RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 IFITM10A6NMD0 228 aa22.07■■□□□ 1.12
CAPNS1-201ENST00000246533 CST7O76096 145 aa22.07■■□□□ 1.12
CAPNS1-201ENST00000246533 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
CAPNS1-201ENST00000246533 CXCL1P09341 107 aa22.07■■□□□ 1.12
CAPNS1-201ENST00000246533 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
CAPNS1-201ENST00000246533 BCL2L14Q9BZR8 327 aa22.07■■□□□ 1.12
CAPNS1-201ENST00000246533 UBTD1Q9HAC8 227 aa22.07■■□□□ 1.12
CAPNS1-201ENST00000246533 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
CAPNS1-201ENST00000246533 HIST1H2BKO60814 126 aa22.06■■□□□ 1.12
CAPNS1-201ENST00000246533 HIST1H2BJP06899 126 aa22.06■■□□□ 1.12
CAPNS1-201ENST00000246533 CCL2P13500 99 aa22.06■■□□□ 1.12
CAPNS1-201ENST00000246533 HIST1H2BOP23527 126 aa22.06■■□□□ 1.12
CAPNS1-201ENST00000246533 HIST1H2BBP33778 126 aa22.06■■□□□ 1.12
CAPNS1-201ENST00000246533 HIST1H2BDP58876 126 aa22.06■■□□□ 1.12
CAPNS1-201ENST00000246533 ERVFRD-1P60508 538 aa22.06■■□□□ 1.12
CAPNS1-201ENST00000246533 HIST1H2BCP62807 126 aa22.06■■□□□ 1.12
CAPNS1-201ENST00000246533 HIST2H2BEQ16778 126 aa22.06■■□□□ 1.12
CAPNS1-201ENST00000246533 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
CAPNS1-201ENST00000246533 MKXQ8IYA7 352 aa22.06■■□□□ 1.12
CAPNS1-201ENST00000246533 HIST1H2BHQ93079 126 aa22.06■■□□□ 1.12
CAPNS1-201ENST00000246533 PFDN5Q99471 154 aa22.06■■□□□ 1.12
CAPNS1-201ENST00000246533 HIST1H2BNQ99877 126 aa22.06■■□□□ 1.12
CAPNS1-201ENST00000246533 HIST1H2BMQ99879 126 aa22.06■■□□□ 1.12
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM50AO95807 157 aa22.06■■□□□ 1.12
CAPNS1-201ENST00000246533 MBD3L1Q8WWY6 194 aa22.06■■□□□ 1.12
CAPNS1-201ENST00000246533 CTDSP1Q9GZU7 261 aa22.06■■□□□ 1.12
CAPNS1-201ENST00000246533 CLDN34H7C241 214 aa22.05■■□□□ 1.12
CAPNS1-201ENST00000246533 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
CAPNS1-201ENST00000246533 CD200P41217 278 aa22.05■■□□□ 1.12
CAPNS1-201ENST00000246533 PAX9P55771 341 aa22.05■■□□□ 1.12
CAPNS1-201ENST00000246533 PMS2P11Q13670 270 aa22.05■■□□□ 1.12
CAPNS1-201ENST00000246533 GFOD1Q9NXC2 390 aa22.05■■□□□ 1.12
CAPNS1-201ENST00000246533 CYB5BO43169 146 aa22.04■■□□□ 1.12
CAPNS1-201ENST00000246533 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
CAPNS1-201ENST00000246533 F2RP25116 425 aa22.04■■□□□ 1.12
CAPNS1-201ENST00000246533 ARR3P36575 388 aa22.04■■□□□ 1.12
CAPNS1-201ENST00000246533 CEBPGP53567 150 aa22.04■■□□□ 1.12
CAPNS1-201ENST00000246533 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
CAPNS1-201ENST00000246533 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
CAPNS1-201ENST00000246533 CREBBPQ92793 2442 aa22.04■■□□□ 1.12
CAPNS1-201ENST00000246533 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
CAPNS1-201ENST00000246533 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF154Q13106 437 aa22.04■■□□□ 1.12
CAPNS1-201ENST00000246533 SSX8Q7RTT4 187 aa22.04■■□□□ 1.12
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM217Q8N7C4 229 aa22.04■■□□□ 1.12
CAPNS1-201ENST00000246533 SCGB1C1Q8TD33 95 aa22.04■■□□□ 1.12
CAPNS1-201ENST00000246533 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
CAPNS1-201ENST00000246533 TAAR3PQ9P1P4 343 aa22.04■■□□□ 1.12
CAPNS1-201ENST00000246533 ARID1AO14497 2285 aa22.03■■□□□ 1.12
CAPNS1-201ENST00000246533 E7EQL1 145 aa22.03■■□□□ 1.12
CAPNS1-201ENST00000246533 GOSR1O95249 250 aa22.03■■□□□ 1.12
CAPNS1-201ENST00000246533 SCTP09683 121 aa22.03■■□□□ 1.12
CAPNS1-201ENST00000246533 BCL2P10415 239 aa22.03■■□□□ 1.12
CAPNS1-201ENST00000246533 EPHA1P21709 976 aa22.03■■□□□ 1.12
CAPNS1-201ENST00000246533 SERF2P84101 59 aa22.03■■□□□ 1.12
CAPNS1-201ENST00000246533 DEFA6Q01524 100 aa22.03■■□□□ 1.12
CAPNS1-201ENST00000246533 PDCD1Q15116 288 aa22.03■■□□□ 1.12
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC25A24Q6NUK1 477 aa22.03■■□□□ 1.12
CAPNS1-201ENST00000246533 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
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CAPNS1-201ENST00000246533 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
CAPNS1-201ENST00000246533 RFNGQ9Y644 331 aa22.03■■□□□ 1.12
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
CAPNS1-201ENST00000246533 OTOGQ6ZRI0 2925 aa22.02■■□□□ 1.12
CAPNS1-201ENST00000246533 BCL3P20749 454 aa22.02■■□□□ 1.12
CAPNS1-201ENST00000246533 RUNX1Q01196 453 aa22.02■■□□□ 1.12
CAPNS1-201ENST00000246533 CEACAM21Q3KPI0 293 aa22.02■■□□□ 1.12
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF343Q6P1L6 599 aa22.02■■□□□ 1.12
CAPNS1-201ENST00000246533 HIST3H2BBQ8N257 126 aa22.02■■□□□ 1.12
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM169BQ8N8A8 192 aa22.02■■□□□ 1.12
CAPNS1-201ENST00000246533 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
CAPNS1-201ENST00000246533 CCL28Q9NRJ3 127 aa22.02■■□□□ 1.12
CAPNS1-201ENST00000246533 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa22.02■■□□□ 1.11
CAPNS1-201ENST00000246533 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa22.02■■□□□ 1.11
CAPNS1-201ENST00000246533 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.11
CAPNS1-201ENST00000246533 IFNA1P01562 189 aa22.02■■□□□ 1.11
CAPNS1-201ENST00000246533 OPN1MWP04001 364 aa22.02■■□□□ 1.11
CAPNS1-201ENST00000246533 OPN1MW2P0DN77 364 aa22.02■■□□□ 1.11
CAPNS1-201ENST00000246533 OPN1MW3P0DN78 364 aa22.02■■□□□ 1.11
CAPNS1-201ENST00000246533 COX5BP10606 129 aa22.02■■□□□ 1.11
CAPNS1-201ENST00000246533 HERPUD1Q15011 391 aa22.02■■□□□ 1.11
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.11
CAPNS1-201ENST00000246533 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa22.01■■□□□ 1.11
CAPNS1-201ENST00000246533 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa22.01■■□□□ 1.11
CAPNS1-201ENST00000246533 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa22.01■■□□□ 1.11
CAPNS1-201ENST00000246533 TRAPPC2LH3BP13 241 aa22.01■■□□□ 1.11
CAPNS1-201ENST00000246533 IGKV1-13P0DP09 117 aa22.01■■□□□ 1.11
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM90A2PQ658T7 463 aa22.01■■□□□ 1.11
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF600Q6ZNG1 722 aa22.01■■□□□ 1.11
CAPNS1-201ENST00000246533 THNSL2Q86YJ6 484 aa22.01■■□□□ 1.11
CAPNS1-201ENST00000246533 PRDX4Q13162 271 aa22■■□□□ 1.11
CAPNS1-201ENST00000246533 ZDHHC23Q8IYP9 409 aa22■■□□□ 1.11
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF383Q8NA42 475 aa22■■□□□ 1.11
CAPNS1-201ENST00000246533 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
CAPNS1-201ENST00000246533 OR2W1Q9Y3N9 320 aa22■■□□□ 1.11
CAPNS1-201ENST00000246533 HS3ST1O14792 307 aa22■■□□□ 1.11
CAPNS1-201ENST00000246533 IFNA10P01566 189 aa22■■□□□ 1.11
CAPNS1-201ENST00000246533 SERPINE2P07093 398 aa22■■□□□ 1.11
CAPNS1-201ENST00000246533 PRSS12P56730 875 aa22■■□□□ 1.11
CAPNS1-201ENST00000246533 GNG13Q9P2W3 67 aa22■■□□□ 1.11
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