RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491302.1

PTPRC-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-212ENST00000491302 TAS2R45P59539 299 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-212ENST00000491302 SNAP25P60880 206 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-212ENST00000491302 CXCR4P61073 352 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-212ENST00000491302 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-212ENST00000491302 OR11H1Q8NG94 326 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-212ENST00000491302 OR2D3Q8NGH3 330 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-212ENST00000491302 OR4K13Q8NH42 304 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-212ENST00000491302 PIGXQ8TBF5 258 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-212ENST00000491302 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-212ENST00000491302 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-212ENST00000491302 SNX12Q9UMY4 172 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-212ENST00000491302 PHLPP1O60346 1717 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-212ENST00000491302 VWDEQ8N2E2 1590 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-212ENST00000491302 SHANK3Q9BYB0 1731 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-212ENST00000491302 OTOFQ9HC10 1997 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-212ENST00000491302 KDM5BQ9UGL1 1544 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-212ENST00000491302 M0QZ92 97 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-212ENST00000491302 TYMSP04818 313 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-212ENST00000491302 BLVRAP53004 296 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-212ENST00000491302 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-212ENST00000491302 BTN3A2P78410 334 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF117Q03924 483 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-212ENST00000491302 RASL11AQ6T310 242 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-212ENST00000491302 TUBA4BQ9H853 241 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-212ENST00000491302 PARVGQ9HBI0 331 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-212ENST00000491302 HES4Q9HCC6 221 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-212ENST00000491302 CACNA1SQ13698 1873 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-212ENST00000491302 NOTCH2Q04721 2471 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-212ENST00000491302 MAP3K5Q99683 1374 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-212ENST00000491302 C3P01024 1663 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-212ENST00000491302 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-212ENST00000491302 FAM135BQ49AJ0 1406 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRC-212ENST00000491302 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRC-212ENST00000491302 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRC-212ENST00000491302 GRIFINA4D1Z8 144 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRC-212ENST00000491302 LRRN3E7EW58 273 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRC-212ENST00000491302 ESDP10768 282 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRC-212ENST00000491302 CPMP14384 443 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRC-212ENST00000491302 NPPCP23582 126 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRC-212ENST00000491302 DDTP30046 118 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRC-212ENST00000491302 TSPEAR-AS2P59090 65 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRC-212ENST00000491302 GNA13Q14344 377 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRC-212ENST00000491302 MNS1Q8NEH6 495 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRC-212ENST00000491302 OR5C1Q8NGR4 320 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRC-212ENST00000491302 FNDC9Q8TBE3 224 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRC-212ENST00000491302 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP3.61□□□□□ -1.83
PTPRC-212ENST00000491302 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP3.61□□□□□ -1.83
PTPRC-212ENST00000491302 AICDAQ9GZX7 198 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRC-212ENST00000491302 C11orf1Q9H5F2 150 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRC-212ENST00000491302 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP3.61□□□□□ -1.83
PTPRC-212ENST00000491302 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
PTPRC-212ENST00000491302 KDM5CP41229 1560 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRC-212ENST00000491302 SDHAF1A6NFY7 115 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRC-212ENST00000491302 H0Y980 276 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRC-212ENST00000491302 NIPSNAP2O75323 286 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRC-212ENST00000491302 LY6HO94772 140 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRC-212ENST00000491302 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP3.6□□□□□ -1.83
PTPRC-212ENST00000491302 DAPP51397 102 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRC-212ENST00000491302 RPS24P62847 133 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
PTPRC-212ENST00000491302 CDKL4Q5MAI5 379 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRC-212ENST00000491302 NAA40Q86UY6 237 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRC-212ENST00000491302 MBOAT7Q96N66 472 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRC-212ENST00000491302 POLR1DQ9Y2S0 133 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRC-212ENST00000491302 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
PTPRC-212ENST00000491302 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRC-212ENST00000491302 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
PTPRC-212ENST00000491302 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
PTPRC-212ENST00000491302 EP400Q96L91 3159 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRC-212ENST00000491302 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRC-212ENST00000491302 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRC-212ENST00000491302 MT-CO2P00403 227 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRC-212ENST00000491302 CBR1P16152 277 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRC-212ENST00000491302 RWDD2BP57060 319 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRC-212ENST00000491302 HLA-DRB3P79483 266 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRC-212ENST00000491302 LRRN1Q6UXK5 716 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRC-212ENST00000491302 MAP1LC3AQ9H492 121 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRC-212ENST00000491302 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
PTPRC-212ENST00000491302 DOCK6Q96HP0 2047 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRC-212ENST00000491302 UTRNP46939 3433 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRC-212ENST00000491302 PTPRGP23470 1445 aa3.59□□□□□ -1.84
PTPRC-212ENST00000491302 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.84
PTPRC-212ENST00000491302 WDR90Q96KV7 1748 aa3.58□□□□□ -1.84
PTPRC-212ENST00000491302 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
PTPRC-212ENST00000491302 J3QRE1 110 aa3.58□□□□□ -1.84
PTPRC-212ENST00000491302 SLC17A3O00476 420 aa3.58□□□□□ -1.84
PTPRC-212ENST00000491302 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
PTPRC-212ENST00000491302 HLA-DRAP01903 254 aa3.58□□□□□ -1.84
PTPRC-212ENST00000491302 CD36P16671 472 aa3.58□□□□□ -1.84
PTPRC-212ENST00000491302 GZMHP20718 246 aa3.58□□□□□ -1.84
PTPRC-212ENST00000491302 PPP1R1AQ13522 171 aa3.58□□□□□ -1.84
PTPRC-212ENST00000491302 FAM229BQ4G0N7 80 aa3.58□□□□□ -1.84
PTPRC-212ENST00000491302 SLC51BQ86UW2 128 aa3.58□□□□□ -1.84
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF567Q8N184 647 aa3.58□□□□□ -1.84
PTPRC-212ENST00000491302 OR4C16Q8NGL9 310 aa3.58□□□□□ -1.84
PTPRC-212ENST00000491302 JOSD2Q8TAC2 188 aa3.58□□□□□ -1.84
PTPRC-212ENST00000491302 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa3.58□□□□□ -1.84
PTPRC-212ENST00000491302 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa3.58□□□□□ -1.84
PTPRC-212ENST00000491302 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa3.58□□□□□ -1.84
PTPRC-212ENST00000491302 ADGBQ8N7X0 1667 aa3.58□□□□□ -1.84
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