RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460567.5

SUCLG2-202, Transcript of succinate-CoA ligase GDP-forming beta subunit, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SUCLG2, Length 1,596 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUCLG2-202ENST00000460567 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
SUCLG2-202ENST00000460567 SSTR5P35346 364 aa13.08□□□□□ -0.32
SUCLG2-202ENST00000460567 DLK1P80370 383 aa13.08□□□□□ -0.32
SUCLG2-202ENST00000460567 TMEM249Q2WGJ8 235 aa13.08□□□□□ -0.32
SUCLG2-202ENST00000460567 Q3ZCU0 254 aa13.08□□□□□ -0.32
SUCLG2-202ENST00000460567 HEPN1Q6WQI6 88 aa13.08□□□□□ -0.32
SUCLG2-202ENST00000460567 ETV3LQ6ZN32 361 aa13.08□□□□□ -0.32
SUCLG2-202ENST00000460567 FAM24BQ8N5W8 94 aa13.08□□□□□ -0.32
SUCLG2-202ENST00000460567 OR13D1Q8NGV5 346 aa13.08□□□□□ -0.32
SUCLG2-202ENST00000460567 R3HDM4Q96D70 268 aa13.08□□□□□ -0.32
SUCLG2-202ENST00000460567 C5orf30Q96GV9 206 aa13.08□□□□□ -0.32
SUCLG2-202ENST00000460567 YPEL4Q96NS1 127 aa13.08□□□□□ -0.32
SUCLG2-202ENST00000460567 DIRC2Q96SL1 478 aa13.08□□□□□ -0.32
SUCLG2-202ENST00000460567 KCNIP2Q9NS61 270 aa13.08□□□□□ -0.32
SUCLG2-202ENST00000460567 IL19Q9UHD0 177 aa13.08□□□□□ -0.32
SUCLG2-202ENST00000460567 DUSP13Q9UII6 198 aa13.08□□□□□ -0.32
SUCLG2-202ENST00000460567 RFNGQ9Y644 331 aa13.08□□□□□ -0.32
SUCLG2-202ENST00000460567 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa13.07□□□□□ -0.32
SUCLG2-202ENST00000460567 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa13.07□□□□□ -0.32
SUCLG2-202ENST00000460567 ZNF98A6NK75 572 aa13.07□□□□□ -0.32
SUCLG2-202ENST00000460567 PMS2P5A8MQ11 134 aa13.07□□□□□ -0.32
SUCLG2-202ENST00000460567 TMEM250H0YL14 139 aa13.07□□□□□ -0.32
SUCLG2-202ENST00000460567 CYB5BO43169 146 aa13.07□□□□□ -0.32
SUCLG2-202ENST00000460567 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
SUCLG2-202ENST00000460567 WISP2O76076 250 aa13.07□□□□□ -0.32
SUCLG2-202ENST00000460567 S100A9P06702 114 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
SUCLG2-202ENST00000460567 AKR1C3P42330 323 aa13.07□□□□□ -0.32
SUCLG2-202ENST00000460567 PSMB3P49720 205 aa13.07□□□□□ -0.32
SUCLG2-202ENST00000460567 ZNF83P51522 516 aa13.07□□□□□ -0.32
SUCLG2-202ENST00000460567 OR8G2PQ6IF36 304 aa13.07□□□□□ -0.32
SUCLG2-202ENST00000460567 FAM57AQ8TBR7 257 aa13.07□□□□□ -0.32
SUCLG2-202ENST00000460567 LHX4Q969G2 390 aa13.07□□□□□ -0.32
SUCLG2-202ENST00000460567 OR2V2Q96R30 315 aa13.07□□□□□ -0.32
SUCLG2-202ENST00000460567 FZR1Q9UM11 496 aa13.07□□□□□ -0.32
SUCLG2-202ENST00000460567 A0A1W2PPE2 198 aa13.07□□□□□ -0.32
SUCLG2-202ENST00000460567 TM4SF5O14894 197 aa13.07□□□□□ -0.32
SUCLG2-202ENST00000460567 SMIM6P0DI80 62 aa13.07□□□□□ -0.32
SUCLG2-202ENST00000460567 NQO2P16083 231 aa13.07□□□□□ -0.32
SUCLG2-202ENST00000460567 BRWD1-AS2P59051 145 aa13.07□□□□□ -0.32
SUCLG2-202ENST00000460567 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
SUCLG2-202ENST00000460567 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
SUCLG2-202ENST00000460567 LCN15Q6UWW0 184 aa13.07□□□□□ -0.32
SUCLG2-202ENST00000460567 NUP37Q8NFH4 326 aa13.07□□□□□ -0.32
SUCLG2-202ENST00000460567 OR4A16Q8NH70 328 aa13.07□□□□□ -0.32
SUCLG2-202ENST00000460567 Q8TCH9 128 aa13.07□□□□□ -0.32
SUCLG2-202ENST00000460567 SDSLQ96GA7 329 aa13.07□□□□□ -0.32
SUCLG2-202ENST00000460567 S1PR3Q99500 378 aa13.07□□□□□ -0.32
SUCLG2-202ENST00000460567 RNF7Q9UBF6 113 aa13.07□□□□□ -0.32
SUCLG2-202ENST00000460567 FAM215AQ9Y5M1 114 aa13.07□□□□□ -0.32
SUCLG2-202ENST00000460567 PTPRBP23467 1997 aa13.07□□□□□ -0.32
SUCLG2-202ENST00000460567 GPR179Q6PRD1 2367 aa13.06□□□□□ -0.32
SUCLG2-202ENST00000460567 SMCO3A2RU48 225 aa13.06□□□□□ -0.32
SUCLG2-202ENST00000460567 ZFP92A6NM28 416 aa13.06□□□□□ -0.32
SUCLG2-202ENST00000460567 ST8SIA5O15466 376 aa13.06□□□□□ -0.32
SUCLG2-202ENST00000460567 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
SUCLG2-202ENST00000460567 MDKP21741 143 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
SUCLG2-202ENST00000460567 FGF7P21781 194 aa13.06□□□□□ -0.32
SUCLG2-202ENST00000460567 RPL35P42766 123 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
SUCLG2-202ENST00000460567 MEOX2P50222 304 aa13.06□□□□□ -0.32
SUCLG2-202ENST00000460567 RAB11AP62491 216 aa13.06□□□□□ -0.32
SUCLG2-202ENST00000460567 EDDM3AQ14507 147 aa13.06□□□□□ -0.32
SUCLG2-202ENST00000460567 ZNF726P1Q15940 193 aa13.06□□□□□ -0.32
SUCLG2-202ENST00000460567 FAM90A2PQ658T7 463 aa13.06□□□□□ -0.32
SUCLG2-202ENST00000460567 OR4S2Q8NH73 311 aa13.06□□□□□ -0.32
SUCLG2-202ENST00000460567 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa13.06□□□□□ -0.32
SUCLG2-202ENST00000460567 ISOC2Q96AB3 205 aa13.06□□□□□ -0.32
SUCLG2-202ENST00000460567 ELOVL5Q9NYP7 299 aa13.06□□□□□ -0.32
SUCLG2-202ENST00000460567 CLN8Q9UBY8 286 aa13.06□□□□□ -0.32
SUCLG2-202ENST00000460567 ARID1AO14497 2285 aa13.06□□□□□ -0.32
SUCLG2-202ENST00000460567 LINC00473A8K010 186 aa13.05□□□□□ -0.32
SUCLG2-202ENST00000460567 ZG16O60844 167 aa13.05□□□□□ -0.32
SUCLG2-202ENST00000460567 ARG1P05089 322 aa13.05□□□□□ -0.32
SUCLG2-202ENST00000460567 EGR1P18146 543 aa13.05□□□□□ -0.32
SUCLG2-202ENST00000460567 THBS3P49746 956 aa13.05□□□□□ -0.32
SUCLG2-202ENST00000460567 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
SUCLG2-202ENST00000460567 BTNL3Q6UXE8 466 aa13.05□□□□□ -0.32
SUCLG2-202ENST00000460567 ZFP82Q8N141 532 aa13.05□□□□□ -0.32
SUCLG2-202ENST00000460567 OR10A7Q8NGE5 316 aa13.05□□□□□ -0.32
SUCLG2-202ENST00000460567 OR10G9Q8NGN4 311 aa13.05□□□□□ -0.32
SUCLG2-202ENST00000460567 OR10G7Q8NGN6 311 aa13.05□□□□□ -0.32
SUCLG2-202ENST00000460567 C2CD4CQ8TF44 421 aa13.05□□□□□ -0.32
SUCLG2-202ENST00000460567 RAB1CQ92928 201 aa13.05□□□□□ -0.32
SUCLG2-202ENST00000460567 TXNDC17Q9BRA2 123 aa13.05□□□□□ -0.32
SUCLG2-202ENST00000460567 ESRP2Q9H6T0 727 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
SUCLG2-202ENST00000460567 CALYQ9NYX4 217 aa13.05□□□□□ -0.32
SUCLG2-202ENST00000460567 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa13.04□□□□□ -0.32
SUCLG2-202ENST00000460567 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa13.04□□□□□ -0.32
SUCLG2-202ENST00000460567 CLDN34H7C241 214 aa13.04□□□□□ -0.32
SUCLG2-202ENST00000460567 AP4M1O00189 453 aa13.04□□□□□ -0.32
SUCLG2-202ENST00000460567 CGB3P0DN86 165 aa13.04□□□□□ -0.32
SUCLG2-202ENST00000460567 CGB7P0DN87 165 aa13.04□□□□□ -0.32
SUCLG2-202ENST00000460567 DAOP14920 347 aa13.04□□□□□ -0.32
SUCLG2-202ENST00000460567 RND2P52198 227 aa13.04□□□□□ -0.32
SUCLG2-202ENST00000460567 CEBPGP53567 150 aa13.04□□□□□ -0.32
SUCLG2-202ENST00000460567 TMPRSS3P57727 454 aa13.04□□□□□ -0.32
SUCLG2-202ENST00000460567 LOXL3P58215 753 aa13.04□□□□□ -0.32
SUCLG2-202ENST00000460567 OR2B8PP59922 312 aa13.04□□□□□ -0.32
SUCLG2-202ENST00000460567 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
SUCLG2-202ENST00000460567 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
SUCLG2-202ENST00000460567 OR2B11Q5JQS5 317 aa13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.3 ms