RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421832.2

CTU1-201, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CTU1, Length 2,087 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU1-201ENST00000421832 FAM58AQ8N1B3 248 aa20.44■□□□□ 0.86
CTU1-201ENST00000421832 OR10G4Q8NGN3 311 aa20.44■□□□□ 0.86
CTU1-201ENST00000421832 ABHD5Q8WTS1 349 aa20.44■□□□□ 0.86
CTU1-201ENST00000421832 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa20.44■□□□□ 0.86
CTU1-201ENST00000421832 IL19Q9UHD0 177 aa20.44■□□□□ 0.86
CTU1-201ENST00000421832 B9A039 149 aa20.43■□□□□ 0.86
CTU1-201ENST00000421832 RND2P52198 227 aa20.43■□□□□ 0.86
CTU1-201ENST00000421832 MZT1Q08AG7 82 aa20.43■□□□□ 0.86
CTU1-201ENST00000421832 CHRFAM7AQ494W8 412 aa20.43■□□□□ 0.86
CTU1-201ENST00000421832 ZNF506Q5JVG8 444 aa20.43■□□□□ 0.86
CTU1-201ENST00000421832 BRICD5Q6PL45 260 aa20.43■□□□□ 0.86
CTU1-201ENST00000421832 C6orf201Q7Z4U5 140 aa20.43■□□□□ 0.86
CTU1-201ENST00000421832 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa20.43■□□□□ 0.86
CTU1-201ENST00000421832 LRTM2Q8N967 370 aa20.43■□□□□ 0.86
CTU1-201ENST00000421832 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
CTU1-201ENST00000421832 SPSB3Q6PJ21 355 aa20.42■□□□□ 0.86
CTU1-201ENST00000421832 C1orf87Q8N0U7 546 aa20.42■□□□□ 0.86
CTU1-201ENST00000421832 FAM210BQ96KR6 192 aa20.42■□□□□ 0.86
CTU1-201ENST00000421832 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa20.42■□□□□ 0.86
CTU1-201ENST00000421832 SH3BGRL3Q9H299 93 aa20.42■□□□□ 0.86
CTU1-201ENST00000421832 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa20.42■□□□□ 0.86
CTU1-201ENST00000421832 ADH4P08319 380 aa20.42■□□□□ 0.86
CTU1-201ENST00000421832 FRZBQ92765 325 aa20.42■□□□□ 0.86
CTU1-201ENST00000421832 PECRQ9BY49 303 aa20.42■□□□□ 0.86
CTU1-201ENST00000421832 GCM1Q9NP62 436 aa20.42■□□□□ 0.86
CTU1-201ENST00000421832 DYNLRB1Q9NP97 96 aa20.42■□□□□ 0.86
CTU1-201ENST00000421832 A6NNC1 897 aa20.41■□□□□ 0.86
CTU1-201ENST00000421832 SERPINE3A8MV23 424 aa20.41■□□□□ 0.86
CTU1-201ENST00000421832 NXPH2O95156 264 aa20.41■□□□□ 0.86
CTU1-201ENST00000421832 PLA2G2AP14555 144 aa20.41■□□□□ 0.86
CTU1-201ENST00000421832 EGR1P18146 543 aa20.41■□□□□ 0.86
CTU1-201ENST00000421832 RND3P61587 244 aa20.41■□□□□ 0.86
CTU1-201ENST00000421832 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
CTU1-201ENST00000421832 LRRC29Q8WV35 223 aa20.41■□□□□ 0.86
CTU1-201ENST00000421832 PHOX2AO14813 284 aa20.41■□□□□ 0.86
CTU1-201ENST00000421832 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
CTU1-201ENST00000421832 OR5H8P0DN80 308 aa20.41■□□□□ 0.86
CTU1-201ENST00000421832 GATA4P43694 442 aa20.41■□□□□ 0.86
CTU1-201ENST00000421832 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
CTU1-201ENST00000421832 HES4Q9HCC6 221 aa20.41■□□□□ 0.86
CTU1-201ENST00000421832 AKAP6Q13023 2319 aa20.4■□□□□ 0.86
CTU1-201ENST00000421832 SCGB1D2O95969 90 aa20.4■□□□□ 0.86
CTU1-201ENST00000421832 TNFSF4P23510 183 aa20.4■□□□□ 0.86
CTU1-201ENST00000421832 ZNF266Q14584 549 aa20.4■□□□□ 0.86
CTU1-201ENST00000421832 TMEM183AQ8IXX5 376 aa20.4■□□□□ 0.86
CTU1-201ENST00000421832 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.86
CTU1-201ENST00000421832 CLDN1O95832 211 aa20.39■□□□□ 0.86
CTU1-201ENST00000421832 CD55P08174 381 aa20.39■□□□□ 0.86
CTU1-201ENST00000421832 PDZD11Q5EBL8 140 aa20.39■□□□□ 0.86
CTU1-201ENST00000421832 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.86
CTU1-201ENST00000421832 FAAP24Q9BTP7 215 aa20.39■□□□□ 0.86
CTU1-201ENST00000421832 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
CTU1-201ENST00000421832 A1L4Q6 167 aa20.39■□□□□ 0.85
CTU1-201ENST00000421832 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
CTU1-201ENST00000421832 GCGP01275 180 aa20.39■□□□□ 0.85
CTU1-201ENST00000421832 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
CTU1-201ENST00000421832 Q8IYB0 196 aa20.39■□□□□ 0.85
CTU1-201ENST00000421832 GCSAMQ8N6F7 178 aa20.39■□□□□ 0.85
CTU1-201ENST00000421832 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa20.39■□□□□ 0.85
CTU1-201ENST00000421832 DYRK2Q92630 601 aa20.39■□□□□ 0.85
CTU1-201ENST00000421832 SUCNR1Q9BXA5 334 aa20.39■□□□□ 0.85
CTU1-201ENST00000421832 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa20.39■□□□□ 0.85
CTU1-201ENST00000421832 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa20.38■□□□□ 0.85
CTU1-201ENST00000421832 HS3ST1O14792 307 aa20.38■□□□□ 0.85
CTU1-201ENST00000421832 TFF1P04155 84 aa20.38■□□□□ 0.85
CTU1-201ENST00000421832 ICAM4Q14773 271 aa20.38■□□□□ 0.85
CTU1-201ENST00000421832 FAM201AQ5SY85 155 aa20.38■□□□□ 0.85
CTU1-201ENST00000421832 DIRC2Q96SL1 478 aa20.38■□□□□ 0.85
CTU1-201ENST00000421832 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
CTU1-201ENST00000421832 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
CTU1-201ENST00000421832 ST8SIA3O43173 380 aa20.38■□□□□ 0.85
CTU1-201ENST00000421832 GZMBP10144 247 aa20.38■□□□□ 0.85
CTU1-201ENST00000421832 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
CTU1-201ENST00000421832 HLA-DRB3P79483 266 aa20.38■□□□□ 0.85
CTU1-201ENST00000421832 TMEM187Q14656 261 aa20.38■□□□□ 0.85
CTU1-201ENST00000421832 MS4A5Q9H3V2 200 aa20.38■□□□□ 0.85
CTU1-201ENST00000421832 WSB1Q9Y6I7 421 aa20.38■□□□□ 0.85
CTU1-201ENST00000421832 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa20.38■□□□□ 0.85
CTU1-201ENST00000421832 SRRM5B3KS81 715 aa20.37■□□□□ 0.85
CTU1-201ENST00000421832 OR5AC1P0C628 307 aa20.37■□□□□ 0.85
CTU1-201ENST00000421832 CCL20P78556 96 aa20.37■□□□□ 0.85
CTU1-201ENST00000421832 TNFRSF9Q07011 255 aa20.37■□□□□ 0.85
CTU1-201ENST00000421832 HAGHQ16775 308 aa20.37■□□□□ 0.85
CTU1-201ENST00000421832 ACP7Q6ZNF0 438 aa20.37■□□□□ 0.85
CTU1-201ENST00000421832 CBY1Q9Y3M2 126 aa20.37■□□□□ 0.85
CTU1-201ENST00000421832 TACC2O95359 2948 aa20.36■□□□□ 0.85
CTU1-201ENST00000421832 CLEC18AA5D8T8 446 aa20.36■□□□□ 0.85
CTU1-201ENST00000421832 PDCD6O75340 191 aa20.36■□□□□ 0.85
CTU1-201ENST00000421832 HBE1P02100 147 aa20.36■□□□□ 0.85
CTU1-201ENST00000421832 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
CTU1-201ENST00000421832 DPPA3Q6W0C5 159 aa20.36■□□□□ 0.85
CTU1-201ENST00000421832 ZNF664Q8N3J9 261 aa20.36■□□□□ 0.85
CTU1-201ENST00000421832 CLEC18CQ8NCF0 446 aa20.36■□□□□ 0.85
CTU1-201ENST00000421832 OR2G3Q8NGZ4 309 aa20.36■□□□□ 0.85
CTU1-201ENST00000421832 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
CTU1-201ENST00000421832 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
CTU1-201ENST00000421832 NAA60Q9H7X0 242 aa20.36■□□□□ 0.85
CTU1-201ENST00000421832 SAP30LQ9HAJ7 183 aa20.36■□□□□ 0.85
CTU1-201ENST00000421832 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa20.36■□□□□ 0.85
CTU1-201ENST00000421832 CLDN34H7C241 214 aa20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.6 ms