□□□ 0.76
GPS1-223	ENST00000584229	ZNF66	Q6ZN08	573 aa		19.81	■□□□□ 0.76
GPS1-223	ENST00000584229	OR4C16	Q8NGL9	310 aa		19.81	■□□□□ 0.76
GPS1-223	ENST00000584229	TSNAX	Q99598	290 aa	Known RBP	19.81	■□□□□ 0.76
GPS1-223	ENST00000584229	PLSCR3	Q9NRY6	295 aa		19.81	■□□□□ 0.76
GPS1-223	ENST00000584229	ANKRD20A5P	A0PJZ0	165 aa		19.8	■□□□□ 0.76
GPS1-223	ENST00000584229	MSMO1	Q15800	293 aa		19.8	■□□□□ 0.76

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