RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000572369.5

SMG6-211, Transcript of SMG6, nonsense mediated mRNA decay factor, humanhuman

TSL 3

Gene SMG6, Length 689 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG6-211ENST00000572369 RTL8BQ17RB0 113 aa6.16□□□□□ -1.42
SMG6-211ENST00000572369 LIN54Q6MZP7 749 aa6.16□□□□□ -1.42
SMG6-211ENST00000572369 ZNF329Q86UD4 541 aa6.16□□□□□ -1.42
SMG6-211ENST00000572369 HOGA1Q86XE5 327 aa6.16□□□□□ -1.42
SMG6-211ENST00000572369 SNX29P2Q8IUI4 249 aa6.16□□□□□ -1.42
SMG6-211ENST00000572369 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
SMG6-211ENST00000572369 ABHD5Q8WTS1 349 aa6.16□□□□□ -1.42
SMG6-211ENST00000572369 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
SMG6-211ENST00000572369 CMTM3Q96MX0 182 aa6.16□□□□□ -1.42
SMG6-211ENST00000572369 NOL4LQ96MY1 436 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
SMG6-211ENST00000572369 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
SMG6-211ENST00000572369 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
SMG6-211ENST00000572369 GON7Q9BXV9 100 aa6.16□□□□□ -1.42
SMG6-211ENST00000572369 WNT10AQ9GZT5 417 aa6.16□□□□□ -1.42
SMG6-211ENST00000572369 FBXL15Q9H469 300 aa6.16□□□□□ -1.42
SMG6-211ENST00000572369 SDHAF2Q9NX18 166 aa6.16□□□□□ -1.42
SMG6-211ENST00000572369 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
SMG6-211ENST00000572369 H0YJW9 148 aa6.15□□□□□ -1.42
SMG6-211ENST00000572369 RRHO14718 337 aa6.15□□□□□ -1.42
SMG6-211ENST00000572369 OR5H8P0DN80 308 aa6.15□□□□□ -1.42
SMG6-211ENST00000572369 RRASP10301 218 aa6.15□□□□□ -1.42
SMG6-211ENST00000572369 PF4V1P10720 104 aa6.15□□□□□ -1.42
SMG6-211ENST00000572369 VDAC1P21796 283 aa6.15□□□□□ -1.42
SMG6-211ENST00000572369 FCGR2CP31995 323 aa6.15□□□□□ -1.42
SMG6-211ENST00000572369 LINC00205P59089 165 aa6.15□□□□□ -1.42
SMG6-211ENST00000572369 FXYD4P59646 89 aa6.15□□□□□ -1.42
SMG6-211ENST00000572369 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
SMG6-211ENST00000572369 CDK10Q15131 360 aa6.15□□□□□ -1.42
SMG6-211ENST00000572369 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
SMG6-211ENST00000572369 NDUFA11Q86Y39 141 aa6.15□□□□□ -1.42
SMG6-211ENST00000572369 PDPNQ86YL7 162 aa6.15□□□□□ -1.42
SMG6-211ENST00000572369 C1QL4Q86Z23 238 aa6.15□□□□□ -1.42
SMG6-211ENST00000572369 STPG2Q8N412 459 aa6.15□□□□□ -1.42
SMG6-211ENST00000572369 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa6.15□□□□□ -1.42
SMG6-211ENST00000572369 ZNF645Q8N7E2 425 aa6.15□□□□□ -1.42
SMG6-211ENST00000572369 ZNF383Q8NA42 475 aa6.15□□□□□ -1.42
SMG6-211ENST00000572369 BVESQ8NE79 360 aa6.15□□□□□ -1.42
SMG6-211ENST00000572369 OR5AP2Q8NGF4 316 aa6.15□□□□□ -1.42
SMG6-211ENST00000572369 OR5AN1Q8NGI8 311 aa6.15□□□□□ -1.42
SMG6-211ENST00000572369 OR5H2Q8NGV7 314 aa6.15□□□□□ -1.42
SMG6-211ENST00000572369 SECTM1Q8WVN6 248 aa6.15□□□□□ -1.42
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SMG6-211ENST00000572369 ADTRPQ96IZ2 230 aa6.15□□□□□ -1.42
SMG6-211ENST00000572369 RITA1Q96K30 269 aa6.15□□□□□ -1.42
SMG6-211ENST00000572369 CLCC1Q96S66 551 aa6.15□□□□□ -1.42
SMG6-211ENST00000572369 BCL7BQ9BQE9 202 aa6.15□□□□□ -1.42
SMG6-211ENST00000572369 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa6.15□□□□□ -1.42
SMG6-211ENST00000572369 MMP27Q9H306 513 aa6.15□□□□□ -1.42
SMG6-211ENST00000572369 PARP11Q9NR21 331 aa6.15□□□□□ -1.42
SMG6-211ENST00000572369 PLSCR3Q9NRY6 295 aa6.15□□□□□ -1.42
SMG6-211ENST00000572369 EHFQ9NZC4 300 aa6.15□□□□□ -1.42
SMG6-211ENST00000572369 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
SMG6-211ENST00000572369 EXTL2Q9UBQ6 330 aa6.15□□□□□ -1.42
SMG6-211ENST00000572369 ADAM30Q9UKF2 790 aa6.15□□□□□ -1.42
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SMG6-211ENST00000572369 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa6.15□□□□□ -1.42
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SMG6-211ENST00000572369 PROP1O75360 226 aa6.14□□□□□ -1.43
SMG6-211ENST00000572369 TSPAN15O95858 294 aa6.14□□□□□ -1.43
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SMG6-211ENST00000572369 HERV-K104P61576 105 aa6.14□□□□□ -1.43
SMG6-211ENST00000572369 TSPAN5P62079 268 aa6.14□□□□□ -1.43
SMG6-211ENST00000572369 C5orf64Q2M2E5 130 aa6.14□□□□□ -1.43
SMG6-211ENST00000572369 TEX38Q6PEX7 206 aa6.14□□□□□ -1.43
SMG6-211ENST00000572369 C10orf99Q6UWK7 81 aa6.14□□□□□ -1.43
SMG6-211ENST00000572369 KCTD9Q7L273 389 aa6.14□□□□□ -1.43
SMG6-211ENST00000572369 TMEM17Q86X19 198 aa6.14□□□□□ -1.43
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SMG6-211ENST00000572369 OR4F17Q8NGA8 305 aa6.14□□□□□ -1.43
SMG6-211ENST00000572369 C15orf40Q8WUR7 153 aa6.14□□□□□ -1.43
SMG6-211ENST00000572369 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa6.14□□□□□ -1.43
SMG6-211ENST00000572369 ISOC1Q96CN7 298 aa6.14□□□□□ -1.43
SMG6-211ENST00000572369 HARBI1Q96MB7 349 aa6.14□□□□□ -1.43
SMG6-211ENST00000572369 OR4F4Q96R69 305 aa6.14□□□□□ -1.43
SMG6-211ENST00000572369 RNF5Q99942 180 aa6.14□□□□□ -1.43
SMG6-211ENST00000572369 HSPB9Q9BQS6 159 aa6.14□□□□□ -1.43
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SMG6-211ENST00000572369 SLC5A7Q9GZV3 580 aa6.14□□□□□ -1.43
SMG6-211ENST00000572369 OR51J1Q9H342 316 aa6.14□□□□□ -1.43
SMG6-211ENST00000572369 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
SMG6-211ENST00000572369 NOTCH3Q9UM47 2321 aa6.14□□□□□ -1.43
SMG6-211ENST00000572369 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa6.13□□□□□ -1.43
SMG6-211ENST00000572369 H3BMQ9 156 aa6.13□□□□□ -1.43
SMG6-211ENST00000572369 ATP6V0E1O15342 81 aa6.13□□□□□ -1.43
SMG6-211ENST00000572369 TNFSF12O43508 249 aa6.13□□□□□ -1.43
SMG6-211ENST00000572369 SLC25A17O43808 307 aa6.13□□□□□ -1.43
SMG6-211ENST00000572369 FCGR3BO75015 233 aa6.13□□□□□ -1.43
SMG6-211ENST00000572369 NDUFA3O95167 84 aa6.13□□□□□ -1.43
SMG6-211ENST00000572369 SPDEFO95238 335 aa6.13□□□□□ -1.43
SMG6-211ENST00000572369 CNIH1O95406 144 aa6.13□□□□□ -1.43
SMG6-211ENST00000572369 CRYZL1O95825 349 aa6.13□□□□□ -1.43
SMG6-211ENST00000572369 PPYP01298 95 aa6.13□□□□□ -1.43
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