RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482439.6

TBC1D15-208, Transcript of TBC1 domain family member 15, human

TSL 5

Gene TBC1D15, Length 863 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TBC1D15-208	ENST00000482439	ODF3B	A8MYP8	253 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TBC1D15-208	ENST00000482439	BUB1B-PAK6	H3BSN5	160 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TBC1D15-208	ENST00000482439	B3GALNT1	O75752	331 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TBC1D15-208	ENST00000482439	SIX6	O95475	246 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TBC1D15-208	ENST00000482439	IGKV1-39	P01597	117 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TBC1D15-208	ENST00000482439	IGKV1D-39	P04432	117 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TBC1D15-208	ENST00000482439	ZNF16	P17020	682 aa	Predicted RBP	11.42	□□□□□ -0.58
TBC1D15-208	ENST00000482439	HOXB4	P17483	251 aa	Predicted RBP	11.42	□□□□□ -0.58
TBC1D15-208	ENST00000482439	LGI3	Q8N145	548 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TBC1D15-208	ENST00000482439	LINC01356	Q8N9X3	169 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TBC1D15-208	ENST00000482439	ZNF383	Q8NA42	475 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TBC1D15-208	ENST00000482439	OR10X1	Q8NGY0	326 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TBC1D15-208	ENST00000482439	TMEM186	Q96B77	213 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TBC1D15-208	ENST00000482439	WDR89	Q96FK6	387 aa	Predicted RBP	11.42	□□□□□ -0.58
TBC1D15-208	ENST00000482439	S1PR3	Q99500	378 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TBC1D15-208	ENST00000482439	PCGF1	Q9BSM1	259 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TBC1D15-208	ENST00000482439	TRAV20	A0A0B4J274	112 aa		11.41	□□□□□ -0.58
TBC1D15-208	ENST00000482439	PFDN1	O60925	122 aa		11.41	□□□□□ -0.58
TBC1D15-208	ENST00000482439	ADAP1	O75689	374 aa		11.41	□□□□□ -0.58
TBC1D15-208	ENST00000482439	OR2A4	O95047	310 aa		11.41	□□□□□ -0.58
TBC1D15-208	ENST00000482439	IGHV4-31	P0DP07	118 aa		11.41	□□□□□ -0.58
TBC1D15-208	ENST00000482439	LPAR6	P43657	344 aa		11.41	□□□□□ -0.58
TBC1D15-208	ENST00000482439	DCAF12L2	Q5VW00	463 aa		11.41	□□□□□ -0.58
TBC1D15-208	ENST00000482439	FAM71F2	Q6NXP2	309 aa		11.41	□□□□□ -0.58
TBC1D15-208	ENST00000482439	LYZL2	Q7Z4W2	148 aa		11.41	□□□□□ -0.58
TBC1D15-208	ENST00000482439	TCTEX1D1	Q8N7M0	179 aa		11.41	□□□□□ -0.58
TBC1D15-208	ENST00000482439	TCTEX1D2	Q8WW35	142 aa		11.41	□□□□□ -0.58
TBC1D15-208	ENST00000482439	OR2A7	Q96R45	310 aa		11.41	□□□□□ -0.58
TBC1D15-208	ENST00000482439	RAB18	Q9NP72	206 aa		11.41	□□□□□ -0.58
TBC1D15-208	ENST00000482439	FAM212B	Q9NTI7	297 aa	Predicted RBP	11.41	□□□□□ -0.58
TBC1D15-208	ENST00000482439	CCS	O14618	274 aa		11.4	□□□□□ -0.58
TBC1D15-208	ENST00000482439	GOSR2	O14653	212 aa		11.4	□□□□□ -0.58
TBC1D15-208	ENST00000482439	RAMP3	O60896	148 aa		11.4	□□□□□ -0.58
TBC1D15-208	ENST00000482439	CCNK	O75909	580 aa		11.4	□□□□□ -0.58
TBC1D15-208	ENST00000482439	ARG1	P05089	322 aa		11.4	□□□□□ -0.58
TBC1D15-208	ENST00000482439	HOXB5	P09067	269 aa		11.4	□□□□□ -0.58
TBC1D15-208	ENST00000482439	THBS3	P49746	956 aa		11.4	□□□□□ -0.58
TBC1D15-208	ENST00000482439	H2BFS	P57053	126 aa		11.4	□□□□□ -0.58
TBC1D15-208	ENST00000482439	CD83	Q01151	205 aa		11.4	□□□□□ -0.58
TBC1D15-208	ENST00000482439	SRSF4	Q08170	494 aa	Known RBP	11.4	□□□□□ -0.58
TBC1D15-208	ENST00000482439	CATR1	Q13166	79 aa		11.4	□□□□□ -0.58
TBC1D15-208	ENST00000482439	TMEM249	Q2WGJ8	235 aa		11.4	□□□□□ -0.58
TBC1D15-208	ENST00000482439	TMEM268	Q5VZI3	342 aa		11.4	□□□□□ -0.58
TBC1D15-208	ENST00000482439	AKAP14	Q86UN6	197 aa		11.4	□□□□□ -0.58
TBC1D15-208	ENST00000482439	PDZD9	Q8IXQ8	264 aa		11.4	□□□□□ -0.58
TBC1D15-208	ENST00000482439	SPAG16	Q8N0X2	631 aa		11.4	□□□□□ -0.58
TBC1D15-208	ENST00000482439	IL22RA2	Q969J5	263 aa		11.4	□□□□□ -0.58
TBC1D15-208	ENST00000482439	ADTRP	Q96IZ2	230 aa		11.4	□□□□□ -0.58
TBC1D15-208	ENST00000482439	NABP2	Q9BQ15	211 aa		11.4	□□□□□ -0.58
TBC1D15-208	ENST00000482439	MRPL20	Q9BYC9	149 aa	Known RBP	11.4	□□□□□ -0.58
TBC1D15-208	ENST00000482439	ZNF436	Q9C0F3	470 aa	Predicted RBP	11.4	□□□□□ -0.58
TBC1D15-208	ENST00000482439	RANGRF	Q9HD47	186 aa	Predicted RBP	11.4	□□□□□ -0.58
TBC1D15-208	ENST00000482439	LIN7C	Q9NUP9	197 aa	Known RBP	11.4	□□□□□ -0.58
TBC1D15-208	ENST00000482439	HIF1AN	Q9NWT6	349 aa		11.4	□□□□□ -0.58
TBC1D15-208	ENST00000482439	VPS13C	Q709C8	3753 aa		11.4	□□□□□ -0.59
TBC1D15-208	ENST00000482439		A0A1W2PRD5	423 aa		11.39	□□□□□ -0.59
TBC1D15-208	ENST00000482439		A0A1W2PRF3	423 aa		11.39	□□□□□ -0.59
TBC1D15-208	ENST00000482439		A0A1W2PRM7	423 aa		11.39	□□□□□ -0.59
TBC1D15-208	ENST00000482439	MPTX1	A8MV57	137 aa		11.39	□□□□□ -0.59
TBC1D15-208	ENST00000482439	SERPINE2	P07093	398 aa		11.39	□□□□□ -0.59
TBC1D15-208	ENST00000482439	IL3RA	P26951	378 aa		11.39	□□□□□ -0.59
TBC1D15-208	ENST00000482439	REG1B	P48304	166 aa		11.39	□□□□□ -0.59
TBC1D15-208	ENST00000482439	UBE2E1	P51965	193 aa		11.39	□□□□□ -0.59
TBC1D15-208	ENST00000482439	SRPX	P78539	464 aa		11.39	□□□□□ -0.59
TBC1D15-208	ENST00000482439	OR2B11	Q5JQS5	317 aa		11.39	□□□□□ -0.59
TBC1D15-208	ENST00000482439	GGNBP1	Q5YKI7	109 aa		11.39	□□□□□ -0.59
TBC1D15-208	ENST00000482439	ZNF695	Q8IW36	515 aa		11.39	□□□□□ -0.59
TBC1D15-208	ENST00000482439	CIART	Q8N365	385 aa	Predicted RBP	11.39	□□□□□ -0.59
TBC1D15-208	ENST00000482439	OR5AN1	Q8NGI8	311 aa		11.39	□□□□□ -0.59
TBC1D15-208	ENST00000482439	OR5M8	Q8NGP6	311 aa		11.39	□□□□□ -0.59
TBC1D15-208	ENST00000482439	LHX4	Q969G2	390 aa		11.39	□□□□□ -0.59
TBC1D15-208	ENST00000482439	RBMXL1	Q96E39	390 aa	Known RBP	11.39	□□□□□ -0.59
TBC1D15-208	ENST00000482439	AJUBA	Q96IF1	538 aa		11.39	□□□□□ -0.59
TBC1D15-208	ENST00000482439	FYTTD1	Q96QD9	318 aa	Known RBP	11.39	□□□□□ -0.59
TBC1D15-208	ENST00000482439	DPM3	Q9P2X0	92 aa		11.39	□□□□□ -0.59
TBC1D15-208	ENST00000482439	PRPF8	Q6P2Q9	2335 aa	Known RBP eCLIP	11.38	□□□□□ -0.59
TBC1D15-208	ENST00000482439	CENPVL3	A0A0U1RRI6	287 aa		11.38	□□□□□ -0.59
TBC1D15-208	ENST00000482439	RBFOX2	O43251	390 aa	Known RBP eCLIP	11.38	□□□□□ -0.59
TBC1D15-208	ENST00000482439	FCGR3B	O75015	233 aa		11.38	□□□□□ -0.59
TBC1D15-208	ENST00000482439	AVP	P01185	164 aa		11.38	□□□□□ -0.59
TBC1D15-208	ENST00000482439	GAPDH	P04406	335 aa	Known RBP	11.38	□□□□□ -0.59
TBC1D15-208	ENST00000482439	GATA3	P23771	443 aa		11.38	□□□□□ -0.59
TBC1D15-208	ENST00000482439	HTR1D	P28221	377 aa		11.38	□□□□□ -0.59
TBC1D15-208	ENST00000482439	GZMK	P49863	264 aa		11.38	□□□□□ -0.59
TBC1D15-208	ENST00000482439	ZNF816	Q0VGE8	651 aa	Predicted RBP	11.38	□□□□□ -0.59
TBC1D15-208	ENST00000482439	TPTE2P1	Q5T6R2	138 aa		11.38	□□□□□ -0.59
TBC1D15-208	ENST00000482439	LHFPL4	Q7Z7J7	247 aa		11.38	□□□□□ -0.59
TBC1D15-208	ENST00000482439	SLC35G3	Q8N808	338 aa		11.38	□□□□□ -0.59
TBC1D15-208	ENST00000482439	CD300LF	Q8TDQ1	290 aa		11.38	□□□□□ -0.59
TBC1D15-208	ENST00000482439	RBPMS	Q93062	196 aa	Known RBP	11.38	□□□□□ -0.59
TBC1D15-208	ENST00000482439	SEC22A	Q96IW7	307 aa		11.38	□□□□□ -0.59
TBC1D15-208	ENST00000482439	OR10C1	Q96KK4	312 aa		11.38	□□□□□ -0.59
TBC1D15-208	ENST00000482439	C7orf69	Q9H7B7	122 aa		11.38	□□□□□ -0.59
TBC1D15-208	ENST00000482439	PRELID3B	Q9Y3B1	194 aa		11.38	□□□□□ -0.59
TBC1D15-208	ENST00000482439	AMMECR1	Q9Y4X0	333 aa	Predicted RBP	11.38	□□□□□ -0.59
TBC1D15-208	ENST00000482439	AUP1	Q9Y679	476 aa		11.38	□□□□□ -0.59
TBC1D15-208	ENST00000482439	C13orf42	A0A1B0GVH6	325 aa		11.37	□□□□□ -0.59
TBC1D15-208	ENST00000482439	DUXB	A0A1W2PPF3	345 aa		11.37	□□□□□ -0.59
TBC1D15-208	ENST00000482439	LEUTX	A8MZ59	168 aa		11.37	□□□□□ -0.59
TBC1D15-208	ENST00000482439		H0YJW9	148 aa		11.37	□□□□□ -0.59

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