RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504450.1

SH3BP2-209, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 844 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-209ENST00000504450 LINC01560Q8TB33 94 aa8.91□□□□□ -0.98
SH3BP2-209ENST00000504450 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa8.91□□□□□ -0.98
SH3BP2-209ENST00000504450 IFI27L2Q9H2X8 130 aa8.91□□□□□ -0.98
SH3BP2-209ENST00000504450 GNG12Q9UBI6 72 aa8.91□□□□□ -0.98
SH3BP2-209ENST00000504450 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
SH3BP2-209ENST00000504450 PPIAL4EA0A075B759 164 aa8.9□□□□□ -0.98
SH3BP2-209ENST00000504450 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa8.9□□□□□ -0.98
SH3BP2-209ENST00000504450 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa8.9□□□□□ -0.98
SH3BP2-209ENST00000504450 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
SH3BP2-209ENST00000504450 LRRC30A6NM36 301 aa8.9□□□□□ -0.98
SH3BP2-209ENST00000504450 B9A039 149 aa8.9□□□□□ -0.98
SH3BP2-209ENST00000504450 PPIAL4DF5H284 164 aa8.9□□□□□ -0.98
SH3BP2-209ENST00000504450 SLC31A2O15432 143 aa8.9□□□□□ -0.98
SH3BP2-209ENST00000504450 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP8.9□□□□□ -0.989e-7■■■■■ 28.3
SH3BP2-209ENST00000504450 SIAH2O43255 324 aa8.9□□□□□ -0.98
SH3BP2-209ENST00000504450 MED6O75586 246 aa8.9□□□□□ -0.98
SH3BP2-209ENST00000504450 NXPH3O95157 252 aa8.9□□□□□ -0.98
SH3BP2-209ENST00000504450 CD3EP07766 207 aa8.9□□□□□ -0.98
SH3BP2-209ENST00000504450 PPIAL4FP0DN26 164 aa8.9□□□□□ -0.98
SH3BP2-209ENST00000504450 GPR12P47775 334 aa8.9□□□□□ -0.98
SH3BP2-209ENST00000504450 SULT1A1P50225 295 aa8.9□□□□□ -0.98
SH3BP2-209ENST00000504450 DYNLT3P51808 116 aa8.9□□□□□ -0.98
SH3BP2-209ENST00000504450 LINC00205P59089 165 aa8.9□□□□□ -0.98
SH3BP2-209ENST00000504450 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
SH3BP2-209ENST00000504450 LTC4SQ16873 150 aa8.9□□□□□ -0.98
SH3BP2-209ENST00000504450 AARDQ4LEZ3 155 aa8.9□□□□□ -0.98
SH3BP2-209ENST00000504450 CT45A1Q5HYN5 189 aa8.9□□□□□ -0.98
SH3BP2-209ENST00000504450 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
SH3BP2-209ENST00000504450 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
SH3BP2-209ENST00000504450 CT45A3Q8NHU0 189 aa8.9□□□□□ -0.98
SH3BP2-209ENST00000504450 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
SH3BP2-209ENST00000504450 CD300LFQ8TDQ1 290 aa8.9□□□□□ -0.98
SH3BP2-209ENST00000504450 MS4A5Q9H3V2 200 aa8.9□□□□□ -0.98
SH3BP2-209ENST00000504450 NARFLQ9H6Q4 476 aa8.9□□□□□ -0.98
SH3BP2-209ENST00000504450 KCNJ16Q9NPI9 418 aa8.9□□□□□ -0.98
SH3BP2-209ENST00000504450 TMEM106BQ9NUM4 274 aa8.9□□□□□ -0.98
SH3BP2-209ENST00000504450 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa8.9□□□□□ -0.98
SH3BP2-209ENST00000504450 HSPB7Q9UBY9 170 aa8.9□□□□□ -0.98
SH3BP2-209ENST00000504450 CACFD1Q9UGQ2 172 aa8.9□□□□□ -0.98
SH3BP2-209ENST00000504450 NDRG3Q9UGV2 375 aa8.9□□□□□ -0.98
SH3BP2-209ENST00000504450 NUP50Q9UKX7 468 aa8.9□□□□□ -0.98
SH3BP2-209ENST00000504450 LAMP3Q9UQV4 416 aa8.9□□□□□ -0.98
SH3BP2-209ENST00000504450 PPIAL4AQ9Y536 164 aa8.9□□□□□ -0.98
SH3BP2-209ENST00000504450 NOTCH2Q04721 2471 aa8.9□□□□□ -0.99
SH3BP2-209ENST00000504450 TEX15Q9BXT5 2789 aa8.9□□□□□ -0.99
SH3BP2-209ENST00000504450 DSCAMO60469 2012 aa8.89□□□□□ -0.99
SH3BP2-209ENST00000504450 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
SH3BP2-209ENST00000504450 TMEM218A2RU14 115 aa8.89□□□□□ -0.99
SH3BP2-209ENST00000504450 NKX6-3A6NJ46 265 aa8.89□□□□□ -0.99
SH3BP2-209ENST00000504450 FAM90A27PA6NNH2 459 aa8.89□□□□□ -0.99
SH3BP2-209ENST00000504450 CST7O76096 145 aa8.89□□□□□ -0.99
SH3BP2-209ENST00000504450 PLAUP00749 431 aa8.89□□□□□ -0.99
SH3BP2-209ENST00000504450 KRASP01116 189 aa8.89□□□□□ -0.99
SH3BP2-209ENST00000504450 OMGP23515 440 aa8.89□□□□□ -0.99
SH3BP2-209ENST00000504450 G6PCP35575 357 aa8.89□□□□□ -0.99
SH3BP2-209ENST00000504450 RAB5CP51148 216 aa8.89□□□□□ -0.99
SH3BP2-209ENST00000504450 RAB7AP51149 207 aa8.89□□□□□ -0.99
SH3BP2-209ENST00000504450 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
SH3BP2-209ENST00000504450 TNFRSF9Q07011 255 aa8.89□□□□□ -0.99
SH3BP2-209ENST00000504450 ZNF266Q14584 549 aa8.89□□□□□ -0.99
SH3BP2-209ENST00000504450 CDSNQ15517 529 aa8.89□□□□□ -0.99
SH3BP2-209ENST00000504450 OR2B11Q5JQS5 317 aa8.89□□□□□ -0.99
SH3BP2-209ENST00000504450 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
SH3BP2-209ENST00000504450 HAPLN4Q86UW8 402 aa8.89□□□□□ -0.99
SH3BP2-209ENST00000504450 C1orf87Q8N0U7 546 aa8.89□□□□□ -0.99
SH3BP2-209ENST00000504450 OR10A7Q8NGE5 316 aa8.89□□□□□ -0.99
SH3BP2-209ENST00000504450 OR5C1Q8NGR4 320 aa8.89□□□□□ -0.99
SH3BP2-209ENST00000504450 DDB2Q92466 427 aa8.89□□□□□ -0.99
SH3BP2-209ENST00000504450 ZNF251Q9BRH9 671 aa8.89□□□□□ -0.99
SH3BP2-209ENST00000504450 TMEM204Q9BSN7 226 aa8.89□□□□□ -0.99
SH3BP2-209ENST00000504450 SH3BGRL3Q9H299 93 aa8.89□□□□□ -0.99
SH3BP2-209ENST00000504450 RBKSQ9H477 322 aa8.89□□□□□ -0.99
SH3BP2-209ENST00000504450 SAP30LQ9HAJ7 183 aa8.89□□□□□ -0.99
SH3BP2-209ENST00000504450 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
SH3BP2-209ENST00000504450 PSENENQ9NZ42 101 aa8.89□□□□□ -0.99
SH3BP2-209ENST00000504450 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
SH3BP2-209ENST00000504450 ARID1AO14497 2285 aa8.89□□□□□ -0.99
SH3BP2-209ENST00000504450 DYSFO75923 2080 aa8.89□□□□□ -0.99
SH3BP2-209ENST00000504450 POLEQ07864 2286 aa8.88□□□□□ -0.99
SH3BP2-209ENST00000504450 hADV38S2A0JD32 116 aa8.88□□□□□ -0.99
SH3BP2-209ENST00000504450 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa8.88□□□□□ -0.99
SH3BP2-209ENST00000504450 M0R1X1 148 aa8.88□□□□□ -0.99
SH3BP2-209ENST00000504450 SCO1O75880 301 aa8.88□□□□□ -0.99
SH3BP2-209ENST00000504450 MMP23AO75900 390 aa8.88□□□□□ -0.99
SH3BP2-209ENST00000504450 CRYZL1O95825 349 aa8.88□□□□□ -0.99
SH3BP2-209ENST00000504450 HPRT1P00492 218 aa8.88□□□□□ -0.99
SH3BP2-209ENST00000504450 ATP6V0CP27449 155 aa8.88□□□□□ -0.99
SH3BP2-209ENST00000504450 GRNP28799 593 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
SH3BP2-209ENST00000504450 KIR2DS2P43631 304 aa8.88□□□□□ -0.99
SH3BP2-209ENST00000504450 ARHGDIBP52566 201 aa8.88□□□□□ -0.99
SH3BP2-209ENST00000504450 UBE2KP61086 200 aa8.88□□□□□ -0.99
SH3BP2-209ENST00000504450 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
SH3BP2-209ENST00000504450 ARL16Q0P5N6 197 aa8.88□□□□□ -0.99
SH3BP2-209ENST00000504450 CLINT1Q14677 625 aa8.88□□□□□ -0.99
SH3BP2-209ENST00000504450 RPL39P5Q59GN2 51 aa8.88□□□□□ -0.99
SH3BP2-209ENST00000504450 C10orf91Q5T1B1 145 aa8.88□□□□□ -0.99
SH3BP2-209ENST00000504450 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa8.88□□□□□ -0.99
SH3BP2-209ENST00000504450 Q6ZRG5 221 aa8.88□□□□□ -0.99
SH3BP2-209ENST00000504450 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa8.88□□□□□ -0.99
SH3BP2-209ENST00000504450 ATP5SQ99766 215 aa8.88□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.1 ms