RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444916.5

SH3BP4-205, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene SH3BP4, Length 570 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-205ENST00000444916 C5orf30Q96GV9 206 aa11.08□□□□□ -0.64
SH3BP4-205ENST00000444916 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
SH3BP4-205ENST00000444916 PSMB8P28062 276 aa11.07□□□□□ -0.64
SH3BP4-205ENST00000444916 THBS3P49746 956 aa11.07□□□□□ -0.64
SH3BP4-205ENST00000444916 NDPQ00604 133 aa11.07□□□□□ -0.64
SH3BP4-205ENST00000444916 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
SH3BP4-205ENST00000444916 PSG5Q15238 335 aa11.07□□□□□ -0.64
SH3BP4-205ENST00000444916 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP11.07□□□□□ -0.64
SH3BP4-205ENST00000444916 CNIH2Q6PI25 160 aa11.07□□□□□ -0.64
SH3BP4-205ENST00000444916 OR13F1Q8NGS4 319 aa11.07□□□□□ -0.64
SH3BP4-205ENST00000444916 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
SH3BP4-205ENST00000444916 FUNDC2Q9BWH2 189 aa11.07□□□□□ -0.64
SH3BP4-205ENST00000444916 DIABLOQ9NR28 239 aa11.07□□□□□ -0.64
SH3BP4-205ENST00000444916 SLC35D1Q9NTN3 355 aa11.07□□□□□ -0.64
SH3BP4-205ENST00000444916 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
SH3BP4-205ENST00000444916 ANXA10Q9UJ72 324 aa11.07□□□□□ -0.64
SH3BP4-205ENST00000444916 WSB1Q9Y6I7 421 aa11.07□□□□□ -0.64
SH3BP4-205ENST00000444916 COL7A1Q02388 2944 aa11.06□□□□□ -0.64
SH3BP4-205ENST00000444916 TRAV41A0A0B4J266 112 aa11.06□□□□□ -0.64
SH3BP4-205ENST00000444916 G3V318 75 aa11.06□□□□□ -0.64
SH3BP4-205ENST00000444916 SMIM18P0DKX4 95 aa11.06□□□□□ -0.64
SH3BP4-205ENST00000444916 PPIFP30405 207 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
SH3BP4-205ENST00000444916 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP11.06□□□□□ -0.64
SH3BP4-205ENST00000444916 RPS16P62249 146 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
SH3BP4-205ENST00000444916 CX3CL1P78423 397 aa11.06□□□□□ -0.64
SH3BP4-205ENST00000444916 LCNL1Q6ZST4 164 aa11.06□□□□□ -0.64
SH3BP4-205ENST00000444916 LINC00482Q8N8I6 264 aa11.06□□□□□ -0.64
SH3BP4-205ENST00000444916 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
SH3BP4-205ENST00000444916 ADTRPQ96IZ2 230 aa11.06□□□□□ -0.64
SH3BP4-205ENST00000444916 AUNIPQ9H7T9 357 aa11.06□□□□□ -0.64
SH3BP4-205ENST00000444916 OR2W1Q9Y3N9 320 aa11.06□□□□□ -0.64
SH3BP4-205ENST00000444916 FCN1O00602 326 aa11.05□□□□□ -0.64
SH3BP4-205ENST00000444916 IGLV1-40P01703 118 aa11.05□□□□□ -0.64
SH3BP4-205ENST00000444916 IGLL1P15814 213 aa11.05□□□□□ -0.64
SH3BP4-205ENST00000444916 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
SH3BP4-205ENST00000444916 MYCNOSP40205 109 aa11.05□□□□□ -0.64
SH3BP4-205ENST00000444916 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
SH3BP4-205ENST00000444916 LUMP51884 338 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
SH3BP4-205ENST00000444916 NCS1P62166 190 aa11.05□□□□□ -0.64
SH3BP4-205ENST00000444916 CBX3Q13185 183 aa11.05□□□□□ -0.64
SH3BP4-205ENST00000444916 RTL8BQ17RB0 113 aa11.05□□□□□ -0.64
SH3BP4-205ENST00000444916 C19orf54Q5BKX5 351 aa11.05□□□□□ -0.64
SH3BP4-205ENST00000444916 UBE2NLQ5JXB2 153 aa11.05□□□□□ -0.64
SH3BP4-205ENST00000444916 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
SH3BP4-205ENST00000444916 BEST4Q8NFU0 473 aa11.05□□□□□ -0.64
SH3BP4-205ENST00000444916 MYOZ3Q8TDC0 251 aa11.05□□□□□ -0.64
SH3BP4-205ENST00000444916 SLC25A46Q96AG3 418 aa11.05□□□□□ -0.64
SH3BP4-205ENST00000444916 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
SH3BP4-205ENST00000444916 FBXO7Q9Y3I1 522 aa11.05□□□□□ -0.64
SH3BP4-205ENST00000444916 XRCC3O43542 346 aa11.04□□□□□ -0.64
SH3BP4-205ENST00000444916 SLC25A17O43808 307 aa11.04□□□□□ -0.64
SH3BP4-205ENST00000444916 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
SH3BP4-205ENST00000444916 CA2P00918 260 aa11.04□□□□□ -0.64
SH3BP4-205ENST00000444916 HLA-DQB1P01920 261 aa11.04□□□□□ -0.64
SH3BP4-205ENST00000444916 RRASP10301 218 aa11.04□□□□□ -0.64
SH3BP4-205ENST00000444916 DUTP33316 252 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
SH3BP4-205ENST00000444916 LGALS7P47929 136 aa11.04□□□□□ -0.64
SH3BP4-205ENST00000444916 ECSCRQ19T08 205 aa11.04□□□□□ -0.64
SH3BP4-205ENST00000444916 TMEM177Q53S58 311 aa11.04□□□□□ -0.64
SH3BP4-205ENST00000444916 TMEM65Q6PI78 240 aa11.04□□□□□ -0.64
SH3BP4-205ENST00000444916 ZNF562Q6V9R5 426 aa11.04□□□□□ -0.64
SH3BP4-205ENST00000444916 HOGA1Q86XE5 327 aa11.04□□□□□ -0.64
SH3BP4-205ENST00000444916 ZNF645Q8N7E2 425 aa11.04□□□□□ -0.64
SH3BP4-205ENST00000444916 GVQW1Q8N7I0 195 aa11.04□□□□□ -0.64
SH3BP4-205ENST00000444916 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa11.04□□□□□ -0.64
SH3BP4-205ENST00000444916 SAMD12Q8N8I0 201 aa11.04□□□□□ -0.64
SH3BP4-205ENST00000444916 MINDY2Q8NBR6 621 aa11.04□□□□□ -0.64
SH3BP4-205ENST00000444916 BVESQ8NE79 360 aa11.04□□□□□ -0.64
SH3BP4-205ENST00000444916 MRAPQ8TCY5 172 aa11.04□□□□□ -0.64
SH3BP4-205ENST00000444916 ABHD5Q8WTS1 349 aa11.04□□□□□ -0.64
SH3BP4-205ENST00000444916 C4orf3Q8WVX3 66 aa11.04□□□□□ -0.64
SH3BP4-205ENST00000444916 DDB2Q92466 427 aa11.04□□□□□ -0.64
SH3BP4-205ENST00000444916 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
SH3BP4-205ENST00000444916 RAX2Q96IS3 184 aa11.04□□□□□ -0.64
SH3BP4-205ENST00000444916 HARBI1Q96MB7 349 aa11.04□□□□□ -0.64
SH3BP4-205ENST00000444916 CLCC1Q96S66 551 aa11.04□□□□□ -0.64
SH3BP4-205ENST00000444916 P2RX4Q99571 388 aa11.04□□□□□ -0.64
SH3BP4-205ENST00000444916 TPSG1Q9NRR2 321 aa11.04□□□□□ -0.64
SH3BP4-205ENST00000444916 TENM3Q9P273 2699 aa11.04□□□□□ -0.64
SH3BP4-205ENST00000444916 DNAH3Q8TD57 4116 aa11.03□□□□□ -0.64
SH3BP4-205ENST00000444916 LINC00473A8K010 186 aa11.03□□□□□ -0.64
SH3BP4-205ENST00000444916 J3QRK9 145 aa11.03□□□□□ -0.64
SH3BP4-205ENST00000444916 CCL24O00175 119 aa11.03□□□□□ -0.64
SH3BP4-205ENST00000444916 TUSC2O75896 110 aa11.03□□□□□ -0.64
SH3BP4-205ENST00000444916 SLC22A5O76082 557 aa11.03□□□□□ -0.64
SH3BP4-205ENST00000444916 IGLV2-23P01705 113 aa11.03□□□□□ -0.64
SH3BP4-205ENST00000444916 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
SH3BP4-205ENST00000444916 PTHLHP12272 177 aa11.03□□□□□ -0.64
SH3BP4-205ENST00000444916 CBX5P45973 191 aa11.03□□□□□ -0.64
SH3BP4-205ENST00000444916 ARPC4P59998 168 aa11.03□□□□□ -0.64
SH3BP4-205ENST00000444916 VBP1P61758 197 aa11.03□□□□□ -0.64
SH3BP4-205ENST00000444916 DEFB136Q30KP8 78 aa11.03□□□□□ -0.64
SH3BP4-205ENST00000444916 REC114Q7Z4M0 266 aa11.03□□□□□ -0.64
SH3BP4-205ENST00000444916 PPP1R27Q86WC6 154 aa11.03□□□□□ -0.64
SH3BP4-205ENST00000444916 DUX3Q96PT4 197 aa11.03□□□□□ -0.64
SH3BP4-205ENST00000444916 KLK15Q9H2R5 256 aa11.03□□□□□ -0.64
SH3BP4-205ENST00000444916 NECAP2Q9NVZ3 263 aa11.03□□□□□ -0.64
SH3BP4-205ENST00000444916 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
SH3BP4-205ENST00000444916 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa11.03□□□□□ -0.64
SH3BP4-205ENST00000444916 A3GALT2U3KPV4 340 aa11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.6 ms