RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509368.6

PDE4D-218, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 2,809 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-218ENST00000509368 CRYBA4P53673 196 aa1.6□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 RAB5BP61020 215 aa1.6□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 RPS28P62857 69 aaKnown RBP1.6□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 SMIM21Q3B7S5 101 aa1.6□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 FAM162BQ5T6X4 162 aa1.6□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP1.6□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 ZNF329Q86UD4 541 aa1.6□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 COMMD7Q86VX2 200 aa1.6□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 GAPTQ8N292 157 aa1.6□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 ZNF283Q8N7M2 679 aa1.6□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 LINC01555Q8NAE3 123 aa1.6□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 OR8J3Q8NGG0 315 aa1.6□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP1.6□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 MARC2Q969Z3 335 aa1.6□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 TESCQ96BS2 214 aa1.6□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 C20orf144Q9BQM9 153 aa1.6□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 HMG20AQ9NP66 347 aa1.6□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 MMP26Q9NRE1 261 aa1.6□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 UBQLN4Q9NRR5 601 aa1.6□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 PSG8Q9UQ74 426 aa1.6□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP1.6□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP1.6□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 BPTFQ12830 3046 aa1.6□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 HCFC1P51610 2035 aa1.6□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa1.6□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 SMIM9A6NGZ8 99 aa1.6□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 C5orf58C9J3I9 102 aa1.6□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 F5H768 121 aa1.6□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 H7C1H1 209 aa1.6□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP1.6□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 SOX14O95416 240 aa1.6□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 GPR75O95800 540 aa1.6□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 MT-CO2P00403 227 aa1.6□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 BPGMP07738 259 aa1.6□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 GABRA1P14867 456 aa1.6□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 TCN2P20062 427 aa1.6□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 PRSS3P35030 304 aa1.6□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP1.6□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP1.6□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 HPCAP84074 193 aa1.6□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 INCA1Q0VD86 236 aa1.6□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 RGNQ15493 299 aa1.6□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 OR10J3Q5JRS4 329 aa1.6□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 EPGNQ6UW88 154 aa1.6□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa1.6□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 OR6V1Q8N148 313 aa1.6□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 GPD1LQ8N335 351 aa1.6□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 GATD1Q8NB37 220 aa1.6□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 ZNF439Q8NDP4 499 aa1.6□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 SLC26A10Q8NG04 563 aa1.6□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 OR4X1Q8NH49 305 aa1.6□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 ZNRF2Q8NHG8 242 aa1.6□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP1.6□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP1.6□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 ASB17Q8WXJ9 295 aa1.6□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 RAB8BQ92930 207 aa1.6□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP1.6□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 VGLL1Q99990 258 aa1.6□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 PDCD10Q9BUL8 212 aa1.6□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa1.6□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 IFT46Q9NQC8 304 aa1.6□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 SLC7A10Q9NS82 523 aa1.6□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 PRO0628Q9UI54 55 aa1.6□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP1.6□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 HEY1Q9Y5J3 304 aa1.6□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 PCDH15Q96QU1 1955 aa1.6□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa1.59□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa1.59□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 FAM168BA1KXE4 195 aa1.59□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 PLAC8L1A1L4L8 177 aa1.59□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa1.59□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 ZNF878C9JN71 531 aa1.59□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 J3QKU1 62 aa1.59□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 J3QT63 122 aa1.59□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 GPR31O00270 319 aa1.59□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 FAAHO00519 579 aa1.59□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 FOXH1O75593 365 aa1.59□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 ADAP1O75689 374 aa1.59□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 ATG12O94817 140 aa1.59□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 S1PR2O95136 353 aa1.59□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP1.59□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 DBIP07108 87 aaKnown RBP1.59□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 GIPP09681 153 aaPredicted RBP1.59□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 RD3LP0DJH9 198 aa1.59□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 OR13C7P0DN81 318 aa1.59□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 DDTP30046 118 aa1.59□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 RBP2P50120 134 aa1.59□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 OR10A3P58181 314 aa1.59□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 DNAJB13P59910 316 aa1.59□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 TBPL1P62380 186 aa1.59□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 UBE2SQ16763 222 aa1.59□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 CEACAM16Q2WEN9 425 aa1.59□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 FAM78AQ5JUQ0 283 aa1.59□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 TMEM78Q5T7P6 136 aa1.59□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 TMEM205Q6UW68 189 aa1.59□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 OR6N1Q8NGY5 312 aa1.59□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 OR13C6PQ8NH95 151 aa1.59□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 RHOXF1Q8NHV9 184 aa1.59□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 JOSD2Q8TAC2 188 aa1.59□□□□□ -2.15
PDE4D-218ENST00000509368 DNAJC9Q8WXX5 260 aa1.59□□□□□ -2.15
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