RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519674.1

TRPS1-209, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRPS1, Length 3,116 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-209ENST00000519674 SFRP2Q96HF1 295 aa7.19□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 ABHD14BQ96IU4 210 aa7.19□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 SIGMAR1Q99720 223 aa7.19□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 VSIRQ9H7M9 311 aa7.19□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa7.18□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 SIRPB1O00241 398 aa7.18□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 S1PR2O95136 353 aa7.18□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 C1QTNF9P0C862 333 aa7.18□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 PCOLCEQ15113 449 aa7.18□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 IGFBP7Q16270 282 aa7.18□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 PHYHD1Q5SRE7 291 aa7.18□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 FAM180AQ6UWF9 173 aa7.18□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 UEVLDQ8IX04 471 aa7.18□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 NEUROG1Q92886 237 aa7.18□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 SELENOKQ9Y6D0 94 aa7.18□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 NCOR1O75376 2440 aa7.18□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa7.18□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 NPIPB13A6NJU9 1138 aa7.18□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 NPIPB4C9JG80 1138 aa7.18□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 H0YJW9 148 aa7.18□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 LAMTOR5O43504 91 aa7.18□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 IGLL1P15814 213 aa7.18□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 SMAGPQ0VAQ4 97 aa7.18□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 IL11RAQ14626 422 aa7.18□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 WDR5BQ86VZ2 330 aa7.18□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa7.18□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 J3KRW8 73 aa7.18□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 RAB29O14966 203 aa7.18□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 TNFSF12O43508 249 aa7.18□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 TMEM50AO95807 157 aa7.18□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 MPIG6BO95866 241 aa7.18□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 ZNF728P0DKX0 622 aa7.18□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 S100GP29377 79 aa7.18□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 CDAP32320 146 aa7.18□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 CLRN1P58418 232 aa7.18□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 MFAP5Q13361 173 aa7.18□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 LPAL2Q16609 132 aa7.18□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 SLC25A53Q5H9E4 307 aa7.18□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 C19orf35Q6ZS72 473 aa7.18□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 HAPLN4Q86UW8 402 aa7.18□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 SLC25A40Q8TBP6 338 aa7.18□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 KCNS1Q96KK3 526 aa7.18□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 TMEM59Q9BXS4 323 aa7.18□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 PECRQ9BY49 303 aa7.18□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 LIME1Q9H400 295 aa7.18□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 POLR1DQ9Y2S0 133 aa7.18□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa7.17□□□□□ -1.26
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TRPS1-209ENST00000519674 HAND1O96004 215 aa7.17□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 OPRM1P35372 400 aa7.17□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 MDH2P40926 338 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 NPBWR2P48146 333 aa7.17□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 AMTP48728 403 aa7.17□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 ZNF83P51522 516 aa7.17□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 CLDN17P56750 224 aa7.17□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 MUC21Q5SSG8 566 aa7.17□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 STUMQ69YW2 141 aa7.17□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 OR2Z1Q8NG97 314 aa7.17□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 SGMS2Q8NHU3 365 aa7.17□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 RNF133Q8WVZ7 376 aa7.17□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 GTSF1LQ9H1H1 148 aa7.17□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 MOB1AQ9H8S9 216 aa7.17□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 WDR54Q9H977 334 aa7.17□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa7.17□□□□□ -1.26
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TRPS1-209ENST00000519674 IGHV1-45A0A0A0MS14 117 aa7.17□□□□□ -1.26
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TRPS1-209ENST00000519674 GAGE10A6NGK3 116 aa7.17□□□□□ -1.26
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TRPS1-209ENST00000519674 TMPRSS2O15393 492 aa7.17□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 TSPAN13O95857 204 aa7.17□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 IGHG1P01857 330 aa7.17□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 CELA3BP08861 270 aa7.17□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 CBLN1P23435 193 aa7.17□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 UCP1P25874 307 aa7.17□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 RHOBP62745 196 aa7.17□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 PSG4Q00888 419 aa7.17□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 ZNF154Q13106 437 aa7.17□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa7.17□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 OR8I2Q8N0Y5 310 aa7.17□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 OR10P1Q8NGE3 313 aa7.17□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 OR5P3Q8WZ94 311 aa7.17□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 SPSB1Q96BD6 273 aa7.17□□□□□ -1.26
TRPS1-209ENST00000519674 GNB4Q9HAV0 340 aa7.17□□□□□ -1.26
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