RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283228.6

PTPRR-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRR, Length 3,529 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-201ENST00000283228 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP9.68□□□□□ -0.86
PTPRR-201ENST00000283228 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP9.68□□□□□ -0.86
PTPRR-201ENST00000283228 IL19Q9UHD0 177 aa9.68□□□□□ -0.86
PTPRR-201ENST00000283228 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa9.68□□□□□ -0.86
PTPRR-201ENST00000283228 K7ERU9 68 aa9.68□□□□□ -0.86
PTPRR-201ENST00000283228 G6PCP35575 357 aa9.68□□□□□ -0.86
PTPRR-201ENST00000283228 GFRA1P56159 465 aa9.68□□□□□ -0.86
PTPRR-201ENST00000283228 RPEL1Q2QD12 228 aa9.68□□□□□ -0.86
PTPRR-201ENST00000283228 RTL10Q7L3V2 364 aa9.68□□□□□ -0.86
PTPRR-201ENST00000283228 MKXQ8IYA7 352 aa9.68□□□□□ -0.86
PTPRR-201ENST00000283228 MRGPRDQ8TDS7 321 aa9.68□□□□□ -0.86
PTPRR-201ENST00000283228 RCHY1Q96PM5 261 aa9.68□□□□□ -0.86
PTPRR-201ENST00000283228 HS3ST6Q96QI5 342 aa9.68□□□□□ -0.86
PTPRR-201ENST00000283228 C17orf112F2Z3M2 114 aa9.67□□□□□ -0.86
PTPRR-201ENST00000283228 NUDT3O95989 172 aa9.67□□□□□ -0.86
PTPRR-201ENST00000283228 WNT2P09544 360 aa9.67□□□□□ -0.86
PTPRR-201ENST00000283228 MMD2Q8IY49 270 aa9.67□□□□□ -0.86
PTPRR-201ENST00000283228 R4GN57 208 aa9.67□□□□□ -0.86
PTPRR-201ENST00000283228 TMEM238C9JI98 176 aa9.67□□□□□ -0.86
PTPRR-201ENST00000283228 PDE6DO43924 150 aa9.67□□□□□ -0.86
PTPRR-201ENST00000283228 YPEL1O60688 119 aa9.67□□□□□ -0.86
PTPRR-201ENST00000283228 TOX4O94842 621 aa9.67□□□□□ -0.86
PTPRR-201ENST00000283228 CCL2P13500 99 aa9.67□□□□□ -0.86
PTPRR-201ENST00000283228 ZNF32P17041 273 aa9.67□□□□□ -0.86
PTPRR-201ENST00000283228 CAPZBP47756 277 aa9.67□□□□□ -0.86
PTPRR-201ENST00000283228 OR8B8Q15620 311 aa9.67□□□□□ -0.86
PTPRR-201ENST00000283228 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP9.67□□□□□ -0.86
PTPRR-201ENST00000283228 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa9.67□□□□□ -0.86
PTPRR-201ENST00000283228 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa9.67□□□□□ -0.86
PTPRR-201ENST00000283228 SLC24A4Q8NFF2 622 aa9.67□□□□□ -0.86
PTPRR-201ENST00000283228 ZDHHC16Q969W1 377 aa9.67□□□□□ -0.86
PTPRR-201ENST00000283228 AP1S3Q96PC3 154 aa9.67□□□□□ -0.86
PTPRR-201ENST00000283228 YPEL2Q96QA6 119 aa9.67□□□□□ -0.86
PTPRR-201ENST00000283228 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa9.67□□□□□ -0.86
PTPRR-201ENST00000283228 OR2T8A6NH00 312 aa9.66□□□□□ -0.86
PTPRR-201ENST00000283228 FOXL1Q12952 345 aa9.66□□□□□ -0.86
PTPRR-201ENST00000283228 MPV17L2Q567V2 206 aa9.66□□□□□ -0.86
PTPRR-201ENST00000283228 C1orf53Q5VUE5 145 aa9.66□□□□□ -0.86
PTPRR-201ENST00000283228 AGBL5Q8NDL9 886 aa9.66□□□□□ -0.86
PTPRR-201ENST00000283228 MRGPRX1Q96LB2 322 aa9.66□□□□□ -0.86
PTPRR-201ENST00000283228 HSPB7Q9UBY9 170 aa9.66□□□□□ -0.86
PTPRR-201ENST00000283228 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP9.66□□□□□ -0.86
PTPRR-201ENST00000283228 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa9.66□□□□□ -0.86
PTPRR-201ENST00000283228 OR2W1Q9Y3N9 320 aa9.66□□□□□ -0.86
PTPRR-201ENST00000283228 ATP23Q9Y6H3 246 aa9.66□□□□□ -0.86
PTPRR-201ENST00000283228 VPS13AQ96RL7 3174 aa9.66□□□□□ -0.86
PTPRR-201ENST00000283228 ABCA7Q8IZY2 2146 aa9.66□□□□□ -0.86
PTPRR-201ENST00000283228 M0R2Z0 102 aa9.66□□□□□ -0.86
PTPRR-201ENST00000283228 GOSR1O95249 250 aa9.66□□□□□ -0.86
PTPRR-201ENST00000283228 APOA2P02652 100 aa9.66□□□□□ -0.86
PTPRR-201ENST00000283228 LINC00310P59036 64 aa9.66□□□□□ -0.86
PTPRR-201ENST00000283228 NIT1Q86X76 327 aa9.66□□□□□ -0.86
PTPRR-201ENST00000283228 OR2Y1Q8NGV0 311 aa9.66□□□□□ -0.86
PTPRR-201ENST00000283228 OR1F12Q8NHA8 337 aa9.66□□□□□ -0.86
PTPRR-201ENST00000283228 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP9.66□□□□□ -0.86
PTPRR-201ENST00000283228 ZG16O60844 167 aa9.66□□□□□ -0.86
PTPRR-201ENST00000283228 SYNGR4O95473 234 aa9.66□□□□□ -0.86
PTPRR-201ENST00000283228 IGKV1-5P01602 117 aa9.66□□□□□ -0.86
PTPRR-201ENST00000283228 MYF5P13349 255 aa9.66□□□□□ -0.86
PTPRR-201ENST00000283228 FASLGP48023 281 aa9.66□□□□□ -0.86
PTPRR-201ENST00000283228 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP9.66□□□□□ -0.86
PTPRR-201ENST00000283228 OR1L1Q8NH94 360 aa9.66□□□□□ -0.86
PTPRR-201ENST00000283228 SSMEM1Q8WWF3 244 aa9.66□□□□□ -0.86
PTPRR-201ENST00000283228 LINC01565O15544 149 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRR-201ENST00000283228 ARL14EPLP0DKL9 152 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRR-201ENST00000283228 TIMP3P35625 211 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRR-201ENST00000283228 HYAL1Q12794 435 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRR-201ENST00000283228 DOLPP1Q86YN1 238 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRR-201ENST00000283228 OR2D3Q8NGH3 330 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRR-201ENST00000283228 NPCDR1Q9BY65 106 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRR-201ENST00000283228 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
PTPRR-201ENST00000283228 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRR-201ENST00000283228 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
PTPRR-201ENST00000283228 K7EP13 123 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRR-201ENST00000283228 ACTL6BO94805 426 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRR-201ENST00000283228 CTXN2P0C2S0 81 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRR-201ENST00000283228 TMEM144Q7Z5S9 345 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRR-201ENST00000283228 FGFRL1Q8N441 504 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRR-201ENST00000283228 DEPPQ9NTK1 212 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRR-201ENST00000283228 IL36BQ9NZH7 164 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRR-201ENST00000283228 SVILO95425 2214 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRR-201ENST00000283228 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa9.65□□□□□ -0.87
PTPRR-201ENST00000283228 S1PR2O95136 353 aa9.65□□□□□ -0.87
PTPRR-201ENST00000283228 COMPP49747 757 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.87
PTPRR-201ENST00000283228 ASPHD1Q5U4P2 390 aa9.65□□□□□ -0.87
PTPRR-201ENST00000283228 PARM1Q6UWI2 310 aa9.65□□□□□ -0.87
PTPRR-201ENST00000283228 FAM234AQ9H0X4 552 aa9.65□□□□□ -0.87
PTPRR-201ENST00000283228 CRIM1Q9NZV1 1036 aa9.65□□□□□ -0.87
PTPRR-201ENST00000283228 A0A1W2PS18 150 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRR-201ENST00000283228 NPIPB13A6NJU9 1138 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRR-201ENST00000283228 NPIPB4C9JG80 1138 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRR-201ENST00000283228 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
PTPRR-201ENST00000283228 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
PTPRR-201ENST00000283228 ZNF841Q6ZN19 808 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRR-201ENST00000283228 KCNS1Q96KK3 526 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRR-201ENST00000283228 ZNF318Q5VUA4 2279 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRR-201ENST00000283228 CFAP54Q96N23 3096 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRR-201ENST00000283228 A0A1W2PQF6 199 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRR-201ENST00000283228 SNAI2O43623 268 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRR-201ENST00000283228 CA6P23280 308 aa9.64□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.4 ms