RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262291.8

VMP1-201, Transcript of vacuole membrane protein 1, human

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene VMP1, Length 2,712 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
VMP1-201	ENST00000262291	C1QL1	O75973	258 aa		11.34	□□□□□ -0.59
VMP1-201	ENST00000262291	CDS2	O95674	445 aa		11.34	□□□□□ -0.59
VMP1-201	ENST00000262291	SERPINE2	P07093	398 aa		11.34	□□□□□ -0.59
VMP1-201	ENST00000262291	RND3	P61587	244 aa		11.34	□□□□□ -0.59
VMP1-201	ENST00000262291	CCL8	P80075	99 aa		11.34	□□□□□ -0.59
VMP1-201	ENST00000262291	FGFRL1	Q8N441	504 aa		11.34	□□□□□ -0.59
VMP1-201	ENST00000262291	OR4D5	Q8NGN0	318 aa		11.34	□□□□□ -0.59
VMP1-201	ENST00000262291	C5orf30	Q96GV9	206 aa		11.34	□□□□□ -0.59
VMP1-201	ENST00000262291	TMEM56	Q96MV1	263 aa		11.34	□□□□□ -0.59
VMP1-201	ENST00000262291	TUBA4B	Q9H853	241 aa		11.34	□□□□□ -0.59
VMP1-201	ENST00000262291	TMED3	Q9Y3Q3	217 aa		11.34	□□□□□ -0.59
VMP1-201	ENST00000262291	TMEM56-RWDD3	S4R434	201 aa		11.34	□□□□□ -0.59
VMP1-201	ENST00000262291	DSCAM	O60469	2012 aa		11.34	□□□□□ -0.59
VMP1-201	ENST00000262291	EREG	O14944	169 aa		11.34	□□□□□ -0.59
VMP1-201	ENST00000262291	ST8SIA3	O43173	380 aa		11.34	□□□□□ -0.59
VMP1-201	ENST00000262291	EDDM3B	P56851	147 aa		11.34	□□□□□ -0.59
VMP1-201	ENST00000262291	TMPRSS3	P57727	454 aa		11.34	□□□□□ -0.59
VMP1-201	ENST00000262291	GUK1	Q16774	197 aa		11.34	□□□□□ -0.59
VMP1-201	ENST00000262291	C4orf17	Q53FE4	359 aa		11.34	□□□□□ -0.59
VMP1-201	ENST00000262291	UTF1	Q5T230	341 aa		11.34	□□□□□ -0.59
VMP1-201	ENST00000262291	MOB1B	Q7L9L4	216 aa		11.34	□□□□□ -0.59
VMP1-201	ENST00000262291	MRGPRG	Q86SM5	289 aa		11.34	□□□□□ -0.59
VMP1-201	ENST00000262291	DRAM1	Q8N682	238 aa		11.34	□□□□□ -0.59
VMP1-201	ENST00000262291	NEUROG1	Q92886	237 aa		11.34	□□□□□ -0.59
VMP1-201	ENST00000262291	GALM	Q96C23	342 aa		11.34	□□□□□ -0.59
VMP1-201	ENST00000262291	OR2D2	Q9H210	308 aa		11.34	□□□□□ -0.59
VMP1-201	ENST00000262291	HIST1H2BK	O60814	126 aa		11.33	□□□□□ -0.6
VMP1-201	ENST00000262291	IGKV1-39	P01597	117 aa		11.33	□□□□□ -0.6
VMP1-201	ENST00000262291	IGHV1-46	P01743	117 aa		11.33	□□□□□ -0.6
VMP1-201	ENST00000262291	IGKV1D-39	P04432	117 aa		11.33	□□□□□ -0.6
VMP1-201	ENST00000262291	HIST1H2BJ	P06899	126 aa		11.33	□□□□□ -0.6
VMP1-201	ENST00000262291	HIST1H2BO	P23527	126 aa		11.33	□□□□□ -0.6
VMP1-201	ENST00000262291	LMO1	P25800	156 aa		11.33	□□□□□ -0.6
VMP1-201	ENST00000262291	UCP1	P25874	307 aa		11.33	□□□□□ -0.6
VMP1-201	ENST00000262291	HIST1H2BB	P33778	126 aa		11.33	□□□□□ -0.6
VMP1-201	ENST00000262291	HIST1H2BD	P58876	126 aa		11.33	□□□□□ -0.6
VMP1-201	ENST00000262291	HIST1H2BC	P62807	126 aa		11.33	□□□□□ -0.6
VMP1-201	ENST00000262291	TNFAIP6	P98066	277 aa	Predicted RBP	11.33	□□□□□ -0.6
VMP1-201	ENST00000262291	HIST2H2BE	Q16778	126 aa		11.33	□□□□□ -0.6
VMP1-201	ENST00000262291	HIST2H2BF	Q5QNW6	126 aa	Predicted RBP	11.33	□□□□□ -0.6
VMP1-201	ENST00000262291	HIST1H2BH	Q93079	126 aa		11.33	□□□□□ -0.6
VMP1-201	ENST00000262291	MALSU1	Q96EH3	234 aa		11.33	□□□□□ -0.6
VMP1-201	ENST00000262291	ABHD14B	Q96IU4	210 aa		11.33	□□□□□ -0.6
VMP1-201	ENST00000262291	HIST1H2BN	Q99877	126 aa		11.33	□□□□□ -0.6
VMP1-201	ENST00000262291	HIST1H2BM	Q99879	126 aa		11.33	□□□□□ -0.6
VMP1-201	ENST00000262291	C1QTNF9B	B2RNN3	333 aa		11.33	□□□□□ -0.6
VMP1-201	ENST00000262291	SRRM5	B3KS81	715 aa		11.33	□□□□□ -0.6
VMP1-201	ENST00000262291		H0Y980	276 aa		11.33	□□□□□ -0.6
VMP1-201	ENST00000262291		H3BP45	60 aa		11.33	□□□□□ -0.6
VMP1-201	ENST00000262291	PPP1R2P9	O14990	202 aa		11.33	□□□□□ -0.6
VMP1-201	ENST00000262291	CXCL1	P09341	107 aa		11.33	□□□□□ -0.6
VMP1-201	ENST00000262291	TUBG1	P23258	451 aa		11.33	□□□□□ -0.6
VMP1-201	ENST00000262291	CD200	P41217	278 aa		11.33	□□□□□ -0.6
VMP1-201	ENST00000262291	NKX2-1	P43699	371 aa	Predicted RBP	11.33	□□□□□ -0.6
VMP1-201	ENST00000262291	SULT1A2	P50226	295 aa		11.33	□□□□□ -0.6
VMP1-201	ENST00000262291		Q6ZRM9	215 aa		11.33	□□□□□ -0.6
VMP1-201	ENST00000262291	GPR146	Q96CH1	333 aa		11.33	□□□□□ -0.6
VMP1-201	ENST00000262291	WFIKKN1	Q96NZ8	548 aa		11.33	□□□□□ -0.6
VMP1-201	ENST00000262291	TUBG2	Q9NRH3	451 aa		11.33	□□□□□ -0.6
VMP1-201	ENST00000262291		E5RGE8	158 aa		11.32	□□□□□ -0.6
VMP1-201	ENST00000262291	SLC35E4	Q6ICL7	350 aa		11.32	□□□□□ -0.6
VMP1-201	ENST00000262291	LEAP2	Q969E1	77 aa		11.32	□□□□□ -0.6
VMP1-201	ENST00000262291	NSG2	Q9Y328	171 aa		11.32	□□□□□ -0.6
VMP1-201	ENST00000262291	LRBA	P50851	2863 aa		11.32	□□□□□ -0.6
VMP1-201	ENST00000262291	TMEM50A	O95807	157 aa		11.32	□□□□□ -0.6
VMP1-201	ENST00000262291	NUTF2	P61970	127 aa	Known RBP	11.32	□□□□□ -0.6
VMP1-201	ENST00000262291	NMS	Q5H8A3	153 aa		11.32	□□□□□ -0.6
VMP1-201	ENST00000262291	TMEM108	Q6UXF1	575 aa		11.32	□□□□□ -0.6
VMP1-201	ENST00000262291	ZNF835	Q9Y2P0	537 aa		11.32	□□□□□ -0.6
VMP1-201	ENST00000262291	IGLV3-9	A0A075B6K5	115 aa		11.31	□□□□□ -0.6
VMP1-201	ENST00000262291	OOEP	A6NGQ2	149 aa		11.31	□□□□□ -0.6
VMP1-201	ENST00000262291	FAM90A27P	A6NNH2	459 aa		11.31	□□□□□ -0.6
VMP1-201	ENST00000262291	RAMP3	O60896	148 aa		11.31	□□□□□ -0.6
VMP1-201	ENST00000262291	ZNF737	O75373	536 aa		11.31	□□□□□ -0.6
VMP1-201	ENST00000262291	CST7	O76096	145 aa		11.31	□□□□□ -0.6
VMP1-201	ENST00000262291	MB	P02144	154 aa		11.31	□□□□□ -0.6
VMP1-201	ENST00000262291	TRGC2	P03986	189 aa		11.31	□□□□□ -0.6
VMP1-201	ENST00000262291	RPL30	P62888	115 aa	Known RBP	11.31	□□□□□ -0.6
VMP1-201	ENST00000262291	ZNF816	Q0VGE8	651 aa	Predicted RBP	11.31	□□□□□ -0.6
VMP1-201	ENST00000262291	HIST3H2BB	Q8N257	126 aa		11.31	□□□□□ -0.6
VMP1-201	ENST00000262291	TMEM217	Q8N7C4	229 aa		11.31	□□□□□ -0.6
VMP1-201	ENST00000262291	OR5D13	Q8NGL4	314 aa		11.31	□□□□□ -0.6
VMP1-201	ENST00000262291	GCM1	Q9NP62	436 aa		11.31	□□□□□ -0.6
VMP1-201	ENST00000262291	PARP11	Q9NR21	331 aa		11.31	□□□□□ -0.6
VMP1-201	ENST00000262291	PSG11	Q9UQ72	335 aa		11.31	□□□□□ -0.6
VMP1-201	ENST00000262291	POMT1	Q9Y6A1	747 aa		11.31	□□□□□ -0.6
VMP1-201	ENST00000262291	TGIF2-C20orf24	A0A0A6YYL0	155 aa		11.31	□□□□□ -0.6
VMP1-201	ENST00000262291	IGSF23	A1L1A6	192 aa		11.31	□□□□□ -0.6
VMP1-201	ENST00000262291	SEC14L6	B5MCN3	397 aa		11.31	□□□□□ -0.6
VMP1-201	ENST00000262291	OR4A8	P0C604	315 aa		11.31	□□□□□ -0.6
VMP1-201	ENST00000262291	GRN	P28799	593 aa	Known RBP	11.31	□□□□□ -0.6
VMP1-201	ENST00000262291	S100G	P29377	79 aa		11.31	□□□□□ -0.6
VMP1-201	ENST00000262291	SNCA	P37840	140 aa		11.31	□□□□□ -0.6
VMP1-201	ENST00000262291	SELENOV	P59797	346 aa		11.31	□□□□□ -0.6
VMP1-201	ENST00000262291	SRPX	P78539	464 aa		11.31	□□□□□ -0.6
VMP1-201	ENST00000262291	ZNF585B	Q52M93	769 aa		11.31	□□□□□ -0.6
VMP1-201	ENST00000262291	RND1	Q92730	232 aa		11.31	□□□□□ -0.6
VMP1-201	ENST00000262291	FAM234A	Q9H0X4	552 aa		11.31	□□□□□ -0.6
VMP1-201	ENST00000262291	KCNJ16	Q9NPI9	418 aa		11.31	□□□□□ -0.6
VMP1-201	ENST00000262291	GYPA	P02724	150 aa		11.3	□□□□□ -0.6

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