RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437028.5

SNHG11-208, Transcript of small nucleolar RNA host gene 11, human

TSL 3

Gene SNHG11, Length 1,169 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNHG11-208	ENST00000437028	SLC25A48	Q6ZT89	311 aa	Known RBP	12.11	□□□□□ -0.47
SNHG11-208	ENST00000437028	RNF152	Q8N8N0	203 aa		12.11	□□□□□ -0.47
SNHG11-208	ENST00000437028	FCAMR	Q8WWV6	532 aa		12.11	□□□□□ -0.47
SNHG11-208	ENST00000437028	SCPEP1	Q9HB40	452 aa		12.11	□□□□□ -0.47
SNHG11-208	ENST00000437028	TAF9B	Q9HBM6	251 aa		12.11	□□□□□ -0.47
SNHG11-208	ENST00000437028	MBNL3	Q9NUK0	354 aa	Known RBP	12.11	□□□□□ -0.47
SNHG11-208	ENST00000437028	ZNF580	Q9UK33	172 aa		12.11	□□□□□ -0.47
SNHG11-208	ENST00000437028	KMT2C	Q8NEZ4	4911 aa	Known RBP	12.11	□□□□□ -0.47
SNHG11-208	ENST00000437028	LINC01548	A6NM66	108 aa		12.1	□□□□□ -0.47
SNHG11-208	ENST00000437028	TRDC	B7Z8K6	153 aa		12.1	□□□□□ -0.47
SNHG11-208	ENST00000437028	SULT1C2	O00338	296 aa		12.1	□□□□□ -0.47
SNHG11-208	ENST00000437028	HLA-DRB3	P79483	266 aa		12.1	□□□□□ -0.47
SNHG11-208	ENST00000437028	MRPS10	P82664	201 aa	Known RBP	12.1	□□□□□ -0.47
SNHG11-208	ENST00000437028	STEAP3	Q658P3	488 aa		12.1	□□□□□ -0.47
SNHG11-208	ENST00000437028	ZNF880	Q6PDB4	577 aa		12.1	□□□□□ -0.47
SNHG11-208	ENST00000437028	LCNL1	Q6ZST4	164 aa		12.1	□□□□□ -0.47
SNHG11-208	ENST00000437028	DUX3	Q96PT4	197 aa		12.1	□□□□□ -0.47
SNHG11-208	ENST00000437028	NBEAL2	Q6ZNJ1	2754 aa		12.1	□□□□□ -0.47
SNHG11-208	ENST00000437028	RBBP9	O75884	186 aa		12.09	□□□□□ -0.47
SNHG11-208	ENST00000437028	IGHG4	P01861	327 aa		12.09	□□□□□ -0.47
SNHG11-208	ENST00000437028	HBZ	P02008	142 aa		12.09	□□□□□ -0.47
SNHG11-208	ENST00000437028	PTBP1	P26599	531 aa	Known RBP eCLIP	12.09	□□□□□ -0.47
SNHG11-208	ENST00000437028	ARPC4	P59998	168 aa		12.09	□□□□□ -0.47
SNHG11-208	ENST00000437028	HMGN3	Q15651	99 aa		12.09	□□□□□ -0.47
SNHG11-208	ENST00000437028	LINC00299	Q6ZSB3	139 aa		12.09	□□□□□ -0.47
SNHG11-208	ENST00000437028	HOGA1	Q86XE5	327 aa		12.09	□□□□□ -0.47
SNHG11-208	ENST00000437028	FAM71E2	Q8N5Q1	922 aa		12.09	□□□□□ -0.47
SNHG11-208	ENST00000437028	GVQW1	Q8N7I0	195 aa		12.09	□□□□□ -0.47
SNHG11-208	ENST00000437028	ZNF439	Q8NDP4	499 aa		12.09	□□□□□ -0.47
SNHG11-208	ENST00000437028	OR10V1	Q8NGI7	309 aa		12.09	□□□□□ -0.47
SNHG11-208	ENST00000437028	OR52I2	Q8NH67	350 aa		12.09	□□□□□ -0.47
SNHG11-208	ENST00000437028	GPX8	Q8TED1	209 aa		12.09	□□□□□ -0.47
SNHG11-208	ENST00000437028	C4orf3	Q8WVX3	66 aa		12.09	□□□□□ -0.47
SNHG11-208	ENST00000437028	IL1F10	Q8WWZ1	152 aa		12.09	□□□□□ -0.47
SNHG11-208	ENST00000437028	S100Z	Q8WXG8	99 aa		12.09	□□□□□ -0.47
SNHG11-208	ENST00000437028	SOST	Q9BQB4	213 aa		12.09	□□□□□ -0.47
SNHG11-208	ENST00000437028	PLSCR3	Q9NRY6	295 aa		12.09	□□□□□ -0.47
SNHG11-208	ENST00000437028		V9GYH0	126 aa		12.09	□□□□□ -0.47
SNHG11-208	ENST00000437028	TENM3	Q9P273	2699 aa		12.08	□□□□□ -0.48
SNHG11-208	ENST00000437028	SEC14L6	B5MCN3	397 aa		12.08	□□□□□ -0.48
SNHG11-208	ENST00000437028	GABARAP	H6UMI1	98 aa		12.08	□□□□□ -0.48
SNHG11-208	ENST00000437028	CTDSPL	O15194	276 aa		12.08	□□□□□ -0.48
SNHG11-208	ENST00000437028	FABP7	O15540	132 aa		12.08	□□□□□ -0.48
SNHG11-208	ENST00000437028	IGF1	P05019	195 aa		12.08	□□□□□ -0.48
SNHG11-208	ENST00000437028	SCT	P09683	121 aa		12.08	□□□□□ -0.48
SNHG11-208	ENST00000437028	GSTT2	P0CG29	244 aa		12.08	□□□□□ -0.48
SNHG11-208	ENST00000437028	GSTT2B	P0CG30	244 aa		12.08	□□□□□ -0.48
SNHG11-208	ENST00000437028	ETV6	P41212	452 aa		12.08	□□□□□ -0.48
SNHG11-208	ENST00000437028	ZNF45	Q02386	682 aa		12.08	□□□□□ -0.48
SNHG11-208	ENST00000437028	DEFB136	Q30KP8	78 aa		12.08	□□□□□ -0.48
SNHG11-208	ENST00000437028	TMEM65	Q6PI78	240 aa		12.08	□□□□□ -0.48
SNHG11-208	ENST00000437028	ZNF554	Q86TJ5	538 aa		12.08	□□□□□ -0.48
SNHG11-208	ENST00000437028	BEST4	Q8NFU0	473 aa		12.08	□□□□□ -0.48
SNHG11-208	ENST00000437028	GALM	Q96C23	342 aa		12.08	□□□□□ -0.48
SNHG11-208	ENST00000437028	RBMXL1	Q96E39	390 aa	Known RBP	12.08	□□□□□ -0.48
SNHG11-208	ENST00000437028	PARP12	Q9H0J9	701 aa	Known RBP	12.08	□□□□□ -0.48
SNHG11-208	ENST00000437028	ZNF107	Q9UII5	783 aa	Predicted RBP	12.08	□□□□□ -0.48
SNHG11-208	ENST00000437028	DNAH9	Q9NYC9	4486 aa		12.07	□□□□□ -0.48
SNHG11-208	ENST00000437028	HSPA12A	O43301	675 aa		12.07	□□□□□ -0.48
SNHG11-208	ENST00000437028	LANCL1	O43813	399 aa		12.07	□□□□□ -0.48
SNHG11-208	ENST00000437028	RCVRN	P35243	200 aa		12.07	□□□□□ -0.48
SNHG11-208	ENST00000437028	LUM	P51884	338 aa	Predicted RBP	12.07	□□□□□ -0.48
SNHG11-208	ENST00000437028	CFHR3	Q02985	330 aa		12.07	□□□□□ -0.48
SNHG11-208	ENST00000437028	SRSF7	Q16629	238 aa	Known RBP eCLIP	12.07	□□□□□ -0.48
SNHG11-208	ENST00000437028	CT45A1	Q5HYN5	189 aa		12.07	□□□□□ -0.48
SNHG11-208	ENST00000437028		Q8N402	240 aa		12.07	□□□□□ -0.48
SNHG11-208	ENST00000437028	OR4A4P	Q8NGN8	299 aa		12.07	□□□□□ -0.48
SNHG11-208	ENST00000437028	CT45A3	Q8NHU0	189 aa		12.07	□□□□□ -0.48
SNHG11-208	ENST00000437028	SMIM4	Q8WVI0	70 aa		12.07	□□□□□ -0.48
SNHG11-208	ENST00000437028	HSPB9	Q9BQS6	159 aa		12.07	□□□□□ -0.48
SNHG11-208	ENST00000437028	OR2S2	Q9NQN1	319 aa		12.07	□□□□□ -0.48
SNHG11-208	ENST00000437028	IGKV1D-8	A0A087WSZ0	117 aa		12.06	□□□□□ -0.48
SNHG11-208	ENST00000437028	ZNF736	B4DX44	427 aa	Predicted RBP	12.06	□□□□□ -0.48
SNHG11-208	ENST00000437028	BET1	O15155	118 aa		12.06	□□□□□ -0.48
SNHG11-208	ENST00000437028	GSTZ1	O43708	216 aa	Predicted RBP	12.06	□□□□□ -0.48
SNHG11-208	ENST00000437028	OR8U8	P0C7N1	319 aa		12.06	□□□□□ -0.48
SNHG11-208	ENST00000437028	PSMB8	P28062	276 aa		12.06	□□□□□ -0.48
SNHG11-208	ENST00000437028	HLA-DMA	P28067	261 aa		12.06	□□□□□ -0.48
SNHG11-208	ENST00000437028	PPP1CC	P36873	323 aa	Known RBP	12.06	□□□□□ -0.48
SNHG11-208	ENST00000437028	ECI1	P42126	302 aa		12.06	□□□□□ -0.48
SNHG11-208	ENST00000437028	INPP1	P49441	399 aa		12.06	□□□□□ -0.48
SNHG11-208	ENST00000437028	INSL3	P51460	131 aa		12.06	□□□□□ -0.48
SNHG11-208	ENST00000437028	F2RL1	P55085	397 aa		12.06	□□□□□ -0.48
SNHG11-208	ENST00000437028	ACTB	P60709	375 aa		12.06	□□□□□ -0.48
SNHG11-208	ENST00000437028	LSAMP	Q13449	338 aa		12.06	□□□□□ -0.48
SNHG11-208	ENST00000437028	ZNF846	Q147U1	533 aa		12.06	□□□□□ -0.48
SNHG11-208	ENST00000437028	MMD	Q15546	238 aa		12.06	□□□□□ -0.48
SNHG11-208	ENST00000437028	ZNF79	Q15937	498 aa		12.06	□□□□□ -0.48
SNHG11-208	ENST00000437028		Q6ZS49	121 aa		12.06	□□□□□ -0.48
SNHG11-208	ENST00000437028	GDPD1	Q8N9F7	314 aa		12.06	□□□□□ -0.48
SNHG11-208	ENST00000437028	THAP7	Q9BT49	309 aa	Predicted RBP	12.06	□□□□□ -0.48
SNHG11-208	ENST00000437028	WDR12	Q9GZL7	423 aa	Known RBP	12.06	□□□□□ -0.48
SNHG11-208	ENST00000437028	AKIP1	Q9NQ31	210 aa		12.06	□□□□□ -0.48
SNHG11-208	ENST00000437028	KLK11	Q9UBX7	282 aa		12.06	□□□□□ -0.48
SNHG11-208	ENST00000437028	MTFP1	Q9UDX5	166 aa		12.06	□□□□□ -0.48
SNHG11-208	ENST00000437028	SLC23A1	Q9UHI7	598 aa		12.06	□□□□□ -0.48
SNHG11-208	ENST00000437028	ANXA10	Q9UJ72	324 aa		12.06	□□□□□ -0.48
SNHG11-208	ENST00000437028	JPT1	Q9UK76	154 aa		12.06	□□□□□ -0.48
SNHG11-208	ENST00000437028		U3KQK5	164 aa		12.06	□□□□□ -0.48
SNHG11-208	ENST00000437028	RGS11	O94810	467 aa		12.05	□□□□□ -0.48

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