RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487538.1

GTPBP1-211, Transcript of GTP binding protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene GTPBP1, Length 358 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTPBP1-211ENST00000487538 DAOP14920 347 aa8.54□□□□□ -1.04
GTPBP1-211ENST00000487538 DUTP33316 252 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
GTPBP1-211ENST00000487538 KIR2DS2P43631 304 aa8.54□□□□□ -1.04
GTPBP1-211ENST00000487538 ZNF134P52741 427 aa8.54□□□□□ -1.04
GTPBP1-211ENST00000487538 KRTAP10-9P60411 292 aa8.54□□□□□ -1.04
GTPBP1-211ENST00000487538 VAMP2P63027 116 aa8.54□□□□□ -1.04
GTPBP1-211ENST00000487538 ID3Q02535 119 aa8.54□□□□□ -1.04
GTPBP1-211ENST00000487538 CT45A1Q5HYN5 189 aa8.54□□□□□ -1.04
GTPBP1-211ENST00000487538 OR2B11Q5JQS5 317 aa8.54□□□□□ -1.04
GTPBP1-211ENST00000487538 CLLU1Q5K131 121 aa8.54□□□□□ -1.04
GTPBP1-211ENST00000487538 GPR157Q5UAW9 335 aa8.54□□□□□ -1.04
GTPBP1-211ENST00000487538 ALKAL2Q6UX46 152 aa8.54□□□□□ -1.04
GTPBP1-211ENST00000487538 ZNF439Q8NDP4 499 aa8.54□□□□□ -1.04
GTPBP1-211ENST00000487538 DMBX1Q8NFW5 382 aa8.54□□□□□ -1.04
GTPBP1-211ENST00000487538 CT45A3Q8NHU0 189 aa8.54□□□□□ -1.04
GTPBP1-211ENST00000487538 STOML3Q8TAV4 291 aa8.54□□□□□ -1.04
GTPBP1-211ENST00000487538 LEAP2Q969E1 77 aa8.54□□□□□ -1.04
GTPBP1-211ENST00000487538 RAB39BQ96DA2 213 aa8.54□□□□□ -1.04
GTPBP1-211ENST00000487538 PHYHIPLQ96FC7 376 aa8.54□□□□□ -1.04
GTPBP1-211ENST00000487538 TIMD4Q96H15 378 aa8.54□□□□□ -1.04
GTPBP1-211ENST00000487538 C11orf1Q9H5F2 150 aa8.54□□□□□ -1.04
GTPBP1-211ENST00000487538 UBTD1Q9HAC8 227 aa8.54□□□□□ -1.04
GTPBP1-211ENST00000487538 CACNG5Q9UF02 275 aa8.54□□□□□ -1.04
GTPBP1-211ENST00000487538 LAMP3Q9UQV4 416 aa8.54□□□□□ -1.04
GTPBP1-211ENST00000487538 MMP24Q9Y5R2 645 aa8.54□□□□□ -1.04
GTPBP1-211ENST00000487538 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa8.54□□□□□ -1.04
GTPBP1-211ENST00000487538 A0A1W2PPR1 153 aa8.53□□□□□ -1.04
GTPBP1-211ENST00000487538 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa8.53□□□□□ -1.04
GTPBP1-211ENST00000487538 A6NNC1 897 aa8.53□□□□□ -1.04
GTPBP1-211ENST00000487538 LINC00473A8K010 186 aa8.53□□□□□ -1.04
GTPBP1-211ENST00000487538 RAB29O14966 203 aa8.53□□□□□ -1.04
GTPBP1-211ENST00000487538 SSSCA1O60232 199 aa8.53□□□□□ -1.04
GTPBP1-211ENST00000487538 S1PR2O95136 353 aa8.53□□□□□ -1.04
GTPBP1-211ENST00000487538 GOSR1O95249 250 aa8.53□□□□□ -1.04
GTPBP1-211ENST00000487538 IGHV3-7P01780 117 aa8.53□□□□□ -1.04
GTPBP1-211ENST00000487538 TPT1P13693 172 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
GTPBP1-211ENST00000487538 CCL3L1P16619 93 aa8.53□□□□□ -1.04
GTPBP1-211ENST00000487538 GNG10P50151 68 aa8.53□□□□□ -1.04
GTPBP1-211ENST00000487538 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP8.53□□□□□ -1.04
GTPBP1-211ENST00000487538 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
GTPBP1-211ENST00000487538 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
GTPBP1-211ENST00000487538 TMEM155Q4W5P6 130 aa8.53□□□□□ -1.04
GTPBP1-211ENST00000487538 RPL39P5Q59GN2 51 aa8.53□□□□□ -1.04
GTPBP1-211ENST00000487538 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
GTPBP1-211ENST00000487538 UTF1Q5T230 341 aa8.53□□□□□ -1.04
GTPBP1-211ENST00000487538 AVPI1Q5T686 147 aa8.53□□□□□ -1.04
GTPBP1-211ENST00000487538 HEPN1Q6WQI6 88 aa8.53□□□□□ -1.04
GTPBP1-211ENST00000487538 RAB1CQ92928 201 aa8.53□□□□□ -1.04
GTPBP1-211ENST00000487538 ADTRPQ96IZ2 230 aa8.53□□□□□ -1.04
GTPBP1-211ENST00000487538 GSX2Q9BZM3 304 aa8.53□□□□□ -1.04
GTPBP1-211ENST00000487538 CYTL1Q9NRR1 136 aa8.53□□□□□ -1.04
GTPBP1-211ENST00000487538 COA4Q9NYJ1 87 aa8.53□□□□□ -1.04
GTPBP1-211ENST00000487538 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa8.53□□□□□ -1.04
GTPBP1-211ENST00000487538 PKDREJQ9NTG1 2253 aa8.52□□□□□ -1.04
GTPBP1-211ENST00000487538 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa8.52□□□□□ -1.05
GTPBP1-211ENST00000487538 A0A1W2PPE3 182 aa8.52□□□□□ -1.05
GTPBP1-211ENST00000487538 LINC00862A6NCI5 91 aa8.52□□□□□ -1.05
GTPBP1-211ENST00000487538 GPR37O15354 613 aa8.52□□□□□ -1.05
GTPBP1-211ENST00000487538 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP8.52□□□□□ -1.05
GTPBP1-211ENST00000487538 PPIHO43447 177 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
GTPBP1-211ENST00000487538 PROP1O75360 226 aa8.52□□□□□ -1.05
GTPBP1-211ENST00000487538 P0C879 139 aa8.52□□□□□ -1.05
GTPBP1-211ENST00000487538 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
GTPBP1-211ENST00000487538 THBS3P49746 956 aa8.52□□□□□ -1.05
GTPBP1-211ENST00000487538 DLX6P56179 175 aa8.52□□□□□ -1.05
GTPBP1-211ENST00000487538 BRWD1-AS2P59051 145 aa8.52□□□□□ -1.05
GTPBP1-211ENST00000487538 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa8.52□□□□□ -1.05
GTPBP1-211ENST00000487538 NCR3LG1Q68D85 454 aa8.52□□□□□ -1.05
GTPBP1-211ENST00000487538 Q6ZRM9 215 aa8.52□□□□□ -1.05
GTPBP1-211ENST00000487538 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
GTPBP1-211ENST00000487538 LYG1Q8N1E2 194 aa8.52□□□□□ -1.05
GTPBP1-211ENST00000487538 OR2C3Q8N628 320 aa8.52□□□□□ -1.05
GTPBP1-211ENST00000487538 OR8B3Q8NGG8 313 aa8.52□□□□□ -1.05
GTPBP1-211ENST00000487538 OR8B2Q96RD0 313 aa8.52□□□□□ -1.05
GTPBP1-211ENST00000487538 SLC25A31Q9H0C2 315 aa8.52□□□□□ -1.05
GTPBP1-211ENST00000487538 MAGT1Q9H0U3 335 aa8.52□□□□□ -1.05
GTPBP1-211ENST00000487538 CHODLQ9H9P2 273 aa8.52□□□□□ -1.05
GTPBP1-211ENST00000487538 FBXL17Q9UF56 701 aa8.52□□□□□ -1.05
GTPBP1-211ENST00000487538 MIOXQ9UGB7 285 aa8.52□□□□□ -1.05
GTPBP1-211ENST00000487538 DSCAML1Q8TD84 2053 aa8.51□□□□□ -1.05
GTPBP1-211ENST00000487538 A0A1W2PPH5 198 aa8.51□□□□□ -1.05
GTPBP1-211ENST00000487538 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
GTPBP1-211ENST00000487538 FAM90A26D6RGX4 464 aa8.51□□□□□ -1.05
GTPBP1-211ENST00000487538 FCGR3BO75015 233 aa8.51□□□□□ -1.05
GTPBP1-211ENST00000487538 LY6HO94772 140 aa8.51□□□□□ -1.05
GTPBP1-211ENST00000487538 NXPH3O95157 252 aa8.51□□□□□ -1.05
GTPBP1-211ENST00000487538 HPRT1P00492 218 aa8.51□□□□□ -1.05
GTPBP1-211ENST00000487538 KRASP01116 189 aa8.51□□□□□ -1.05
GTPBP1-211ENST00000487538 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
GTPBP1-211ENST00000487538 S100A1P23297 94 aa8.51□□□□□ -1.05
GTPBP1-211ENST00000487538 G6PCP35575 357 aa8.51□□□□□ -1.05
GTPBP1-211ENST00000487538 CAV2P51636 162 aa8.51□□□□□ -1.05
GTPBP1-211ENST00000487538 TMEM33P57088 247 aa8.51□□□□□ -1.05
GTPBP1-211ENST00000487538 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP8.51□□□□□ -1.05
GTPBP1-211ENST00000487538 ZNF841Q6ZN19 808 aa8.51□□□□□ -1.05
GTPBP1-211ENST00000487538 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa8.51□□□□□ -1.05
GTPBP1-211ENST00000487538 BAP18Q8IXM2 172 aa8.51□□□□□ -1.05
GTPBP1-211ENST00000487538 ODF3L1Q8IXM7 274 aa8.51□□□□□ -1.05
GTPBP1-211ENST00000487538 C8orf31Q8N9H6 132 aa8.51□□□□□ -1.05
GTPBP1-211ENST00000487538 OR4S2Q8NH73 311 aa8.51□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 346 ms