RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478954.1

STRADBP1-201, Transcript of STE20-related kinase adaptor beta pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene STRADBP1, Length 1,281 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRADBP1-201ENST00000478954 EFNA4P52798 201 aa3.85□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 CRISP3P54108 245 aa3.85□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 LYZP61626 148 aa3.85□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 IFITM2Q01629 132 aa3.85□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 CDK10Q15131 360 aa3.85□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 THEM4Q5T1C6 240 aa3.85□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 ARL9Q6T311 187 aa3.85□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP3.85□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 ZNF485Q8NCK3 441 aa3.85□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 APCDD1LQ8NCL9 501 aa3.85□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa3.85□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 OR11H7Q8NGC8 314 aa3.85□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 KCTD4Q8WVF5 259 aa3.85□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 CANT1Q8WVQ1 401 aa3.85□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 C22orf15Q8WYQ4 148 aa3.85□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 RORBQ92753 470 aa3.85□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 RDH5Q92781 318 aa3.85□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP3.85□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 FAM19A4Q96LR4 140 aa3.85□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 RBBP8Q99708 897 aa3.85□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 APOL4Q9BPW4 351 aa3.85□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 DHRS9Q9BPW9 319 aa3.85□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 C20orf144Q9BQM9 153 aa3.85□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP3.85□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 C12orf10Q9HB07 376 aa3.85□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 ISYNA1Q9NPH2 558 aa3.85□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 MMP26Q9NRE1 261 aa3.85□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP3.85□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP3.85□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 ORC6Q9Y5N6 252 aa3.85□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 HSPG2P98160 4391 aa3.85□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa3.84□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 C5orf63A6NC05 138 aa3.84□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 PRORSD1PA6NEY8 169 aa3.84□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 M0QXV9 152 aa3.84□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 SGCEO43556 437 aa3.84□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 INSP01308 110 aa3.84□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 TRAPPC2P0DI81 140 aa3.84□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 TRAPPC2BP0DI82 140 aa3.84□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 CRHBPP24387 322 aa3.84□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 GGT2P36268 569 aa3.84□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 P2RX1P51575 399 aa3.84□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 OR4D2P58180 307 aa3.84□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 TPBGQ13641 420 aa3.84□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 TMEM183BQ1AE95 376 aa3.84□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP3.84□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 CCDC58Q4VC31 144 aa3.84□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 COQ5Q5HYK3 327 aa3.84□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 DEFB121Q5J5C9 76 aa3.84□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 SLC25A30Q5SVS4 291 aa3.84□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 IDO2Q6ZQW0 420 aa3.84□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 SLC51BQ86UW2 128 aa3.84□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 SLC30A8Q8IWU4 369 aa3.84□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 TMEM183AQ8IXX5 376 aa3.84□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 BOD1L2Q8IYS8 172 aa3.84□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 CA13Q8N1Q1 262 aa3.84□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 C11orf42Q8N5U0 333 aa3.84□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa3.84□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 LINC01555Q8NAE3 123 aa3.84□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 PLPP5Q8NEB5 264 aa3.84□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 MCFD2Q8NI22 146 aa3.84□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 JOSD2Q8TAC2 188 aa3.84□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 PPP1R36Q96LQ0 422 aa3.84□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP3.84□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 SLC25A2Q9BXI2 301 aa3.84□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 UGT2B28Q9BY64 529 aa3.84□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 HDHD2Q9H0R4 259 aa3.84□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 ARV1Q9H2C2 271 aa3.84□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 DSN1Q9H410 356 aa3.84□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 TNFRSF19Q9NS68 423 aa3.84□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 CBLN4Q9NTU7 201 aa3.84□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 SCN3BQ9NY72 215 aa3.84□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 USE1Q9NZ43 259 aa3.84□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 ACOT9Q9Y305 439 aa3.84□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 TPRKBQ9Y3C4 175 aa3.84□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP3.84□□□□□ -1.8
STRADBP1-201ENST00000478954 SMIM26A0A096LP01 95 aa3.83□□□□□ -1.8
STRADBP1-201ENST00000478954 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa3.83□□□□□ -1.8
STRADBP1-201ENST00000478954 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa3.83□□□□□ -1.8
STRADBP1-201ENST00000478954 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP3.83□□□□□ -1.8
STRADBP1-201ENST00000478954 LINC01619G3V211 115 aa3.83□□□□□ -1.8
STRADBP1-201ENST00000478954 CCRL2O00421 344 aa3.83□□□□□ -1.8
STRADBP1-201ENST00000478954 EMC8O43402 210 aa3.83□□□□□ -1.8
STRADBP1-201ENST00000478954 GATCO43716 136 aaKnown RBP3.83□□□□□ -1.8
STRADBP1-201ENST00000478954 TPST1O60507 370 aa3.83□□□□□ -1.8
STRADBP1-201ENST00000478954 OR2J2O76002 312 aa3.83□□□□□ -1.8
STRADBP1-201ENST00000478954 SNAP29O95721 258 aa3.83□□□□□ -1.8
STRADBP1-201ENST00000478954 PIRTP0C851 137 aa3.83□□□□□ -1.8
STRADBP1-201ENST00000478954 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP3.83□□□□□ -1.8
STRADBP1-201ENST00000478954 RAB3AP20336 220 aa3.83□□□□□ -1.8
STRADBP1-201ENST00000478954 DNAJB13P59910 316 aa3.83□□□□□ -1.8
STRADBP1-201ENST00000478954 UBE2G2P60604 165 aa3.83□□□□□ -1.8
STRADBP1-201ENST00000478954 GNB2P62879 340 aa3.83□□□□□ -1.8
STRADBP1-201ENST00000478954 KIR2DS1Q14954 304 aa3.83□□□□□ -1.8
STRADBP1-201ENST00000478954 GUSBP1Q15486 140 aa3.83□□□□□ -1.8
STRADBP1-201ENST00000478954 OR1Q1Q15612 314 aa3.83□□□□□ -1.8
STRADBP1-201ENST00000478954 ZNF404Q494X3 552 aa3.83□□□□□ -1.8
STRADBP1-201ENST00000478954 C5orf47Q569G3 176 aa3.83□□□□□ -1.8
STRADBP1-201ENST00000478954 HES5Q5TA89 166 aa3.83□□□□□ -1.8
STRADBP1-201ENST00000478954 XAF1Q6GPH4 301 aa3.83□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.1 ms