RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477812.1

ACTB-210, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 2

Gene ACTB, Length 820 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-210ENST00000477812 Q8N6K4 173 aa15.97■□□□□ 0.15
ACTB-210ENST00000477812 AKR1E2Q96JD6 320 aa15.97■□□□□ 0.15
ACTB-210ENST00000477812 JMJD8Q96S16 334 aa15.97■□□□□ 0.15
ACTB-210ENST00000477812 GPHA2Q96T91 129 aa15.97■□□□□ 0.15
ACTB-210ENST00000477812 MCUBQ9NWR8 336 aa15.97■□□□□ 0.15
ACTB-210ENST00000477812 BTBD17A6NE02 478 aa15.96■□□□□ 0.15
ACTB-210ENST00000477812 CHST1O43916 411 aa15.96■□□□□ 0.15
ACTB-210ENST00000477812 UPK1BO75841 260 aa15.96■□□□□ 0.15
ACTB-210ENST00000477812 IFNA2P01563 188 aa15.96■□□□□ 0.15
ACTB-210ENST00000477812 IGKV1D-33P01593 117 aa15.96■□□□□ 0.15
ACTB-210ENST00000477812 IGKV1-33P01594 117 aa15.96■□□□□ 0.15
ACTB-210ENST00000477812 BTCP35070 178 aa15.96■□□□□ 0.15
ACTB-210ENST00000477812 THBS3P49746 956 aa15.96■□□□□ 0.15
ACTB-210ENST00000477812 IFITM3Q01628 133 aa15.96■□□□□ 0.15
ACTB-210ENST00000477812 IDO2Q6ZQW0 420 aa15.96■□□□□ 0.15
ACTB-210ENST00000477812 SLC38A6Q8IZM9 456 aa15.96■□□□□ 0.15
ACTB-210ENST00000477812 CAPSLQ8WWF8 208 aa15.96■□□□□ 0.15
ACTB-210ENST00000477812 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
ACTB-210ENST00000477812 TNFRSF19Q9NS68 423 aa15.96■□□□□ 0.15
ACTB-210ENST00000477812 FAM106CPP0CH98 169 aa15.95■□□□□ 0.14
ACTB-210ENST00000477812 INPP1P49441 399 aa15.95■□□□□ 0.14
ACTB-210ENST00000477812 BRWD1-AS2P59051 145 aa15.95■□□□□ 0.14
ACTB-210ENST00000477812 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
ACTB-210ENST00000477812 LY6EQ16553 131 aa15.95■□□□□ 0.14
ACTB-210ENST00000477812 LPCAT3Q6P1A2 487 aa15.95■□□□□ 0.14
ACTB-210ENST00000477812 ZNF66Q6ZN08 573 aa15.95■□□□□ 0.14
ACTB-210ENST00000477812 TMEM219Q86XT9 240 aa15.95■□□□□ 0.14
ACTB-210ENST00000477812 MARCH1Q8TCQ1 289 aa15.95■□□□□ 0.14
ACTB-210ENST00000477812 BORCS5Q969J3 196 aa15.95■□□□□ 0.14
ACTB-210ENST00000477812 ADTRPQ96IZ2 230 aa15.95■□□□□ 0.14
ACTB-210ENST00000477812 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
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ACTB-210ENST00000477812 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa15.94■□□□□ 0.14
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ACTB-210ENST00000477812 TNFSF12O43508 249 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTB-210ENST00000477812 GPR137BO60478 399 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTB-210ENST00000477812 IGKV1-16P04430 117 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTB-210ENST00000477812 MC5RP33032 325 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTB-210ENST00000477812 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
ACTB-210ENST00000477812 LIAT1Q6ZQX7 453 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTB-210ENST00000477812 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
ACTB-210ENST00000477812 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTB-210ENST00000477812 TBC1D24Q9ULP9 559 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTB-210ENST00000477812 ATRQ13535 2644 aa15.93■□□□□ 0.14
ACTB-210ENST00000477812 NAP1L6A6NFF2 107 aa15.93■□□□□ 0.14
ACTB-210ENST00000477812 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
ACTB-210ENST00000477812 MOSP00540 346 aa15.93■□□□□ 0.14
ACTB-210ENST00000477812 PI3P19957 117 aa15.93■□□□□ 0.14
ACTB-210ENST00000477812 ECI1P42126 302 aa15.93■□□□□ 0.14
ACTB-210ENST00000477812 RND3P61587 244 aa15.93■□□□□ 0.14
ACTB-210ENST00000477812 PHLDA2Q53GA4 152 aa15.93■□□□□ 0.14
ACTB-210ENST00000477812 KCTD9Q7L273 389 aa15.93■□□□□ 0.14
ACTB-210ENST00000477812 PDPNQ86YL7 162 aa15.93■□□□□ 0.14
ACTB-210ENST00000477812 OR2T10Q8NGZ9 312 aa15.93■□□□□ 0.14
ACTB-210ENST00000477812 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
ACTB-210ENST00000477812 RITA1Q96K30 269 aa15.93■□□□□ 0.14
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ACTB-210ENST00000477812 C16orf87Q6PH81 154 aa15.92■□□□□ 0.14
ACTB-210ENST00000477812 CMTM1Q8IZ96 169 aa15.92■□□□□ 0.14
ACTB-210ENST00000477812 TSC22D3Q99576 134 aa15.92■□□□□ 0.14
ACTB-210ENST00000477812 RTBDNQ9BSG5 229 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
ACTB-210ENST00000477812 C5orf66Q9H5L9 145 aa15.92■□□□□ 0.14
ACTB-210ENST00000477812 PLSCR3Q9NRY6 295 aa15.92■□□□□ 0.14
ACTB-210ENST00000477812 SLC35D1Q9NTN3 355 aa15.92■□□□□ 0.14
ACTB-210ENST00000477812 GPR132Q9UNW8 380 aa15.92■□□□□ 0.14
ACTB-210ENST00000477812 VSIG4Q9Y279 399 aa15.92■□□□□ 0.14
ACTB-210ENST00000477812 LYRM1O43325 122 aa15.91■□□□□ 0.14
ACTB-210ENST00000477812 AMY1AP04745 511 aa15.91■□□□□ 0.14
ACTB-210ENST00000477812 RLN1P04808 185 aa15.91■□□□□ 0.14
ACTB-210ENST00000477812 TMEM11P17152 192 aa15.91■□□□□ 0.14
ACTB-210ENST00000477812 CCR6P51684 374 aa15.91■□□□□ 0.14
ACTB-210ENST00000477812 ASAH1Q13510 395 aa15.91■□□□□ 0.14
ACTB-210ENST00000477812 HES1Q14469 280 aa15.91■□□□□ 0.14
ACTB-210ENST00000477812 C16orf82Q7Z2V1 217 aa15.91■□□□□ 0.14
ACTB-210ENST00000477812 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa15.91■□□□□ 0.14
ACTB-210ENST00000477812 SLC25A33Q9BSK2 321 aa15.91■□□□□ 0.14
ACTB-210ENST00000477812 H7C2Y5 167 aa15.9■□□□□ 0.14
ACTB-210ENST00000477812 OR2B11Q5JQS5 317 aa15.9■□□□□ 0.14
ACTB-210ENST00000477812 OR51H1Q8NH63 302 aa15.9■□□□□ 0.14
ACTB-210ENST00000477812 ZFAND1Q8TCF1 268 aa15.9■□□□□ 0.14
ACTB-210ENST00000477812 ZFAND2BQ8WV99 257 aa15.9■□□□□ 0.14
ACTB-210ENST00000477812 FAM181BA6NEQ2 426 aa15.89■□□□□ 0.13
ACTB-210ENST00000477812 CENPXA8MT69 81 aa15.89■□□□□ 0.13
ACTB-210ENST00000477812 TRIM77I1YAP6 450 aa15.89■□□□□ 0.13
ACTB-210ENST00000477812 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP15.89■□□□□ 0.133e-25■■■■■ 34.8
ACTB-210ENST00000477812 FCGR3BO75015 233 aa15.89■□□□□ 0.13
ACTB-210ENST00000477812 NDUFB6O95139 128 aa15.89■□□□□ 0.13
ACTB-210ENST00000477812 RRASP10301 218 aa15.89■□□□□ 0.13
ACTB-210ENST00000477812 F2RL1P55085 397 aa15.89■□□□□ 0.13
ACTB-210ENST00000477812 PIGPP57054 158 aa15.89■□□□□ 0.13
ACTB-210ENST00000477812 RPL15P61313 204 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
ACTB-210ENST00000477812 CATR1Q13166 79 aa15.89■□□□□ 0.13
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