RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534143.5

CMTM1-220, Transcript of CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CMTM1, Length 781 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM1-220ENST00000534143 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
CMTM1-220ENST00000534143 ZNF286AQ9HBT8 521 aa5.05□□□□□ -1.6
CMTM1-220ENST00000534143 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
CMTM1-220ENST00000534143 TREM1Q9NP99 234 aa5.05□□□□□ -1.6
CMTM1-220ENST00000534143 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
CMTM1-220ENST00000534143 ANXA10Q9UJ72 324 aa5.05□□□□□ -1.6
CMTM1-220ENST00000534143 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa5.05□□□□□ -1.6
CMTM1-220ENST00000534143 DMRT1Q9Y5R6 373 aa5.05□□□□□ -1.6
CMTM1-220ENST00000534143 POLQO75417 2590 aa5.05□□□□□ -1.6
CMTM1-220ENST00000534143 F8P00451 2351 aa5.04□□□□□ -1.6
CMTM1-220ENST00000534143 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa5.04□□□□□ -1.6
CMTM1-220ENST00000534143 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa5.04□□□□□ -1.6
CMTM1-220ENST00000534143 KIR2DS1A0A191URI9 304 aa5.04□□□□□ -1.6
CMTM1-220ENST00000534143 TMEM218A2RU14 115 aa5.04□□□□□ -1.6
CMTM1-220ENST00000534143 FAM74A7A6NL05 159 aa5.04□□□□□ -1.6
CMTM1-220ENST00000534143 LINC00587B1AMM8 73 aa5.04□□□□□ -1.6
CMTM1-220ENST00000534143 C12orf77C9JDV5 145 aa5.04□□□□□ -1.6
CMTM1-220ENST00000534143 TSTD3H0UI37 97 aa5.04□□□□□ -1.6
CMTM1-220ENST00000534143 C15orf65H3BRN8 121 aa5.04□□□□□ -1.6
CMTM1-220ENST00000534143 M0QYG6 137 aa5.04□□□□□ -1.6
CMTM1-220ENST00000534143 GOSR2O14653 212 aa5.04□□□□□ -1.6
CMTM1-220ENST00000534143 BCL2L11O43521 198 aa5.04□□□□□ -1.6
CMTM1-220ENST00000534143 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP5.04□□□□□ -1.6
CMTM1-220ENST00000534143 OR2A4O95047 310 aa5.04□□□□□ -1.6
CMTM1-220ENST00000534143 SIX6O95475 246 aa5.04□□□□□ -1.6
CMTM1-220ENST00000534143 IFNA17P01571 189 aa5.04□□□□□ -1.6
CMTM1-220ENST00000534143 IGHV2-5P01817 119 aa5.04□□□□□ -1.6
CMTM1-220ENST00000534143 PMP2P02689 132 aa5.04□□□□□ -1.6
CMTM1-220ENST00000534143 RLN1P04808 185 aa5.04□□□□□ -1.6
CMTM1-220ENST00000534143 HEXAP06865 529 aa5.04□□□□□ -1.6
CMTM1-220ENST00000534143 TPT1P13693 172 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
CMTM1-220ENST00000534143 FOLR2P14207 255 aa5.04□□□□□ -1.6
CMTM1-220ENST00000534143 RPS2P15880 293 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
CMTM1-220ENST00000534143 NDUFB7P17568 137 aa5.04□□□□□ -1.6
CMTM1-220ENST00000534143 CXCL2P19875 107 aa5.04□□□□□ -1.6
CMTM1-220ENST00000534143 GZMHP20718 246 aa5.04□□□□□ -1.6
CMTM1-220ENST00000534143 PAX6P26367 422 aa5.04□□□□□ -1.6
CMTM1-220ENST00000534143 HRH1P35367 487 aa5.04□□□□□ -1.6
CMTM1-220ENST00000534143 KIR2DS4P43632 304 aa5.04□□□□□ -1.6
CMTM1-220ENST00000534143 NPY4RP50391 375 aa5.04□□□□□ -1.6
CMTM1-220ENST00000534143 ARHGDIBP52566 201 aa5.04□□□□□ -1.6
CMTM1-220ENST00000534143 EDDM3BP56851 147 aa5.04□□□□□ -1.6
CMTM1-220ENST00000534143 TAS2R46P59540 309 aa5.04□□□□□ -1.6
CMTM1-220ENST00000534143 HLA-DRB3P79483 266 aa5.04□□□□□ -1.6
CMTM1-220ENST00000534143 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
CMTM1-220ENST00000534143 EDDM3AQ14507 147 aa5.04□□□□□ -1.6
CMTM1-220ENST00000534143 ZNF345Q14585 488 aa5.04□□□□□ -1.6
CMTM1-220ENST00000534143 KIR2DS1Q14954 304 aa5.04□□□□□ -1.6
CMTM1-220ENST00000534143 HERPUD1Q15011 391 aa5.04□□□□□ -1.6
CMTM1-220ENST00000534143 C17orf58Q2M2W7 97 aa5.04□□□□□ -1.6
CMTM1-220ENST00000534143 FAM74A3Q4VXF1 159 aa5.04□□□□□ -1.6
CMTM1-220ENST00000534143 ACTBL2Q562R1 376 aa5.04□□□□□ -1.6
CMTM1-220ENST00000534143 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
CMTM1-220ENST00000534143 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
CMTM1-220ENST00000534143 CLEC2AQ6UVW9 174 aa5.04□□□□□ -1.6
CMTM1-220ENST00000534143 DHRS11Q6UWP2 260 aa5.04□□□□□ -1.6
CMTM1-220ENST00000534143 MOB1BQ7L9L4 216 aa5.04□□□□□ -1.6
CMTM1-220ENST00000534143 OR8B3Q8NGG8 313 aa5.04□□□□□ -1.6
CMTM1-220ENST00000534143 OR4A4PQ8NGN8 299 aa5.04□□□□□ -1.6
CMTM1-220ENST00000534143 OR5H2Q8NGV7 314 aa5.04□□□□□ -1.6
CMTM1-220ENST00000534143 CLDND2Q8NHS1 167 aa5.04□□□□□ -1.6
CMTM1-220ENST00000534143 C8orf46Q8TAG6 207 aa5.04□□□□□ -1.6
CMTM1-220ENST00000534143 C16orf92Q96LL3 132 aa5.04□□□□□ -1.6
CMTM1-220ENST00000534143 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
CMTM1-220ENST00000534143 OR2A7Q96R45 310 aa5.04□□□□□ -1.6
CMTM1-220ENST00000534143 OR8B2Q96RD0 313 aa5.04□□□□□ -1.6
CMTM1-220ENST00000534143 SLC6A7Q99884 636 aa5.04□□□□□ -1.6
CMTM1-220ENST00000534143 CABLES2Q9BTV7 478 aa5.04□□□□□ -1.6
CMTM1-220ENST00000534143 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
CMTM1-220ENST00000534143 SEC11CQ9BY50 192 aa5.04□□□□□ -1.6
CMTM1-220ENST00000534143 TOLLIPQ9H0E2 274 aa5.04□□□□□ -1.6
CMTM1-220ENST00000534143 LINC00574Q9H8X3 128 aa5.04□□□□□ -1.6
CMTM1-220ENST00000534143 TAF9BQ9HBM6 251 aa5.04□□□□□ -1.6
CMTM1-220ENST00000534143 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa5.04□□□□□ -1.6
CMTM1-220ENST00000534143 C19orf12Q9NSK7 152 aa5.04□□□□□ -1.6
CMTM1-220ENST00000534143 OR6C3Q9NZP0 311 aa5.04□□□□□ -1.6
CMTM1-220ENST00000534143 OPN4Q9UHM6 478 aa5.04□□□□□ -1.6
CMTM1-220ENST00000534143 AKAP6Q13023 2319 aa5.04□□□□□ -1.6
CMTM1-220ENST00000534143 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa5.04□□□□□ -1.6
CMTM1-220ENST00000534143 ARID1AO14497 2285 aa5.04□□□□□ -1.6
CMTM1-220ENST00000534143 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa5.04□□□□□ -1.6
CMTM1-220ENST00000534143 A0A096LNT2 108 aa5.03□□□□□ -1.6
CMTM1-220ENST00000534143 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa5.03□□□□□ -1.6
CMTM1-220ENST00000534143 hADV38S2A0JD32 116 aa5.03□□□□□ -1.6
CMTM1-220ENST00000534143 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP5.03□□□□□ -1.6
CMTM1-220ENST00000534143 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa5.03□□□□□ -1.6
CMTM1-220ENST00000534143 F2RL2O00254 374 aa5.03□□□□□ -1.6
CMTM1-220ENST00000534143 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP5.03□□□□□ -1.6
CMTM1-220ENST00000534143 UBE2CO00762 179 aa5.03□□□□□ -1.6
CMTM1-220ENST00000534143 NDUFB6O95139 128 aa5.03□□□□□ -1.6
CMTM1-220ENST00000534143 DIRAS3O95661 229 aa5.03□□□□□ -1.6
CMTM1-220ENST00000534143 HBZP02008 142 aa5.03□□□□□ -1.6
CMTM1-220ENST00000534143 CTXN2P0C2S0 81 aa5.03□□□□□ -1.6
CMTM1-220ENST00000534143 SPP1P10451 314 aa5.03□□□□□ -1.6
CMTM1-220ENST00000534143 DLX6P56179 175 aa5.03□□□□□ -1.6
CMTM1-220ENST00000534143 RPL31P62899 125 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
CMTM1-220ENST00000534143 HTD2P86397 168 aa5.03□□□□□ -1.6
CMTM1-220ENST00000534143 PAX2Q02962 417 aa5.03□□□□□ -1.6
CMTM1-220ENST00000534143 MEF2DQ14814 521 aa5.03□□□□□ -1.6
CMTM1-220ENST00000534143 CLEC12BQ2HXU8 276 aa5.03□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.1 ms