RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000365280.1

RNU6-407P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 407, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-407P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-407P-201ENST00000365280 CRPP02741 224 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-407P-201ENST00000365280 LIMS3P0CW19 117 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-407P-201ENST00000365280 LIMS4P0CW20 117 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-407P-201ENST00000365280 OR13C7P0DN81 318 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-407P-201ENST00000365280 CCL2P13500 99 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-407P-201ENST00000365280 PSMB8P28062 276 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-407P-201ENST00000365280 ALDH3A1P30838 453 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-407P-201ENST00000365280 OR10J1P30954 320 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-407P-201ENST00000365280 SULT1A2P50226 295 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-407P-201ENST00000365280 DAPP51397 102 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-407P-201ENST00000365280 GNA12Q03113 381 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-407P-201ENST00000365280 OR4D1Q15615 310 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-407P-201ENST00000365280 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP0.19□□□□□ -2.38
RNU6-407P-201ENST00000365280 CLEC12BQ2HXU8 276 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-407P-201ENST00000365280 LGALS9BQ3B8N2 356 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-407P-201ENST00000365280 TMEM155Q4W5P6 130 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-407P-201ENST00000365280 OR10J3Q5JRS4 329 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-407P-201ENST00000365280 DRAM2Q6UX65 266 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-407P-201ENST00000365280 SCGB1D4Q6XE38 83 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-407P-201ENST00000365280 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-407P-201ENST00000365280 NAA40Q86UY6 237 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-407P-201ENST00000365280 GID4Q8IVV7 300 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-407P-201ENST00000365280 MS4A6EQ96DS6 147 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-407P-201ENST00000365280 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP0.19□□□□□ -2.38
RNU6-407P-201ENST00000365280 HINT2Q9BX68 163 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-407P-201ENST00000365280 CST9LQ9H4G1 147 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-407P-201ENST00000365280 SLC2A9Q9NRM0 540 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-407P-201ENST00000365280 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP0.19□□□□□ -2.38
RNU6-407P-201ENST00000365280 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP0.19□□□□□ -2.38
RNU6-407P-201ENST00000365280 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP0.19□□□□□ -2.38
RNU6-407P-201ENST00000365280 SMARCA4P51532 1647 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-407P-201ENST00000365280 SIPA1L1O43166 1804 aa0.18□□□□□ -2.38
RNU6-407P-201ENST00000365280 EXPH5Q8NEV8 1989 aa0.18□□□□□ -2.38
RNU6-407P-201ENST00000365280 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa0.18□□□□□ -2.38
RNU6-407P-201ENST00000365280 RAB19A4D1S5 217 aa0.18□□□□□ -2.38
RNU6-407P-201ENST00000365280 PHGR1C9JFL3 82 aa0.18□□□□□ -2.38
RNU6-407P-201ENST00000365280 SGCEO43556 437 aa0.18□□□□□ -2.38
RNU6-407P-201ENST00000365280 NPPAP01160 153 aa0.18□□□□□ -2.38
RNU6-407P-201ENST00000365280 BPGMP07738 259 aa0.18□□□□□ -2.38
RNU6-407P-201ENST00000365280 GABRA2P47869 451 aa0.18□□□□□ -2.38
RNU6-407P-201ENST00000365280 FXYD7P58549 80 aa0.18□□□□□ -2.38
RNU6-407P-201ENST00000365280 RAB8AP61006 207 aa0.18□□□□□ -2.38
RNU6-407P-201ENST00000365280 C1DQ13901 141 aaKnown RBP0.18□□□□□ -2.38
RNU6-407P-201ENST00000365280 CDK5R1Q15078 307 aa0.18□□□□□ -2.38
RNU6-407P-201ENST00000365280 ELOBQ15370 118 aa0.18□□□□□ -2.38
RNU6-407P-201ENST00000365280 MIAQ16674 131 aa0.18□□□□□ -2.38
RNU6-407P-201ENST00000365280 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa0.18□□□□□ -2.38
RNU6-407P-201ENST00000365280 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP0.18□□□□□ -2.38
RNU6-407P-201ENST00000365280 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa0.18□□□□□ -2.38
RNU6-407P-201ENST00000365280 Q8N2B8 174 aa0.18□□□□□ -2.38
RNU6-407P-201ENST00000365280 NATD1Q8N6N6 113 aa0.18□□□□□ -2.38
RNU6-407P-201ENST00000365280 OR52E4Q8NGH9 312 aa0.18□□□□□ -2.38
RNU6-407P-201ENST00000365280 OR1L8Q8NGR8 309 aa0.18□□□□□ -2.38
RNU6-407P-201ENST00000365280 LRRC20Q8TCA0 184 aa0.18□□□□□ -2.38
RNU6-407P-201ENST00000365280 SMIM12Q96EX1 92 aa0.18□□□□□ -2.38
RNU6-407P-201ENST00000365280 MSANTD3Q96H12 275 aa0.18□□□□□ -2.38
RNU6-407P-201ENST00000365280 TAAR3PQ9P1P4 343 aa0.18□□□□□ -2.38
RNU6-407P-201ENST00000365280 GREB1Q4ZG55 1949 aa0.17□□□□□ -2.38
RNU6-407P-201ENST00000365280 CUL9Q8IWT3 2517 aa0.17□□□□□ -2.38
RNU6-407P-201ENST00000365280 A0A087WUU8 490 aa0.17□□□□□ -2.38
RNU6-407P-201ENST00000365280 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa0.17□□□□□ -2.38
RNU6-407P-201ENST00000365280 A0A0J9YW62 118 aa0.17□□□□□ -2.38
RNU6-407P-201ENST00000365280 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa0.17□□□□□ -2.38
RNU6-407P-201ENST00000365280 A0A1B0GW15 77 aa0.17□□□□□ -2.38
RNU6-407P-201ENST00000365280 GOLGA8RI6L899 631 aa0.17□□□□□ -2.38
RNU6-407P-201ENST00000365280 TXNDC9O14530 226 aa0.17□□□□□ -2.38
RNU6-407P-201ENST00000365280 COPEO14579 308 aa0.17□□□□□ -2.38
RNU6-407P-201ENST00000365280 KLRC4O43908 158 aa0.17□□□□□ -2.38
RNU6-407P-201ENST00000365280 MT-CO2P00403 227 aa0.17□□□□□ -2.38
RNU6-407P-201ENST00000365280 HBZP02008 142 aa0.17□□□□□ -2.38
RNU6-407P-201ENST00000365280 IVLP07476 585 aa0.17□□□□□ -2.38
RNU6-407P-201ENST00000365280 CFL1P23528 166 aaKnown RBP0.17□□□□□ -2.38
RNU6-407P-201ENST00000365280 DLX6P56179 175 aa0.17□□□□□ -2.38
RNU6-407P-201ENST00000365280 UBE2KP61086 200 aa0.17□□□□□ -2.38
RNU6-407P-201ENST00000365280 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP0.17□□□□□ -2.38
RNU6-407P-201ENST00000365280 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP0.17□□□□□ -2.38
RNU6-407P-201ENST00000365280 AKR1C1Q04828 323 aa0.17□□□□□ -2.38
RNU6-407P-201ENST00000365280 RAB31Q13636 194 aa0.17□□□□□ -2.38
RNU6-407P-201ENST00000365280 MOGQ16653 247 aa0.17□□□□□ -2.38
RNU6-407P-201ENST00000365280 SLC36A2Q495M3 483 aa0.17□□□□□ -2.38
RNU6-407P-201ENST00000365280 C7orf65Q6ZTY9 151 aa0.17□□□□□ -2.38
RNU6-407P-201ENST00000365280 DYNAPQ8N1N2 210 aa0.17□□□□□ -2.38
RNU6-407P-201ENST00000365280 FAM19A2Q8N3H0 131 aa0.17□□□□□ -2.38
RNU6-407P-201ENST00000365280 RPS4Y2Q8TD47 263 aa0.17□□□□□ -2.38
RNU6-407P-201ENST00000365280 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP0.17□□□□□ -2.38
RNU6-407P-201ENST00000365280 CYGBQ8WWM9 190 aa0.17□□□□□ -2.38
RNU6-407P-201ENST00000365280 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP0.17□□□□□ -2.38
RNU6-407P-201ENST00000365280 FAM210AQ96ND0 272 aa0.17□□□□□ -2.38
RNU6-407P-201ENST00000365280 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP0.17□□□□□ -2.38
RNU6-407P-201ENST00000365280 REREQ9P2R6 1566 aa0.17□□□□□ -2.38
RNU6-407P-201ENST00000365280 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP0.17□□□□□ -2.38
RNU6-407P-201ENST00000365280 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP0.17□□□□□ -2.38
RNU6-407P-201ENST00000365280 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa0.17□□□□□ -2.38
RNU6-407P-201ENST00000365280 MAP3K19Q56UN5 1328 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-407P-201ENST00000365280 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP0.16□□□□□ -2.38
RNU6-407P-201ENST00000365280 NUP160Q12769 1436 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-407P-201ENST00000365280 HMSDA8MTL9 139 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-407P-201ENST00000365280 H7C2G1 150 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-407P-201ENST00000365280 NDUFS8O00217 210 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-407P-201ENST00000365280 ATP8B1O43520 1251 aa0.16□□□□□ -2.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.2 ms