RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523628.5

HDAC2-216, Transcript of histone deacetylase 2, humanhuman

TSL 4

Gene HDAC2, Length 549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC2-216ENST00000523628 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 SLC35E3Q7Z769 313 aa3.3□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 C11orf42Q8N5U0 333 aa3.3□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 DRAM1Q8N682 238 aa3.3□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 C19orf18Q8NEA5 215 aa3.3□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 BBS1Q8NFJ9 593 aa3.3□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 OR5AU1Q8NGC0 362 aa3.3□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 OR4P4Q8NGL7 312 aa3.3□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 RHOXF1Q8NHV9 184 aa3.3□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 CNIH3Q8TBE1 160 aa3.3□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 ZNRF4Q8WWF5 429 aa3.3□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 BORCS5Q969J3 196 aa3.3□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 TMEM106AQ96A25 262 aa3.3□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 FGGYQ96C11 551 aa3.3□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 PELI1Q96FA3 418 aa3.3□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 C4orf36Q96KX1 117 aa3.3□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 S1PR3Q99500 378 aa3.3□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 SLC29A1Q99808 456 aa3.3□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 RASL11BQ9BPW5 248 aa3.3□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 SULT4A1Q9BR01 284 aa3.3□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 MND1Q9BWT6 205 aa3.3□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 ZNF702PQ9H963 129 aa3.3□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 TNFRSF19Q9NS68 423 aa3.3□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 BABAM2Q9NXR7 383 aa3.3□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 CALYQ9NYX4 217 aa3.3□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa3.3□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa3.3□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa3.3□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 WNK1Q9H4A3 2382 aa3.29□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 TRAV34A0A0B4J273 112 aa3.29□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 A0A0G2JLM5 398 aa3.29□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa3.29□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 OR5H14A6NHG9 310 aa3.29□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 SERPINE3A8MV23 424 aa3.29□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 AIPO00170 330 aa3.29□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 EI24O14681 340 aa3.29□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 HSD17B6O14756 317 aa3.29□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 RAB29O14966 203 aa3.29□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 CYB5BO43169 146 aa3.29□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 SC5DO75845 299 aa3.29□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 BRI3O95415 125 aa3.29□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 IGF1P05019 195 aa3.29□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 RRASP10301 218 aa3.29□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 PSKH1P11801 424 aa3.29□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 CCL3L1P16619 93 aa3.29□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 BCL3P20749 454 aa3.29□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 FUT3P21217 361 aa3.29□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 DUTP33316 252 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 SOX6P35712 828 aa3.29□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 RBM11P57052 281 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 ARPC4P59998 168 aa3.29□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 GMFBP60983 142 aa3.29□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 RUNX1Q01196 453 aa3.29□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 ZNF85Q03923 595 aa3.29□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 KLRD1Q13241 179 aa3.29□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 HES1Q14469 280 aa3.29□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 CDK5R1Q15078 307 aa3.29□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 TATDN3Q17R31 274 aa3.29□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 FAM27D1Q5T7N8 215 aa3.29□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 DDI2Q5TDH0 399 aa3.29□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 TMEM236Q5W0B7 351 aa3.29□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa3.29□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 ZNF429Q86V71 674 aa3.29□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 ZNF695Q8IW36 515 aa3.29□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 PRSS35Q8N3Z0 413 aa3.29□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 OR4M1Q8NGD0 313 aa3.29□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 OR13C9Q8NGT0 318 aa3.29□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 KCNG3Q8TAE7 436 aa3.29□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 PIFOQ8TCI5 191 aa3.29□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 MRAPQ8TCY5 172 aa3.29□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 NEK7Q8TDX7 302 aa3.29□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 TNFAIP8L1Q8WVP5 186 aa3.29□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 C4orf3Q8WVX3 66 aa3.29□□□□□ -1.88
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HDAC2-216ENST00000523628 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 TMEM80Q96HE8 168 aa3.29□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 UBE2E2Q96LR5 201 aa3.29□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 NEDD4LQ96PU5 975 aa3.29□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 B9D2Q9BPU9 175 aa3.29□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 ABCG5Q9H222 651 aa3.29□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 OR51J1Q9H342 316 aa3.29□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 ISYNA1Q9NPH2 558 aa3.29□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa3.29□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 RBFOX1Q9NWB1 397 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 SCN3BQ9NY72 215 aa3.29□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 GNG12Q9UBI6 72 aa3.29□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa3.29□□□□□ -1.88
HDAC2-216ENST00000523628 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa3.29□□□□□ -1.88
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