RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555743.1

PSMA3-208, Transcript of proteasome subunit alpha 3, human

TSL 2

Gene PSMA3, Length 640 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PSMA3-208	ENST00000555743	LINC01548	A6NM66	108 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PSMA3-208	ENST00000555743	HSPA12A	O43301	675 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PSMA3-208	ENST00000555743	TUSC2	O75896	110 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PSMA3-208	ENST00000555743	HLA-DQB1	P01920	261 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PSMA3-208	ENST00000555743	TFAP2A	P05549	437 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PSMA3-208	ENST00000555743	FGF2	P09038	288 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PSMA3-208	ENST00000555743	GSTT2	P0CG29	244 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PSMA3-208	ENST00000555743	GSTT2B	P0CG30	244 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PSMA3-208	ENST00000555743	RRAS	P10301	218 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PSMA3-208	ENST00000555743	SLC2A2	P11168	524 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PSMA3-208	ENST00000555743	MYCNOS	P40205	109 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PSMA3-208	ENST00000555743	LGALS7	P47929	136 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PSMA3-208	ENST00000555743	DEFA6	Q01524	100 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PSMA3-208	ENST00000555743	EGFEM1P	Q0D2K5	195 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PSMA3-208	ENST00000555743	KIAA0141	Q14154	515 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PSMA3-208	ENST00000555743	MMD	Q15546	238 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PSMA3-208	ENST00000555743	ZNF124	Q15973	351 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PSMA3-208	ENST00000555743	CDNF	Q49AH0	187 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PSMA3-208	ENST00000555743	AKIRIN2	Q53H80	203 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PSMA3-208	ENST00000555743	TMEM177	Q53S58	311 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PSMA3-208	ENST00000555743	RPL39P5	Q59GN2	51 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PSMA3-208	ENST00000555743	IGSF11	Q5DX21	431 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PSMA3-208	ENST00000555743	PYHIN1	Q6K0P9	492 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PSMA3-208	ENST00000555743	LIN54	Q6MZP7	749 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PSMA3-208	ENST00000555743	CNIH2	Q6PI25	160 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PSMA3-208	ENST00000555743	C10orf99	Q6UWK7	81 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PSMA3-208	ENST00000555743	ZNF562	Q6V9R5	426 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PSMA3-208	ENST00000555743	ETV3L	Q6ZN32	361 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PSMA3-208	ENST00000555743	OVCH2	Q7RTZ1	564 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PSMA3-208	ENST00000555743	C5orf24	Q7Z6I8	188 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PSMA3-208	ENST00000555743	H1FOO	Q8IZA3	346 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PSMA3-208	ENST00000555743	LINC00482	Q8N8I6	264 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PSMA3-208	ENST00000555743	C11orf44	Q8N8P7	122 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PSMA3-208	ENST00000555743	ZNF383	Q8NA42	475 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PSMA3-208	ENST00000555743	FAM110D	Q8TAY7	271 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PSMA3-208	ENST00000555743	LGALS14	Q8TCE9	139 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PSMA3-208	ENST00000555743	R3HDM4	Q96D70	268 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PSMA3-208	ENST00000555743	ANAPC16	Q96DE5	110 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PSMA3-208	ENST00000555743	RITA1	Q96K30	269 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PSMA3-208	ENST00000555743	UBE2E2	Q96LR5	201 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PSMA3-208	ENST00000555743	NOL4L	Q96MY1	436 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PSMA3-208	ENST00000555743	HSPB9	Q9BQS6	159 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PSMA3-208	ENST00000555743	GPR61	Q9BZJ8	451 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PSMA3-208	ENST00000555743	OR51J1	Q9H342	316 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PSMA3-208	ENST00000555743	AP5S1	Q9NUS5	200 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PSMA3-208	ENST00000555743	RHBDL2	Q9NX52	303 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PSMA3-208	ENST00000555743	PRR13	Q9NZ81	148 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PSMA3-208	ENST00000555743	DAPK2	Q9UIK4	370 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PSMA3-208	ENST00000555743	ANAPC10	Q9UM13	185 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PSMA3-208	ENST00000555743	IGKV1D-8	A0A087WSZ0	117 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PSMA3-208	ENST00000555743		A0A0B4J203	849 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PSMA3-208	ENST00000555743	SH2D7	A6NKC9	451 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
PSMA3-208	ENST00000555743	RRH	O14718	337 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PSMA3-208	ENST00000555743	XRCC3	O43542	346 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PSMA3-208	ENST00000555743	SSX5	O60225	188 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PSMA3-208	ENST00000555743	TPPP	O94811	219 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PSMA3-208	ENST00000555743	IGLV2-14	P01704	120 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PSMA3-208	ENST00000555743	IGLV2-23	P01705	113 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PSMA3-208	ENST00000555743	IGKV1-16	P04430	117 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PSMA3-208	ENST00000555743	CRYGB	P07316	175 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PSMA3-208	ENST00000555743	PF4V1	P10720	104 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PSMA3-208	ENST00000555743	VDAC1	P21796	283 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PSMA3-208	ENST00000555743	THBS3	P49746	956 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PSMA3-208	ENST00000555743	EIF4EBP1	Q13541	118 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
PSMA3-208	ENST00000555743	PSG5	Q15238	335 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PSMA3-208	ENST00000555743	NEDD8	Q15843	81 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PSMA3-208	ENST00000555743	NSUN5P1	Q3KNT7	163 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PSMA3-208	ENST00000555743	FAM131A	Q6UXB0	335 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PSMA3-208	ENST00000555743	ZNF329	Q86UD4	541 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PSMA3-208	ENST00000555743	HOGA1	Q86XE5	327 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PSMA3-208	ENST00000555743	ZNF695	Q8IW36	515 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PSMA3-208	ENST00000555743	OR13F1	Q8NGS4	319 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PSMA3-208	ENST00000555743	OR8U1	Q8NH10	309 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PSMA3-208	ENST00000555743	SETD6	Q8TBK2	473 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PSMA3-208	ENST00000555743	C4orf3	Q8WVX3	66 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PSMA3-208	ENST00000555743	SLC25A46	Q96AG3	418 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PSMA3-208	ENST00000555743	ABHD14B	Q96IU4	210 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PSMA3-208	ENST00000555743	ADTRP	Q96IZ2	230 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PSMA3-208	ENST00000555743	TMEM68	Q96MH6	324 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PSMA3-208	ENST00000555743	TSNAX	Q99598	290 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
PSMA3-208	ENST00000555743	MCRIP2	Q9BUT9	160 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
PSMA3-208	ENST00000555743	ATG5	Q9H1Y0	275 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PSMA3-208	ENST00000555743	NECAP2	Q9NVZ3	263 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PSMA3-208	ENST00000555743	SDHAF2	Q9NX18	166 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PSMA3-208	ENST00000555743	KIAA1456	Q9P272	454 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PSMA3-208	ENST00000555743	ANXA10	Q9UJ72	324 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PSMA3-208	ENST00000555743	ZNF221	Q9UK13	617 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PSMA3-208	ENST00000555743	OR2W1	Q9Y3N9	320 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PSMA3-208	ENST00000555743	NUBP2	Q9Y5Y2	271 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PSMA3-208	ENST00000555743	TRAV41	A0A0B4J266	112 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PSMA3-208	ENST00000555743	LOC100506127	A0A0U1RQW1	187 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PSMA3-208	ENST00000555743	TMEM235	A6NFC5	223 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PSMA3-208	ENST00000555743		G3V4G9	280 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PSMA3-208	ENST00000555743		H3BUA1	57 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PSMA3-208	ENST00000555743		I3L521	148 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PSMA3-208	ENST00000555743	ARPC1B	O15143	372 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
PSMA3-208	ENST00000555743	BET1	O15155	118 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PSMA3-208	ENST00000555743	AIRE	O43918	545 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PSMA3-208	ENST00000555743	APOA2	P02652	100 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PSMA3-208	ENST00000555743	EGR2	P11161	476 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64

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