RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380828.6

RABGEF1-202, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

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Gene RABGEF1, Length 3,864 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-202ENST00000380828 CMTM2Q8TAZ6 248 aa5.75□□□□□ -1.49
RABGEF1-202ENST00000380828 FGF11Q92914 225 aa5.75□□□□□ -1.49
RABGEF1-202ENST00000380828 ADTRPQ96IZ2 230 aa5.75□□□□□ -1.49
RABGEF1-202ENST00000380828 LINC01587Q99440 93 aa5.75□□□□□ -1.49
RABGEF1-202ENST00000380828 ATP5SQ99766 215 aa5.75□□□□□ -1.49
RABGEF1-202ENST00000380828 OR2H1Q9GZK4 316 aa5.75□□□□□ -1.49
RABGEF1-202ENST00000380828 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa5.75□□□□□ -1.49
RABGEF1-202ENST00000380828 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa5.75□□□□□ -1.49
RABGEF1-202ENST00000380828 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
RABGEF1-202ENST00000380828 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
RABGEF1-202ENST00000380828 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
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RABGEF1-202ENST00000380828 OR4C12Q96R67 309 aa5.74□□□□□ -1.49
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RABGEF1-202ENST00000380828 EFNA2O43921 213 aa5.74□□□□□ -1.49
RABGEF1-202ENST00000380828 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa5.74□□□□□ -1.49
RABGEF1-202ENST00000380828 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa5.74□□□□□ -1.49
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RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF141Q15928 474 aa5.74□□□□□ -1.49
RABGEF1-202ENST00000380828 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
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RABGEF1-202ENST00000380828 ADOQ96SZ5 270 aa5.74□□□□□ -1.49
RABGEF1-202ENST00000380828 SYNPO2LQ9H987 977 aa5.74□□□□□ -1.49
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RABGEF1-202ENST00000380828 C1QL1O75973 258 aa5.74□□□□□ -1.49
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RABGEF1-202ENST00000380828 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
RABGEF1-202ENST00000380828 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
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RABGEF1-202ENST00000380828 IL21Q9HBE4 155 aa5.74□□□□□ -1.49
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RABGEF1-202ENST00000380828 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa5.74□□□□□ -1.49
RABGEF1-202ENST00000380828 SCN8AQ9UQD0 1980 aa5.74□□□□□ -1.49
RABGEF1-202ENST00000380828 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa5.74□□□□□ -1.49
RABGEF1-202ENST00000380828 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa5.74□□□□□ -1.49
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RABGEF1-202ENST00000380828 PRADC1Q9BSG0 188 aa5.73□□□□□ -1.49
RABGEF1-202ENST00000380828 TMEM59Q9BXS4 323 aa5.73□□□□□ -1.49
RABGEF1-202ENST00000380828 C1RLQ9NZP8 487 aa5.73□□□□□ -1.49
RABGEF1-202ENST00000380828 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
RABGEF1-202ENST00000380828 MEIS3P1A6NDR6 274 aa5.73□□□□□ -1.49
RABGEF1-202ENST00000380828 SYNGR1O43759 233 aa5.73□□□□□ -1.49
RABGEF1-202ENST00000380828 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
RABGEF1-202ENST00000380828 MS4A18Q3C1V0 323 aa5.73□□□□□ -1.49
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