RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474643.5

VARS-223, Transcript of valyl-tRNA synthetase, human

TSL 5

Gene VARS, Length 885 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
VARS-223	ENST00000474643	PARP12	Q9H0J9	701 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
VARS-223	ENST00000474643	C11orf54	Q9H0W9	315 aa	Predicted RBP	11.95	□□□□□ -0.5
VARS-223	ENST00000474643	IFI27L2	Q9H2X8	130 aa		11.95	□□□□□ -0.5
VARS-223	ENST00000474643	AUNIP	Q9H7T9	357 aa		11.95	□□□□□ -0.5
VARS-223	ENST00000474643	SCPEP1	Q9HB40	452 aa		11.95	□□□□□ -0.5
VARS-223	ENST00000474643	RNF150	Q9ULK6	438 aa		11.95	□□□□□ -0.5
VARS-223	ENST00000474643	IGKV1-6	A0A0C4DH72	117 aa		11.94	□□□□□ -0.5
VARS-223	ENST00000474643	DIRAS3	O95661	229 aa		11.94	□□□□□ -0.5
VARS-223	ENST00000474643	IGHG2	P01859	326 aa		11.94	□□□□□ -0.5
VARS-223	ENST00000474643	HLA-DQB1	P01920	261 aa		11.94	□□□□□ -0.5
VARS-223	ENST00000474643	VDAC1	P21796	283 aa		11.94	□□□□□ -0.5
VARS-223	ENST00000474643	HOXD3	P31249	432 aa	Predicted RBP	11.94	□□□□□ -0.5
VARS-223	ENST00000474643	GPR12	P47775	334 aa		11.94	□□□□□ -0.5
VARS-223	ENST00000474643	TAS2R20	P59543	309 aa		11.94	□□□□□ -0.5
VARS-223	ENST00000474643	RPL39P5	Q59GN2	51 aa		11.94	□□□□□ -0.5
VARS-223	ENST00000474643	PYHIN1	Q6K0P9	492 aa		11.94	□□□□□ -0.5
VARS-223	ENST00000474643	STPG2	Q8N412	459 aa		11.94	□□□□□ -0.5
VARS-223	ENST00000474643	CABLES2	Q9BTV7	478 aa		11.94	□□□□□ -0.5
VARS-223	ENST00000474643	GHITM	Q9H3K2	345 aa		11.94	□□□□□ -0.5
VARS-223	ENST00000474643	LIN7C	Q9NUP9	197 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
VARS-223	ENST00000474643	EXTL2	Q9UBQ6	330 aa		11.94	□□□□□ -0.5
VARS-223	ENST00000474643	ZMAT5	Q9UDW3	170 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
VARS-223	ENST00000474643	ZNF736	B4DX44	427 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
VARS-223	ENST00000474643	ITGB1BP1	O14713	200 aa		11.93	□□□□□ -0.5
VARS-223	ENST00000474643	ARPC4	P59998	168 aa		11.93	□□□□□ -0.5
VARS-223	ENST00000474643	SSBP1	Q04837	148 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
VARS-223	ENST00000474643	LSAMP	Q13449	338 aa		11.93	□□□□□ -0.5
VARS-223	ENST00000474643	SPANXN2	Q5MJ10	180 aa		11.93	□□□□□ -0.5
VARS-223	ENST00000474643	CNIH2	Q6PI25	160 aa		11.93	□□□□□ -0.5
VARS-223	ENST00000474643	ZNF833P	Q6ZTB9	187 aa		11.93	□□□□□ -0.5
VARS-223	ENST00000474643	ZNF695	Q8IW36	515 aa		11.93	□□□□□ -0.5
VARS-223	ENST00000474643	MRPL41	Q8IXM3	137 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
VARS-223	ENST00000474643	ODF3L1	Q8IXM7	274 aa		11.93	□□□□□ -0.5
VARS-223	ENST00000474643	LINC00482	Q8N8I6	264 aa		11.93	□□□□□ -0.5
VARS-223	ENST00000474643	OR8H1	Q8NGG4	311 aa		11.93	□□□□□ -0.5
VARS-223	ENST00000474643	IFT46	Q9NQC8	304 aa		11.93	□□□□□ -0.5
VARS-223	ENST00000474643	TRBV6-7	A0A0A0MS04	114 aa		11.92	□□□□□ -0.5
VARS-223	ENST00000474643	FABP12	A6NFH5	140 aa		11.92	□□□□□ -0.5
VARS-223	ENST00000474643		H7C2Y5	167 aa		11.92	□□□□□ -0.5
VARS-223	ENST00000474643	CTXN2	P0C2S0	81 aa		11.92	□□□□□ -0.5
VARS-223	ENST00000474643	OR8U9	P0C7N5	309 aa		11.92	□□□□□ -0.5
VARS-223	ENST00000474643	PRSS3	P35030	304 aa		11.92	□□□□□ -0.5
VARS-223	ENST00000474643	THBS3	P49746	956 aa		11.92	□□□□□ -0.5
VARS-223	ENST00000474643	ZNF45	Q02386	682 aa		11.92	□□□□□ -0.5
VARS-223	ENST00000474643	DCTN2	Q13561	401 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
VARS-223	ENST00000474643	FAM71F2	Q6NXP2	309 aa		11.92	□□□□□ -0.5
VARS-223	ENST00000474643	OR8U1	Q8NH10	309 aa		11.92	□□□□□ -0.5
VARS-223	ENST00000474643	S100Z	Q8WXG8	99 aa		11.92	□□□□□ -0.5
VARS-223	ENST00000474643	NABP2	Q9BQ15	211 aa		11.92	□□□□□ -0.5
VARS-223	ENST00000474643	OR2D2	Q9H210	308 aa		11.92	□□□□□ -0.5
VARS-223	ENST00000474643	ZNF107	Q9UII5	783 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
VARS-223	ENST00000474643	MRPS7	Q9Y2R9	242 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
VARS-223	ENST00000474643	IGKV1D-8	A0A087WSZ0	117 aa		11.91	□□□□□ -0.5
VARS-223	ENST00000474643		J3QRK9	145 aa		11.91	□□□□□ -0.5
VARS-223	ENST00000474643	SSX5	O60225	188 aa		11.91	□□□□□ -0.5
VARS-223	ENST00000474643	FCER2	P06734	321 aa		11.91	□□□□□ -0.5
VARS-223	ENST00000474643	OR5H8	P0DN80	308 aa		11.91	□□□□□ -0.5
VARS-223	ENST00000474643	PTHLH	P12272	177 aa		11.91	□□□□□ -0.5
VARS-223	ENST00000474643	MYCNOS	P40205	109 aa		11.91	□□□□□ -0.5
VARS-223	ENST00000474643	CD69	Q07108	199 aa		11.91	□□□□□ -0.5
VARS-223	ENST00000474643	EBI3	Q14213	229 aa		11.91	□□□□□ -0.5
VARS-223	ENST00000474643	MMD	Q15546	238 aa		11.91	□□□□□ -0.5
VARS-223	ENST00000474643	BEST4	Q8NFU0	473 aa		11.91	□□□□□ -0.5
VARS-223	ENST00000474643	GPX8	Q8TED1	209 aa		11.91	□□□□□ -0.5
VARS-223	ENST00000474643	ZNF251	Q9BRH9	671 aa		11.91	□□□□□ -0.5
VARS-223	ENST00000474643	ANXA10	Q9UJ72	324 aa		11.91	□□□□□ -0.5
VARS-223	ENST00000474643	ANAPC10	Q9UM13	185 aa		11.91	□□□□□ -0.5
VARS-223	ENST00000474643	MEIS3P1	A6NDR6	274 aa		11.9	□□□□□ -0.5
VARS-223	ENST00000474643	GABARAP	H6UMI1	98 aa		11.9	□□□□□ -0.5
VARS-223	ENST00000474643		M0R1X1	148 aa		11.9	□□□□□ -0.5
VARS-223	ENST00000474643	GSTZ1	O43708	216 aa	Predicted RBP	11.9	□□□□□ -0.5
VARS-223	ENST00000474643	FAM131A	Q6UXB0	335 aa		11.9	□□□□□ -0.5
VARS-223	ENST00000474643	GLDN	Q6ZMI3	551 aa	Predicted RBP	11.9	□□□□□ -0.5
VARS-223	ENST00000474643	GVQW1	Q8N7I0	195 aa		11.9	□□□□□ -0.5
VARS-223	ENST00000474643	DRAXIN	Q8NBI3	349 aa	Predicted RBP	11.9	□□□□□ -0.5
VARS-223	ENST00000474643	DEDD2	Q8WXF8	326 aa		11.9	□□□□□ -0.5
VARS-223	ENST00000474643	AGMAT	Q9BSE5	352 aa		11.9	□□□□□ -0.5
VARS-223	ENST00000474643	KIAA1456	Q9P272	454 aa		11.9	□□□□□ -0.5
VARS-223	ENST00000474643		V9GYH0	126 aa		11.9	□□□□□ -0.5
VARS-223	ENST00000474643	OR5H14	A6NHG9	310 aa		11.89	□□□□□ -0.51
VARS-223	ENST00000474643	CCL24	O00175	119 aa		11.89	□□□□□ -0.51
VARS-223	ENST00000474643	APOA2	P02652	100 aa		11.89	□□□□□ -0.51
VARS-223	ENST00000474643	RPLP1	P05386	114 aa	Known RBP	11.89	□□□□□ -0.51
VARS-223	ENST00000474643	CT45A6	P0DMU7	189 aa		11.89	□□□□□ -0.51
VARS-223	ENST00000474643	CT45A5	P0DMU8	189 aa		11.89	□□□□□ -0.51
VARS-223	ENST00000474643	CT45A7	P0DMV0	189 aa		11.89	□□□□□ -0.51
VARS-223	ENST00000474643	NAT1	P18440	290 aa		11.89	□□□□□ -0.51
VARS-223	ENST00000474643	NFYA	P23511	347 aa	Predicted RBP	11.89	□□□□□ -0.51
VARS-223	ENST00000474643	MC5R	P33032	325 aa		11.89	□□□□□ -0.51
VARS-223	ENST00000474643	ACTB	P60709	375 aa		11.89	□□□□□ -0.51
VARS-223	ENST00000474643	FOXE3	Q13461	319 aa		11.89	□□□□□ -0.51
VARS-223	ENST00000474643	IL18	Q14116	193 aa		11.89	□□□□□ -0.51
VARS-223	ENST00000474643	TMEM65	Q6PI78	240 aa		11.89	□□□□□ -0.51
VARS-223	ENST00000474643	ETV3L	Q6ZN32	361 aa		11.89	□□□□□ -0.51
VARS-223	ENST00000474643	C18orf65	Q6ZTR6	163 aa		11.89	□□□□□ -0.51
VARS-223	ENST00000474643	HOGA1	Q86XE5	327 aa		11.89	□□□□□ -0.51
VARS-223	ENST00000474643	H1FOO	Q8IZA3	346 aa	Predicted RBP	11.89	□□□□□ -0.51
VARS-223	ENST00000474643	GDPD1	Q8N9F7	314 aa		11.89	□□□□□ -0.51
VARS-223	ENST00000474643		Q8N9W7	124 aa		11.89	□□□□□ -0.51
VARS-223	ENST00000474643	ZNF436-AS1	Q8NC38	126 aa	Predicted RBP	11.89	□□□□□ -0.51

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