RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421004.3

SCAMP1-AS1-201, SCAMP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SCAMP1-AS1, Length 1,479 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP10.04□□□□□ -0.8
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TM2D1Q9BX74 207 aa10.04□□□□□ -0.8
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP10.04□□□□□ -0.8
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KCNK15Q9H427 330 aa10.04□□□□□ -0.8
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR1A1Q9P1Q5 309 aa10.04□□□□□ -0.8
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 A0A0G2JLM5 398 aa10.04□□□□□ -0.8
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ANKRD34BA5PLL1 514 aa10.04□□□□□ -0.8
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EFCAB10A6NFE3 127 aa10.04□□□□□ -0.8
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MYL12BO14950 172 aa10.04□□□□□ -0.8
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC25A17O43808 307 aa10.04□□□□□ -0.8
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 JTBO76095 146 aa10.04□□□□□ -0.8
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RPS16P62249 146 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP10.04□□□□□ -0.8
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 UNC119Q13432 240 aa10.04□□□□□ -0.8
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IL34Q6ZMJ4 242 aa10.04□□□□□ -0.8
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF383Q8NA42 475 aa10.04□□□□□ -0.8
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP10.04□□□□□ -0.8
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TMED9Q9BVK6 235 aa10.04□□□□□ -0.8
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZFAND3Q9H8U3 227 aa10.04□□□□□ -0.8
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa10.03□□□□□ -0.8
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PROP1O75360 226 aa10.03□□□□□ -0.8
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 APOA2P02652 100 aa10.03□□□□□ -0.8
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZBTB25P24278 435 aa10.03□□□□□ -0.8
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CEACAM6P40199 344 aa10.03□□□□□ -0.8
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ALDH3B2P48448 385 aa10.03□□□□□ -0.8
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 WNT4P56705 351 aa10.03□□□□□ -0.8
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SYNJ2BPP57105 145 aa10.03□□□□□ -0.8
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GABARAPL2P60520 117 aa10.03□□□□□ -0.8
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DEFA5Q01523 94 aa10.03□□□□□ -0.8
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 INSL4Q14641 139 aa10.03□□□□□ -0.8
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GLT8D1Q68CQ7 371 aa10.03□□□□□ -0.8
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LCN12Q6JVE5 192 aa10.03□□□□□ -0.8
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR5T1Q8NG75 326 aa10.03□□□□□ -0.8
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KCNG3Q8TAE7 436 aa10.03□□□□□ -0.8
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FBLIM1Q8WUP2 373 aa10.03□□□□□ -0.8
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PTX4Q96A99 478 aa10.03□□□□□ -0.8
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP10.03□□□□□ -0.8
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP10.03□□□□□ -0.8
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TUBA4BQ9H853 241 aa10.03□□□□□ -0.8
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 VCX3AQ9NNX9 186 aa10.03□□□□□ -0.8
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa10.03□□□□□ -0.8
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 A0A0A6YYD4 124 aa10.02□□□□□ -0.81
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TMEM14DPA8MWL7 114 aa10.02□□□□□ -0.81
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CRHBPP24387 322 aa10.02□□□□□ -0.81
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LINC00205P59089 165 aa10.02□□□□□ -0.81
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C1orf100Q5SVJ3 147 aa10.02□□□□□ -0.81
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF773Q6PK81 442 aa10.02□□□□□ -0.81
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LRRTM1Q86UE6 522 aa10.02□□□□□ -0.81
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 Q8N402 240 aa10.02□□□□□ -0.81
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RETNQ9HD89 108 aa10.02□□□□□ -0.81
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa10.02□□□□□ -0.81
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 AK3Q9UIJ7 227 aa10.02□□□□□ -0.81
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ADAM30Q9UKF2 790 aa10.02□□□□□ -0.81
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MGAT4AQ9UM21 535 aa10.02□□□□□ -0.81
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CCDC160A6NGH7 325 aa10.01□□□□□ -0.81
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CNIH1O95406 144 aa10.01□□□□□ -0.81
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BRI3O95415 125 aa10.01□□□□□ -0.81
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CSN3P07498 182 aa10.01□□□□□ -0.81
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 AADACP22760 399 aa10.01□□□□□ -0.81
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 QRFPP83859 136 aa10.01□□□□□ -0.81
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ACSM3Q53FZ2 586 aa10.01□□□□□ -0.81
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PHYHIPQ92561 330 aa10.01□□□□□ -0.81
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TMEM68Q96MH6 324 aa10.01□□□□□ -0.81
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC35D1Q9NTN3 355 aa10.01□□□□□ -0.81
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa10.01□□□□□ -0.81
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF221Q9UK13 617 aa10.01□□□□□ -0.81
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TPRKBQ9Y3C4 175 aa10.01□□□□□ -0.81
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SHISA3A0PJX4 238 aa10□□□□□ -0.81
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IZUMO1RA6ND01 250 aa10□□□□□ -0.81
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BPNT1O95861 308 aa10□□□□□ -0.81
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IGLV2-23P01705 113 aa10□□□□□ -0.81
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TRBV12-3P01733 135 aa10□□□□□ -0.81
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SCTP09683 121 aa10□□□□□ -0.81
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PJVKQ0ZLH3 352 aa10□□□□□ -0.81
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DYRK1AQ13627 763 aa10□□□□□ -0.81
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TATDN3Q17R31 274 aa10□□□□□ -0.81
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RPEL1Q2QD12 228 aa10□□□□□ -0.81
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CNPY1Q3B7I2 92 aa10□□□□□ -0.81
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF343Q6P1L6 599 aa10□□□□□ -0.81
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 AHSA2Q719I0 299 aa10□□□□□ -0.81
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GPR141Q7Z602 305 aa10□□□□□ -0.81
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BVESQ8NE79 360 aa10□□□□□ -0.81
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa10□□□□□ -0.81
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IL17DQ8TAD2 202 aa10□□□□□ -0.81
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LPAR5Q9H1C0 372 aa10□□□□□ -0.81
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 Q9N2K0 584 aa10□□□□□ -0.81
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C12orf4Q9NQ89 552 aa10□□□□□ -0.81
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SCN3BQ9NY72 215 aa10□□□□□ -0.81
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CEPT1Q9Y6K0 416 aa10□□□□□ -0.81
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 M0R1X1 148 aa9.99□□□□□ -0.81
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SOCS1O15524 211 aa9.99□□□□□ -0.81
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR2A4O95047 310 aa9.99□□□□□ -0.81
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CRYGBP07316 175 aa9.99□□□□□ -0.81
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LGALS7P47929 136 aa9.99□□□□□ -0.81
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LAIR2Q6ISS4 152 aa9.99□□□□□ -0.81
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MS4A15Q8N5U1 240 aa9.99□□□□□ -0.81
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NANOGP1Q8N7R0 232 aa9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.9 ms