RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495327.1

RBM28-208, Transcript of RNA binding motif protein 28, human

TSL 2

Gene RBM28, Length 395 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM28-208	ENST00000495327	IGKV1-16	P04430	117 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBM28-208	ENST00000495327	CTXN2	P0C2S0	81 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBM28-208	ENST00000495327	GNG2	P59768	71 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBM28-208	ENST00000495327	TAGLN	Q01995	201 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
RBM28-208	ENST00000495327	PLGLA	Q15195	96 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBM28-208	ENST00000495327	PSG5	Q15238	335 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBM28-208	ENST00000495327	FOXB2	Q5VYV0	432 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBM28-208	ENST00000495327	LCNL1	Q6ZST4	164 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBM28-208	ENST00000495327	CROCCP3	Q8IVE0	287 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBM28-208	ENST00000495327	TCTEX1D1	Q8N7M0	179 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBM28-208	ENST00000495327	MINDY2	Q8NBR6	621 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBM28-208	ENST00000495327	NUDCD2	Q8WVJ2	157 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBM28-208	ENST00000495327	C4orf3	Q8WVX3	66 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBM28-208	ENST00000495327	YIPF6	Q96EC8	236 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBM28-208	ENST00000495327	C5orf30	Q96GV9	206 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBM28-208	ENST00000495327	SLC35D1	Q9NTN3	355 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBM28-208	ENST00000495327		G3V318	75 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBM28-208	ENST00000495327	LINC00205	P59089	165 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBM28-208	ENST00000495327	CX3CL1	P78423	397 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBM28-208	ENST00000495327	IDNK	Q5T6J7	187 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBM28-208	ENST00000495327	OR5H6	Q8NGV6	325 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBM28-208	ENST00000495327	RAX2	Q96IS3	184 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBM28-208	ENST00000495327	UBE2E2	Q96LR5	201 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBM28-208	ENST00000495327	MCRIP2	Q9BUT9	160 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
RBM28-208	ENST00000495327	AURKAIP1	Q9NWT8	199 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
RBM28-208	ENST00000495327	METTL1	Q9UBP6	276 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
RBM28-208	ENST00000495327	SPATA2	Q9UM82	520 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBM28-208	ENST00000495327	FBXO7	Q9Y3I1	522 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBM28-208	ENST00000495327	WSB1	Q9Y6I7	421 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBM28-208	ENST00000495327	CCL24	O00175	119 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RBM28-208	ENST00000495327	AIRE	O43918	545 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RBM28-208	ENST00000495327	SSX5	O60225	188 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RBM28-208	ENST00000495327	RPS16	P62249	146 aa	Known RBP	10.4	□□□□□ -0.74
RBM28-208	ENST00000495327	EGFEM1P	Q0D2K5	195 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RBM28-208	ENST00000495327	FHL3	Q13643	280 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RBM28-208	ENST00000495327	ECSCR	Q19T08	205 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RBM28-208	ENST00000495327	CNIH2	Q6PI25	160 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RBM28-208	ENST00000495327	FLYWCH2	Q96CP2	140 aa	Known RBP	10.4	□□□□□ -0.74
RBM28-208	ENST00000495327	ADTRP	Q96IZ2	230 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RBM28-208	ENST00000495327	FOXA2	Q9Y261	457 aa	Predicted RBP	10.4	□□□□□ -0.74
RBM28-208	ENST00000495327	RBM7	Q9Y580	266 aa	Known RBP	10.4	□□□□□ -0.74
RBM28-208	ENST00000495327	FCN1	O00602	326 aa		10.39	□□□□□ -0.75
RBM28-208	ENST00000495327	CA2	P00918	260 aa		10.39	□□□□□ -0.75
RBM28-208	ENST00000495327	IGLV2-23	P01705	113 aa		10.39	□□□□□ -0.75
RBM28-208	ENST00000495327	PRB2	P02812	416 aa	Predicted RBP	10.39	□□□□□ -0.75
RBM28-208	ENST00000495327	RRAS	P10301	218 aa		10.39	□□□□□ -0.75
RBM28-208	ENST00000495327	DUT	P33316	252 aa	Known RBP	10.39	□□□□□ -0.75
RBM28-208	ENST00000495327	LGALS7	P47929	136 aa		10.39	□□□□□ -0.75
RBM28-208	ENST00000495327	RUNX1	Q01196	453 aa		10.39	□□□□□ -0.75
RBM28-208	ENST00000495327	TMEM267	Q0VDI3	215 aa	Predicted RBP	10.39	□□□□□ -0.75
RBM28-208	ENST00000495327	CBX3	Q13185	183 aa		10.39	□□□□□ -0.75
RBM28-208	ENST00000495327	KIAA0141	Q14154	515 aa	Predicted RBP	10.39	□□□□□ -0.75
RBM28-208	ENST00000495327	RTL8B	Q17RB0	113 aa		10.39	□□□□□ -0.75
RBM28-208	ENST00000495327	DEFB136	Q30KP8	78 aa		10.39	□□□□□ -0.75
RBM28-208	ENST00000495327	TMEM177	Q53S58	311 aa		10.39	□□□□□ -0.75
RBM28-208	ENST00000495327	PYHIN1	Q6K0P9	492 aa		10.39	□□□□□ -0.75
RBM28-208	ENST00000495327	TMEM65	Q6PI78	240 aa		10.39	□□□□□ -0.75
RBM28-208	ENST00000495327	ZNF562	Q6V9R5	426 aa		10.39	□□□□□ -0.75
RBM28-208	ENST00000495327	ZNF645	Q8N7E2	425 aa		10.39	□□□□□ -0.75
RBM28-208	ENST00000495327	ZNF491	Q8N8L2	437 aa		10.39	□□□□□ -0.75
RBM28-208	ENST00000495327	DDB2	Q92466	427 aa		10.39	□□□□□ -0.75
RBM28-208	ENST00000495327	DPF1	Q92782	380 aa		10.39	□□□□□ -0.75
RBM28-208	ENST00000495327	HARBI1	Q96MB7	349 aa		10.39	□□□□□ -0.75
RBM28-208	ENST00000495327	ST6GALNAC5	Q9BVH7	336 aa		10.39	□□□□□ -0.75
RBM28-208	ENST00000495327	ANXA10	Q9UJ72	324 aa		10.39	□□□□□ -0.75
RBM28-208	ENST00000495327	VSIG4	Q9Y279	399 aa		10.39	□□□□□ -0.75
RBM28-208	ENST00000495327	OR2W1	Q9Y3N9	320 aa		10.39	□□□□□ -0.75
RBM28-208	ENST00000495327	NUBP2	Q9Y5Y2	271 aa		10.39	□□□□□ -0.75
RBM28-208	ENST00000495327		A0A1W2PN81	502 aa		10.38	□□□□□ -0.75
RBM28-208	ENST00000495327	SLC25A17	O43808	307 aa		10.38	□□□□□ -0.75
RBM28-208	ENST00000495327	SOX15	O60248	233 aa		10.38	□□□□□ -0.75
RBM28-208	ENST00000495327	SLC22A5	O76082	557 aa		10.38	□□□□□ -0.75
RBM28-208	ENST00000495327	HLA-DQB1	P01920	261 aa		10.38	□□□□□ -0.75
RBM28-208	ENST00000495327	CRYGB	P07316	175 aa		10.38	□□□□□ -0.75
RBM28-208	ENST00000495327	EGR2	P11161	476 aa	Predicted RBP	10.38	□□□□□ -0.75
RBM28-208	ENST00000495327	CHRNA7	P36544	502 aa		10.38	□□□□□ -0.75
RBM28-208	ENST00000495327	TGFBR1	P36897	503 aa		10.38	□□□□□ -0.75
RBM28-208	ENST00000495327	RAB9A	P51151	201 aa		10.38	□□□□□ -0.75
RBM28-208	ENST00000495327	LUM	P51884	338 aa	Predicted RBP	10.38	□□□□□ -0.75
RBM28-208	ENST00000495327	AKIRIN2	Q53H80	203 aa		10.38	□□□□□ -0.75
RBM28-208	ENST00000495327	PPP1R27	Q86WC6	154 aa		10.38	□□□□□ -0.75
RBM28-208	ENST00000495327	OR5M8	Q8NGP6	311 aa		10.38	□□□□□ -0.75
RBM28-208	ENST00000495327	ARPC1A	Q92747	370 aa		10.38	□□□□□ -0.75
RBM28-208	ENST00000495327	DUX3	Q96PT4	197 aa		10.38	□□□□□ -0.75
RBM28-208	ENST00000495327	KLK15	Q9H2R5	256 aa		10.38	□□□□□ -0.75
RBM28-208	ENST00000495327	DIABLO	Q9NR28	239 aa		10.38	□□□□□ -0.75
RBM28-208	ENST00000495327	TPSG1	Q9NRR2	321 aa		10.38	□□□□□ -0.75
RBM28-208	ENST00000495327	TRAV18	A0A075B6X5	111 aa		10.37	□□□□□ -0.75
RBM28-208	ENST00000495327	LINC00473	A8K010	186 aa		10.37	□□□□□ -0.75
RBM28-208	ENST00000495327		I3L521	148 aa		10.37	□□□□□ -0.75
RBM28-208	ENST00000495327	TUSC2	O75896	110 aa		10.37	□□□□□ -0.75
RBM28-208	ENST00000495327	NFYA	P23511	347 aa	Predicted RBP	10.37	□□□□□ -0.75
RBM28-208	ENST00000495327	RPS19	P39019	145 aa	Known RBP	10.37	□□□□□ -0.75
RBM28-208	ENST00000495327	SSBP2	P81877	361 aa	Predicted RBP	10.37	□□□□□ -0.75
RBM28-208	ENST00000495327	ACTBL2	Q562R1	376 aa		10.37	□□□□□ -0.75
RBM28-208	ENST00000495327	UBE2NL	Q5JXB2	153 aa		10.37	□□□□□ -0.75
RBM28-208	ENST00000495327	OVCH2	Q7RTZ1	564 aa		10.37	□□□□□ -0.75
RBM28-208	ENST00000495327	BVES	Q8NE79	360 aa		10.37	□□□□□ -0.75
RBM28-208	ENST00000495327	BEST4	Q8NFU0	473 aa		10.37	□□□□□ -0.75
RBM28-208	ENST00000495327	MRAP	Q8TCY5	172 aa		10.37	□□□□□ -0.75

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