RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331789.9

ACTB-201, Transcript of actin beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTB, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-201ENST00000331789 TMEM200BQ69YZ2 307 aa14.73□□□□□ -0.05
ACTB-201ENST00000331789 LRRC20Q8TCA0 184 aa14.73□□□□□ -0.05
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ACTB-201ENST00000331789 ZG16O60844 167 aa14.72□□□□□ -0.05
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ACTB-201ENST00000331789 DYNLT3P51808 116 aa14.72□□□□□ -0.05
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ACTB-201ENST00000331789 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
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ACTB-201ENST00000331789 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa14.7□□□□□ -0.06
ACTB-201ENST00000331789 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
ACTB-201ENST00000331789 R3HDM4Q96D70 268 aa14.7□□□□□ -0.06
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ACTB-201ENST00000331789 ZNRD1Q9P1U0 126 aa14.7□□□□□ -0.06
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ACTB-201ENST00000331789 S1PR3Q99500 378 aa14.69□□□□□ -0.06
ACTB-201ENST00000331789 HSPB7Q9UBY9 170 aa14.69□□□□□ -0.06
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ACTB-201ENST00000331789 SESN1Q9Y6P5 492 aa14.69□□□□□ -0.06
ACTB-201ENST00000331789 FAM90A26D6RGX4 464 aa14.68□□□□□ -0.06
ACTB-201ENST00000331789 SPP1P10451 314 aa14.68□□□□□ -0.06
ACTB-201ENST00000331789 TMEM30BQ3MIR4 351 aa14.68□□□□□ -0.06
ACTB-201ENST00000331789 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
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ACTB-201ENST00000331789 SEC11BP0C7V7 166 aa14.68□□□□□ -0.06
ACTB-201ENST00000331789 SULT1A1P50225 295 aa14.68□□□□□ -0.06
ACTB-201ENST00000331789 HEPN1Q6WQI6 88 aa14.68□□□□□ -0.06
ACTB-201ENST00000331789 SSX9Q7RTT3 188 aa14.68□□□□□ -0.06
ACTB-201ENST00000331789 OR10A7Q8NGE5 316 aa14.68□□□□□ -0.06
ACTB-201ENST00000331789 MARC2Q969Z3 335 aa14.68□□□□□ -0.06
ACTB-201ENST00000331789 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
ACTB-201ENST00000331789 CBLN4Q9NTU7 201 aa14.68□□□□□ -0.06
ACTB-201ENST00000331789 LY6HO94772 140 aa14.67□□□□□ -0.06
ACTB-201ENST00000331789 SOD3P08294 240 aa14.67□□□□□ -0.06
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ACTB-201ENST00000331789 PXDC1Q5TGL8 231 aa14.67□□□□□ -0.06
ACTB-201ENST00000331789 STX12Q86Y82 276 aa14.67□□□□□ -0.06
ACTB-201ENST00000331789 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa14.67□□□□□ -0.06
ACTB-201ENST00000331789 ZNF383Q8NA42 475 aa14.67□□□□□ -0.06
ACTB-201ENST00000331789 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP14.66□□□□□ -0.063e-25■■■■■ 34.8
ACTB-201ENST00000331789 METTL15P1P0C7V9 234 aa14.66□□□□□ -0.06
ACTB-201ENST00000331789 KIR2DS2P43631 304 aa14.66□□□□□ -0.06
ACTB-201ENST00000331789 ARL16Q0P5N6 197 aa14.66□□□□□ -0.06
ACTB-201ENST00000331789 ZNF266Q14584 549 aa14.66□□□□□ -0.06
ACTB-201ENST00000331789 SPANXN5Q5MJ07 72 aa14.66□□□□□ -0.06
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