RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000443120.5

ANKRD39-202, Transcript of ankyrin repeat domain 39, humanhuman

TSL 2

Gene ANKRD39, Length 4,965 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39-202ENST00000443120 TRAV39A0A0B4J263 110 aa13.24□□□□□ -0.29
ANKRD39-202ENST00000443120 TNFSF13O75888 250 aa13.24□□□□□ -0.29
ANKRD39-202ENST00000443120 ZNF645Q8N7E2 425 aa13.24□□□□□ -0.29
ANKRD39-202ENST00000443120 FBLN5Q9UBX5 448 aa13.24□□□□□ -0.29
ANKRD39-202ENST00000443120 CLDN14O95500 239 aa13.23□□□□□ -0.29
ANKRD39-202ENST00000443120 ORM1P02763 201 aa13.23□□□□□ -0.29
ANKRD39-202ENST00000443120 SMIM13P0DJ93 91 aa13.23□□□□□ -0.29
ANKRD39-202ENST00000443120 WNT5AP41221 380 aa13.23□□□□□ -0.29
ANKRD39-202ENST00000443120 FXYD3Q14802 87 aa13.23□□□□□ -0.29
ANKRD39-202ENST00000443120 RTP5Q14D33 572 aa13.23□□□□□ -0.29
ANKRD39-202ENST00000443120 TMEM92Q6UXU6 159 aa13.23□□□□□ -0.29
ANKRD39-202ENST00000443120 CFHR5Q9BXR6 569 aa13.23□□□□□ -0.29
ANKRD39-202ENST00000443120 ASCL3Q9NQ33 180 aa13.23□□□□□ -0.29
ANKRD39-202ENST00000443120 TMEM140Q9NV12 185 aa13.23□□□□□ -0.29
ANKRD39-202ENST00000443120 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa13.23□□□□□ -0.29
ANKRD39-202ENST00000443120 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa13.23□□□□□ -0.29
ANKRD39-202ENST00000443120 CA7P43166 264 aa13.23□□□□□ -0.29
ANKRD39-202ENST00000443120 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa13.23□□□□□ -0.29
ANKRD39-202ENST00000443120 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP13.23□□□□□ -0.29
ANKRD39-202ENST00000443120 NUBP1P53384 320 aa13.23□□□□□ -0.29
ANKRD39-202ENST00000443120 P2RY6Q15077 328 aa13.23□□□□□ -0.29
ANKRD39-202ENST00000443120 GFRALQ6UXV0 394 aa13.23□□□□□ -0.29
ANKRD39-202ENST00000443120 SAXO1Q8IYX7 474 aa13.23□□□□□ -0.29
ANKRD39-202ENST00000443120 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP13.23□□□□□ -0.29
ANKRD39-202ENST00000443120 TSPAN2O60636 221 aa13.23□□□□□ -0.29
ANKRD39-202ENST00000443120 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP13.23□□□□□ -0.29
ANKRD39-202ENST00000443120 TTC32Q5I0X7 151 aa13.23□□□□□ -0.29
ANKRD39-202ENST00000443120 CYTL1Q9NRR1 136 aa13.23□□□□□ -0.29
ANKRD39-202ENST00000443120 CLEC1BQ9P126 229 aa13.23□□□□□ -0.29
ANKRD39-202ENST00000443120 K7ESF4 209 aa13.22□□□□□ -0.29
ANKRD39-202ENST00000443120 SPRY3O43610 288 aa13.22□□□□□ -0.29
ANKRD39-202ENST00000443120 PSMG4Q5JS54 123 aa13.22□□□□□ -0.29
ANKRD39-202ENST00000443120 SPRED2Q7Z698 418 aa13.22□□□□□ -0.29
ANKRD39-202ENST00000443120 FAM216AQ8WUB2 273 aa13.22□□□□□ -0.29
ANKRD39-202ENST00000443120 THYN1Q9P016 225 aa13.22□□□□□ -0.29
ANKRD39-202ENST00000443120 HSPB7Q9UBY9 170 aa13.22□□□□□ -0.29
ANKRD39-202ENST00000443120 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP13.22□□□□□ -0.29
ANKRD39-202ENST00000443120 MARCH11A6NNE9 402 aa13.22□□□□□ -0.29
ANKRD39-202ENST00000443120 UCP1P25874 307 aa13.22□□□□□ -0.29
ANKRD39-202ENST00000443120 DLX1P56177 255 aa13.22□□□□□ -0.29
ANKRD39-202ENST00000443120 RPL30P62888 115 aaKnown RBP13.22□□□□□ -0.29
ANKRD39-202ENST00000443120 UFC1Q9Y3C8 167 aa13.22□□□□□ -0.29
ANKRD39-202ENST00000443120 TPRP12270 2363 aaKnown RBP13.22□□□□□ -0.29
ANKRD39-202ENST00000443120 C4orf51C9J302 202 aa13.22□□□□□ -0.29
ANKRD39-202ENST00000443120 SMIM10L1P0DMW3 83 aa13.22□□□□□ -0.29
ANKRD39-202ENST00000443120 SMIM10Q96HG1 83 aa13.22□□□□□ -0.29
ANKRD39-202ENST00000443120 C5orf67F2Z3F1 127 aa13.22□□□□□ -0.29
ANKRD39-202ENST00000443120 MS4A18H0YCH9 400 aa13.22□□□□□ -0.29
ANKRD39-202ENST00000443120 SERF1AO75920 110 aa13.22□□□□□ -0.29
ANKRD39-202ENST00000443120 CRYBB3P26998 211 aa13.22□□□□□ -0.29
ANKRD39-202ENST00000443120 ARF6P62330 175 aa13.22□□□□□ -0.29
ANKRD39-202ENST00000443120 MS4A18Q3C1V0 323 aa13.22□□□□□ -0.29
ANKRD39-202ENST00000443120 VASH2Q86V25 355 aa13.22□□□□□ -0.29
ANKRD39-202ENST00000443120 NRN1Q9NPD7 142 aa13.22□□□□□ -0.29
ANKRD39-202ENST00000443120 OR51B2Q9Y5P1 312 aa13.22□□□□□ -0.29
ANKRD39-202ENST00000443120 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP13.21□□□□□ -0.29
ANKRD39-202ENST00000443120 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP13.21□□□□□ -0.29
ANKRD39-202ENST00000443120 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa13.21□□□□□ -0.29
ANKRD39-202ENST00000443120 TMEM229AB2RXF0 380 aa13.21□□□□□ -0.29
ANKRD39-202ENST00000443120 C8orf88P0DMB2 117 aa13.21□□□□□ -0.29
ANKRD39-202ENST00000443120 IL11P20809 199 aa13.21□□□□□ -0.29
ANKRD39-202ENST00000443120 GCHFRP30047 84 aa13.21□□□□□ -0.29
ANKRD39-202ENST00000443120 GFI1BQ5VTD9 330 aa13.21□□□□□ -0.29
ANKRD39-202ENST00000443120 ARL17AQ8IVW1 177 aa13.21□□□□□ -0.29
ANKRD39-202ENST00000443120 TINAGQ9UJW2 476 aa13.21□□□□□ -0.29
ANKRD39-202ENST00000443120 NDUFS8O00217 210 aa13.21□□□□□ -0.29
ANKRD39-202ENST00000443120 CXCL1P09341 107 aa13.21□□□□□ -0.29
ANKRD39-202ENST00000443120 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP13.21□□□□□ -0.29
ANKRD39-202ENST00000443120 COL9A1P20849 921 aa13.21□□□□□ -0.3
ANKRD39-202ENST00000443120 SSPNQ14714 243 aa13.21□□□□□ -0.3
ANKRD39-202ENST00000443120 ASPHD2Q6ICH7 369 aa13.21□□□□□ -0.3
ANKRD39-202ENST00000443120 UCN2Q96RP3 112 aa13.21□□□□□ -0.3
ANKRD39-202ENST00000443120 PLSCR2Q9NRY7 297 aa13.21□□□□□ -0.3
ANKRD39-202ENST00000443120 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa13.2□□□□□ -0.3
ANKRD39-202ENST00000443120 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP13.2□□□□□ -0.3
ANKRD39-202ENST00000443120 KIR2DL2P43627 348 aaPredicted RBP13.2□□□□□ -0.3
ANKRD39-202ENST00000443120 RPL31P62899 125 aaKnown RBP13.2□□□□□ -0.3
ANKRD39-202ENST00000443120 CENPWQ5EE01 88 aa13.2□□□□□ -0.3
ANKRD39-202ENST00000443120 IMMP2LQ96T52 175 aa13.2□□□□□ -0.3
ANKRD39-202ENST00000443120 SPTA1P02549 2419 aa13.2□□□□□ -0.3
ANKRD39-202ENST00000443120 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP13.2□□□□□ -0.3
ANKRD39-202ENST00000443120 DEFB124Q8NES8 71 aa13.2□□□□□ -0.3
ANKRD39-202ENST00000443120 R4GN57 208 aa13.2□□□□□ -0.3
ANKRD39-202ENST00000443120 A0A1W2PPE3 182 aa13.2□□□□□ -0.3
ANKRD39-202ENST00000443120 ZG16O60844 167 aa13.2□□□□□ -0.3
ANKRD39-202ENST00000443120 HYPMO75409 117 aa13.2□□□□□ -0.3
ANKRD39-202ENST00000443120 EGR1P18146 543 aa13.2□□□□□ -0.3
ANKRD39-202ENST00000443120 HIST1H4GQ99525 98 aa13.2□□□□□ -0.3
ANKRD39-202ENST00000443120 HBBP68871 147 aa13.19□□□□□ -0.3
ANKRD39-202ENST00000443120 KCNMB1Q16558 191 aa13.19□□□□□ -0.3
ANKRD39-202ENST00000443120 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa13.19□□□□□ -0.3
ANKRD39-202ENST00000443120 IGHV3-13P01766 116 aa13.19□□□□□ -0.3
ANKRD39-202ENST00000443120 IGHV3-7P01780 117 aa13.19□□□□□ -0.3
ANKRD39-202ENST00000443120 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP13.19□□□□□ -0.3
ANKRD39-202ENST00000443120 OR4A8P0C604 315 aa13.19□□□□□ -0.3
ANKRD39-202ENST00000443120 MST1P26927 711 aa13.19□□□□□ -0.3
ANKRD39-202ENST00000443120 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP13.19□□□□□ -0.3
ANKRD39-202ENST00000443120 RASL11BQ9BPW5 248 aa13.19□□□□□ -0.3
ANKRD39-202ENST00000443120 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP13.19□□□□□ -0.3
ANKRD39-202ENST00000443120 C19orf67A6NJJ6 358 aa13.19□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 66.8 ms