RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428394.6

HCLS1-202, Transcript of hematopoietic cell-specific Lyn substrate 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HCLS1, Length 1,560 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCLS1-202ENST00000428394 ODAMA1E959 279 aa14.15□□□□□ -0.14
HCLS1-202ENST00000428394 IGKV1D-33P01593 117 aa14.15□□□□□ -0.14
HCLS1-202ENST00000428394 IGKV1-33P01594 117 aa14.15□□□□□ -0.14
HCLS1-202ENST00000428394 SP1P08047 785 aa14.15□□□□□ -0.14
HCLS1-202ENST00000428394 RAB4BP61018 213 aa14.15□□□□□ -0.14
HCLS1-202ENST00000428394 MZT1Q08AG7 82 aa14.15□□□□□ -0.14
HCLS1-202ENST00000428394 GAMTQ14353 236 aa14.15□□□□□ -0.14
HCLS1-202ENST00000428394 SLC10A1Q14973 349 aa14.15□□□□□ -0.14
HCLS1-202ENST00000428394 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa14.15□□□□□ -0.14
HCLS1-202ENST00000428394 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP14.15□□□□□ -0.14
HCLS1-202ENST00000428394 FFAR4Q5NUL3 377 aa14.15□□□□□ -0.14
HCLS1-202ENST00000428394 TMEM164Q5U3C3 297 aa14.15□□□□□ -0.14
HCLS1-202ENST00000428394 GFI1BQ5VTD9 330 aa14.15□□□□□ -0.14
HCLS1-202ENST00000428394 CDCP2Q5VXM1 449 aa14.15□□□□□ -0.14
HCLS1-202ENST00000428394 OR8G2PQ6IF36 304 aa14.15□□□□□ -0.14
HCLS1-202ENST00000428394 OR52E5Q8NH55 327 aa14.15□□□□□ -0.14
HCLS1-202ENST00000428394 TMEM18Q96B42 140 aa14.15□□□□□ -0.14
HCLS1-202ENST00000428394 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP14.15□□□□□ -0.14
HCLS1-202ENST00000428394 WDR83OSQ9Y284 106 aa14.15□□□□□ -0.14
HCLS1-202ENST00000428394 CACNA1AO00555 2505 aa14.15□□□□□ -0.14
HCLS1-202ENST00000428394 ARGFXA6NJG6 315 aa14.14□□□□□ -0.15
HCLS1-202ENST00000428394 FAM166BA8MTA8 275 aa14.14□□□□□ -0.15
HCLS1-202ENST00000428394 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP14.14□□□□□ -0.15
HCLS1-202ENST00000428394 ADH4P08319 380 aa14.14□□□□□ -0.15
HCLS1-202ENST00000428394 JMJD7P0C870 316 aa14.14□□□□□ -0.15
HCLS1-202ENST00000428394 HTD2P86397 168 aa14.14□□□□□ -0.15
HCLS1-202ENST00000428394 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa14.14□□□□□ -0.15
HCLS1-202ENST00000428394 OR4F5Q8NH21 305 aa14.14□□□□□ -0.15
HCLS1-202ENST00000428394 OR4F4Q96R69 305 aa14.14□□□□□ -0.15
HCLS1-202ENST00000428394 TMEM204Q9BSN7 226 aa14.14□□□□□ -0.15
HCLS1-202ENST00000428394 OR2D2Q9H210 308 aa14.14□□□□□ -0.15
HCLS1-202ENST00000428394 OR6C3Q9NZP0 311 aa14.14□□□□□ -0.15
HCLS1-202ENST00000428394 GAB2Q9UQC2 676 aa14.14□□□□□ -0.15
HCLS1-202ENST00000428394 MYO15AQ9UKN7 3530 aa14.14□□□□□ -0.15
HCLS1-202ENST00000428394 C12orf77C9JDV5 145 aa14.13□□□□□ -0.15
HCLS1-202ENST00000428394 MLNRO43193 412 aa14.13□□□□□ -0.15
HCLS1-202ENST00000428394 GYPAP02724 150 aa14.13□□□□□ -0.15
HCLS1-202ENST00000428394 AMBPP02760 352 aa14.13□□□□□ -0.15
HCLS1-202ENST00000428394 CD46P15529 392 aa14.13□□□□□ -0.15
HCLS1-202ENST00000428394 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP14.13□□□□□ -0.15
HCLS1-202ENST00000428394 MEOX1P50221 254 aa14.13□□□□□ -0.15
HCLS1-202ENST00000428394 COL10A1Q03692 680 aa14.13□□□□□ -0.15
HCLS1-202ENST00000428394 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa14.13□□□□□ -0.15
HCLS1-202ENST00000428394 C2orf88Q9BSF0 95 aa14.13□□□□□ -0.15
HCLS1-202ENST00000428394 CXXC4Q9H2H0 198 aa14.13□□□□□ -0.15
HCLS1-202ENST00000428394 A0A087X0M5 115 aa14.13□□□□□ -0.15
HCLS1-202ENST00000428394 A0A1B0GX30 115 aa14.13□□□□□ -0.15
HCLS1-202ENST00000428394 XKRY2A2RUG3 117 aa14.13□□□□□ -0.15
HCLS1-202ENST00000428394 TMPRSS3P57727 454 aa14.13□□□□□ -0.15
HCLS1-202ENST00000428394 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP14.13□□□□□ -0.15
HCLS1-202ENST00000428394 FOXL1Q12952 345 aa14.13□□□□□ -0.15
HCLS1-202ENST00000428394 SSX9Q7RTT3 188 aa14.13□□□□□ -0.15
HCLS1-202ENST00000428394 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP14.13□□□□□ -0.15
HCLS1-202ENST00000428394 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP14.13□□□□□ -0.15
HCLS1-202ENST00000428394 SLC25A22Q9H936 323 aa14.13□□□□□ -0.15
HCLS1-202ENST00000428394 DNAH14Q0VDD8 3507 aa14.12□□□□□ -0.15
HCLS1-202ENST00000428394 PATE3B3GLJ2 98 aa14.12□□□□□ -0.15
HCLS1-202ENST00000428394 HBZP02008 142 aa14.12□□□□□ -0.15
HCLS1-202ENST00000428394 KIR2DS2P43631 304 aa14.12□□□□□ -0.15
HCLS1-202ENST00000428394 OR3A1P47881 315 aa14.12□□□□□ -0.15
HCLS1-202ENST00000428394 FAM90A1Q86YD7 464 aa14.12□□□□□ -0.15
HCLS1-202ENST00000428394 WDYHV1Q96HA8 205 aa14.12□□□□□ -0.15
HCLS1-202ENST00000428394 CDIPTO14735 213 aa14.11□□□□□ -0.15
HCLS1-202ENST00000428394 S1PR2O95136 353 aa14.11□□□□□ -0.15
HCLS1-202ENST00000428394 GZMBP10144 247 aa14.11□□□□□ -0.15
HCLS1-202ENST00000428394 OPRK1P41145 380 aa14.11□□□□□ -0.15
HCLS1-202ENST00000428394 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP14.11□□□□□ -0.15
HCLS1-202ENST00000428394 HNF4GQ14541 408 aa14.11□□□□□ -0.15
HCLS1-202ENST00000428394 SMIM21Q3B7S5 101 aa14.11□□□□□ -0.15
HCLS1-202ENST00000428394 BEND4Q6ZU67 534 aa14.11□□□□□ -0.15
HCLS1-202ENST00000428394 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP14.11□□□□□ -0.15
HCLS1-202ENST00000428394 PRR18Q8N4B5 295 aa14.11□□□□□ -0.15
HCLS1-202ENST00000428394 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa14.11□□□□□ -0.15
HCLS1-202ENST00000428394 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP14.11□□□□□ -0.15
HCLS1-202ENST00000428394 A0A1B0GWJ7 208 aa14.1□□□□□ -0.15
HCLS1-202ENST00000428394 C9orf172C9J069 976 aa14.1□□□□□ -0.15
HCLS1-202ENST00000428394 C11orf94C9JXX5 98 aa14.1□□□□□ -0.15
HCLS1-202ENST00000428394 SPINT2O43291 252 aa14.1□□□□□ -0.15
HCLS1-202ENST00000428394 KRASP01116 189 aa14.1□□□□□ -0.15
HCLS1-202ENST00000428394 KITLGP21583 273 aa14.1□□□□□ -0.15
HCLS1-202ENST00000428394 G6PCP35575 357 aa14.1□□□□□ -0.15
HCLS1-202ENST00000428394 SPCS3P61009 180 aa14.1□□□□□ -0.15
HCLS1-202ENST00000428394 IQCJQ1A5X6 159 aa14.1□□□□□ -0.15
HCLS1-202ENST00000428394 TMEM144Q7Z5S9 345 aa14.1□□□□□ -0.15
HCLS1-202ENST00000428394 OR1L1Q8NH94 360 aa14.1□□□□□ -0.15
HCLS1-202ENST00000428394 NDUFAF3Q9BU61 184 aa14.1□□□□□ -0.15
HCLS1-202ENST00000428394 RAB9BQ9NP90 201 aa14.1□□□□□ -0.15
HCLS1-202ENST00000428394 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa14.1□□□□□ -0.15
HCLS1-202ENST00000428394 LY96Q9Y6Y9 160 aa14.1□□□□□ -0.15
HCLS1-202ENST00000428394 DMDP11532 3685 aa14.1□□□□□ -0.15
HCLS1-202ENST00000428394 FREM1Q5H8C1 2179 aa14.1□□□□□ -0.15
HCLS1-202ENST00000428394 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa14.09□□□□□ -0.15
HCLS1-202ENST00000428394 ITGB1BP1O14713 200 aa14.09□□□□□ -0.15
HCLS1-202ENST00000428394 SLC31A2O15432 143 aa14.09□□□□□ -0.15
HCLS1-202ENST00000428394 C4orf17Q53FE4 359 aa14.09□□□□□ -0.15
HCLS1-202ENST00000428394 PDZD11Q5EBL8 140 aa14.09□□□□□ -0.15
HCLS1-202ENST00000428394 ACP7Q6ZNF0 438 aa14.09□□□□□ -0.15
HCLS1-202ENST00000428394 SLC25A40Q8TBP6 338 aa14.09□□□□□ -0.15
HCLS1-202ENST00000428394 OR2J1Q9GZK6 312 aa14.09□□□□□ -0.15
HCLS1-202ENST00000428394 NCOR1P1Q9H4R4 102 aa14.09□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 71 ms