RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000319942.7

RABGGTB-201, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTB, Length 1,496 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-201ENST00000319942 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
RABGGTB-201ENST00000319942 U3KQ87 197 aa8.32□□□□□ -1.08
RABGGTB-201ENST00000319942 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa8.32□□□□□ -1.08
RABGGTB-201ENST00000319942 K7EPK0 472 aa8.31□□□□□ -1.08
RABGGTB-201ENST00000319942 M0R1X1 148 aa8.31□□□□□ -1.08
RABGGTB-201ENST00000319942 WRBO00258 174 aa8.31□□□□□ -1.08
RABGGTB-201ENST00000319942 IGHV3-7P01780 117 aa8.31□□□□□ -1.08
RABGGTB-201ENST00000319942 DUTP33316 252 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
RABGGTB-201ENST00000319942 CDKN1AP38936 164 aa8.31□□□□□ -1.08
RABGGTB-201ENST00000319942 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
RABGGTB-201ENST00000319942 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF273Q14593 569 aa8.31□□□□□ -1.08
RABGGTB-201ENST00000319942 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa8.31□□□□□ -1.08
RABGGTB-201ENST00000319942 GPR157Q5UAW9 335 aa8.31□□□□□ -1.08
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
RABGGTB-201ENST00000319942 LYG1Q8N1E2 194 aa8.31□□□□□ -1.08
RABGGTB-201ENST00000319942 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa8.31□□□□□ -1.08
RABGGTB-201ENST00000319942 C8orf31Q8N9H6 132 aa8.31□□□□□ -1.08
RABGGTB-201ENST00000319942 OR4D5Q8NGN0 318 aa8.31□□□□□ -1.08
RABGGTB-201ENST00000319942 OR1S1Q8NH92 325 aa8.31□□□□□ -1.08
RABGGTB-201ENST00000319942 GPR146Q96CH1 333 aa8.31□□□□□ -1.08
RABGGTB-201ENST00000319942 MMP24Q9Y5R2 645 aa8.31□□□□□ -1.08
RABGGTB-201ENST00000319942 POMT1Q9Y6A1 747 aa8.31□□□□□ -1.08
RABGGTB-201ENST00000319942 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
RABGGTB-201ENST00000319942 HCFC1P51610 2035 aa8.3□□□□□ -1.08
RABGGTB-201ENST00000319942 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa8.3□□□□□ -1.08
RABGGTB-201ENST00000319942 C17orf98A8MV24 154 aa8.3□□□□□ -1.08
RABGGTB-201ENST00000319942 TAAR5O14804 337 aa8.3□□□□□ -1.08
RABGGTB-201ENST00000319942 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP8.3□□□□□ -1.086e-7■■■■□ 24
RABGGTB-201ENST00000319942 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
RABGGTB-201ENST00000319942 C1QL1O75973 258 aa8.3□□□□□ -1.08
RABGGTB-201ENST00000319942 HPRT1P00492 218 aa8.3□□□□□ -1.08
RABGGTB-201ENST00000319942 PPIAL4GP0DN37 164 aa8.3□□□□□ -1.08
RABGGTB-201ENST00000319942 CCL3L1P16619 93 aa8.3□□□□□ -1.08
RABGGTB-201ENST00000319942 THBS3P49746 956 aa8.3□□□□□ -1.08
RABGGTB-201ENST00000319942 RPL30P62888 115 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
RABGGTB-201ENST00000319942 VAMP2P63027 116 aa8.3□□□□□ -1.08
RABGGTB-201ENST00000319942 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
RABGGTB-201ENST00000319942 ID3Q02535 119 aa8.3□□□□□ -1.08
RABGGTB-201ENST00000319942 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
RABGGTB-201ENST00000319942 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa8.3□□□□□ -1.08
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF841Q6ZN19 808 aa8.3□□□□□ -1.08
RABGGTB-201ENST00000319942 TCF23Q7RTU1 214 aa8.3□□□□□ -1.08
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF439Q8NDP4 499 aa8.3□□□□□ -1.08
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF680Q8NEM1 530 aa8.3□□□□□ -1.08
RABGGTB-201ENST00000319942 LEAP2Q969E1 77 aa8.3□□□□□ -1.08
RABGGTB-201ENST00000319942 IFI27L2Q9H2X8 130 aa8.3□□□□□ -1.08
RABGGTB-201ENST00000319942 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa8.3□□□□□ -1.08
RABGGTB-201ENST00000319942 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
RABGGTB-201ENST00000319942 OR5AC2Q9NZP5 309 aa8.3□□□□□ -1.08
RABGGTB-201ENST00000319942 A0A1W2PPE3 182 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGGTB-201ENST00000319942 RNF222A6NCQ9 220 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGGTB-201ENST00000319942 F5H0A9 414 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
RABGGTB-201ENST00000319942 OVOL3O00110 214 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGGTB-201ENST00000319942 TOR1AO14656 332 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGGTB-201ENST00000319942 BCL2L11O43521 198 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGGTB-201ENST00000319942 MMP23AO75900 390 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGGTB-201ENST00000319942 LY6HO94772 140 aa8.29□□□□□ -1.08
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RABGGTB-201ENST00000319942 MMP9P14780 707 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGGTB-201ENST00000319942 RPL12P30050 165 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
RABGGTB-201ENST00000319942 P2RY1P47900 373 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGGTB-201ENST00000319942 ARHGDIBP52566 201 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGGTB-201ENST00000319942 PRRX1P54821 245 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGGTB-201ENST00000319942 RAB14P61106 215 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGGTB-201ENST00000319942 GNB2P62879 340 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGGTB-201ENST00000319942 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
RABGGTB-201ENST00000319942 NCR3LG1Q68D85 454 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGGTB-201ENST00000319942 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
RABGGTB-201ENST00000319942 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGGTB-201ENST00000319942 LINC00311Q8N616 119 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGGTB-201ENST00000319942 OR10X1Q8NGY0 326 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGGTB-201ENST00000319942 OR9G1Q8NH87 305 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGGTB-201ENST00000319942 C8orf46Q8TAG6 207 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGGTB-201ENST00000319942 TMEM186Q96B77 213 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGGTB-201ENST00000319942 AQP10Q96PS8 301 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGGTB-201ENST00000319942 ARPC5LQ9BPX5 153 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGGTB-201ENST00000319942 AIFM2Q9BRQ8 373 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGGTB-201ENST00000319942 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
RABGGTB-201ENST00000319942 COA4Q9NYJ1 87 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGGTB-201ENST00000319942 CACFD1Q9UGQ2 172 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGGTB-201ENST00000319942 UBQLN2Q9UHD9 624 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGGTB-201ENST00000319942 USP24Q9UPU5 2620 aa8.28□□□□□ -1.08
RABGGTB-201ENST00000319942 DSCAMO60469 2012 aa8.28□□□□□ -1.08
RABGGTB-201ENST00000319942 LOC105371242A0A075B767 164 aa8.28□□□□□ -1.08
RABGGTB-201ENST00000319942 LINC00473A8K010 186 aa8.28□□□□□ -1.08
RABGGTB-201ENST00000319942 FAM90A26D6RGX4 464 aa8.28□□□□□ -1.08
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC31A2O15432 143 aa8.28□□□□□ -1.08
RABGGTB-201ENST00000319942 GPR137BO60478 399 aa8.28□□□□□ -1.08
RABGGTB-201ENST00000319942 RAMP3O60896 148 aa8.28□□□□□ -1.08
RABGGTB-201ENST00000319942 FCGR3BO75015 233 aa8.28□□□□□ -1.08
RABGGTB-201ENST00000319942 PROP1O75360 226 aa8.28□□□□□ -1.08
RABGGTB-201ENST00000319942 PITX3O75364 302 aa8.28□□□□□ -1.08
RABGGTB-201ENST00000319942 MED6O75586 246 aa8.28□□□□□ -1.08
RABGGTB-201ENST00000319942 FCN3O75636 299 aa8.28□□□□□ -1.08
RABGGTB-201ENST00000319942 IGKV1-39P01597 117 aa8.28□□□□□ -1.08
RABGGTB-201ENST00000319942 IGKV1D-39P04432 117 aa8.28□□□□□ -1.08
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