RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530309.1

CASP4-208, Transcript of caspase 4, human

TSL 2

Gene CASP4, Length 481 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CASP4-208	ENST00000530309	CCDC58	Q4VC31	144 aa		2.59	□□□□□ -1.99
CASP4-208	ENST00000530309	NIT1	Q86X76	327 aa		2.59	□□□□□ -1.99
CASP4-208	ENST00000530309	SLC13A5	Q86YT5	568 aa	Predicted RBP	2.59	□□□□□ -1.99
CASP4-208	ENST00000530309	SYCE1	Q8N0S2	351 aa		2.59	□□□□□ -1.99
CASP4-208	ENST00000530309	DTD1	Q8TEA8	209 aa		2.59	□□□□□ -1.99
CASP4-208	ENST00000530309	KCTD4	Q8WVF5	259 aa		2.59	□□□□□ -1.99
CASP4-208	ENST00000530309	RASSF5	Q8WWW0	418 aa		2.59	□□□□□ -1.99
CASP4-208	ENST00000530309	C12orf43	Q96C57	262 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
CASP4-208	ENST00000530309	TAS2R7	Q9NYW3	318 aa		2.59	□□□□□ -1.99
CASP4-208	ENST00000530309	RPUSD1	Q9UJJ7	312 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
CASP4-208	ENST00000530309	PHLDA3	Q9Y5J5	127 aa		2.59	□□□□□ -1.99
CASP4-208	ENST00000530309	USP54	Q70EL1	1684 aa		2.59	□□□□□ -2
CASP4-208	ENST00000530309	PKD1L3	Q7Z443	1732 aa		2.59	□□□□□ -2
CASP4-208	ENST00000530309	AKAP12	Q02952	1782 aa		2.59	□□□□□ -2
CASP4-208	ENST00000530309	KDM3B	Q7LBC6	1761 aa		2.59	□□□□□ -2
CASP4-208	ENST00000530309	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		2.59	□□□□□ -2
CASP4-208	ENST00000530309	MAP2	P11137	1827 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
CASP4-208	ENST00000530309	PSME4	Q14997	1843 aa		2.58	□□□□□ -2
CASP4-208	ENST00000530309	LAMA4	Q16363	1823 aa		2.58	□□□□□ -2
CASP4-208	ENST00000530309	PHRF1	Q9P1Y6	1649 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
CASP4-208	ENST00000530309		A0A1B0GX12	115 aa		2.58	□□□□□ -2
CASP4-208	ENST00000530309	ARGFX	A6NJG6	315 aa		2.58	□□□□□ -2
CASP4-208	ENST00000530309	PSMD12	O00232	456 aa	Predicted RBP	2.58	□□□□□ -2
CASP4-208	ENST00000530309	KPNA4	O00629	521 aa	Predicted RBP	2.58	□□□□□ -2
CASP4-208	ENST00000530309	YKT6	O15498	198 aa		2.58	□□□□□ -2
CASP4-208	ENST00000530309	CRYZL1	O95825	349 aa		2.58	□□□□□ -2
CASP4-208	ENST00000530309	SERPINA6	P08185	405 aa		2.58	□□□□□ -2
CASP4-208	ENST00000530309	UCHL3	P15374	230 aa		2.58	□□□□□ -2
CASP4-208	ENST00000530309	ZNF22	P17026	224 aa	Predicted RBP	2.58	□□□□□ -2
CASP4-208	ENST00000530309	AKR1C4	P17516	323 aa		2.58	□□□□□ -2
CASP4-208	ENST00000530309	PHB	P35232	272 aa		2.58	□□□□□ -2
CASP4-208	ENST00000530309	SLCO1A2	P46721	670 aa		2.58	□□□□□ -2
CASP4-208	ENST00000530309	HSPA13	P48723	471 aa		2.58	□□□□□ -2
CASP4-208	ENST00000530309	EIF2B2	P49770	351 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
CASP4-208	ENST00000530309	TMBIM6	P55061	237 aa		2.58	□□□□□ -2
CASP4-208	ENST00000530309	OR10A3	P58181	314 aa		2.58	□□□□□ -2
CASP4-208	ENST00000530309	GNG2	P59768	71 aa		2.58	□□□□□ -2
CASP4-208	ENST00000530309	CST6	Q15828	149 aa		2.58	□□□□□ -2
CASP4-208	ENST00000530309		Q5BKY6	102 aa		2.58	□□□□□ -2
CASP4-208	ENST00000530309	OR10J3	Q5JRS4	329 aa		2.58	□□□□□ -2
CASP4-208	ENST00000530309	C10orf91	Q5T1B1	145 aa		2.58	□□□□□ -2
CASP4-208	ENST00000530309	LPCAT4	Q643R3	524 aa		2.58	□□□□□ -2
CASP4-208	ENST00000530309	SSX7	Q7RTT5	188 aa		2.58	□□□□□ -2
CASP4-208	ENST00000530309	FAM19A3	Q7Z5A8	133 aa		2.58	□□□□□ -2
CASP4-208	ENST00000530309	CLVS1	Q8IUQ0	354 aa	Predicted RBP	2.58	□□□□□ -2
CASP4-208	ENST00000530309	OR11G2	Q8NGC1	345 aa		2.58	□□□□□ -2
CASP4-208	ENST00000530309	LHFPL5	Q8TAF8	219 aa		2.58	□□□□□ -2
CASP4-208	ENST00000530309	PDCD6IP	Q8WUM4	868 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
CASP4-208	ENST00000530309	DCUN1D1	Q96GG9	259 aa		2.58	□□□□□ -2
CASP4-208	ENST00000530309	OR8B2	Q96RD0	313 aa		2.58	□□□□□ -2
CASP4-208	ENST00000530309	PRSS27	Q9BQR3	290 aa		2.58	□□□□□ -2
CASP4-208	ENST00000530309	NDEL1	Q9GZM8	345 aa		2.58	□□□□□ -2
CASP4-208	ENST00000530309	ALX4	Q9H161	411 aa	Predicted RBP	2.58	□□□□□ -2
CASP4-208	ENST00000530309	TRABD	Q9H4I3	376 aa		2.58	□□□□□ -2
CASP4-208	ENST00000530309	KCNIP2	Q9NS61	270 aa		2.58	□□□□□ -2
CASP4-208	ENST00000530309	NKIRAS1	Q9NYS0	192 aa		2.58	□□□□□ -2
CASP4-208	ENST00000530309	SLC23A2	Q9UGH3	650 aa		2.58	□□□□□ -2
CASP4-208	ENST00000530309	LINC00588	Q9Y4M8	146 aa		2.58	□□□□□ -2
CASP4-208	ENST00000530309	CLUH	O75153	1309 aa		2.58	□□□□□ -2
CASP4-208	ENST00000530309	GLI3	P10071	1580 aa		2.57	□□□□□ -2
CASP4-208	ENST00000530309	KIF1A	Q12756	1690 aa		2.57	□□□□□ -2
CASP4-208	ENST00000530309	RREB1	Q92766	1687 aa		2.57	□□□□□ -2
CASP4-208	ENST00000530309	C8orf87	E5RJ46	101 aa		2.57	□□□□□ -2
CASP4-208	ENST00000530309		K7ERQ8	282 aa		2.57	□□□□□ -2
CASP4-208	ENST00000530309	EEF1E1	O43324	174 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
CASP4-208	ENST00000530309	ZNF73	O43830	326 aa	Predicted RBP	2.57	□□□□□ -2
CASP4-208	ENST00000530309	SNAP29	O95721	258 aa		2.57	□□□□□ -2
CASP4-208	ENST00000530309	EPPIN	O95925	133 aa		2.57	□□□□□ -2
CASP4-208	ENST00000530309	TRAPPC2	P0DI81	140 aa		2.57	□□□□□ -2
CASP4-208	ENST00000530309	TRAPPC2B	P0DI82	140 aa		2.57	□□□□□ -2
CASP4-208	ENST00000530309	NQO2	P16083	231 aa		2.57	□□□□□ -2
CASP4-208	ENST00000530309	CFL1	P23528	166 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
CASP4-208	ENST00000530309	MARCKSL1	P49006	195 aa		2.57	□□□□□ -2
CASP4-208	ENST00000530309	INPP1	P49441	399 aa		2.57	□□□□□ -2
CASP4-208	ENST00000530309	MP68	P56378	58 aa		2.57	□□□□□ -2
CASP4-208	ENST00000530309	OR4D1	Q15615	310 aa		2.57	□□□□□ -2
CASP4-208	ENST00000530309	BRMS1L	Q5PSV4	323 aa		2.57	□□□□□ -2
CASP4-208	ENST00000530309	XAF1	Q6GPH4	301 aa		2.57	□□□□□ -2
CASP4-208	ENST00000530309	PACRGL	Q8N7B6	248 aa		2.57	□□□□□ -2
CASP4-208	ENST00000530309	SUN5	Q8TC36	379 aa		2.57	□□□□□ -2
CASP4-208	ENST00000530309	PHOSPHO2	Q8TCD6	241 aa		2.57	□□□□□ -2
CASP4-208	ENST00000530309	SPPL2B	Q8TCT7	592 aa		2.57	□□□□□ -2
CASP4-208	ENST00000530309	PYDC1	Q8WXC3	89 aa		2.57	□□□□□ -2
CASP4-208	ENST00000530309	RORB	Q92753	470 aa		2.57	□□□□□ -2
CASP4-208	ENST00000530309	HIST1H2BA	Q96A08	127 aa		2.57	□□□□□ -2
CASP4-208	ENST00000530309	TAMM41	Q96BW9	452 aa		2.57	□□□□□ -2
CASP4-208	ENST00000530309	DDIT4L	Q96D03	193 aa		2.57	□□□□□ -2
CASP4-208	ENST00000530309	CXorf21	Q9HAI6	301 aa		2.57	□□□□□ -2
CASP4-208	ENST00000530309	MRPL16	Q9NX20	251 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
CASP4-208	ENST00000530309	URGCP-MRPS24	S4R325	110 aa		2.57	□□□□□ -2
CASP4-208	ENST00000530309	ROBO3	Q96MS0	1386 aa		2.57	□□□□□ -2
CASP4-208	ENST00000530309	NRXN3	Q9Y4C0	1643 aa		2.57	□□□□□ -2
CASP4-208	ENST00000530309	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
CASP4-208	ENST00000530309	TOPAZ1	Q8N9V7	1692 aa		2.57	□□□□□ -2
CASP4-208	ENST00000530309	IGHV3OR15-7	A0A075B7D8	119 aa		2.56	□□□□□ -2
CASP4-208	ENST00000530309		A0A087WXM4	84 aa		2.56	□□□□□ -2
CASP4-208	ENST00000530309	TCRBV3S1	A0A5B6	114 aa		2.56	□□□□□ -2
CASP4-208	ENST00000530309	LINC00862	A6NCI5	91 aa		2.56	□□□□□ -2
CASP4-208	ENST00000530309	CCDC160	A6NGH7	325 aa		2.56	□□□□□ -2
CASP4-208	ENST00000530309	GOLGA8R	I6L899	631 aa		2.56	□□□□□ -2

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