RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509870.1

HOXC-AS3-201, HOXC cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene HOXC-AS3, Length 544 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS3-201ENST00000509870 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP11.77□□□□□ -0.53
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PSMB9P28065 219 aa11.77□□□□□ -0.53
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CD40LGP29965 261 aa11.77□□□□□ -0.53
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CHRNA7P36544 502 aa11.77□□□□□ -0.53
HOXC-AS3-201ENST00000509870 LGALS7P47929 136 aa11.77□□□□□ -0.53
HOXC-AS3-201ENST00000509870 INSL3P51460 131 aa11.77□□□□□ -0.53
HOXC-AS3-201ENST00000509870 NDPQ00604 133 aa11.77□□□□□ -0.53
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ARFRP1Q13795 201 aa11.77□□□□□ -0.53
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ECSCRQ19T08 205 aa11.77□□□□□ -0.53
HOXC-AS3-201ENST00000509870 IGSF11Q5DX21 431 aa11.77□□□□□ -0.53
HOXC-AS3-201ENST00000509870 Q6ZS49 121 aa11.77□□□□□ -0.53
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PPP1R27Q86WC6 154 aa11.77□□□□□ -0.53
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ABHD5Q8WTS1 349 aa11.77□□□□□ -0.53
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ATG5Q9H1Y0 275 aa11.77□□□□□ -0.53
HOXC-AS3-201ENST00000509870 GNB4Q9HAV0 340 aa11.77□□□□□ -0.53
HOXC-AS3-201ENST00000509870 FBXO7Q9Y3I1 522 aa11.77□□□□□ -0.53
HOXC-AS3-201ENST00000509870 A0A075B6Q4 140 aa11.76□□□□□ -0.53
HOXC-AS3-201ENST00000509870 LUMP51884 338 aaPredicted RBP11.76□□□□□ -0.53
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ACTBL2Q562R1 376 aa11.76□□□□□ -0.53
HOXC-AS3-201ENST00000509870 NR2C2APQ86WQ0 139 aa11.76□□□□□ -0.53
HOXC-AS3-201ENST00000509870 GINS4Q9BRT9 223 aa11.76□□□□□ -0.53
HOXC-AS3-201ENST00000509870 OR2D2Q9H210 308 aa11.76□□□□□ -0.53
HOXC-AS3-201ENST00000509870 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP11.76□□□□□ -0.53
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SLC35D1Q9NTN3 355 aa11.76□□□□□ -0.53
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP11.76□□□□□ -0.53
HOXC-AS3-201ENST00000509870 STUB1Q9UNE7 303 aa11.76□□□□□ -0.53
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SSR3Q9UNL2 185 aa11.76□□□□□ -0.53
HOXC-AS3-201ENST00000509870 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP11.76□□□□□ -0.53
HOXC-AS3-201ENST00000509870 A0A0B4J203 849 aa11.75□□□□□ -0.53
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SOX15O60248 233 aa11.75□□□□□ -0.53
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SCGNO76038 276 aa11.75□□□□□ -0.53
HOXC-AS3-201ENST00000509870 RRASP10301 218 aa11.75□□□□□ -0.53
HOXC-AS3-201ENST00000509870 DTYMKP23919 212 aa11.75□□□□□ -0.53
HOXC-AS3-201ENST00000509870 LINC00205P59089 165 aa11.75□□□□□ -0.53
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CBX3Q13185 183 aa11.75□□□□□ -0.53
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ZNF260Q3ZCT1 412 aa11.75□□□□□ -0.53
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CDNFQ49AH0 187 aa11.75□□□□□ -0.53
HOXC-AS3-201ENST00000509870 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa11.75□□□□□ -0.53
HOXC-AS3-201ENST00000509870 OR5B12Q96R08 314 aa11.75□□□□□ -0.53
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CLCC1Q96S66 551 aa11.75□□□□□ -0.53
HOXC-AS3-201ENST00000509870 B9D2Q9BPU9 175 aa11.75□□□□□ -0.53
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SLA2Q9H6Q3 261 aa11.75□□□□□ -0.53
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SDHAF2Q9NX18 166 aa11.75□□□□□ -0.53
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SCOCQ9UIL1 159 aa11.75□□□□□ -0.53
HOXC-AS3-201ENST00000509870 A3GALT2U3KPV4 340 aa11.75□□□□□ -0.53
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SLC25A17O43808 307 aa11.74□□□□□ -0.53
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CA2P00918 260 aa11.74□□□□□ -0.53
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CTXN2P0C2S0 81 aa11.74□□□□□ -0.53
HOXC-AS3-201ENST00000509870 GNB1P62873 340 aa11.74□□□□□ -0.53
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PITPNAQ00169 270 aa11.74□□□□□ -0.53
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CD69Q07108 199 aa11.74□□□□□ -0.53
HOXC-AS3-201ENST00000509870 FXYD3Q14802 87 aa11.74□□□□□ -0.53
HOXC-AS3-201ENST00000509870 RTL8BQ17RB0 113 aa11.74□□□□□ -0.53
HOXC-AS3-201ENST00000509870 VAX1Q5SQQ9 334 aa11.74□□□□□ -0.53
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ZNF773Q6PK81 442 aa11.74□□□□□ -0.53
HOXC-AS3-201ENST00000509870 LFNGQ8NES3 379 aa11.74□□□□□ -0.53
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ARPC1AQ92747 370 aa11.74□□□□□ -0.53
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ADTRPQ96IZ2 230 aa11.74□□□□□ -0.53
HOXC-AS3-201ENST00000509870 DCSTAMPQ9H295 470 aa11.74□□□□□ -0.53
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP11.73□□□□□ -0.53
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CNIH1O95406 144 aa11.73□□□□□ -0.53
HOXC-AS3-201ENST00000509870 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP11.73□□□□□ -0.53
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ECI1P42126 302 aa11.73□□□□□ -0.53
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ASPHD1Q5U4P2 390 aa11.73□□□□□ -0.53
HOXC-AS3-201ENST00000509870 HACD4Q5VWC8 232 aa11.73□□□□□ -0.53
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ZNF429Q86V71 674 aa11.73□□□□□ -0.53
HOXC-AS3-201ENST00000509870 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP11.73□□□□□ -0.53
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MAFIPQ8WZ33 124 aa11.73□□□□□ -0.53
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TMEM68Q96MH6 324 aa11.73□□□□□ -0.53
HOXC-AS3-201ENST00000509870 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP11.73□□□□□ -0.53
HOXC-AS3-201ENST00000509870 DAPK2Q9UIK4 370 aa11.73□□□□□ -0.53
HOXC-AS3-201ENST00000509870 LINC01619G3V211 115 aa11.72□□□□□ -0.53
HOXC-AS3-201ENST00000509870 H3BUA1 57 aa11.72□□□□□ -0.53
HOXC-AS3-201ENST00000509870 OVOL1O14753 267 aa11.72□□□□□ -0.53
HOXC-AS3-201ENST00000509870 IGLV2-23P01705 113 aa11.72□□□□□ -0.53
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TMEM177Q53S58 311 aa11.72□□□□□ -0.53
HOXC-AS3-201ENST00000509870 DCUN1D4Q92564 292 aa11.72□□□□□ -0.53
HOXC-AS3-201ENST00000509870 HARBI1Q96MB7 349 aa11.72□□□□□ -0.53
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa11.72□□□□□ -0.53
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SMIM30A4D0T7 59 aa11.71□□□□□ -0.53
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SHOXO15266 292 aa11.71□□□□□ -0.53
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SLC22A5O76082 557 aa11.71□□□□□ -0.53
HOXC-AS3-201ENST00000509870 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.53
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CRYGBP07316 175 aa11.71□□□□□ -0.53
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SCAND1P57086 179 aa11.71□□□□□ -0.53
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TPPP2P59282 170 aa11.71□□□□□ -0.53
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SFXN4Q6P4A7 337 aa11.71□□□□□ -0.53
HOXC-AS3-201ENST00000509870 BVESQ8NE79 360 aa11.71□□□□□ -0.53
HOXC-AS3-201ENST00000509870 GRPEL2Q8TAA5 225 aa11.71□□□□□ -0.53
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CASTOR1Q8WTX7 329 aa11.71□□□□□ -0.53
HOXC-AS3-201ENST00000509870 RHOVQ96L33 236 aa11.71□□□□□ -0.53
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MS4A10Q96PG2 267 aa11.71□□□□□ -0.53
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TPSG1Q9NRR2 321 aa11.71□□□□□ -0.53
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP11.71□□□□□ -0.53
HOXC-AS3-201ENST00000509870 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.53
HOXC-AS3-201ENST00000509870 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.53
HOXC-AS3-201ENST00000509870 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa11.7□□□□□ -0.54
HOXC-AS3-201ENST00000509870 A0A0G2JLM5 398 aa11.7□□□□□ -0.54
HOXC-AS3-201ENST00000509870 BRI3O95415 125 aa11.7□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.5 ms