RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530579.6

NEDD8-MDP1-201, Transcript of NEDD8-MDP1 readthrough, humanhuman

TSL 2

Gene NEDD8-MDP1, Length 471 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PHB2Q99623 299 aa6.89□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 NABP2Q9BQ15 211 aa6.89□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MED28Q9H204 178 aa6.89□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PTPN13Q12923 2485 aa6.89□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 NAV2Q8IVL1 2488 aa6.89□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SPG11Q96JI7 2443 aa6.88□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa6.88□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa6.88□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 C7orf66A4D0T2 115 aa6.88□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 OOSP1A8MZH6 123 aa6.88□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RAMP3O60896 148 aa6.88□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RRASP10301 218 aa6.88□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CD99P14209 185 aa6.88□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PAX6P26367 422 aa6.88□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MC5RP33032 325 aa6.88□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SRP14P37108 136 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ARHGDIBP52566 201 aa6.88□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SRPXP78539 464 aa6.88□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TMEM187Q14656 261 aa6.88□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ANKRD55Q3KP44 614 aa6.88□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa6.88□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TMEM268Q5VZI3 342 aa6.88□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 LIAT1Q6ZQX7 453 aa6.88□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PIP4P2Q8N4L2 257 aa6.88□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TEX29Q8N6K0 151 aa6.88□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa6.88□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CD300LFQ8TDQ1 290 aa6.88□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 GLYATL2Q8WU03 294 aa6.88□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MITD1Q8WV92 249 aa6.88□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 C17orf50Q8WW18 174 aa6.88□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TMEM222Q9H0R3 208 aa6.88□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SLC35D1Q9NTN3 355 aa6.88□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 NUP50Q9UKX7 468 aa6.88□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CELSR2Q9HCU4 2923 aa6.88□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 POLQO75417 2590 aa6.88□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa6.87□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 A0A0B4J2A0 478 aa6.87□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 A0A0U1RQK1 487 aa6.87□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa6.87□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FAM25EA8MYX2 175 aa6.87□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 H0YJW9 148 aa6.87□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TIMM23O14925 209 aa6.87□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ATG12O94817 140 aa6.87□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CRYZL1O95825 349 aa6.87□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 LY6G6DO95868 133 aa6.87□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 IFNA21P01568 189 aa6.87□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 HOXB5P09067 269 aa6.87□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RPA2P15927 270 aa6.87□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 UCP1P25874 307 aa6.87□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 BRS3P32247 399 aa6.87□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 BPIFB3P59826 476 aa6.87□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RPS16P62249 146 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ZNF585BQ52M93 769 aa6.87□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SPNS3Q6ZMD2 512 aa6.87□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 OR8H3Q8N146 312 aa6.87□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 DYNAPQ8N1N2 210 aa6.87□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 OR5AN1Q8NGI8 311 aa6.87□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 OR4S2Q8NH73 311 aa6.87□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 DDB2Q92466 427 aa6.87□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TMEM56Q96MV1 263 aa6.87□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SHPKQ9UHJ6 478 aa6.87□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 WASHC3Q9Y3C0 194 aa6.87□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa6.87□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 UNC79Q9P2D8 2635 aa6.87□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ABCA12Q86UK0 2595 aa6.87□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 APCP25054 2843 aa6.86□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa6.86□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 A0A1W2PPI3 338 aa6.86□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 C5orf51A6NDU8 294 aa6.86□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 HMX3A6NHT5 357 aa6.86□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 GOSR2O14653 212 aa6.86□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SHOXO15266 292 aa6.86□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP6.86□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ADAP1O75689 374 aa6.86□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 S1PR2O95136 353 aa6.86□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CDS2O95674 445 aa6.86□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 HPRT1P00492 218 aa6.86□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 KRASP01116 189 aa6.86□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FBP1P09467 338 aa6.86□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FOSL1P15407 271 aa6.86□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 HNF1AP20823 631 aa6.86□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CD24P25063 80 aa6.86□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CD1BP29016 333 aa6.86□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RAB13P51153 203 aa6.86□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 BRWD1-AS2P59051 145 aa6.86□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ERVK-16P61578 105 aa6.86□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 KRTAP1-1Q07627 177 aa6.86□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 HES1Q14469 280 aa6.86□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 HNF4GQ14541 408 aa6.86□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FCN2Q15485 313 aa6.86□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FAM120AOSQ5T036 256 aa6.86□□□□□ -1.31
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