RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332175.12

PTPRM-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 6,095 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-201ENST00000332175 ELOVL1Q9BW60 279 aa19.2■□□□□ 0.66
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PTPRM-201ENST00000332175 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa19.2■□□□□ 0.66
PTPRM-201ENST00000332175 PDLIM4P50479 330 aa19.2■□□□□ 0.66
PTPRM-201ENST00000332175 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP19.2■□□□□ 0.66
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PTPRM-201ENST00000332175 TMEM252Q8N6L7 170 aa19.2■□□□□ 0.66
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PTPRM-201ENST00000332175 RECKO95980 971 aa19.14■□□□□ 0.66
PTPRM-201ENST00000332175 GPX1P07203 203 aa19.14■□□□□ 0.66
PTPRM-201ENST00000332175 RFPL3SP0C7P2 107 aa19.14■□□□□ 0.66
PTPRM-201ENST00000332175 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP19.14■□□□□ 0.66
PTPRM-201ENST00000332175 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP19.14■□□□□ 0.66
PTPRM-201ENST00000332175 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa19.14■□□□□ 0.65
PTPRM-201ENST00000332175 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa19.14■□□□□ 0.65
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