RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462256.5

DDX39B-215, Transcript of DExD-box helicase 39B, humanhuman

TSL 2

Gene DDX39B, Length 4,027 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39B-215ENST00000462256 CLEC5AQ9NY25 188 aa7.7□□□□□ -1.18
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DDX39B-215ENST00000462256 XRCC3O43542 346 aa7.7□□□□□ -1.18
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DDX39B-215ENST00000462256 THBS3P49746 956 aa7.7□□□□□ -1.18
DDX39B-215ENST00000462256 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP7.7□□□□□ -1.18
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DDX39B-215ENST00000462256 ZNF709Q8N972 641 aa7.7□□□□□ -1.18
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DDX39B-215ENST00000462256 PRR32B1ATL7 298 aa7.68□□□□□ -1.18
DDX39B-215ENST00000462256 C22orf46C9J442 243 aa7.68□□□□□ -1.18
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DDX39B-215ENST00000462256 C1orf100Q5SVJ3 147 aa7.68□□□□□ -1.18
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DDX39B-215ENST00000462256 TMEM200BQ69YZ2 307 aa7.68□□□□□ -1.18
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DDX39B-215ENST00000462256 OR13A1Q8NGR1 328 aa7.68□□□□□ -1.18
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DDX39B-215ENST00000462256 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa7.68□□□□□ -1.18
DDX39B-215ENST00000462256 A0A1W2PRX2 142 aa7.68□□□□□ -1.18
DDX39B-215ENST00000462256 C7orf66A4D0T2 115 aa7.68□□□□□ -1.18
DDX39B-215ENST00000462256 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP7.68□□□□□ -1.18
DDX39B-215ENST00000462256 LANCL1O43813 399 aa7.68□□□□□ -1.18
DDX39B-215ENST00000462256 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP7.68□□□□□ -1.18
DDX39B-215ENST00000462256 GUCA2BQ16661 112 aa7.68□□□□□ -1.18
DDX39B-215ENST00000462256 C1QL2Q7Z5L3 287 aa7.68□□□□□ -1.18
DDX39B-215ENST00000462256 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP7.68□□□□□ -1.18
DDX39B-215ENST00000462256 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa7.68□□□□□ -1.18
DDX39B-215ENST00000462256 ZNF383Q8NA42 475 aa7.68□□□□□ -1.18
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DDX39B-215ENST00000462256 SULT4A1Q9BR01 284 aa7.68□□□□□ -1.18
DDX39B-215ENST00000462256 VPS25Q9BRG1 176 aa7.68□□□□□ -1.18
DDX39B-215ENST00000462256 SLC25A33Q9BSK2 321 aa7.68□□□□□ -1.18
DDX39B-215ENST00000462256 TLNRD1Q9H1K6 362 aa7.68□□□□□ -1.18
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DDX39B-215ENST00000462256 C5orf52A6NGY3 159 aa7.68□□□□□ -1.18
DDX39B-215ENST00000462256 ARPC5O15511 151 aa7.68□□□□□ -1.18
DDX39B-215ENST00000462256 HRH1P35367 487 aa7.68□□□□□ -1.18
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DDX39B-215ENST00000462256 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa7.68□□□□□ -1.18
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DDX39B-215ENST00000462256 PGLYRP3Q96LB9 341 aa7.68□□□□□ -1.18
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DDX39B-215ENST00000462256 OR4C12Q96R67 309 aa7.68□□□□□ -1.18
DDX39B-215ENST00000462256 ANXA10Q9UJ72 324 aa7.68□□□□□ -1.18
DDX39B-215ENST00000462256 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa7.68□□□□□ -1.18
DDX39B-215ENST00000462256 OPN1MWP04001 364 aa7.68□□□□□ -1.18
DDX39B-215ENST00000462256 OPN1MW2P0DN77 364 aa7.68□□□□□ -1.18
DDX39B-215ENST00000462256 OPN1MW3P0DN78 364 aa7.68□□□□□ -1.18
DDX39B-215ENST00000462256 RNF212Q495C1 297 aa7.68□□□□□ -1.18
DDX39B-215ENST00000462256 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa7.68□□□□□ -1.18
DDX39B-215ENST00000462256 SCARB1Q8WTV0 552 aa7.68□□□□□ -1.18
DDX39B-215ENST00000462256 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP7.68□□□□□ -1.18
DDX39B-215ENST00000462256 MALSU1Q96EH3 234 aa7.68□□□□□ -1.18
DDX39B-215ENST00000462256 WNK1Q9H4A3 2382 aa7.67□□□□□ -1.18
DDX39B-215ENST00000462256 GABARAPH6UMI1 98 aa7.67□□□□□ -1.18
DDX39B-215ENST00000462256 UBE2CO00762 179 aa7.67□□□□□ -1.18
DDX39B-215ENST00000462256 TGOLN2O43493 480 aa7.67□□□□□ -1.18
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