RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567434.5

CCNDBP1-211, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene CCNDBP1, Length 713 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-211ENST00000567434 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP13.38□□□□□ -0.27
CCNDBP1-211ENST00000567434 ADTRPQ96IZ2 230 aa13.38□□□□□ -0.27
CCNDBP1-211ENST00000567434 RNF167Q9H6Y7 350 aa13.38□□□□□ -0.27
CCNDBP1-211ENST00000567434 SLC35D1Q9NTN3 355 aa13.38□□□□□ -0.27
CCNDBP1-211ENST00000567434 SDHAF2Q9NX18 166 aa13.38□□□□□ -0.27
CCNDBP1-211ENST00000567434 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP13.38□□□□□ -0.27
CCNDBP1-211ENST00000567434 TMEM235A6NFC5 223 aa13.37□□□□□ -0.27
CCNDBP1-211ENST00000567434 CCL24O00175 119 aa13.37□□□□□ -0.27
CCNDBP1-211ENST00000567434 IGLV1-40P01703 118 aa13.37□□□□□ -0.27
CCNDBP1-211ENST00000567434 IGKV1-16P04430 117 aa13.37□□□□□ -0.27
CCNDBP1-211ENST00000567434 RRASP10301 218 aa13.37□□□□□ -0.27
CCNDBP1-211ENST00000567434 LGALS7P47929 136 aa13.37□□□□□ -0.27
CCNDBP1-211ENST00000567434 RPS16P62249 146 aaKnown RBP13.37□□□□□ -0.27
CCNDBP1-211ENST00000567434 CX3CL1P78423 397 aa13.37□□□□□ -0.27
CCNDBP1-211ENST00000567434 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP13.37□□□□□ -0.27
CCNDBP1-211ENST00000567434 PSG5Q15238 335 aa13.37□□□□□ -0.27
CCNDBP1-211ENST00000567434 CNIH2Q6PI25 160 aa13.37□□□□□ -0.27
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZNF562Q6V9R5 426 aa13.37□□□□□ -0.27
CCNDBP1-211ENST00000567434 C18orf65Q6ZTR6 163 aa13.37□□□□□ -0.27
CCNDBP1-211ENST00000567434 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa13.37□□□□□ -0.27
CCNDBP1-211ENST00000567434 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP13.37□□□□□ -0.27
CCNDBP1-211ENST00000567434 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP13.37□□□□□ -0.27
CCNDBP1-211ENST00000567434 WSB1Q9Y6I7 421 aa13.37□□□□□ -0.27
CCNDBP1-211ENST00000567434 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa13.36□□□□□ -0.27
CCNDBP1-211ENST00000567434 AIREO43918 545 aa13.36□□□□□ -0.27
CCNDBP1-211ENST00000567434 SLC22A5O76082 557 aa13.36□□□□□ -0.27
CCNDBP1-211ENST00000567434 RTL8BQ17RB0 113 aa13.36□□□□□ -0.27
CCNDBP1-211ENST00000567434 C19orf54Q5BKX5 351 aa13.36□□□□□ -0.27
CCNDBP1-211ENST00000567434 FOXB2Q5VYV0 432 aa13.36□□□□□ -0.27
CCNDBP1-211ENST00000567434 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa13.36□□□□□ -0.27
CCNDBP1-211ENST00000567434 DPF1Q92782 380 aa13.36□□□□□ -0.27
CCNDBP1-211ENST00000567434 SLC25A38Q96DW6 304 aa13.36□□□□□ -0.27
CCNDBP1-211ENST00000567434 YIPF6Q96EC8 236 aa13.36□□□□□ -0.27
CCNDBP1-211ENST00000567434 RAX2Q96IS3 184 aa13.36□□□□□ -0.27
CCNDBP1-211ENST00000567434 UBE2E2Q96LR5 201 aa13.36□□□□□ -0.27
CCNDBP1-211ENST00000567434 DIABLOQ9NR28 239 aa13.36□□□□□ -0.27
CCNDBP1-211ENST00000567434 SPATA2Q9UM82 520 aa13.36□□□□□ -0.27
CCNDBP1-211ENST00000567434 TRIM64CA6NLI5 447 aa13.35□□□□□ -0.27
CCNDBP1-211ENST00000567434 G3V318 75 aa13.35□□□□□ -0.27
CCNDBP1-211ENST00000567434 NDPQ00604 133 aa13.35□□□□□ -0.27
CCNDBP1-211ENST00000567434 RUNX1Q01196 453 aa13.35□□□□□ -0.27
CCNDBP1-211ENST00000567434 AKIRIN2Q53H80 203 aa13.35□□□□□ -0.27
CCNDBP1-211ENST00000567434 PYHIN1Q6K0P9 492 aa13.35□□□□□ -0.27
CCNDBP1-211ENST00000567434 LCNL1Q6ZST4 164 aa13.35□□□□□ -0.27
CCNDBP1-211ENST00000567434 OR5H6Q8NGV6 325 aa13.35□□□□□ -0.27
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP13.35□□□□□ -0.27
CCNDBP1-211ENST00000567434 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP13.35□□□□□ -0.27
CCNDBP1-211ENST00000567434 OR2W1Q9Y3N9 320 aa13.35□□□□□ -0.27
CCNDBP1-211ENST00000567434 SSX5O60225 188 aa13.34□□□□□ -0.27
CCNDBP1-211ENST00000567434 LUMP51884 338 aaPredicted RBP13.34□□□□□ -0.27
CCNDBP1-211ENST00000567434 TMEM177Q53S58 311 aa13.34□□□□□ -0.27
CCNDBP1-211ENST00000567434 ANXA10Q9UJ72 324 aa13.34□□□□□ -0.27
CCNDBP1-211ENST00000567434 VSIG4Q9Y279 399 aa13.34□□□□□ -0.27
CCNDBP1-211ENST00000567434 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa13.34□□□□□ -0.27
CCNDBP1-211ENST00000567434 TRAV18A0A075B6X5 111 aa13.33□□□□□ -0.28
CCNDBP1-211ENST00000567434 FCN1O00602 326 aa13.33□□□□□ -0.28
CCNDBP1-211ENST00000567434 SLC25A17O43808 307 aa13.33□□□□□ -0.28
CCNDBP1-211ENST00000567434 HLA-DQB1P01920 261 aa13.33□□□□□ -0.28
CCNDBP1-211ENST00000567434 RAB9AP51151 201 aa13.33□□□□□ -0.28
CCNDBP1-211ENST00000567434 LINC00205P59089 165 aa13.33□□□□□ -0.28
CCNDBP1-211ENST00000567434 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa13.33□□□□□ -0.28
CCNDBP1-211ENST00000567434 FHL3Q13643 280 aa13.33□□□□□ -0.28
CCNDBP1-211ENST00000567434 ECSCRQ19T08 205 aa13.33□□□□□ -0.28
CCNDBP1-211ENST00000567434 PPP1R27Q86WC6 154 aa13.33□□□□□ -0.28
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZNF645Q8N7E2 425 aa13.33□□□□□ -0.28
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZNF491Q8N8L2 437 aa13.33□□□□□ -0.28
CCNDBP1-211ENST00000567434 OR5M8Q8NGP6 311 aa13.33□□□□□ -0.28
CCNDBP1-211ENST00000567434 ABHD5Q8WTS1 349 aa13.33□□□□□ -0.28
CCNDBP1-211ENST00000567434 ARPC1AQ92747 370 aa13.33□□□□□ -0.28
CCNDBP1-211ENST00000567434 C5orf30Q96GV9 206 aa13.33□□□□□ -0.28
CCNDBP1-211ENST00000567434 HARBI1Q96MB7 349 aa13.33□□□□□ -0.28
CCNDBP1-211ENST00000567434 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP13.33□□□□□ -0.28
CCNDBP1-211ENST00000567434 FBXO7Q9Y3I1 522 aa13.33□□□□□ -0.28
CCNDBP1-211ENST00000567434 A0A1W2PN81 502 aa13.32□□□□□ -0.28
CCNDBP1-211ENST00000567434 CA2P00918 260 aa13.32□□□□□ -0.28
CCNDBP1-211ENST00000567434 IGLV2-23P01705 113 aa13.32□□□□□ -0.28
CCNDBP1-211ENST00000567434 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP13.32□□□□□ -0.28
CCNDBP1-211ENST00000567434 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP13.32□□□□□ -0.28
CCNDBP1-211ENST00000567434 CD40LGP29965 261 aa13.32□□□□□ -0.28
CCNDBP1-211ENST00000567434 DUTP33316 252 aaKnown RBP13.32□□□□□ -0.28
CCNDBP1-211ENST00000567434 CHRNA7P36544 502 aa13.32□□□□□ -0.28
CCNDBP1-211ENST00000567434 CBX5P45973 191 aa13.32□□□□□ -0.28
CCNDBP1-211ENST00000567434 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP13.32□□□□□ -0.28
CCNDBP1-211ENST00000567434 BVESQ8NE79 360 aa13.32□□□□□ -0.28
CCNDBP1-211ENST00000567434 BEST4Q8NFU0 473 aa13.32□□□□□ -0.28
CCNDBP1-211ENST00000567434 DDB2Q92466 427 aa13.32□□□□□ -0.28
CCNDBP1-211ENST00000567434 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP13.32□□□□□ -0.28
CCNDBP1-211ENST00000567434 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP13.32□□□□□ -0.28
CCNDBP1-211ENST00000567434 KLK15Q9H2R5 256 aa13.32□□□□□ -0.28
CCNDBP1-211ENST00000567434 DNAH3Q8TD57 4116 aa13.32□□□□□ -0.28
CCNDBP1-211ENST00000567434 I3L521 148 aa13.31□□□□□ -0.28
CCNDBP1-211ENST00000567434 SHOXO15266 292 aa13.31□□□□□ -0.28
CCNDBP1-211ENST00000567434 XRCC3O43542 346 aa13.31□□□□□ -0.28
CCNDBP1-211ENST00000567434 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP13.31□□□□□ -0.28
CCNDBP1-211ENST00000567434 RPS19P39019 145 aaKnown RBP13.31□□□□□ -0.28
CCNDBP1-211ENST00000567434 ARPC4P59998 168 aa13.31□□□□□ -0.28
CCNDBP1-211ENST00000567434 DEFB136Q30KP8 78 aa13.31□□□□□ -0.28
CCNDBP1-211ENST00000567434 ACTBL2Q562R1 376 aa13.31□□□□□ -0.28
CCNDBP1-211ENST00000567434 UBE2NLQ5JXB2 153 aa13.31□□□□□ -0.28
CCNDBP1-211ENST00000567434 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa13.31□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.9 ms