RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463533.1

ANKRD28-208, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 3

Gene ANKRD28, Length 742 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-208ENST00000463533 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
ANKRD28-208ENST00000463533 IGLV2-14P01704 120 aa6.76□□□□□ -1.33
ANKRD28-208ENST00000463533 IGHV4-59P01825 116 aa6.76□□□□□ -1.33
ANKRD28-208ENST00000463533 CT45A6P0DMU7 189 aa6.76□□□□□ -1.33
ANKRD28-208ENST00000463533 CT45A5P0DMU8 189 aa6.76□□□□□ -1.33
ANKRD28-208ENST00000463533 CT45A7P0DMV0 189 aa6.76□□□□□ -1.33
ANKRD28-208ENST00000463533 IL7P13232 177 aa6.76□□□□□ -1.33
ANKRD28-208ENST00000463533 TBPP20226 339 aa6.76□□□□□ -1.33
ANKRD28-208ENST00000463533 CD40LGP29965 261 aa6.76□□□□□ -1.33
ANKRD28-208ENST00000463533 IER3P46695 156 aa6.76□□□□□ -1.33
ANKRD28-208ENST00000463533 ZNF137PP52743 207 aa6.76□□□□□ -1.33
ANKRD28-208ENST00000463533 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
ANKRD28-208ENST00000463533 MEF2DQ14814 521 aa6.76□□□□□ -1.33
ANKRD28-208ENST00000463533 LY6EQ16553 131 aa6.76□□□□□ -1.33
ANKRD28-208ENST00000463533 LRRC75BQ2VPJ9 315 aa6.76□□□□□ -1.33
ANKRD28-208ENST00000463533 FBLN7Q53RD9 439 aa6.76□□□□□ -1.33
ANKRD28-208ENST00000463533 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
ANKRD28-208ENST00000463533 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
ANKRD28-208ENST00000463533 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa6.76□□□□□ -1.33
ANKRD28-208ENST00000463533 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa6.76□□□□□ -1.33
ANKRD28-208ENST00000463533 ZNF645Q8N7E2 425 aa6.76□□□□□ -1.33
ANKRD28-208ENST00000463533 PIFOQ8TCI5 191 aa6.76□□□□□ -1.33
ANKRD28-208ENST00000463533 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
ANKRD28-208ENST00000463533 MOB3AQ96BX8 217 aa6.76□□□□□ -1.33
ANKRD28-208ENST00000463533 GPHA2Q96T91 129 aa6.76□□□□□ -1.33
ANKRD28-208ENST00000463533 S1PR3Q99500 378 aa6.76□□□□□ -1.33
ANKRD28-208ENST00000463533 FXYD6Q9H0Q3 95 aa6.76□□□□□ -1.33
ANKRD28-208ENST00000463533 ESM1Q9NQ30 184 aa6.76□□□□□ -1.33
ANKRD28-208ENST00000463533 ABCB10Q9NRK6 738 aa6.76□□□□□ -1.33
ANKRD28-208ENST00000463533 MCUBQ9NWR8 336 aa6.76□□□□□ -1.33
ANKRD28-208ENST00000463533 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa6.75□□□□□ -1.33
ANKRD28-208ENST00000463533 NPIPB6E9PJ23 425 aa6.75□□□□□ -1.33
ANKRD28-208ENST00000463533 TNFSF12O43508 249 aa6.75□□□□□ -1.33
ANKRD28-208ENST00000463533 VENTXO95231 258 aa6.75□□□□□ -1.33
ANKRD28-208ENST00000463533 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
ANKRD28-208ENST00000463533 PGAM2P15259 253 aa6.75□□□□□ -1.33
ANKRD28-208ENST00000463533 GNRHRP30968 328 aa6.75□□□□□ -1.33
ANKRD28-208ENST00000463533 BRS3P32247 399 aa6.75□□□□□ -1.33
ANKRD28-208ENST00000463533 AP3S2P59780 193 aa6.75□□□□□ -1.33
ANKRD28-208ENST00000463533 SLC9A3R2Q15599 337 aa6.75□□□□□ -1.33
ANKRD28-208ENST00000463533 AADACL3Q5VUY0 350 aa6.75□□□□□ -1.33
ANKRD28-208ENST00000463533 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa6.75□□□□□ -1.33
ANKRD28-208ENST00000463533 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
ANKRD28-208ENST00000463533 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa6.75□□□□□ -1.33
ANKRD28-208ENST00000463533 LHFPL1Q86WI0 220 aa6.75□□□□□ -1.33
ANKRD28-208ENST00000463533 OR8H3Q8N146 312 aa6.75□□□□□ -1.33
ANKRD28-208ENST00000463533 ARRDC1Q8N5I2 433 aa6.75□□□□□ -1.33
ANKRD28-208ENST00000463533 ZDHHC22Q8N966 263 aa6.75□□□□□ -1.33
ANKRD28-208ENST00000463533 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
ANKRD28-208ENST00000463533 OR51S1Q8NGJ8 323 aa6.75□□□□□ -1.33
ANKRD28-208ENST00000463533 CAPSLQ8WWF8 208 aa6.75□□□□□ -1.33
ANKRD28-208ENST00000463533 CFHR4Q92496 578 aa6.75□□□□□ -1.33
ANKRD28-208ENST00000463533 NABP2Q9BQ15 211 aa6.75□□□□□ -1.33
ANKRD28-208ENST00000463533 CCDC32Q9BV29 185 aa6.75□□□□□ -1.33
ANKRD28-208ENST00000463533 GHITMQ9H3K2 345 aa6.75□□□□□ -1.33
ANKRD28-208ENST00000463533 GAB2Q9UQC2 676 aa6.75□□□□□ -1.33
ANKRD28-208ENST00000463533 JMJD1CQ15652 2540 aa6.75□□□□□ -1.33
ANKRD28-208ENST00000463533 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
ANKRD28-208ENST00000463533 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa6.74□□□□□ -1.33
ANKRD28-208ENST00000463533 LINC00473A8K010 186 aa6.74□□□□□ -1.33
ANKRD28-208ENST00000463533 VGLL3A8MV65 326 aa6.74□□□□□ -1.33
ANKRD28-208ENST00000463533 PLA2G10O15496 165 aa6.74□□□□□ -1.33
ANKRD28-208ENST00000463533 TXNL1O43396 289 aa6.74□□□□□ -1.33
ANKRD28-208ENST00000463533 TCF21O43680 179 aa6.74□□□□□ -1.33
ANKRD28-208ENST00000463533 SLC22A5O76082 557 aa6.74□□□□□ -1.33
ANKRD28-208ENST00000463533 IGKV1D-33P01593 117 aa6.74□□□□□ -1.33
ANKRD28-208ENST00000463533 IGKV1-33P01594 117 aa6.74□□□□□ -1.33
ANKRD28-208ENST00000463533 PI3P19957 117 aa6.74□□□□□ -1.33
ANKRD28-208ENST00000463533 DUTP33316 252 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
ANKRD28-208ENST00000463533 FAUP35544 74 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
ANKRD28-208ENST00000463533 DYNLT3P51808 116 aa6.74□□□□□ -1.33
ANKRD28-208ENST00000463533 ARHGDIBP52566 201 aa6.74□□□□□ -1.33
ANKRD28-208ENST00000463533 HILS1P60008 231 aa6.74□□□□□ -1.33
ANKRD28-208ENST00000463533 IFITM3Q01628 133 aa6.74□□□□□ -1.33
ANKRD28-208ENST00000463533 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
ANKRD28-208ENST00000463533 HNF4GQ14541 408 aa6.74□□□□□ -1.33
ANKRD28-208ENST00000463533 AANATQ16613 207 aa6.74□□□□□ -1.33
ANKRD28-208ENST00000463533 PHLDA2Q53GA4 152 aa6.74□□□□□ -1.33
ANKRD28-208ENST00000463533 FAM71F2Q6NXP2 309 aa6.74□□□□□ -1.33
ANKRD28-208ENST00000463533 IDO2Q6ZQW0 420 aa6.74□□□□□ -1.33
ANKRD28-208ENST00000463533 TMEM219Q86XT9 240 aa6.74□□□□□ -1.33
ANKRD28-208ENST00000463533 C1QL4Q86Z23 238 aa6.74□□□□□ -1.33
ANKRD28-208ENST00000463533 ZNF383Q8NA42 475 aa6.74□□□□□ -1.33
ANKRD28-208ENST00000463533 TERB2Q8NHR7 220 aa6.74□□□□□ -1.33
ANKRD28-208ENST00000463533 MARCH1Q8TCQ1 289 aa6.74□□□□□ -1.33
ANKRD28-208ENST00000463533 FAM216AQ8WUB2 273 aa6.74□□□□□ -1.33
ANKRD28-208ENST00000463533 SSMEM1Q8WWF3 244 aa6.74□□□□□ -1.33
ANKRD28-208ENST00000463533 MRGPRFQ96AM1 343 aa6.74□□□□□ -1.33
ANKRD28-208ENST00000463533 AKR1E2Q96JD6 320 aa6.74□□□□□ -1.33
ANKRD28-208ENST00000463533 RITA1Q96K30 269 aa6.74□□□□□ -1.33
ANKRD28-208ENST00000463533 TSC22D3Q99576 134 aa6.74□□□□□ -1.33
ANKRD28-208ENST00000463533 CHIAQ9BZP6 476 aa6.74□□□□□ -1.33
ANKRD28-208ENST00000463533 DPAGT1Q9H3H5 408 aa6.74□□□□□ -1.33
ANKRD28-208ENST00000463533 MXRA5Q9NR99 2828 aa6.73□□□□□ -1.33
ANKRD28-208ENST00000463533 A6NDX4 124 aa6.73□□□□□ -1.33
ANKRD28-208ENST00000463533 BTBD17A6NE02 478 aa6.73□□□□□ -1.33
ANKRD28-208ENST00000463533 H0YJW9 148 aa6.73□□□□□ -1.33
ANKRD28-208ENST00000463533 H7C2Y5 167 aa6.73□□□□□ -1.33
ANKRD28-208ENST00000463533 GPR31O00270 319 aa6.73□□□□□ -1.33
ANKRD28-208ENST00000463533 UPK1BO75841 260 aa6.73□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.8 ms