RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439106.5

PRAME-209, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene PRAME, Length 891 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-209ENST00000439106 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa10.77□□□□□ -0.69
PRAME-209ENST00000439106 KIR2DS1Q14954 304 aa10.77□□□□□ -0.69
PRAME-209ENST00000439106 PSG5Q15238 335 aa10.77□□□□□ -0.69
PRAME-209ENST00000439106 C19orf54Q5BKX5 351 aa10.77□□□□□ -0.69
PRAME-209ENST00000439106 ASPHD1Q5U4P2 390 aa10.77□□□□□ -0.69
PRAME-209ENST00000439106 SFXN4Q6P4A7 337 aa10.77□□□□□ -0.69
PRAME-209ENST00000439106 OR11H1Q8NG94 326 aa10.77□□□□□ -0.69
PRAME-209ENST00000439106 OR10J5Q8NHC4 309 aa10.77□□□□□ -0.69
PRAME-209ENST00000439106 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa10.77□□□□□ -0.69
PRAME-209ENST00000439106 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP10.77□□□□□ -0.69
PRAME-209ENST00000439106 SLC35D1Q9NTN3 355 aa10.77□□□□□ -0.69
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PRAME-209ENST00000439106 TGFBR1P36897 503 aa10.76□□□□□ -0.69
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PRAME-209ENST00000439106 TOLLIPQ9H0E2 274 aa10.76□□□□□ -0.69
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PRAME-209ENST00000439106 I3L521 148 aa10.75□□□□□ -0.69
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PRAME-209ENST00000439106 RAB9AP51151 201 aa10.75□□□□□ -0.69
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PRAME-209ENST00000439106 DEFB121Q5J5C9 76 aa10.75□□□□□ -0.69
PRAME-209ENST00000439106 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP10.75□□□□□ -0.69
PRAME-209ENST00000439106 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa10.75□□□□□ -0.69
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PRAME-209ENST00000439106 OR5M8Q8NGP6 311 aa10.75□□□□□ -0.69
PRAME-209ENST00000439106 GRPEL2Q8TAA5 225 aa10.75□□□□□ -0.69
PRAME-209ENST00000439106 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP10.75□□□□□ -0.69
PRAME-209ENST00000439106 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa10.75□□□□□ -0.69
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PRAME-209ENST00000439106 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP10.74□□□□□ -0.69
PRAME-209ENST00000439106 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP10.74□□□□□ -0.69
PRAME-209ENST00000439106 PJVKQ0ZLH3 352 aa10.74□□□□□ -0.69
PRAME-209ENST00000439106 ZNF260Q3ZCT1 412 aa10.74□□□□□ -0.69
PRAME-209ENST00000439106 IDNKQ5T6J7 187 aa10.74□□□□□ -0.69
PRAME-209ENST00000439106 PPP1R27Q86WC6 154 aa10.74□□□□□ -0.69
PRAME-209ENST00000439106 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP10.74□□□□□ -0.69
PRAME-209ENST00000439106 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP10.74□□□□□ -0.69
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PRAME-209ENST00000439106 SLC25A38Q96DW6 304 aa10.74□□□□□ -0.69
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PRAME-209ENST00000439106 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP10.74□□□□□ -0.69
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PRAME-209ENST00000439106 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP10.74□□□□□ -0.69
PRAME-209ENST00000439106 VSIG4Q9Y279 399 aa10.74□□□□□ -0.69
PRAME-209ENST00000439106 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa10.74□□□□□ -0.69
PRAME-209ENST00000439106 LINC00473A8K010 186 aa10.73□□□□□ -0.69
PRAME-209ENST00000439106 SEC14L6B5MCN3 397 aa10.73□□□□□ -0.69
PRAME-209ENST00000439106 SSX5O60225 188 aa10.73□□□□□ -0.69
PRAME-209ENST00000439106 SPDEFO95238 335 aa10.73□□□□□ -0.69
PRAME-209ENST00000439106 FCER2P06734 321 aa10.73□□□□□ -0.69
PRAME-209ENST00000439106 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP10.73□□□□□ -0.69
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PRAME-209ENST00000439106 KCTD21Q4G0X4 260 aa10.73□□□□□ -0.69
PRAME-209ENST00000439106 HACD4Q5VWC8 232 aa10.73□□□□□ -0.69
PRAME-209ENST00000439106 OR1N2Q8NGR9 330 aa10.73□□□□□ -0.69
PRAME-209ENST00000439106 ARPC1AQ92747 370 aa10.73□□□□□ -0.69
PRAME-209ENST00000439106 HARBI1Q96MB7 349 aa10.73□□□□□ -0.69
PRAME-209ENST00000439106 PRR25Q96S07 402 aa10.73□□□□□ -0.69
PRAME-209ENST00000439106 RNF5Q99942 180 aa10.73□□□□□ -0.69
PRAME-209ENST00000439106 GPR61Q9BZJ8 451 aa10.73□□□□□ -0.69
PRAME-209ENST00000439106 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP10.72□□□□□ -0.69
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PRAME-209ENST00000439106 DUTP33316 252 aaKnown RBP10.72□□□□□ -0.69
PRAME-209ENST00000439106 GNG2P59768 71 aa10.72□□□□□ -0.69
PRAME-209ENST00000439106 ZNF616Q08AN1 781 aa10.72□□□□□ -0.69
PRAME-209ENST00000439106 FXYD3Q14802 87 aa10.72□□□□□ -0.69
PRAME-209ENST00000439106 ACTBL2Q562R1 376 aa10.72□□□□□ -0.69
PRAME-209ENST00000439106 OR2B11Q5JQS5 317 aa10.72□□□□□ -0.69
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PRAME-209ENST00000439106 Q6ZS49 121 aa10.72□□□□□ -0.69
PRAME-209ENST00000439106 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa10.71□□□□□ -0.69
PRAME-209ENST00000439106 A0A087WW49 117 aa10.71□□□□□ -0.69
PRAME-209ENST00000439106 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa10.71□□□□□ -0.69
PRAME-209ENST00000439106 SHOXO15266 292 aa10.71□□□□□ -0.69
PRAME-209ENST00000439106 DIRAS3O95661 229 aa10.71□□□□□ -0.69
PRAME-209ENST00000439106 CRYGBP07316 175 aa10.71□□□□□ -0.69
PRAME-209ENST00000439106 APELAP0DMC3 54 aa10.71□□□□□ -0.69
PRAME-209ENST00000439106 IGKV1-13P0DP09 117 aa10.71□□□□□ -0.69
PRAME-209ENST00000439106 TPPP2P59282 170 aa10.71□□□□□ -0.69
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