RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540606.5

ATE1-208, Transcript of arginyltransferase 1, human

TSL 2 BASIC

Gene ATE1, Length 5,165 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATE1-208	ENST00000540606	NUBP1	P53384	320 aa		11.36	□□□□□ -0.59
ATE1-208	ENST00000540606	C1orf100	Q5SVJ3	147 aa		11.36	□□□□□ -0.59
ATE1-208	ENST00000540606	HSD17B13	Q7Z5P4	300 aa	Predicted RBP	11.36	□□□□□ -0.59
ATE1-208	ENST00000540606	TCTEX1D1	Q8N7M0	179 aa		11.36	□□□□□ -0.59
ATE1-208	ENST00000540606	OR5AU1	Q8NGC0	362 aa		11.36	□□□□□ -0.59
ATE1-208	ENST00000540606	OR1L6	Q8NGR2	347 aa		11.36	□□□□□ -0.59
ATE1-208	ENST00000540606	ZFHX2	Q9C0A1	2572 aa	Predicted RBP	11.36	□□□□□ -0.59
ATE1-208	ENST00000540606	ISG15	P05161	165 aa		11.36	□□□□□ -0.59
ATE1-208	ENST00000540606	LRP11	Q86VZ4	500 aa		11.36	□□□□□ -0.59
ATE1-208	ENST00000540606		H0Y980	276 aa		11.35	□□□□□ -0.59
ATE1-208	ENST00000540606	ZNF841	Q6ZN19	808 aa		11.35	□□□□□ -0.59
ATE1-208	ENST00000540606	ZNF738	Q8NE65	137 aa		11.35	□□□□□ -0.59
ATE1-208	ENST00000540606	SGK494	Q96LW2	274 aa		11.35	□□□□□ -0.59
ATE1-208	ENST00000540606	TGFBR3L	H3BV60	316 aa		11.35	□□□□□ -0.59
ATE1-208	ENST00000540606	ALX4	Q9H161	411 aa	Predicted RBP	11.35	□□□□□ -0.59
ATE1-208	ENST00000540606	MIOX	Q9UGB7	285 aa		11.35	□□□□□ -0.59
ATE1-208	ENST00000540606	PDE6D	O43924	150 aa		11.35	□□□□□ -0.59
ATE1-208	ENST00000540606	F12	P00748	615 aa	Predicted RBP	11.35	□□□□□ -0.59
ATE1-208	ENST00000540606	CECR9	P0C854	216 aa		11.35	□□□□□ -0.59
ATE1-208	ENST00000540606	HIST1H1B	P16401	226 aa	Known RBP	11.35	□□□□□ -0.59
ATE1-208	ENST00000540606	GBGT1	Q8N5D6	347 aa		11.35	□□□□□ -0.59
ATE1-208	ENST00000540606	ZNF645	Q8N7E2	425 aa		11.35	□□□□□ -0.59
ATE1-208	ENST00000540606	OR8A1	Q8NGG7	326 aa		11.35	□□□□□ -0.59
ATE1-208	ENST00000540606	OR9G1	Q8NH87	305 aa		11.35	□□□□□ -0.59
ATE1-208	ENST00000540606	SGMS2	Q8NHU3	365 aa		11.35	□□□□□ -0.59
ATE1-208	ENST00000540606	GPR146	Q96CH1	333 aa		11.35	□□□□□ -0.59
ATE1-208	ENST00000540606	METTL26	Q96S19	204 aa		11.35	□□□□□ -0.59
ATE1-208	ENST00000540606	AP5S1	Q9NUS5	200 aa		11.35	□□□□□ -0.59
ATE1-208	ENST00000540606	PLXNB2	O15031	1838 aa		11.35	□□□□□ -0.59
ATE1-208	ENST00000540606	LOC389332	A0A1B0GUA5	103 aa		11.35	□□□□□ -0.59
ATE1-208	ENST00000540606	PGP	A6NDG6	321 aa		11.35	□□□□□ -0.59
ATE1-208	ENST00000540606	MARCH11	A6NNE9	402 aa		11.35	□□□□□ -0.59
ATE1-208	ENST00000540606	MMP9	P14780	707 aa		11.35	□□□□□ -0.59
ATE1-208	ENST00000540606	P2RY4	P51582	365 aa		11.35	□□□□□ -0.59
ATE1-208	ENST00000540606	CD81	P60033	236 aa		11.35	□□□□□ -0.59
ATE1-208	ENST00000540606	G6PC2	Q9NQR9	355 aa		11.35	□□□□□ -0.59
ATE1-208	ENST00000540606	TNFSF18	Q9UNG2	199 aa		11.35	□□□□□ -0.59
ATE1-208	ENST00000540606	TNS1	Q9HBL0	1735 aa	Known RBP	11.35	□□□□□ -0.59
ATE1-208	ENST00000540606	IGKV3D-11	A0A0A0MRZ8	115 aa		11.34	□□□□□ -0.59
ATE1-208	ENST00000540606	OR2A4	O95047	310 aa		11.34	□□□□□ -0.59
ATE1-208	ENST00000540606	NDUFB4	O95168	129 aa		11.34	□□□□□ -0.59
ATE1-208	ENST00000540606	LIPF	P07098	398 aa		11.34	□□□□□ -0.59
ATE1-208	ENST00000540606	TNFSF10	P50591	281 aa		11.34	□□□□□ -0.59
ATE1-208	ENST00000540606	TMEM97	Q5BJF2	176 aa		11.34	□□□□□ -0.59
ATE1-208	ENST00000540606	DDB2	Q92466	427 aa		11.34	□□□□□ -0.59
ATE1-208	ENST00000540606	OR2A7	Q96R45	310 aa		11.34	□□□□□ -0.59
ATE1-208	ENST00000540606	CCL19	Q99731	98 aa		11.34	□□□□□ -0.59
ATE1-208	ENST00000540606	IL36RN	Q9UBH0	155 aa		11.34	□□□□□ -0.59
ATE1-208	ENST00000540606	RALY	Q9UKM9	306 aa	Known RBP	11.34	□□□□□ -0.59
ATE1-208	ENST00000540606	ACACB	O00763	2458 aa		11.34	□□□□□ -0.59
ATE1-208	ENST00000540606	CORT	O00230	105 aa		11.34	□□□□□ -0.59
ATE1-208	ENST00000540606	CD1A	P06126	327 aa		11.34	□□□□□ -0.59
ATE1-208	ENST00000540606	CENPV	Q7Z7K6	275 aa	Predicted RBP	11.34	□□□□□ -0.59
ATE1-208	ENST00000540606	SLC25A33	Q9BSK2	321 aa		11.34	□□□□□ -0.59
ATE1-208	ENST00000540606	DOCK8	Q8NF50	2099 aa		11.34	□□□□□ -0.59
ATE1-208	ENST00000540606		B9A039	149 aa		11.34	□□□□□ -0.59
ATE1-208	ENST00000540606	ANAPC16	Q96DE5	110 aa		11.34	□□□□□ -0.59
ATE1-208	ENST00000540606	RBKS	Q9H477	322 aa		11.34	□□□□□ -0.59
ATE1-208	ENST00000540606	SPG11	Q96JI7	2443 aa		11.34	□□□□□ -0.59
ATE1-208	ENST00000540606	GLRX	P35754	106 aa		11.34	□□□□□ -0.59
ATE1-208	ENST00000540606	PDLIM4	P50479	330 aa		11.34	□□□□□ -0.59
ATE1-208	ENST00000540606	PEAR1	Q5VY43	1037 aa	Predicted RBP	11.34	□□□□□ -0.59
ATE1-208	ENST00000540606	RAX	Q9Y2V3	346 aa		11.34	□□□□□ -0.59
ATE1-208	ENST00000540606	ZG16	O60844	167 aa		11.33	□□□□□ -0.6
ATE1-208	ENST00000540606	S1PR2	O95136	353 aa		11.33	□□□□□ -0.6
ATE1-208	ENST00000540606	ZNF883	P0CG24	379 aa		11.33	□□□□□ -0.6
ATE1-208	ENST00000540606	KIR2DL2	P43627	348 aa	Predicted RBP	11.33	□□□□□ -0.6
ATE1-208	ENST00000540606	HSPE1	P61604	102 aa	Known RBP	11.33	□□□□□ -0.6
ATE1-208	ENST00000540606	ELOB	Q15370	118 aa		11.33	□□□□□ -0.6
ATE1-208	ENST00000540606	CYB561D1	Q8N8Q1	229 aa		11.33	□□□□□ -0.6
ATE1-208	ENST00000540606	DCTN5	Q9BTE1	182 aa		11.33	□□□□□ -0.6
ATE1-208	ENST00000540606	TMEM56-RWDD3	S4R434	201 aa		11.33	□□□□□ -0.6
ATE1-208	ENST00000540606	TDRD15	B5MCY1	1934 aa	Known RBP	11.33	□□□□□ -0.6
ATE1-208	ENST00000540606	IGKV1D-43	A0A0B4J1Z2	117 aa		11.33	□□□□□ -0.6
ATE1-208	ENST00000540606	SS18L1	O75177	396 aa	Predicted RBP	11.33	□□□□□ -0.6
ATE1-208	ENST00000540606	IGKV3-20	P01619	116 aa		11.33	□□□□□ -0.6
ATE1-208	ENST00000540606	TMEM183B	Q1AE95	376 aa		11.33	□□□□□ -0.6
ATE1-208	ENST00000540606	TIMM23B	Q5SRD1	257 aa		11.33	□□□□□ -0.6
ATE1-208	ENST00000540606	DPPA3	Q6W0C5	159 aa		11.33	□□□□□ -0.6
ATE1-208	ENST00000540606	OR10J6P	Q8NGY7	276 aa		11.33	□□□□□ -0.6
ATE1-208	ENST00000540606	ZNF837	Q96EG3	531 aa	Predicted RBP	11.33	□□□□□ -0.6
ATE1-208	ENST00000540606	OR4C12	Q96R67	309 aa		11.33	□□□□□ -0.6
ATE1-208	ENST00000540606	CLEC7A	Q9BXN2	247 aa		11.33	□□□□□ -0.6
ATE1-208	ENST00000540606	ANKRD31	Q8N7Z5	1873 aa		11.33	□□□□□ -0.6
ATE1-208	ENST00000540606	IGHV3-49	A0A0A0MS15	119 aa		11.33	□□□□□ -0.6
ATE1-208	ENST00000540606	COX5B	P10606	129 aa		11.33	□□□□□ -0.6
ATE1-208	ENST00000540606	PTGDS	P41222	190 aa		11.33	□□□□□ -0.6
ATE1-208	ENST00000540606	PPOX	P50336	477 aa		11.33	□□□□□ -0.6
ATE1-208	ENST00000540606	SELENOT	P62341	195 aa		11.33	□□□□□ -0.6
ATE1-208	ENST00000540606	LCN2	P80188	198 aa		11.33	□□□□□ -0.6
ATE1-208	ENST00000540606	RRN3P1	Q2M238	152 aa		11.33	□□□□□ -0.6
ATE1-208	ENST00000540606	DHRS11	Q6UWP2	260 aa		11.33	□□□□□ -0.6
ATE1-208	ENST00000540606	BPIFA4P	Q86YQ2	179 aa		11.33	□□□□□ -0.6
ATE1-208	ENST00000540606	TMEM191A	Q9H0A3	160 aa		11.33	□□□□□ -0.6
ATE1-208	ENST00000540606	GSX1	Q9H4S2	264 aa	Predicted RBP	11.33	□□□□□ -0.6
ATE1-208	ENST00000540606	SCN10A	Q9Y5Y9	1956 aa		11.33	□□□□□ -0.6
ATE1-208	ENST00000540606	PTBP3	O95758	552 aa	Known RBP	11.33	□□□□□ -0.6
ATE1-208	ENST00000540606	APOBEC3A	P31941	199 aa	Predicted RBP	11.33	□□□□□ -0.6
ATE1-208	ENST00000540606	SERF2	P84101	59 aa		11.33	□□□□□ -0.6
ATE1-208	ENST00000540606		A0A1W2PS18	150 aa		11.32	□□□□□ -0.6

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